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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000012.1:732794..734596- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_9000-T1 ID=CAN33_9000-T1|Name=CAN33_9000-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=1803bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000012.1:732794..734596- (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGGCGATACTAAGTCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCCTGCT
GCTTGCTTCCCCCACCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCCGAGG
GTGCCGCCATCTCCGAGGATCCGATTGTATGTTGTCGCACCCACGGCTGA
CCTGTCTGCGATTGCTGCGGCCTCAACATTATACTGACTAGTCGCCTAGG
ACACAACACTATGGATACATATGATCCTTATGGGGTTTGCCTTTGGCGTT
ATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGGTAAGCTGGCCCGGTTACATCCT
ATCTCCGACCTTCCGCGGTCGGGGATACTCGATTACTCGATCAAATGAGA
CGCATATCTGACATTTCCGCTTTACCATCATAGATTATACGCTCGCGCTG
GCACGTCCCTCTCCAGATTGTCGGAACGATTATCGCTGTGCTCGCATACT
TCCTCGGACATGCTCACAAAGGCCGCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCG
TCCTTTGCGAACACACTGATGCTCATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGG
CGTCTATCTCAAGCTGCACCTTACCAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCC
GGGTTATTGTGATTGCGCACGGAGTGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCG
AGCTGGGTCCAGATGCTCTTCGGAGGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCG
GGATGATCACTTGGGACAGTGTCTGGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTT
TCATCGCCTACGGTATCCTGCTGACCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTAC
TGGCTGCGCCGCACTGGCCGCAGCCAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCAT
CGCTGCATGGGGATGTGTCAACACCTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTC
CCTGGGTCCACAATGATTTGCAGCACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGG
TGCGCCGGTCTACTGGGTATTTGGATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCC
CAAGCGGAACTTGATCCCAGCCATAGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCA
TGTCTGCCCACCCGCAGACTCTGATGATCAGCACTATGATCCACTCCATC
TTCGGCTACACGTTAATGGCTGCCGGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTC
CTTCGTGCTTCGGGACAAGGGCTCTGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTA
ACAGCTTCCAATATCTCACGCCTTTCGTAAGTCTTCCACAGCCCTTCCGG
CTGAAGTGTGTCGTCATTTCTAACTTATCGCAGCTTCTGTACGCCTCGGG
CTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCAACTCCTGAACGATG
CAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCTACAGCATCGCCTTC
ATTCTCTTCCTATGTAAGACCACCTCCCTTCCCCCAAAAACCAGAGAACC
ACACTAACCCCACCCCCAACACAGTCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTAC
GCCGTCCATGCATGGCCCGAATCCGCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTC
TTCCAGCGCTGCAGATGCCGGCGAGGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCG
CCAACGGCCGCCTCATGAACGGCCATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAG
CACCTGCACGATGCGGAGGAATTCGAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGA
GGAAGATGACGCGAAAGACACCCACGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAG
ACGAGGAGAGCTCTCCTTTGGTTGCTAATGGGACAGCAGCTACGACGCAT
TAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000012.1:732794..734596- >CAN33_9000-T1 ID=CAN33_9000-T1|Name=CAN33_9000-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=7530bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000012.1:732794..734596- (Aspergillus niger FDAARGOS_311) TCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTACGCCGTCCATGCATGGCCCGAATCC GCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTCTTCCAGCGCTGCAGATGCCGGCGA GGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCGCCAACGGCCGCCTCATGAACGGCC ATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAGCACCTGCACGATGCGGAGGAATTC GAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGAGGAAGATGACGCGAAAGACACCCA CGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAGACGAGGAGAGCTCTCCTTTGGTTG CTAATGGGACAGCAGCTACGACGCATTAACTTCTGTACGCCTCGGGCTTC CTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCAACTCCTGAACGATGCAGG AATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCTACAGCATCGCCTTCATTC TCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTGGCACGTCCCTCTCCAGATTGTCGG AACGATTATCGCTGTGCTCGCATACTTCCTCGGACATGCTCACAAAGGCC GCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCGTCCTTTGCGAACACACTGATGCTC ATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGGCGTCTATCTCAAGCTGCACCTTAC CAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCCGGGTTATTGTGATTGCGCACGGAG TGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCGAGCTGGGTCCAGATGCTCTTCGGA GGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCGGGATGATCACTTGGGACAGTGTCT GGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTTTCATCGCCTACGGTATCCTGCTGA CCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTACTGGCTGCGCCGCACTGGCCGCAGC CAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCATCGCTGCATGGGGATGTGTCAACAC CTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTCCCTGGGTCCACAATGATTTGCAGC ACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGGTGCGCCGGTCTACTGGGTATTTGG ATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCCCAAGCGGAACTTGATCCCAGCCAT AGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCATGTCTGCCCACCCGCAGACTCTGA TGATCAGCACTATGATCCACTCCATCTTCGGCTACACGTTAATGGCTGCC GGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTCCTTCGTGCTTCGGGACAAGGGCTC TGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTAACAGCTTCCAATATCTCACGCCTT TCGACACAACACTATGGATACATATGATCCTTATGGGGTTTGCCTTTGGC GTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGATGGCGATACTAAGTCGACT TGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCCTGCTGCTTGCTTCCCCCACCCTGG CCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCCGAGGGTGCCGCCATCTCCGAGGAT CCGATTTCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTACGCCGTCCATGCATGGCCC GAATCCGCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTCTTCCAGCGCTGCAGATGC CGGCGAGGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCGCCAACGGCCGCCTCATGA ACGGCCATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAGCACCTGCACGATGCGGAG GAATTCGAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGAGGAAGATGACGCGAAAGA CACCCACGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAGACGAGGAGAGCTCTCCTT TGGTTGCTAATGGGACAGCAGCTACGACGCATTAACTTCTGTACGCCTCG GGCTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCAACTCCTGAACGA TGCAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCTACAGCATCGCCT TCATTCTCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTGGCACGTCCCTCTCCAGAT TGTCGGAACGATTATCGCTGTGCTCGCATACTTCCTCGGACATGCTCACA AAGGCCGCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCGTCCTTTGCGAACACACTG ATGCTCATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGGCGTCTATCTCAAGCTGCA CCTTACCAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCCGGGTTATTGTGATTGCGC ACGGAGTGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCGAGCTGGGTCCAGATGCTC TTCGGAGGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCGGGATGATCACTTGGGACA GTGTCTGGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTTTCATCGCCTACGGTATCC TGCTGACCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTACTGGCTGCGCCGCACTGGC CGCAGCCAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCATCGCTGCATGGGGATGTGT CAACACCTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTCCCTGGGTCCACAATGATT TGCAGCACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGGTGCGCCGGTCTACTGGGT ATTTGGATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCCCAAGCGGAACTTGATCCC AGCCATAGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCATGTCTGCCCACCCGCAGA CTCTGATGATCAGCACTATGATCCACTCCATCTTCGGCTACACGTTAATG GCTGCCGGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTCCTTCGTGCTTCGGGACAA GGGCTCTGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTAACAGCTTCCAATATCTCA CGCCTTTCGACACAACACTATGGATACATATGATCCTTATGGGGTTTGCC TTTGGCGTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGATGGCGATACTAAG TCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCCTGCTGCTTGCTTCCCCCA CCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCCGAGGGTGCCGCCATCTCC GAGGATCCGATTTCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTACGCCGTCCATGCA TGGCCCGAATCCGCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTCTTCCAGCGCTGC AGATGCCGGCGAGGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCGCCAACGGCCGCC TCATGAACGGCCATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAGCACCTGCACGAT GCGGAGGAATTCGAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGAGGAAGATGACGC GAAAGACACCCACGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAGACGAGGAGAGCT CTCCTTTGGTTGCTAATGGGACAGCAGCTACGACGCATTAACTTCTGTAC GCCTCGGGCTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCAACTCCT GAACGATGCAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCTACAGCA TCGCCTTCATTCTCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTGGCACGTCCCTCT CCAGATTGTCGGAACGATTATCGCTGTGCTCGCATACTTCCTCGGACATG CTCACAAAGGCCGCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCGTCCTTTGCGAAC ACACTGATGCTCATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGGCGTCTATCTCAA GCTGCACCTTACCAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCCGGGTTATTGTGA TTGCGCACGGAGTGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCGAGCTGGGTCCAG ATGCTCTTCGGAGGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCGGGATGATCACTT GGGACAGTGTCTGGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTTTCATCGCCTACG GTATCCTGCTGACCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTACTGGCTGCGCCGC ACTGGCCGCAGCCAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCATCGCTGCATGGGG ATGTGTCAACACCTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTCCCTGGGTCCACA ATGATTTGCAGCACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGGTGCGCCGGTCTA CTGGGTATTTGGATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCCCAAGCGGAACTT GATCCCAGCCATAGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCATGTCTGCCCACC CGCAGACTCTGATGATCAGCACTATGATCCACTCCATCTTCGGCTACACG TTAATGGCTGCCGGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTCCTTCGTGCTTCG GGACAAGGGCTCTGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTAACAGCTTCCAAT ATCTCACGCCTTTCGACACAACACTATGGATACATATGATCCTTATGGGG TTTGCCTTTGGCGTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGATGGCGAT ACTAAGTCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCCTGCTGCTTGCTT CCCCCACCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCCGAGGGTGCCGCC ATCTCCGAGGATCCGATTTCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTACGCCGTC CATGCATGGCCCGAATCCGCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTCTTCCAG CGCTGCAGATGCCGGCGAGGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCGCCAACG GCCGCCTCATGAACGGCCATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAGCACCTG CACGATGCGGAGGAATTCGAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGAGGAAGA TGACGCGAAAGACACCCACGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAGACGAGG AGAGCTCTCCTTTGGTTGCTAATGGGACAGCAGCTACGACGCATTAACTT CTGTACGCCTCGGGCTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCA ACTCCTGAACGATGCAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCT ACAGCATCGCCTTCATTCTCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTGGCACGT CCCTCTCCAGATTGTCGGAACGATTATCGCTGTGCTCGCATACTTCCTCG GACATGCTCACAAAGGCCGCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCGTCCTTT GCGAACACACTGATGCTCATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGGCGTCTA TCTCAAGCTGCACCTTACCAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCCGGGTTA TTGTGATTGCGCACGGAGTGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCGAGCTGG GTCCAGATGCTCTTCGGAGGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCGGGATGA TCACTTGGGACAGTGTCTGGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTTTCATCG CCTACGGTATCCTGCTGACCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTACTGGCTG CGCCGCACTGGCCGCAGCCAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCATCGCTGC ATGGGGATGTGTCAACACCTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTCCCTGGG TCCACAATGATTTGCAGCACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGGTGCGCC GGTCTACTGGGTATTTGGATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCCCAAGCG GAACTTGATCCCAGCCATAGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCATGTCTG CCCACCCGCAGACTCTGATGATCAGCACTATGATCCACTCCATCTTCGGC TACACGTTAATGGCTGCCGGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTCCTTCGT GCTTCGGGACAAGGGCTCTGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTAACAGCT TCCAATATCTCACGCCTTTCGACACAACACTATGGATACATATGATCCTT ATGGGGTTTGCCTTTGGCGTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGAT GGCGATACTAAGTCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCCTGCTGC TTGCTTCCCCCACCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCCGAGGGT GCCGCCATCTCCGAGGATCCGATTTCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTAC GCCGTCCATGCATGGCCCGAATCCGCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTC TTCCAGCGCTGCAGATGCCGGCGAGGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCG CCAACGGCCGCCTCATGAACGGCCATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAG CACCTGCACGATGCGGAGGAATTCGAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGA GGAAGATGACGCGAAAGACACCCACGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAG ACGAGGAGAGCTCTCCTTTGGTTGCTAATGGGACAGCAGCTACGACGCAT TAACTTCTGTACGCCTCGGGCTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCA GATGCAACTCCTGAACGATGCAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGA TTCTCTACAGCATCGCCTTCATTCTCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTG GCACGTCCCTCTCCAGATTGTCGGAACGATTATCGCTGTGCTCGCATACT TCCTCGGACATGCTCACAAAGGCCGCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCG TCCTTTGCGAACACACTGATGCTCATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGG CGTCTATCTCAAGCTGCACCTTACCAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCC GGGTTATTGTGATTGCGCACGGAGTGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCG AGCTGGGTCCAGATGCTCTTCGGAGGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCG GGATGATCACTTGGGACAGTGTCTGGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTT TCATCGCCTACGGTATCCTGCTGACCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTAC TGGCTGCGCCGCACTGGCCGCAGCCAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCAT CGCTGCATGGGGATGTGTCAACACCTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTC CCTGGGTCCACAATGATTTGCAGCACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGG TGCGCCGGTCTACTGGGTATTTGGATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCC CAAGCGGAACTTGATCCCAGCCATAGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCA TGTCTGCCCACCCGCAGACTCTGATGATCAGCACTATGATCCACTCCATC TTCGGCTACACGTTAATGGCTGCCGGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTC CTTCGTGCTTCGGGACAAGGGCTCTGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTA ACAGCTTCCAATATCTCACGCCTTTCGACACAACACTATGGATACATATG ATCCTTATGGGGTTTGCCTTTGGCGTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCT TGGGATGGCGATACTAAGTCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCC TGCTGCTTGCTTCCCCCACCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCC GAGGGTGCCGCCATCTCCGAGGATCCGATT back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | EggNog:ENOG41 |
| Note | SECRETED:SignalP(1-26) |
| DBxref | InterPro:IPR018827 |
| DBxref | InterPro:IPR018825 |
| DBxref | PFAM:PF10355 |
| DBxref | PFAM:PF10348 |
| Product | Protein of unknown function (Ytp1) family protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| NKJJ01000012.1 | supercontig | NKJJ01000012.1:732794..734596 - |
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