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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:3126616..3130805+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_005575-T1 ID=KJC3_005575-T1|Name=KJC3_005575-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=4190bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:3126616..3130805+ (Aspergillus niger KJC3) GTACATTCCCTCCCTTCGCTCCCCTCTCTTCTTCTTCTCTTCTTCATAGG
ACTATCCGACTCTTGCCATTCCTGCCATTTTTTGTTTGCGTCTGCTCATA
TCGTTGGGTTCGAAGGCTGTGTGAGCCGAAGCAACAATGGCGGAGCGGAG
GATTTCCTATGCTCCCGACGTGGAGAATGGTGACCATTCTCGCGCTCCTC
AACTTGATGATGGTGCTGGTCTCGACGAGTACGCCGCGTTGAACCGTTAC
ATCTCGACCGCCCCCGACAAGCGCCGCGGTTCGACTGCTAGTGCCGGTGG
CGTGAGTGCCGGCAAGAAGAAGAAGGGTTTCTCCCTCTTCGGTAAGAAGG
GTGATGGTGTGGAGGATGGCTTCGTCTGCCCCGATGACTGGCTCGAGACC
GACATGCGCTCCGGTCTGCGCTCCAGCGACATCGAGCCTCGTCGCAAGCG
TACCGGGTGGAACGAGCTGACCACCGAGAAGACCAACTTCTTCGTTCAGT
TCATTGGTTACTTCCGTGGTCCTATTCTTTATGGTAAGGCAATCGACTCG
GACATTGCATTGCAGGGATGTCTCTAACAGTGCTATAGTTATGGAATTGG
CTGTCTGTCTTGCTGCTGGTCTTCGTGACTGGATCGATTTCGGTGTCATT
ATTGGTATTCTTATGCTTAACGCTATCGTCGGTTGGTACCAGGAGAAGCA
GGCTGCCGACGTTGTCGCTTCCCTCAAGGGTGATATTGCTATGAAGGCCA
TCGTCATTCGTGATGGTCAGGAACAGGAAATCCTTGCCCGTGAACTTGTT
ACTGGTGATATTGTACGTTTATTCTCCGCCGTTTCCACTCTGTCGGCACT
GTCTAACATGCTTTCCTATAGATCGTTATCGAGGAAGGTACCGTTGTCCC
CGCCGATATTCGCCTGATCTGTGACTACGACAAGCCCGAGAACTTCGAGA
CCTACAAGGAGTACCTCGCCACCGTTGGTGACGACACCCTTAAGGAGAAG
GAGGATGAGGACGACGAGGATGGTGGCATTGAGGCCCGTGCCGGTGTCTC
TCTCGTCGCCGTTGACCAGTCCGCCATCACTGGTGAATCTCTCGCTGTCG
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GACCGCTGCTCTCGTTCAGGGTGCCCAGGACCAGGGTCACTTCAAGGCTG
TCATGGACAACATCGGTACCACCCTGCTTGTTCTTGTCATGTTCTGGATT
CTCGCTGCCTGGATCGGTGGTTTCTACCGTCACCTCAAGATCGCTACTCC
CGAGAACGAGGACCGCAACTTGCTCCACTACACCCTGATTCTCCTGATCA
TTGGTGTCCCCGTCGGTCTCCCCGTCGTCACCACCACCACCCTCGCTGTC
GGTGCTGCCTACTTGGCTGAGCAGAAGGCTATTGTCCAGAAGCTCACTGC
CATTGAGTCCCTTGCCGGTGTCGACATTCTCTGCTCTGACAAGACTGGTA
CCCTCACTGCCAACCAGCTCTCCATCCGTGAGCCCTACGTCAACGAGGGT
GTCGATGTTAACTGGATGATGGCTGTCGCTGCCATTGCCTCCAACCACAA
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GTTACCCCAAGGCCCGTGAGATTCTCGCCCGCAACTGGGTCACCGAGAAG
TACACTCCTTTCGACCCCGTCTCCAAGCGTATCACCACCATCTGTACCTG
CGATGGTGTCCGCTACGTCTGCGCCAAGGGTGCCCCCAAGGCTATCCTCA
ACATGTCCCAGTGCTCTGAGGAGGAGGCCGACAAGTTCCGTGAGAAGGCT
GCTGAGTTCGCTCGTCGTGGTTTCCGTTCCCTCGGTGTTGCCGTCCAGAA
GGAGGGTGAGCCCTGGCAACTGCTGGGCATGTACCCCATGTTCGACCCCC
CCCGTGAGGATACCGCCCACACCATCGCTGAGGCCCAGCACCTTGGTCTG
TCCGTCAAGATGTTGACTGGTGATGCTCTCGCTATTGCCAAGGAAACCTG
CAAGATGCTTGCTCTTTCTACTAAGGTCTACGACTCCGAGCGTCTGATCC
ACGGTGGTCTTGCTGGCTCTGCTCAGCACGATCTCGTTGAGAAGGCTGAC
GGTTTCGCTGAGGTCTTCCCCGAGCACAAGTACCAGGTCGTCGAGATGCT
CCAGCAGCGTGGTCACTTGACTGCCATGACTGGTGACGGTGTCAACGACG
CTCCCTCTCTCAAGAAGGCTGACTGCGGTATCGCTGTCGAGGGTTCCACT
GAGGCTGCCCAGGCTGCTGCCGATATTGTCTTCCTTGCCCCCGGTCTGTC
CACCATTGTTGATGCCATCAAGCTCGCCCGTCAGATCTTCCAGCGTATGA
AGGCCTACATCCAGTACCGTATTGCTCTGTGTCTCCACCTTGAGGTCTAC
CTTGTCACCTCCATGATCATCATTGACGAGACCATCCGTGCCGATCTGAT
TGTCTTCATTGCCCTGTTCGCTGATTTGGCCACCATCGCCATTGCCTACG
ACAACGCCCACTACGAACAGCGCCCCGTCGAGTGGCAGCTGCCCAAGATC
TGGGTGATTTCCGTCATCCTTGGTATCCTCCTGGCTGGCGCCACCTGGAT
CATCCGTGCCTCCCTCTTCCTCACCAACGGTGGTATTATCCAGAACTTCG
GTTCTCCCCAGGAAATCCTCTTCCTCGAGGTTGCCCTTACCGAGAACTGG
CTCATCTTCGTCACCCGTGGTGGTAAGACCTGGCCCTCTTGGCAGCTGGT
TGGCGCCATCTTCATTGTCGATGTGCTCGCCACCCTGTTCTGTGTCTTCG
GCTGGCTCTCCGGCGACTACCTCCAGACCCACCCCGTTGACCGTGCCGAC
TTCTCCGTCAACGGTGATGTCGACATTGTCACCGTCGTTGTTGTCTGGGG
TTACTCCATTGGTGTCACCATCATCATCGCTGTGGTGTACTATCTCCTTA
CCATCATCCCCTTCCTTGACAACCTTGGTCGCAAGACCCGCTCTCGCGCT
GACACCCAGATCGAGAACCTGCTTGGCCACCTGTCCAAGCTGGCCATCGA
GCACGAGGTCGACGCCCACGGCAAGAGCCGCTACATGCTGGGTGCTCGCG
CTGAGGTCGAAGAGGATGAGTAAACGCTTGATTGCGCTCCTTAATACCAT
CCGACCTGGATATCACTTGCTGCGCATACATGCATGAGCTGGGATCCCGG
CTACCCTTTTTACCCGTATTATAGACTTTTTTTTTTCCCTTATTACCTTG
TCTCTACTGATAGAGTCAATTTCTTTTCTTTTTACATGTATGTATGTCAT
TAATAGTGGTAAATTTAGTCAATCAAGGGTTCAATTAATACATCTTCCAT
TGTAACTTCACTACTACCCAATTTTCTAACCTCTTCACCTTCAACCAAAC
TAAACTCTCCTTGCAATCCACCAAATCAATAATCAAAGTGCGCCCACTGC
CGACCACTTAGCCGAACCAGACCACCTCAGCCCTGACCTGACCACTTCAC
CACGGTCCACCCATCGGACCAAGTTCTGGGTGCAGTGGGACCCGGTAAAT
TGGAGTCAGGGGCGCACCACTTCACTCACCATCTCCTCGGTTCCCGTTTC
ACTTGCGCCCGTTCGGACTCCGGCCGATAGCCAGACAGCCAGTTGCGTCG
CACCTCACCTTCGGTCCTTGACACCGAACATACGTGTGTGAGAGAAGCTC
GAGTGGATCCGAGCTATTGATTCTGGTCCGGACAAGAGCGAGACAAAACT
CTCGTAATTGCGCCTATCAATCGGCCTGTACCTGCCGAGTCAGTCGTCGA
CTAATCGGTCGGGCGTCTTGGATACGTTTACGAGAGAGGCCGAGGTTAGT
TGTAGATGATAGTTTAATTGGCCTCGTATTGATGAGGAGGGTGTAATTTG
CCGATGCCGATGGATGCATTGATAGTGTTTGTTAAAGTGGTGCACGGATG
GTGTTTGTGCTGGTTACTCGCGCCTTAGTGTGGTGGTGGTAGGTACGTAG
TTGGGAGCTGTGCAGTGGAGGGGGGTGTTTTGGATAGATTATGCTTGTGC
AAGGTGGGCGTGCATTGCTGCTTTACTTGCTGGTTTGGGG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:3126616..3130805+ >KJC3_005575-T1 ID=KJC3_005575-T1|Name=KJC3_005575-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=8919bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:3126616..3130805+ (Aspergillus niger KJC3) ATGGCGGAGCGGAGGATTTCCTATGCTCCCGACGTGGAGAATGGTGACCA TTCTCGCGCTCCTCAACTTGATGATGGTGCTGGTCTCGACGAGTACGCCG CGTTGAACCGTTACATCTCGACCGCCCCCGACAAGCGCCGCGGTTCGACT GCTAGTGCCGGTGGCGTGAGTGCCGGCAAGAAGAAGAAGGGTTTCTCCCT CTTCGGTAAGAAGGGTGATGGTGTGGAGGATGGCTTCGTCTGCCCCGATG ACTGGCTCGAGACCGACATGCGCTCCGGTCTGCGCTCCAGCGACATCGAG CCTCGTCGCAAGCGTACCGGGTGGAACGAGCTGACCACCGAGAAGACCAA CTTCTTCGTTCAGTTCATTGGTTACTTCCGTGGTCCTATTCTTTATGTTA TGGAATTGGCTGTCTGTCTTGCTGCTGGTCTTCGTGACTGGATCGATTTC GGTGTCATTATTGGTATTCTTATGCTTAACGCTATCGTCGGTTGGTACCA GGAGAAGCAGGCTGCCGACGTTGTCGCTTCCCTCAAGGGTGATATTGCTA TGAAGGCCATCGTCATTCGTGATGGTCAGGAACAGGAAATCCTTGCCCGT GAACTTGTTACTGGTGATATTATCGTTATCGAGGAAGGTACCGTTGTCCC CGCCGATATTCGCCTGATCTGTGACTACGACAAGCCCGAGAACTTCGAGA CCTACAAGGAGTACCTCGCCACCGTTGGTGACGACACCCTTAAGGAGAAG GAGGATGAGGACGACGAGGATGGTGGCATTGAGGCCCGTGCCGGTGTCTC TCTCGTCGCCGTTGACCAGTCCGCCATCACTGGTGAATCTCTCGCTGTCG ACAAGTACATGGCCGACACTTGCTACTACACCACTGGTTGCAAGCGTGGT AAGGCCTACGCTATCGTTACTGCCACCGCCAGACACTCTTTCGTCGGTAA GACCGCTGCTCTCGTTCAGGGTGCCCAGGACCAGGGTCACTTCAAGGCTG TCATGGACAACATCGGTACCACCCTGCTTGTTCTTGTCATGTTCTGGATT CTCGCTGCCTGGATCGGTGGTTTCTACCGTCACCTCAAGATCGCTACTCC CGAGAACGAGGACCGCAACTTGCTCCACTACACCCTGATTCTCCTGATCA TTGGTGTCCCCGTCGGTCTCCCCGTCGTCACCACCACCACCCTCGCTGTC GGTGCTGCCTACTTGGCTGAGCAGAAGGCTATTGTCCAGAAGCTCACTGC CATTGAGTCCCTTGCCGGTGTCGACATTCTCTGCTCTGACAAGACTGGTA CCCTCACTGCCAACCAGCTCTCCATCCGTGAGCCCTACGTCAACGAGGGT GTCGATGTTAACTGGATGATGGCTGTCGCTGCCATTGCCTCCAACCACAA CATCAAGAACCTCGACCCCATTGACAAGGTCACTATCATGACCCTCCGTC GTTACCCCAAGGCCCGTGAGATTCTCGCCCGCAACTGGGTCACCGAGAAG TACACTCCTTTCGACCCCGTCTCCAAGCGTATCACCACCATCTGTACCTG CGATGGTGTCCGCTACGTCTGCGCCAAGGGTGCCCCCAAGGCTATCCTCA 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CTCATCTTCGTCACCCGTGGTGGTAAGACCTGGCCCTCTTGGCAGCTGGT TGGCGCCATCTTCATTGTCGATGTGCTCGCCACCCTGTTCTGTGTCTTCG GCTGGCTCTCCGGCGACTACCTCCAGACCCACCCCGTTGACCGTGCCGAC TTCTCCGTCAACGGTGATGTCGACATTGTCACCGTCGTTGTTGTCTGGGG TTACTCCATTGGTGTCACCATCATCATCGCTGTGGTGTACTATCTCCTTA CCATCATCCCCTTCCTTGACAACCTTGGTCGCAAGACCCGCTCTCGCGCT GACACCCAGATCGAGAACCTGCTTGGCCACCTGTCCAAGCTGGCCATCGA GCACGAGGTCGACGCCCACGGCAAGAGCCGCTACATGCTGGGTGCTCGCG CTGAGGTCGAAGAGGATGAGTAAATGGCGGAGCGGAGGATTTCCTATGCT CCCGACGTGGAGAATGGTGACCATTCTCGCGCTCCTCAACTTGATGATGG TGCTGGTCTCGACGAGTACGCCGCGTTGAACCGTTACATCTCGACCGCCC CCGACAAGCGCCGCGGTTCGACTGCTAGTGCCGGTGGCGTGAGTGCCGGC AAGAAGAAGAAGGGTTTCTCCCTCTTCGGTAAGAAGGGTGATGGTGTGGA GGATGGCTTCGTCTGCCCCGATGACTGGCTCGAGACCGACATGCGCTCCG GTCTGCGCTCCAGCGACATCGAGCCTCGTCGCAAGCGTACCGGGTGGAAC GAGCTGACCACCGAGAAGACCAACTTCTTCGTTCAGTTCATTGGTTACTT CCGTGGTCCTATTCTTTATGTTATGGAATTGGCTGTCTGTCTTGCTGCTG GTCTTCGTGACTGGATCGATTTCGGTGTCATTATTGGTATTCTTATGCTT AACGCTATCGTCGGTTGGTACCAGGAGAAGCAGGCTGCCGACGTTGTCGC 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CCCGCAACTGGGTCACCGAGAAGTACACTCCTTTCGACCCCGTCTCCAAG CGTATCACCACCATCTGTACCTGCGATGGTGTCCGCTACGTCTGCGCCAA GGGTGCCCCCAAGGCTATCCTCAACATGTCCCAGTGCTCTGAGGAGGAGG CCGACAAGTTCCGTGAGAAGGCTGCTGAGTTCGCTCGTCGTGGTTTCCGT TCCCTCGGTGTTGCCGTCCAGAAGGAGGGTGAGCCCTGGCAACTGCTGGG CATGTACCCCATGTTCGACCCCCCCCGTGAGGATACCGCCCACACCATCG CTGAGGCCCAGCACCTTGGTCTGTCCGTCAAGATGTTGACTGGTGATGCT CTCGCTATTGCCAAGGAAACCTGCAAGATGCTTGCTCTTTCTACTAAGGT CTACGACTCCGAGCGTCTGATCCACGGTGGTCTTGCTGGCTCTGCTCAGC ACGATCTCGTTGAGAAGGCTGACGGTTTCGCTGAGGTCTTCCCCGAGCAC AAGTACCAGGTCGTCGAGATGCTCCAGCAGCGTGGTCACTTGACTGCCAT GACTGGTGACGGTGTCAACGACGCTCCCTCTCTCAAGAAGGCTGACTGCG GTATCGCTGTCGAGGGTTCCACTGAGGCTGCCCAGGCTGCTGCCGATATT GTCTTCCTTGCCCCCGGTCTGTCCACCATTGTTGATGCCATCAAGCTCGC CCGTCAGATCTTCCAGCGTATGAAGGCCTACATCCAGTACCGTATTGCTC TGTGTCTCCACCTTGAGGTCTACCTTGTCACCTCCATGATCATCATTGAC GAGACCATCCGTGCCGATCTGATTGTCTTCATTGCCCTGTTCGCTGATTT GGCCACCATCGCCATTGCCTACGACAACGCCCACTACGAACAGCGCCCCG TCGAGTGGCAGCTGCCCAAGATCTGGGTGATTTCCGTCATCCTTGGTATC 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ATTGGCTGTCTGTCTTGCTGCTGGTCTTCGTGACTGGATCGATTTCGGTG TCATTATTGGTATTCTTATGCTTAACGCTATCGTCGGTTGGTACCAGGAG AAGCAGGCTGCCGACGTTGTCGCTTCCCTCAAGGGTGATATTGCTATGAA GGCCATCGTCATTCGTGATGGTCAGGAACAGGAAATCCTTGCCCGTGAAC TTGTTACTGGTGATATTATCGTTATCGAGGAAGGTACCGTTGTCCCCGCC GATATTCGCCTGATCTGTGACTACGACAAGCCCGAGAACTTCGAGACCTA CAAGGAGTACCTCGCCACCGTTGGTGACGACACCCTTAAGGAGAAGGAGG ATGAGGACGACGAGGATGGTGGCATTGAGGCCCGTGCCGGTGTCTCTCTC GTCGCCGTTGACCAGTCCGCCATCACTGGTGAATCTCTCGCTGTCGACAA GTACATGGCCGACACTTGCTACTACACCACTGGTTGCAAGCGTGGTAAGG CCTACGCTATCGTTACTGCCACCGCCAGACACTCTTTCGTCGGTAAGACC GCTGCTCTCGTTCAGGGTGCCCAGGACCAGGGTCACTTCAAGGCTGTCAT GGACAACATCGGTACCACCCTGCTTGTTCTTGTCATGTTCTGGATTCTCG CTGCCTGGATCGGTGGTTTCTACCGTCACCTCAAGATCGCTACTCCCGAG AACGAGGACCGCAACTTGCTCCACTACACCCTGATTCTCCTGATCATTGG TGTCCCCGTCGGTCTCCCCGTCGTCACCACCACCACCCTCGCTGTCGGTG CTGCCTACTTGGCTGAGCAGAAGGCTATTGTCCAGAAGCTCACTGCCATT GAGTCCCTTGCCGGTGTCGACATTCTCTGCTCTGACAAGACTGGTACCCT CACTGCCAACCAGCTCTCCATCCGTGAGCCCTACGTCAACGAGGGTGTCG ATGTTAACTGGATGATGGCTGTCGCTGCCATTGCCTCCAACCACAACATC AAGAACCTCGACCCCATTGACAAGGTCACTATCATGACCCTCCGTCGTTA CCCCAAGGCCCGTGAGATTCTCGCCCGCAACTGGGTCACCGAGAAGTACA CTCCTTTCGACCCCGTCTCCAAGCGTATCACCACCATCTGTACCTGCGAT GGTGTCCGCTACGTCTGCGCCAAGGGTGCCCCCAAGGCTATCCTCAACAT GTCCCAGTGCTCTGAGGAGGAGGCCGACAAGTTCCGTGAGAAGGCTGCTG AGTTCGCTCGTCGTGGTTTCCGTTCCCTCGGTGTTGCCGTCCAGAAGGAG GGTGAGCCCTGGCAACTGCTGGGCATGTACCCCATGTTCGACCCCCCCCG TGAGGATACCGCCCACACCATCGCTGAGGCCCAGCACCTTGGTCTGTCCG TCAAGATGTTGACTGGTGATGCTCTCGCTATTGCCAAGGAAACCTGCAAG ATGCTTGCTCTTTCTACTAAGGTCTACGACTCCGAGCGTCTGATCCACGG TGGTCTTGCTGGCTCTGCTCAGCACGATCTCGTTGAGAAGGCTGACGGTT TCGCTGAGGTCTTCCCCGAGCACAAGTACCAGGTCGTCGAGATGCTCCAG CAGCGTGGTCACTTGACTGCCATGACTGGTGACGGTGTCAACGACGCTCC CTCTCTCAAGAAGGCTGACTGCGGTATCGCTGTCGAGGGTTCCACTGAGG CTGCCCAGGCTGCTGCCGATATTGTCTTCCTTGCCCCCGGTCTGTCCACC ATTGTTGATGCCATCAAGCTCGCCCGTCAGATCTTCCAGCGTATGAAGGC CTACATCCAGTACCGTATTGCTCTGTGTCTCCACCTTGAGGTCTACCTTG TCACCTCCATGATCATCATTGACGAGACCATCCGTGCCGATCTGATTGTC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
| GO:0016021 | integral component of membrane |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0120029 | proton export across plasma membrane |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0000166 | nucleotide binding |
| GO:0008553 | proton-exporting ATPase activity, phosphorylative mechanism |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| KJC3_005575-T1.utr5p1 | KJC3_005575-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| KJC3_005575-T1.utr3p1 | KJC3_005575-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR008250 |
| DBxref | InterPro:IPR036412 |
| DBxref | InterPro:IPR023298 |
| DBxref | InterPro:IPR018303 |
| DBxref | InterPro:IPR023299 |
| DBxref | InterPro:IPR006534 |
| DBxref | InterPro:IPR004014 |
| DBxref | InterPro:IPR001757 |
| DBxref | PFAM:PF00702 |
| DBxref | PFAM:PF00122 |
| DBxref | PFAM:PF00690 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| ch4 | supercontig | ch4:3126616..3130805 + |
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