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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:3077141..3079719- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_005563-T1 ID=KJC3_005563-T1|Name=KJC3_005563-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=2579bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:3077141..3079719- (Aspergillus niger KJC3)
CCGGCCTTGACCTCGTCTCTCCTCTCCCCTCCCCCGTCTTTTTGTGCCGC
TGGTTTCCCTTCCTCCACCACATCTCCCCTCCTTCGGACTCATTGGAAAA
GTGTTTCTTTTCTCTTGATCCGTCATCATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAG
CCTAGCTCCCGCATCGAAGGTCTGTATCCGACTTCTTTTGCCGTGATGCC
GAATTCTGGCTCACCATATTCTCCTCTATCCTCAATGGTCTTACTGACTC
CTCTTGTTGGCGCAGATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTC
CTCTTCCCGCCCGGCTGGTACGCATTGAACTCGCACATCCGCCCCTGCCT
ACGTTTGCTAACTGGTCCCTCCGCTAGCCCGGATATTTGGCAACGGCCCT
CTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCAT
TGTAAGCTACTATGTGGATATATCTTGTGGGAACGATGGTCGCTAATGCA
ATTGCAGGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCG
GTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGT
GTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGTGG
TATCAACGCCGCTCTTGGAAAGTGAGTTGCCCTGTATTGACTCCATTGCG
AGTGGCGCTAATGGTCTGGCTTGCAGCATGCACGAGGATGACTGGAGATG
GCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATG
CCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAG
GGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCG
TGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACC
GTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTC
TACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGC
CCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACA
ACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTG
GCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACAC
TTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACC
AGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGT
TGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTC
CGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGG
CCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGC
CGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCT
GCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCT
CTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCC
ACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGT
CCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACG
CTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGT
GCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCG
TGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCG
ACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAG
GGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCA
GTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTG
AGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGAC
CGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAA
CCTGTTGACCTGCGCGTATGTATTCCTGCAGAGTTTTGTAATGTTGGATG
TTGGCTAACTCGAGTTATAGTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCG
TAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGACG
ACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGT
GAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAA
CGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAGACGCGATGTA
TCAGCCTAGGGGATGGTGGAGGAAAAGAGCGTGACGAAAATTCGACCGTG
TTTATTTGTGTGTTCATATGTGTATATCCAAGGTTTCTTTCCAGGCGATG
AGTTTGGTGTACTCACGTGTATTGTCTTTTATAGCCGTTTACTACATCCC
ATACAATGGAGTTTTTGTGTTGAGCCACA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:3077141..3079719- >KJC3_005563-T1 ID=KJC3_005563-T1|Name=KJC3_005563-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=11646bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:3077141..3079719- (Aspergillus niger KJC3)
TTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCC
ACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCAC
ACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCG
CGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTC
CCTTCAAGCGTGTTTACTAGCATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACAT
GTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTC
ACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTAC
GGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTT
CGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCT
GCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGA
CAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGA
CCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGG
AGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACC
GGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCAC
TGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATC
TGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTG
ATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGG
TGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCC
GTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGT
GTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGC
TAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCT
TCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTC
CACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGAC
CCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCG
GTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAAC
TCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCG
TGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTG
GTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCC
AAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGA
TGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGG
TCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGC
ATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTT
GACCTGCGCGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGC
CGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCT
GTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGT
GGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGC
GCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCATTATT
TCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGA
TGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGTTCCCAAAC
CGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTG
AGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACC
TGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGA
GCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGC
GTGTTTACTAGCATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACAC
CGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGA
CCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCC
TTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCA
GTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCG
CTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTC
CGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGAT
GGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAA
CCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTAC
GGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGG
TATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCG
TCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAG
GGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTT
CATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTG
TCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCC
GAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCT
GCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTG
TCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAAC
ATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGA
GAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCG
CTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTG
GATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGC
CACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGT
CCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACC
AACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGT
CTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTA
TCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGCATGATCTGG
AACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGC
GACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCG
TGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTA
AGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGTGGTATCAAC
GCCGCTCTTGGAAACCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGG
AGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCATTATTTCCCGCGCT
TTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGATGAGCTCCT
TGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGTTCCCAAACCGCCATTGC
CGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACC
CCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAG
AAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACAC
TCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACT
AGCATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGG
TTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAG
CTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGT
ACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGA
GTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTA
CCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAAC
ACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGG
CGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACC
GTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCC
TACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCAT
GGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCC
ACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGT
GGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCG
TTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTT
CCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGAC
CACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCG
TCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCA
CCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGT
ATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAA
CGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCT
CCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTT
GTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGG
CAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCG
ACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATC
CGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTAC
CCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGA
TGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGAT
CTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCGACCACGAG
TACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTT
CGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCC
CCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTT
GGAAACCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAG
GCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCATTATTTCCCGCGCTTTGGGCCAG
AGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGATGAGCTCCTTGGGCTTGC
GGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAA
CCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTG
ACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCAC
GGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGA
GAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAGCATGCAC
GAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTG
GCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTA
GTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGAC
GGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAA
GGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACG
CCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTAC
TTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCG
CGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGG
CCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGT
TGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCG
TGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTG
GTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGT
GGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCC
TACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCC
TGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTAC
CTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGG
TATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGC
CCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACC
AAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGT
TGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACG
GTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGC
CGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCA
CAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACT
TCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCC
ATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAG
TTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACC
AGGTCGGTACCAAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAG
ACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCGACCACGAGTACGATGCC
GTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGC
GGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGAT
CTCACACTGTCGCCGCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACCCG
GATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTG
CTCAGAAGTACCCTATCATTATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTC
TTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAG
CTCCCGCATCGAAGTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGA
GTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGA
ACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTC
AAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTG
CAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAGCATGCACGAGGATGAC
TGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGA
CCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTG
AGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATC
TACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCA
GGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCC
ACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAA
TACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCAT
CGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACA
CCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCT
GCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCT
CCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACG
GTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTG
CTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAA
GGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCC
GTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTG
AGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGA
GACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCG
TCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACC
GGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGG
TCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACC
GTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTC
TCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCT
GAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTA
CCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAG
GCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGA
GGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTA
CCAAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAG
CTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTC
GGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGG
CTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTG
TCGCCGCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACCCGGATATTTGG
CAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGT
ACCCTATCATTATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCT
TCCCGCCCGGCTGATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCAT
CGAAGTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGG
TGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGA
AGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGC
TACCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGT
GCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAGCATGCACGAGGATGACTGGAGATGG
CACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGC
CATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGG
GCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGT
GCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCG
TTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCT
ACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCC
CTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAA
CCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGG
CCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACT
TGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCA
GGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTT
GCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCC
GAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGC
CTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCC
GTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTG
CCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTC
TATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCA
CCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTC
CTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGC
TTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTG
CCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGT
GTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGA
CGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGG
GTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAG
TCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGA
GAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGACC
GCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAAC
CTGTTGACCTGCGCGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGT
GGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACAC
TGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTC
AGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACCCGGATATTTGGCAACGGCCC
TCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCA
TTATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCG
GCTGATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0016491 | oxidoreductase activity |
| GO:0016627 | oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors |
| GO:0050660 | flavin adenine dinucleotide binding |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle |
| GO:0055114 | oxidation-reduction process |
| GO:0022900 | electron transport chain |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_005563-T1.utr3p1 | KJC3_005563-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_005563-T1.utr5p1 | KJC3_005563-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR037099 |
| DBxref | InterPro:IPR003952 |
| DBxref | InterPro:IPR015939 |
| DBxref | InterPro:IPR003953 |
| DBxref | InterPro:IPR011281 |
| DBxref | InterPro:IPR014006 |
| DBxref | InterPro:IPR036188 |
| DBxref | InterPro:IPR027477 |
| DBxref | PFAM:PF02910 |
| DBxref | PFAM:PF00890 |
| Product | succinate dehydrogenase flavoprotein subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch4 | supercontig | ch4:3077141..3079719 - |
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