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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000022.1:3215214..3216918+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_47320-T1 ID=CAN33_47320-T1|Name=CAN33_47320-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=1705bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000022.1:3215214..3216918+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGGCTGACATGCCCATTGGTATGTTTATGCGTGTTCCCCCTCCTCTTCC
TTACCTTCATCTTCCCTTACCCCCTCCCCGAGTTCTCCTTGTCGGTGCCT
GTCCCTCCCGTGCTTCCCAGCTAACCAACCACGCCCCCCAGTGCTCGACG
GAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGGTCTGTCATCAC
CTCCCATCCCATTGCGTACTCTTACTTACCTCCTCTTCTTCCCCATGGAT
AGAACTTCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGC
GAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGA
GATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTGTACG
TCATTTACATTCGCGTGCCTTCGTTCTCCCCCCACCCCCGATCGCTCCAT
TGTCTCCCCGGAGGTGTGGCAGACGTGTTAACGTTGGGCCCGACTTGGTA
TACAGATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTA
TGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAA
GATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAA
TGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCT
ATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGGTAAGTCTTGCACGCTTCA
TATCCTCTCTCTTATCCCGCAGCTCTGATCGCCCGCTCTTTCGCAATCCA
CAGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCAC
ATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCT
TGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCC
GTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAG
ATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAA
GCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATG
GTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTC
TTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCT
CTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACA
AGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCC
CGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGG
CAACCCGGAGAGGTTGAACGTACGTGTTCTCATTCACTGGCGGACCATAC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAGAAGAAATCAACAGCTAATTCCATGA
TACAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATG
GTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTAAGCTTCTTCACTTC
TTCCCTCCTTCCCCTGTACACCCGTTTTCCAGTTCGAAAATCACACCATA
GCTAACATAATTACCTAGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAA
GCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTA
GATAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000022.1:3215214..3216918+ >CAN33_47320-T1 ID=CAN33_47320-T1|Name=CAN33_47320-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=8043bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000022.1:3215214..3216918+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGGCTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGT CGGATATGCTGCGCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAA CGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGAT GAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAGAA TGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCT TTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACC GAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTAT GCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGC TTGCACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGT GACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCA CCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCA TCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTC GAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCT CGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCT ACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAA GCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGG TATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGC GCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTAC CCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCAC ACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCGCA TCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTC CTCGCCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGA GTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGA TGGCTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTC GGATATGCTGCGCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAAC GGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATG AAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAGAAT GGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTT TTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCG AACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATG CTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCT TGCACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTG ACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCAC CACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCAT CGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCG AAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTC GAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTA CACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAG CCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGT ATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCG CTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACC CCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACA CGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCGCAT CGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCC TCGCCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAG TGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAT GGCTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCG GATATGCTGCGCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACG GAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGA AGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAGAATG GTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTT TACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGA ACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGC TGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTT GCACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGA CGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACC ACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATC GCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGA AACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCG AGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTAC ACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGC CCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTA TCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGC TCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCC CGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACAC GGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCGCATC GAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCT CGCCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGT GGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGATG GCTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGG ATATGCTGCGCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGG AGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAA GCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAGAATGG TATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTT ACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAA CCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCT GGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTG CACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGAC GGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCA CATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCG CCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAA ACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGA GTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACA CCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCC CCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTAT CGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCT CCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCC GGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACG GGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCGCATCG AGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTC GCCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTG GCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGATGG CTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGA TATGCTGCGCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGA GGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAG CTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAGAATGGT ATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTA CGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAAC CCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTG GAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGC ACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACG GTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCAC ATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGC CCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAA CCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAG TTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACAC CCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCC CCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATC GCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTC CAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCG GTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGG GTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCGCATCGA GGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCG CCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGG CAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGATGGC TGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGAT ATGCTGCGCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAG GAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGC TGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAGAATGGTA TCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTAC GAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACC CCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGG AAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCA CTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGG TGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACA TTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCC CTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAAC CGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGT TGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACC CTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCC CGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCG CCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTCC AGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGG TCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGG TCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCGCATCGAG GACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGC CAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGC AGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGATGGCT GACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATA TGCTGCGCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGG AGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCT GCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAGAATGGTAT CGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACG AGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCC CCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGA AGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCAC TATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGT GTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACAT TCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCC TCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACC GTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTT GGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCC TTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCC GAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGC CGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTCCA GTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGT CTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGT CCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGG ACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCC AACCTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCA GGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | BUSCO:EOG09262MEK |
| DBxref | InterPro:IPR020902 |
| DBxref | InterPro:IPR004000 |
| DBxref | PFAM:PF00022 |
| Product | actin nucleation center |
| Product | Arp2/3 complex subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| NKJJ01000022.1 | supercontig | NKJJ01000022.1:3215214..3216918 + |
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