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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch2:109839..111207+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_001579-T1 ID=KJC3_001579-T1|Name=KJC3_001579-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=1369bp|location=Sequence derived from alignment at ch2:109839..111207+ (Aspergillus niger KJC3) ATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTATTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGC
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CTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACG
GCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGC
GACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGC
TGGTCAGGGTAACCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch2:109839..111207+ >KJC3_001579-T1 ID=KJC3_001579-T1|Name=KJC3_001579-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=5610bp|location=Sequence derived from alignment at ch2:109839..111207+ (Aspergillus niger KJC3) ATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTATTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGC CGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCA CTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTG GTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGAC TTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTC CCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGG TGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACAC TGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTG AGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGT GTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGA GTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCT GGATTGACCACGTTACTACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTC GGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGG CGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGT ACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTAC AAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACAT CTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCT CCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACC GTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGC CTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCA ACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGC GGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAA CGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTA TTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCC GTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTA CCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCC GTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACT ACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCT GGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCA CCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAAC TCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCG TGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTG CTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACC CTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACGTTACTACTGCCCGCAT TGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCA TCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGAC GGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCAC CTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCC AGGACAACACCTACCTCCACATCTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCG GGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAA CTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTG CTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGC CGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCAC CACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTG CCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAG TACGCTGCTGCTCTCACGGCTATTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGC TGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTG GTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCT TACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGA CTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGG GTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACC AACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGG TGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTA CCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCC AACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGT CTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTG ACCACGTTACTACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACC GACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTC TGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTG ACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACC TCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTACAA CAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTG GCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTC GAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTC CACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCG GTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGAC ACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGG TCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTATTGCCG CCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGT TTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTAC 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Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | SECRETED:SignalP(1-19) |
Note | CAZy:PL1 |
Note | CAZy:PL1_4 |
DBxref | InterPro:IPR011050 |
DBxref | InterPro:IPR012334 |
DBxref | InterPro:IPR002022 |
DBxref | PFAM:PF00544 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch2 | supercontig | ch2:109839..111207 + |
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