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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000019.1:1012046..1013739+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_5420-T1 ID=CAN33_5420-T1|Name=CAN33_5420-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=1694bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000019.1:1012046..1013739+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
ATGAAGAACGTTGCGACCCTTGCAGCCTTCGCTGCTGGGGCTAATGCCCT
TGTTGGCCGGAGCGACTCTTGCTGCTTTCACCTGACAGCTTCTGGTGATG
CTTCTGGCACCATTGGCCAGCTGGGTGATGGTCAGAACCGCATTGGTGGT
GGACTGCCCGCCACCCAGTTCTGCATTGACTCCAATGGTGGCATCACTGA
TAGCAGCGGACGCGGTTGTGTCGTGACTAGTAAGCTATCCACATATACAT
AATATCAGGTATGTTACTAACCACACATGTTGACAGGCGATACCACGCAG
TTCCAGTGTGACTTGGGTAAATCTCCTATGTCGGGTTTCTCCATCACCTC
CTCTGGTGAGCTGGAGTACAACGGTGACGCCGATTTTGTTGCCTGCCAAA
CTGGCGACAACAACGAACTGAACCTTTACACCACCGAGAACTCCTCCGTC
ACTGGCTGCGAGAACATCAAGTTGACAGCTGATTCCTGCGCGGGCTCTGG
TGCTGGTTCTGTTGGTTCTAGCTCTGCTCCGGCTTCGACCCCCGCGCCTC
AGTCCAGCACGCCGGCTCCTGCTCCTTCCTCCAGCGCTCCAGGTGTCCCT
GGCGCTGGTGCGTCGACTGGTTGGGTTCCCGGTGGTCCTGCCTCCAGTGC
TTCCGTGCCCTACGGTCCTGGTCCCCAGTCTAGCGGCGCCGTGCAAGTGA
CGACCGTCTATGTGACTGAAACCTACTGTGGTGCTGAGACTACTCCTGTG
GTTTCTGTTCCTGGGGAGAGTACTGTTCCGCTGGTTCCCGTTGGACCCGG
GTCTTCTGCTCCCGCTGGCTCCCAGCCGGCCCCGTCCGGATCCCCTGCTC
CTCAGCCATCCGAGACTCCATCCTACCCTCAGTCGTCCGAAAGCCCTGCT
CCTCAGCCTTCGGAAACTCCTTCGTACCCCCAGTCCTCGGAGACCCCGGC
CCCCAGCCTTCTGAGACTCCCGCTCCTCAGCCCTCTGGCTCTCCTGCTCC
TCAGCCATCCGGGTCTCCGGCTCCCCAGCCTTCCTCCTACCCCCAGACCT
CTGGAACTCCTGCTCCTCAGCCGTCTGGTACTCCCTCTTACCCCCAGACC
TCCGCGTCTCCCAGCAGCGCTCAGCCTTCTGGCACGGCTACCCAGTCGTC
CTCTGCCAGCTGCCCCACCGATCTCTCTGGCGACTATGAGTACCCTCACT
TGATCGTCCCCATCAACTCTTCTACTCCCGACACCGCCTACGGTACTCAG
TACTTCGGCACCGTCTCCTCCACCGTCTCGACCATCTTCAACTTCGATAT
CCCCTCTTCGGACTCTGGAAAGACCTGCAGTCTGATCTTCCTGTTCCCCA
CCAAGGATCAGCTTGAGACCTCTGACTACACCTTCAGCGGAGACGGCAAG
ATTGACTTCTCCCAGCTCGAGTCTGCTGCTAGTGAGTCGACGACCTACAA
CAACGCTCCTGGGGTCAAGCAGGACTACGGCGACTTCACCGTCTCGCCTG
GCAACTCCTACCTGATCTCCACGTTCTCCTGCCCGGCTGGCCAGACTGTC
AGCTACGAGATGAAGGAGGCTGGTAGCACCTACCTCAACTTCTTTGAGGA
CTACAACCCCTCTCCGTAAGTATTCTCCATACCATCTTCTATGAACCATT
GCTAATTGAAATCTAGTCTCGGTCTGTACATCACGGTCTGCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000019.1:1012046..1013739+ >CAN33_5420-T1 ID=CAN33_5420-T1|Name=CAN33_5420-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=7260bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000019.1:1012046..1013739+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
ATGAAGAACGTTGCGACCCTTGCAGCCTTCGCTGCTGGGGCTAATGCCCT
TGTTGGCCGGAGCGACTCTTGCTGCTTTCACCTGACAGCTTCTGGTGATG
CTTCTGGCACCATTGGCCAGCTGGGTGATGGTCAGAACCGCATTGGTGGT
GGACTGCCCGCCACCCAGTTCTGCATTGACTCCAATGGTGGCATCACTGA
TAGCAGCGGACGCGGTTGTGTCGTGACTAGCGATACCACGCAGTTCCAGT
GTGACTTGGGTAAATCTCCTATGTCGGGTTTCTCCATCACCTCCTCTGGT
GAGCTGGAGTACAACGGTGACGCCGATTTTGTTGCCTGCCAAACTGGCGA
CAACAACGAACTGAACCTTTACACCACCGAGAACTCCTCCGTCACTGGCT
GCGAGAACATCAACGCTCCAGGTGTCCCTGGCGCTGGTGCGTCGACTGGT
TGGGTTCCCGGTGGTCCTGCCTCCAGTGCTTCCGTGCCCTACGGTCCTGG
TCCCCAGTCTAGCGGCGCCGTGCAAGTGACGACCGTCTATGTGACTGAAA
CCTACTGTGGTGCTGAGACTACTCCTGTGGTTTCTGTTCCTGGGGAGAGT
ACTGTTCCGCTGGTTCCCGTTGGACCCGGGTCTTCTGCTCCCGCTGGCTC
CCAGCCGGCCCCGTCCGGATCCCCTGCTCCTCAGCCATCCGAGACTCCAT
CCTACCCTCAGTCGTCCGAAAGCCCTGCTCCTCAGCCTTCGGAAACTCCT
TCGTACCCCCAGTCCTCGGAGACCCCGGCCCCCAGCCTTCTGAGACTCCC
GCTCCTCAGCCCTCTGGCTCTCCTGCTCCTCAGCCATCCGGGTCTCCGGC
TCCCCAGCCTTCCTCCTACCCCCAGACCTCTGGAACTCCTGCTCCTCAGC
CGTCTGACCTCCGCGTCTCCCAGCAGCGCTCAGCCTTCTGGCACGGCTAC
CCAGTCGTCCTCTGCCAGCTGCCCCACCGATCTCTCTGGCGACTATGAGT
ACCCTCACTTGATCGTCCCCATCAACTCTTCTACTCCCGACACCGCCTAC
GGTACTCAGTACTTCGGCACCGTCTCCTCCACCGTCTCGACCATCTTCAA
CTTCGATATCCCCTCTTCGGACTCTGGAAAGACCTGCAGTCTGATCTTCC
TGTTCCCCACCAAGGATCAGCTTGAGACCTCTGACTACACCTTCAGCGGA
GACGGCAAGATTGACTTCTCCCAGCTCGAGTCTGCTGCTAGTGAGTCGAC
GACCTACAACAACGCTCCTGGGGTCAAGCAGGACTACGGCGACTTCACCG
TCTCGCCTGGCAACTCCTACCTGATCTCCACGTTCTCCTGCCCGGCTGGC
CAGACTGTCAGCTACGAGATGAAGGAGGCTGGTAGCACCTACCTCAACTT
CTTTGAGGACTACAACCCCTCTCCTCTCGGTCTGTACATCACGGTCTGCT
AAATGAAGAACGTTGCGACCCTTGCAGCCTTCGCTGCTGGGGCTAATGCC
CTTGTTGGCCGGAGCGACTCTTGCTGCTTTCACCTGACAGCTTCTGGTGA
TGCTTCTGGCACCATTGGCCAGCTGGGTGATGGTCAGAACCGCATTGGTG
GTGGACTGCCCGCCACCCAGTTCTGCATTGACTCCAATGGTGGCATCACT
GATAGCAGCGGACGCGGTTGTGTCGTGACTAGCGATACCACGCAGTTCCA
GTGTGACTTGGGTAAATCTCCTATGTCGGGTTTCTCCATCACCTCCTCTG
GTGAGCTGGAGTACAACGGTGACGCCGATTTTGTTGCCTGCCAAACTGGC
GACAACAACGAACTGAACCTTTACACCACCGAGAACTCCTCCGTCACTGG
CTGCGAGAACATCAACGCTCCAGGTGTCCCTGGCGCTGGTGCGTCGACTG
GTTGGGTTCCCGGTGGTCCTGCCTCCAGTGCTTCCGTGCCCTACGGTCCT
GGTCCCCAGTCTAGCGGCGCCGTGCAAGTGACGACCGTCTATGTGACTGA
AACCTACTGTGGTGCTGAGACTACTCCTGTGGTTTCTGTTCCTGGGGAGA
GTACTGTTCCGCTGGTTCCCGTTGGACCCGGGTCTTCTGCTCCCGCTGGC
TCCCAGCCGGCCCCGTCCGGATCCCCTGCTCCTCAGCCATCCGAGACTCC
ATCCTACCCTCAGTCGTCCGAAAGCCCTGCTCCTCAGCCTTCGGAAACTC
CTTCGTACCCCCAGTCCTCGGAGACCCCGGCCCCCAGCCTTCTGAGACTC
CCGCTCCTCAGCCCTCTGGCTCTCCTGCTCCTCAGCCATCCGGGTCTCCG
GCTCCCCAGCCTTCCTCCTACCCCCAGACCTCTGGAACTCCTGCTCCTCA
GCCGTCTGACCTCCGCGTCTCCCAGCAGCGCTCAGCCTTCTGGCACGGCT
ACCCAGTCGTCCTCTGCCAGCTGCCCCACCGATCTCTCTGGCGACTATGA
GTACCCTCACTTGATCGTCCCCATCAACTCTTCTACTCCCGACACCGCCT
ACGGTACTCAGTACTTCGGCACCGTCTCCTCCACCGTCTCGACCATCTTC
AACTTCGATATCCCCTCTTCGGACTCTGGAAAGACCTGCAGTCTGATCTT
CCTGTTCCCCACCAAGGATCAGCTTGAGACCTCTGACTACACCTTCAGCG
GAGACGGCAAGATTGACTTCTCCCAGCTCGAGTCTGCTGCTAGTGAGTCG
ACGACCTACAACAACGCTCCTGGGGTCAAGCAGGACTACGGCGACTTCAC
CGTCTCGCCTGGCAACTCCTACCTGATCTCCACGTTCTCCTGCCCGGCTG
GCCAGACTGTCAGCTACGAGATGAAGGAGGCTGGTAGCACCTACCTCAAC
TTCTTTGAGGACTACAACCCCTCTCCTCTCGGTCTGTACATCACGGTCTG
CTAAATGAAGAACGTTGCGACCCTTGCAGCCTTCGCTGCTGGGGCTAATG
CCCTTGTTGGCCGGAGCGACTCTTGCTGCTTTCACCTGACAGCTTCTGGT
GATGCTTCTGGCACCATTGGCCAGCTGGGTGATGGTCAGAACCGCATTGG
TGGTGGACTGCCCGCCACCCAGTTCTGCATTGACTCCAATGGTGGCATCA
CTGATAGCAGCGGACGCGGTTGTGTCGTGACTAGCGATACCACGCAGTTC
CAGTGTGACTTGGGTAAATCTCCTATGTCGGGTTTCTCCATCACCTCCTC
TGGTGAGCTGGAGTACAACGGTGACGCCGATTTTGTTGCCTGCCAAACTG
GCGACAACAACGAACTGAACCTTTACACCACCGAGAACTCCTCCGTCACT
GGCTGCGAGAACATCAACGCTCCAGGTGTCCCTGGCGCTGGTGCGTCGAC
TGGTTGGGTTCCCGGTGGTCCTGCCTCCAGTGCTTCCGTGCCCTACGGTC
CTGGTCCCCAGTCTAGCGGCGCCGTGCAAGTGACGACCGTCTATGTGACT
GAAACCTACTGTGGTGCTGAGACTACTCCTGTGGTTTCTGTTCCTGGGGA
GAGTACTGTTCCGCTGGTTCCCGTTGGACCCGGGTCTTCTGCTCCCGCTG
GCTCCCAGCCGGCCCCGTCCGGATCCCCTGCTCCTCAGCCATCCGAGACT
CCATCCTACCCTCAGTCGTCCGAAAGCCCTGCTCCTCAGCCTTCGGAAAC
TCCTTCGTACCCCCAGTCCTCGGAGACCCCGGCCCCCAGCCTTCTGAGAC
TCCCGCTCCTCAGCCCTCTGGCTCTCCTGCTCCTCAGCCATCCGGGTCTC
CGGCTCCCCAGCCTTCCTCCTACCCCCAGACCTCTGGAACTCCTGCTCCT
CAGCCGTCTGACCTCCGCGTCTCCCAGCAGCGCTCAGCCTTCTGGCACGG
CTACCCAGTCGTCCTCTGCCAGCTGCCCCACCGATCTCTCTGGCGACTAT
GAGTACCCTCACTTGATCGTCCCCATCAACTCTTCTACTCCCGACACCGC
CTACGGTACTCAGTACTTCGGCACCGTCTCCTCCACCGTCTCGACCATCT
TCAACTTCGATATCCCCTCTTCGGACTCTGGAAAGACCTGCAGTCTGATC
TTCCTGTTCCCCACCAAGGATCAGCTTGAGACCTCTGACTACACCTTCAG
CGGAGACGGCAAGATTGACTTCTCCCAGCTCGAGTCTGCTGCTAGTGAGT
CGACGACCTACAACAACGCTCCTGGGGTCAAGCAGGACTACGGCGACTTC
ACCGTCTCGCCTGGCAACTCCTACCTGATCTCCACGTTCTCCTGCCCGGC
TGGCCAGACTGTCAGCTACGAGATGAAGGAGGCTGGTAGCACCTACCTCA
ACTTCTTTGAGGACTACAACCCCTCTCCTCTCGGTCTGTACATCACGGTC
TGCTAAATGAAGAACGTTGCGACCCTTGCAGCCTTCGCTGCTGGGGCTAA
TGCCCTTGTTGGCCGGAGCGACTCTTGCTGCTTTCACCTGACAGCTTCTG
GTGATGCTTCTGGCACCATTGGCCAGCTGGGTGATGGTCAGAACCGCATT
GGTGGTGGACTGCCCGCCACCCAGTTCTGCATTGACTCCAATGGTGGCAT
CACTGATAGCAGCGGACGCGGTTGTGTCGTGACTAGCGATACCACGCAGT
TCCAGTGTGACTTGGGTAAATCTCCTATGTCGGGTTTCTCCATCACCTCC
TCTGGTGAGCTGGAGTACAACGGTGACGCCGATTTTGTTGCCTGCCAAAC
TGGCGACAACAACGAACTGAACCTTTACACCACCGAGAACTCCTCCGTCA
CTGGCTGCGAGAACATCAACGCTCCAGGTGTCCCTGGCGCTGGTGCGTCG
ACTGGTTGGGTTCCCGGTGGTCCTGCCTCCAGTGCTTCCGTGCCCTACGG
TCCTGGTCCCCAGTCTAGCGGCGCCGTGCAAGTGACGACCGTCTATGTGA
CTGAAACCTACTGTGGTGCTGAGACTACTCCTGTGGTTTCTGTTCCTGGG
GAGAGTACTGTTCCGCTGGTTCCCGTTGGACCCGGGTCTTCTGCTCCCGC
TGGCTCCCAGCCGGCCCCGTCCGGATCCCCTGCTCCTCAGCCATCCGAGA
CTCCATCCTACCCTCAGTCGTCCGAAAGCCCTGCTCCTCAGCCTTCGGAA
ACTCCTTCGTACCCCCAGTCCTCGGAGACCCCGGCCCCCAGCCTTCTGAG
ACTCCCGCTCCTCAGCCCTCTGGCTCTCCTGCTCCTCAGCCATCCGGGTC
TCCGGCTCCCCAGCCTTCCTCCTACCCCCAGACCTCTGGAACTCCTGCTC
CTCAGCCGTCTGACCTCCGCGTCTCCCAGCAGCGCTCAGCCTTCTGGCAC
GGCTACCCAGTCGTCCTCTGCCAGCTGCCCCACCGATCTCTCTGGCGACT
ATGAGTACCCTCACTTGATCGTCCCCATCAACTCTTCTACTCCCGACACC
GCCTACGGTACTCAGTACTTCGGCACCGTCTCCTCCACCGTCTCGACCAT
CTTCAACTTCGATATCCCCTCTTCGGACTCTGGAAAGACCTGCAGTCTGA
TCTTCCTGTTCCCCACCAAGGATCAGCTTGAGACCTCTGACTACACCTTC
AGCGGAGACGGCAAGATTGACTTCTCCCAGCTCGAGTCTGCTGCTAGTGA
GTCGACGACCTACAACAACGCTCCTGGGGTCAAGCAGGACTACGGCGACT
TCACCGTCTCGCCTGGCAACTCCTACCTGATCTCCACGTTCTCCTGCCCG
GCTGGCCAGACTGTCAGCTACGAGATGAAGGAGGCTGGTAGCACCTACCT
CAACTTCTTTGAGGACTACAACCCCTCTCCTCTCGGTCTGTACATCACGG
TCTGCTAAATGAAGAACGTTGCGACCCTTGCAGCCTTCGCTGCTGGGGCT
AATGCCCTTGTTGGCCGGAGCGACTCTTGCTGCTTTCACCTGACAGCTTC
TGGTGATGCTTCTGGCACCATTGGCCAGCTGGGTGATGGTCAGAACCGCA
TTGGTGGTGGACTGCCCGCCACCCAGTTCTGCATTGACTCCAATGGTGGC
ATCACTGATAGCAGCGGACGCGGTTGTGTCGTGACTAGCGATACCACGCA
GTTCCAGTGTGACTTGGGTAAATCTCCTATGTCGGGTTTCTCCATCACCT
CCTCTGGTGAGCTGGAGTACAACGGTGACGCCGATTTTGTTGCCTGCCAA
ACTGGCGACAACAACGAACTGAACCTTTACACCACCGAGAACTCCTCCGT
CACTGGCTGCGAGAACATCAACGCTCCAGGTGTCCCTGGCGCTGGTGCGT
CGACTGGTTGGGTTCCCGGTGGTCCTGCCTCCAGTGCTTCCGTGCCCTAC
GGTCCTGGTCCCCAGTCTAGCGGCGCCGTGCAAGTGACGACCGTCTATGT
GACTGAAACCTACTGTGGTGCTGAGACTACTCCTGTGGTTTCTGTTCCTG
GGGAGAGTACTGTTCCGCTGGTTCCCGTTGGACCCGGGTCTTCTGCTCCC
GCTGGCTCCCAGCCGGCCCCGTCCGGATCCCCTGCTCCTCAGCCATCCGA
GACTCCATCCTACCCTCAGTCGTCCGAAAGCCCTGCTCCTCAGCCTTCGG
AAACTCCTTCGTACCCCCAGTCCTCGGAGACCCCGGCCCCCAGCCTTCTG
AGACTCCCGCTCCTCAGCCCTCTGGCTCTCCTGCTCCTCAGCCATCCGGG
TCTCCGGCTCCCCAGCCTTCCTCCTACCCCCAGACCTCTGGAACTCCTGC
TCCTCAGCCGTCTGACCTCCGCGTCTCCCAGCAGCGCTCAGCCTTCTGGC
ACGGCTACCCAGTCGTCCTCTGCCAGCTGCCCCACCGATCTCTCTGGCGA
CTATGAGTACCCTCACTTGATCGTCCCCATCAACTCTTCTACTCCCGACA
CCGCCTACGGTACTCAGTACTTCGGCACCGTCTCCTCCACCGTCTCGACC
ATCTTCAACTTCGATATCCCCTCTTCGGACTCTGGAAAGACCTGCAGTCT
GATCTTCCTGTTCCCCACCAAGGATCAGCTTGAGACCTCTGACTACACCT
TCAGCGGAGACGGCAAGATTGACTTCTCCCAGCTCGAGTCTGCTGCTAGT
GAGTCGACGACCTACAACAACGCTCCTGGGGTCAAGCAGGACTACGGCGA
CTTCACCGTCTCGCCTGGCAACTCCTACCTGATCTCCACGTTCTCCTGCC
CGGCTGGCCAGACTGTCAGCTACGAGATGAAGGAGGCTGGTAGCACCTAC
CTCAACTTCTTTGAGGACTACAACCCCTCTCCTCTCGGTCTGTACATCAC
GGTCTGCTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | EggNog:ENOG41 |
| DBxref | InterPro:IPR018620 |
| DBxref | PFAM:PF09792 |
| Product | Ubiquitin 3 binding protein But2 C-terminal domain family protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| NKJJ01000019.1 | supercontig | NKJJ01000019.1:1012046..1013739 + |
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