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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch1:1692358..1694399+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_000731-T1 ID=KJC3_000731-T1|Name=KJC3_000731-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=2042bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:1692358..1694399+ (Aspergillus niger KJC3)
CATCGTTTCTGATCCGCCCAACGACCGCCAGCAGCCTTTCCCTGCTCCCA
CTCCTCTCAACCCTCCCAATTGCTGTCGAGCTTCTCGGCTAACCACTCTC
CTCGCCCTCCTCTATCCCTCTCACACATGCGATGATGCTGTCGCGGTCTA
CTTTCAGCCGAAATGCGCCCCGTGCGCTCCAGAAGCAGTGCTCTGCTACT
GGCGTCAGCAGCCGTCGGGGCATGGCCTCTGCTGCCACTCCTGGTCTCCA
GTACGATGTCTCTGAGTCTGCTGGTGTGAAGGTCGCCAACCGGGAAGTTG
CTGGCCCTACCAGCACTCTTGCTCTGGTTGCAAAGGCCGGTCCCCGTTAC
CAGCCCGTCCCTGGCTTCTCCGATGCCCTCGAACAGTTCGCTTTCAAGGT
TCGTCCTTCCTGGCTTCGATCCCACGTCCACACTCTCTACCACATTCCTC
TTTAAGGCAAATACTAACCCATTCTTCTTCTCAATTGACAGTCTACTCTG
AAGCGCTCGGCACTGCGGATCAATCGGGAAGTCGAACTGCTGGGCGGTGA
AGTTTCCTCTACACACTCTCGCGAGAACGTCGTCCTCAAGGCCAAGTTCC
TCTCGGGCGATCTCCCCTACTTCGCTGAGCTTCTCGCCGAGGTTGCTTCT
CAGACCAAGTTTGCAGGTGAGTAAGGAGACAACGGGAACAAGCCGCCACC
CCTTCCCCCCTCCAAAAGTCAGACGAACCGGTCTAATTCGGCTTCTCAGC
CCACGAGTTGAGCGAGGTTGTCCTCAAGACCCTCAAGTACAGACAACAGG
CCCTTGCCGCCAACCCCGAGGCCGTCGCTGTCGATGCCGCTCACGCCGTC
GCTTTCCACCGGGGCCTGGGTGAAAGCATCACCCCCTCGACCACCGTTCC
CCTCGAGAAGTACCTCTCCGCTGAGGCTCTGGCTGAGTACGCTCAGCAGG
CCTTTGCCAAGTCCAACATCGCTCTTGTTGGCAGCGGTGCCAGCTCCGCC
GACGTCTCCAAGTGGGTTGGTGACTTCTTCAAGGCTGTCCCCAGCGGTGC
CCAGCTCCAGAGCGCTGCCTCCAAGTACTACGGTGGTGAGCAGCGTATCT
CCACCAAGGCCGGCAACGCCCTTGTGATTGCCTTCCCTGGCTCTGGTGCT
TTCGGAACCTCTGCCTACAAGCCCGAGGCCTCTGTCCTTGCTGCCCTCTT
GGGTGGTGAGTCCTCCATCAAGTGGACCCCCGGTTTCTCCCTCCTCGCCC
AGGCCACCCAGGGCTTCTCCCAGGTCCGTGCCTCGACCCAGAACCTTACC
TACTCGGACGCTGGTCTCTTCACCATCGCTCTCTCCGGTAAGGCCGACCA
GATCACTTCTGCTGGTAAGAACGCCGTCGACCTTCTCAAGAAGGTTGCCG
CTGGTGAGATTGCCGGTGAGGAGATCAAGAAGGCCGTTGCCCTCGCCAAG
TTCCGCGCTCTCGAGTCCGCCCAGACCCTTGAGACTGGTCTCGAGGCTAC
CGGATCCGCTCTCATCAACGGCAGCAAGCCTTACCAGATTGGTGAGGTTG
CTCAGAGCATTGATGCCGTCACTGAGGCTCAGGTTAAGGATGTAAGTTTA
CCTATTTACCTTCCCTTGTCTTCTCTGGGATCAATTTCTTTGGAGAGTAA
CGGCTAATGTTTTTGTACACAGGTTGCCAAGTCCTTCCTGTCTGGCAAGG
CCTCCGTCGCCACTGTTGGAGATCTCTTCCAGCTCCCCTACGGCGAGGAC
CTTGGTCTGACTGTTTAAACATGTATACAATACATATTAGACTGGCTTTG
GAAAAAACCGAACACCCCCTTTTTTTATCATGTGTCTAGATCGACCTTTC
CGCAGATATTCTCTTTTGTGATGTGGCTGTAGTTGTGTGTCTGTAATACA
ATTGTACCTTAACCCATCTTTGTTCAATACCTCTCTCGCTGCGATGTAGG
CTGCTTGCAGTATATTGTGAATAGTTTGGACAACCCAATTTGCAAAATGC
AACCAATCTTATTTCTCTGGTATGAAATTTCCTCCTGTTGCC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch1:1692358..1694399+ >KJC3_000731-T1 ID=KJC3_000731-T1|Name=KJC3_000731-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=5520bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:1692358..1694399+ (Aspergillus niger KJC3)
ATGATGCTGTCGCGGTCTACTTTCAGCCGAAATGCGCCCCGTGCGCTCCA
GAAGCAGTGCTCTGCTACTGGCGTCAGCAGCCGTCGGGGCATGGCCTCTG
CTGCCACTCCTGGTCTCCAGTACGATGTCTCTGAGTCTGCTGGTGTGAAG
GTCGCCAACCGGGAAGTTGCTGGCCCTACCAGCACTCTTGCTCTGGTTGC
AAAGGCCGGTCCCCGTTACCAGCCCGTCCCTGGCTTCTCCGATGCCCTCG
AACAGTTCGCTTTCAAGTCTACTCTGAAGCGCTCGGCACTGCGGATCAAT
CGGGAAGTCGAACTGCTGGGCGGTGAAGTTTCCTCTACACACTCTCGCGA
GAACGTCGTCCTCAAGGCCAAGTTCCTCTCGGGCGATCTCCCCTACTTCG
CTGAGCTTCTCGCCGAGGTTGCTTCTCAGACCAAGTTTGCAGCCCACGAG
TTGAGCGAGGTTGTCCTCAAGACCCTCAAGTACAGACAACAGGCCCTTGC
CGCCAACCCCGAGGCCGTCGCTGTCGATGCCGCTCACGCCGTCGCTTTCC
ACCGGGGCCTGGGTGAAAGCATCACCCCCTCGACCACCGTTCCCCTCGAG
AAGTACCTCTCCGCTGAGGCTCTGGCTGAGTACGCTCAGCAGGCCTTTGC
CAAGTCCAACATCGCTCTTGTTGGCAGCGGTGCCAGCTCCGCCGACGTCT
CCAAGTGGGTTGGTGACTTCTTCAAGGCTGTCCCCAGCGGTGCCCAGCTC
CAGAGCGCTGCCTCCAAGTACTACGGTGGTGAGCAGCGTATCTCCACCAA
GGCCGGCAACGCCCTTGTGATTGCCTTCCCTGGCTCTGGTGCTTTCGGAA
CCTCTGCCTACAAGCCCGAGGCCTCTGTCCTTGCTGCCCTCTTGGGTGGT
GAGTCCTCCATCAAGTGGACCCCCGGTTTCTCCCTCCTCGCCCAGGCCAC
CCAGGGCTTCTCCCAGGTCCGTGCCTCGACCCAGAACCTTACCTACTCGG
ACGCTGGTCTCTTCACCATCGCTCTCTCCGGTAAGGCCGACCAGATCACT
TCTGCTGGTAAGAACGCCGTCGACCTTCTCAAGAAGGTTGCCGCTGGTGA
GATTGCCGGTGAGGAGATCAAGAAGGCCGTTGCCCTCGCCAAGTTCCGCG
CTCTCGAGTCCGCCCAGACCCTTGAGACTGGTCTCGAGGCTACCGGATCC
GCTCTCATCAACGGCAGCAAGCCTTACCAGATTGGTGAGGTTGCTCAGAG
CATTGATGCCGTCACTGAGGCTCAGGTTAAGGATGTTGCCAAGTCCTTCC
TGTCTGGCAAGGCCTCCGTCGCCACTGTTGGAGATCTCTTCCAGCTCCCC
TACGGCGAGGACCTTGGTCTGACTGTTTAAATGATGCTGTCGCGGTCTAC
TTTCAGCCGAAATGCGCCCCGTGCGCTCCAGAAGCAGTGCTCTGCTACTG
GCGTCAGCAGCCGTCGGGGCATGGCCTCTGCTGCCACTCCTGGTCTCCAG
TACGATGTCTCTGAGTCTGCTGGTGTGAAGGTCGCCAACCGGGAAGTTGC
TGGCCCTACCAGCACTCTTGCTCTGGTTGCAAAGGCCGGTCCCCGTTACC
AGCCCGTCCCTGGCTTCTCCGATGCCCTCGAACAGTTCGCTTTCAAGTCT
ACTCTGAAGCGCTCGGCACTGCGGATCAATCGGGAAGTCGAACTGCTGGG
CGGTGAAGTTTCCTCTACACACTCTCGCGAGAACGTCGTCCTCAAGGCCA
AGTTCCTCTCGGGCGATCTCCCCTACTTCGCTGAGCTTCTCGCCGAGGTT
GCTTCTCAGACCAAGTTTGCAGCCCACGAGTTGAGCGAGGTTGTCCTCAA
GACCCTCAAGTACAGACAACAGGCCCTTGCCGCCAACCCCGAGGCCGTCG
CTGTCGATGCCGCTCACGCCGTCGCTTTCCACCGGGGCCTGGGTGAAAGC
ATCACCCCCTCGACCACCGTTCCCCTCGAGAAGTACCTCTCCGCTGAGGC
TCTGGCTGAGTACGCTCAGCAGGCCTTTGCCAAGTCCAACATCGCTCTTG
TTGGCAGCGGTGCCAGCTCCGCCGACGTCTCCAAGTGGGTTGGTGACTTC
TTCAAGGCTGTCCCCAGCGGTGCCCAGCTCCAGAGCGCTGCCTCCAAGTA
CTACGGTGGTGAGCAGCGTATCTCCACCAAGGCCGGCAACGCCCTTGTGA
TTGCCTTCCCTGGCTCTGGTGCTTTCGGAACCTCTGCCTACAAGCCCGAG
GCCTCTGTCCTTGCTGCCCTCTTGGGTGGTGAGTCCTCCATCAAGTGGAC
CCCCGGTTTCTCCCTCCTCGCCCAGGCCACCCAGGGCTTCTCCCAGGTCC
GTGCCTCGACCCAGAACCTTACCTACTCGGACGCTGGTCTCTTCACCATC
GCTCTCTCCGGTAAGGCCGACCAGATCACTTCTGCTGGTAAGAACGCCGT
CGACCTTCTCAAGAAGGTTGCCGCTGGTGAGATTGCCGGTGAGGAGATCA
AGAAGGCCGTTGCCCTCGCCAAGTTCCGCGCTCTCGAGTCCGCCCAGACC
CTTGAGACTGGTCTCGAGGCTACCGGATCCGCTCTCATCAACGGCAGCAA
GCCTTACCAGATTGGTGAGGTTGCTCAGAGCATTGATGCCGTCACTGAGG
CTCAGGTTAAGGATGTTGCCAAGTCCTTCCTGTCTGGCAAGGCCTCCGTC
GCCACTGTTGGAGATCTCTTCCAGCTCCCCTACGGCGAGGACCTTGGTCT
GACTGTTTAAATGATGCTGTCGCGGTCTACTTTCAGCCGAAATGCGCCCC
GTGCGCTCCAGAAGCAGTGCTCTGCTACTGGCGTCAGCAGCCGTCGGGGC
ATGGCCTCTGCTGCCACTCCTGGTCTCCAGTACGATGTCTCTGAGTCTGC
TGGTGTGAAGGTCGCCAACCGGGAAGTTGCTGGCCCTACCAGCACTCTTG
CTCTGGTTGCAAAGGCCGGTCCCCGTTACCAGCCCGTCCCTGGCTTCTCC
GATGCCCTCGAACAGTTCGCTTTCAAGTCTACTCTGAAGCGCTCGGCACT
GCGGATCAATCGGGAAGTCGAACTGCTGGGCGGTGAAGTTTCCTCTACAC
ACTCTCGCGAGAACGTCGTCCTCAAGGCCAAGTTCCTCTCGGGCGATCTC
CCCTACTTCGCTGAGCTTCTCGCCGAGGTTGCTTCTCAGACCAAGTTTGC
AGCCCACGAGTTGAGCGAGGTTGTCCTCAAGACCCTCAAGTACAGACAAC
AGGCCCTTGCCGCCAACCCCGAGGCCGTCGCTGTCGATGCCGCTCACGCC
GTCGCTTTCCACCGGGGCCTGGGTGAAAGCATCACCCCCTCGACCACCGT
TCCCCTCGAGAAGTACCTCTCCGCTGAGGCTCTGGCTGAGTACGCTCAGC
AGGCCTTTGCCAAGTCCAACATCGCTCTTGTTGGCAGCGGTGCCAGCTCC
GCCGACGTCTCCAAGTGGGTTGGTGACTTCTTCAAGGCTGTCCCCAGCGG
TGCCCAGCTCCAGAGCGCTGCCTCCAAGTACTACGGTGGTGAGCAGCGTA
TCTCCACCAAGGCCGGCAACGCCCTTGTGATTGCCTTCCCTGGCTCTGGT
GCTTTCGGAACCTCTGCCTACAAGCCCGAGGCCTCTGTCCTTGCTGCCCT
CTTGGGTGGTGAGTCCTCCATCAAGTGGACCCCCGGTTTCTCCCTCCTCG
CCCAGGCCACCCAGGGCTTCTCCCAGGTCCGTGCCTCGACCCAGAACCTT
ACCTACTCGGACGCTGGTCTCTTCACCATCGCTCTCTCCGGTAAGGCCGA
CCAGATCACTTCTGCTGGTAAGAACGCCGTCGACCTTCTCAAGAAGGTTG
CCGCTGGTGAGATTGCCGGTGAGGAGATCAAGAAGGCCGTTGCCCTCGCC
AAGTTCCGCGCTCTCGAGTCCGCCCAGACCCTTGAGACTGGTCTCGAGGC
TACCGGATCCGCTCTCATCAACGGCAGCAAGCCTTACCAGATTGGTGAGG
TTGCTCAGAGCATTGATGCCGTCACTGAGGCTCAGGTTAAGGATGTTGCC
AAGTCCTTCCTGTCTGGCAAGGCCTCCGTCGCCACTGTTGGAGATCTCTT
CCAGCTCCCCTACGGCGAGGACCTTGGTCTGACTGTTTAAATGATGCTGT
CGCGGTCTACTTTCAGCCGAAATGCGCCCCGTGCGCTCCAGAAGCAGTGC
TCTGCTACTGGCGTCAGCAGCCGTCGGGGCATGGCCTCTGCTGCCACTCC
TGGTCTCCAGTACGATGTCTCTGAGTCTGCTGGTGTGAAGGTCGCCAACC
GGGAAGTTGCTGGCCCTACCAGCACTCTTGCTCTGGTTGCAAAGGCCGGT
CCCCGTTACCAGCCCGTCCCTGGCTTCTCCGATGCCCTCGAACAGTTCGC
TTTCAAGTCTACTCTGAAGCGCTCGGCACTGCGGATCAATCGGGAAGTCG
AACTGCTGGGCGGTGAAGTTTCCTCTACACACTCTCGCGAGAACGTCGTC
CTCAAGGCCAAGTTCCTCTCGGGCGATCTCCCCTACTTCGCTGAGCTTCT
CGCCGAGGTTGCTTCTCAGACCAAGTTTGCAGCCCACGAGTTGAGCGAGG
TTGTCCTCAAGACCCTCAAGTACAGACAACAGGCCCTTGCCGCCAACCCC
GAGGCCGTCGCTGTCGATGCCGCTCACGCCGTCGCTTTCCACCGGGGCCT
GGGTGAAAGCATCACCCCCTCGACCACCGTTCCCCTCGAGAAGTACCTCT
CCGCTGAGGCTCTGGCTGAGTACGCTCAGCAGGCCTTTGCCAAGTCCAAC
ATCGCTCTTGTTGGCAGCGGTGCCAGCTCCGCCGACGTCTCCAAGTGGGT
TGGTGACTTCTTCAAGGCTGTCCCCAGCGGTGCCCAGCTCCAGAGCGCTG
CCTCCAAGTACTACGGTGGTGAGCAGCGTATCTCCACCAAGGCCGGCAAC
GCCCTTGTGATTGCCTTCCCTGGCTCTGGTGCTTTCGGAACCTCTGCCTA
CAAGCCCGAGGCCTCTGTCCTTGCTGCCCTCTTGGGTGGTGAGTCCTCCA
TCAAGTGGACCCCCGGTTTCTCCCTCCTCGCCCAGGCCACCCAGGGCTTC
TCCCAGGTCCGTGCCTCGACCCAGAACCTTACCTACTCGGACGCTGGTCT
CTTCACCATCGCTCTCTCCGGTAAGGCCGACCAGATCACTTCTGCTGGTA
AGAACGCCGTCGACCTTCTCAAGAAGGTTGCCGCTGGTGAGATTGCCGGT
GAGGAGATCAAGAAGGCCGTTGCCCTCGCCAAGTTCCGCGCTCTCGAGTC
CGCCCAGACCCTTGAGACTGGTCTCGAGGCTACCGGATCCGCTCTCATCA
ACGGCAGCAAGCCTTACCAGATTGGTGAGGTTGCTCAGAGCATTGATGCC
GTCACTGAGGCTCAGGTTAAGGATGTTGCCAAGTCCTTCCTGTCTGGCAA
GGCCTCCGTCGCCACTGTTGGAGATCTCTTCCAGCTCCCCTACGGCGAGG
ACCTTGGTCTGACTGTTTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0046872 | metal ion binding |
| GO:0003824 | catalytic activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_000731-T1.utr5p1 | KJC3_000731-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_000731-T1.utr3p1 | KJC3_000731-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | MEROPS:MER0003544 |
| DBxref | InterPro:IPR011249 |
| DBxref | InterPro:IPR007863 |
| DBxref | InterPro:IPR011765 |
| DBxref | PFAM:PF05193 |
| DBxref | PFAM:PF00675 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch1 | supercontig | ch1:1692358..1694399 + |
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