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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:3317486..3324022- Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_005648-T1 ID=KJC3_005648-T1|Name=KJC3_005648-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=6537bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:3317486..3324022- (Aspergillus niger KJC3)
TTCAGGAGAAGAGTTCCTCCATGGGTGTGACCGAAGTTCGCCGCCCCCTG
CAGTGACTGATCGGATTGCCTCCGTTTCCTTCCCCTCAGAGTGACTTGGC
AGCTGCTCCCCGGTCATTGTTCCGGCGGCAGCATATGCTAATTGCTATTC
GCTCAATTTTAGGTGCAGGGTATGGTAGTACCTGGCTATTTGCGGCGGTC
AATCAATATTAATCAAATTAGGTAAACTTCCGAGGTTAGTCGACTCAAAA
CCCGGTCAACTTTAACTAGAAGTCCTAACTGGGTCGGTCTTTTAGAGTTT
CCACAGGAACGAACAACGATCGAACCCATCTGCAAGTGATGAAACCACGA
AGACATCATGCAGATGCCACTGTTCCAGAGTCAAACAAACCTGTGTCCAC
AACTAACCCAGTGTCCACTTCCACTGCCTTGATTCCATCGTCTGGAGGGG
AAGCCGTCGGCCCAGGACTGGCCTTACTAGTAGTGTTCGGTTAAAGCGGG
CAACCGGCAGCTCAGGCCATTGGGATTTGGGGGAAAAGAGGGGGGTGGAG
CCTCAGGAACCAAAGGTACGAGACCTTCGGGTCAGGAACGCCTGTTCGGG
CAACGATTGCCCTTTCCAAAAGGCTTTCTTGCCATTACGATTGCCAGGTC
GACTAGCCAGGGATCAATATTGGTATTGAAGAGCAGTCTAGATTGCTGCA
CGAGAAAGTCAACCGACATTTTAGGGCAGACTGTGTTGTGCAGCTTGTCG
TTTGCTTGTGGTGGATGATGTTCTCTTGGCTTCTCTGCTTCTCAGGCTGA
GGGCGCTTTACCGTAAGTATTCTTGCCTGCCGCGCTAAGGCAGTACCTAC
TGCATCCGCAGCTTCCTGTCCCTGACTAAAAAGCGATGCTAATAATGCAC
TAATTTAGCGTGCAAAGGCTGCATCCACCAGACCACATTCGGTTGTGCGC
AGCACAGGAAAGTTGTGCTCCTGTTCTGCTTGTTGTTGTCCCCTGCACAC
TTCAGTCCACGAGTAGTCTCCCGCTACTTTTTTAGGTTAGTGACCCCAGC
TGGCTTGTTTGAAGTGAGAGTTTTCTTCCTCCTTGGGGGAAATTAATTTT
TCTATATTTGGAGTGGGTAGATAGAGCATGACACTGTCGAGCACTCGCCC
GGATTCTCAATCGATGTTTTGATTTTACTACGAGTCCTTCATGACTGTAG
TGCGCAGATAAGATCTGTGCTCCTTTCAATTATTGATTGCACTATCTACT
TTGTATTGTGGAATGGATTTCTTGTCCGGGGGAAGAGTGGGCGGCCCCCT
CTCTATTAGTTTTCAGAGTTCACTTGTCTCTTGCATTTGTCATTGCTTTT
TCCTTTGTCTTTTGAAGCCTAACGTTCCGGAACTGGATTTATGCACCGCC
CCGGAAATTAGTTGATCAGTCAACGCACATATGTCACAAAAATCTTAACG
CCTTTTTTTTGTTGCTTTTCCTAGTTTTTGTTCCCTTTGCCTTCCCCTCC
TCTGCCCACTATACCTGTCTTTTTCTCTCCTAACCACACCTGGATAGCGT
CGGTTAGGCTCCGTACTCCGTATTTGACTATTTTTCTCTCTTAGTTGTTT
TATCACATTTTGAAAGGGGATCTAAGCAACTCTAAAGTTTCACATTGACT
TCATCCATGGGAGAAGGTGGAACCGGGCTCACAATTCAGGGACAAAACAC
CGGCCGTGTTGATCGCCCATGGGTCGGCCTCGACGGCTGGCCGGCACTGG
GATTATCCTCTTGTTTACCTGATGAGGGTCTGCGCAGTCTGACTGCCATT
GGCCCGTCATCCGATCACCACAGCCAACATCACACCCCCGACTTGCTCTT
CTGGTTGGCATTCGGTCGCTGACCACCCCACGGGTGACCCGACGATGATG
TTGATGATAATGATGTTGCTCATGCTGTGCTGCCGATGCCCACTGTACTG
TACCTTCCCGCAGCAGTGTTGCACACCCAGACGCTCACACCGAAGCATCC
ATGTTTTTTCTTCTTACTTGCTTTTTTCTTTCCCACCGTGGATGCTAGCA
TGAGCGTCTTCAAATCAGAAGCATGGTTGATTGATACTAGTGTACTCACT
CACTTACTCCCTGACAACGGAGCCTCTCACCAGTACTGAATTGAGAGCCC
CAATTGGTGGCGGCCTTGGTCAGTGGCTCACCGGCCTAGGCTCCTCCCCC
TGCTTACAGCGTCCGTTGCTTGACAAAATAATACTACTATGGACGGAAAA
GGTCAGAGGTGACCCGCAAAAAGCTCGGAACTAATACCTTCTCAGTCCAG
GATACCCCGTTCCCCTAAATAGTATTCTCGTTCTGCTTAGTTTGTTTCGG
ATGAGCCCACATACAACGGTAGTCCGCTCTGGTTTGCTTCCTAGTTTCCA
CTGGCACCCGGCGCATCCACTTGGCTAGCTTGGCCTCGAAGATCCGGGTC
CCTCGATCACAGAGGACCCAACATGCTCTCAGCCGGGTGTGCAGCTCCAT
TCGTGGTTCCAGACTTGGGGGAGAACTCCATCGCCCGATCCCGCTGGCAC
GGGAGGAAATCCCTCTCAGGGGTATATAAACCTCCAGGCTGATCACCTCG
TTCGATGAACATCAAGCCCTTCGTCAGTCACTTTGTTTTGTCTTGCTTTT
TGGGTTCTGTCTTTCCTTACCCGACCCTCATTTTCACCAGTCTGTCGTTA
ACCAATTAGGCTGCCTCGAGCCAGCCGTTCTTCCATTTTCATACTCTTTT
GGATTCTTTTGACAGGTTCAATTCAGACACTCGCTGACGTCTTACTCACT
CTTTGTTATACATTCTTTGTCTCTCGGCACAATGCGTTCCGACAAGCTTC
TCGTGCTCGCCGGTCTGGCGAGCTATGCTCTCGCTCTCCCCACGAAGGAC
TTGGACCCCCGTACCTTCGGCCTCGTCGCCGAGATCCTCACTGACCTTGG
TGAGGACCTGACCGGTTTCATCGAGGCCCTCCTTGGCGGCGGTGTCAAGA
GCTCCGCAAGCCTCCTCACTGGTATCAGCGCTCAGGCAGCTGCTGTCCTT
GAAGGTGGTGCCCTGGGTTGCACTGCTGGCAAGATCGAGGCCTCCGCTCG
TGCGGAGCTGGCTGCGTGGATCCGGGCTCATGCCAGCTTCGATGCCTCCC
TCAAGTCGTCTCTGTTGGCCTGGTGTGAGGGTGAGGACTCTGCCACCTTG
TCCGTCGATGTCCGTGCTGGTCTCGCTCTGTTCATTCCCACCTGCGCCGA
GGTCGCTGCCAAGGGCGACATTTACGTGACTGTCGACGGTATCTTCTCCG
TTTCCGAACTCGAGGCCGCTGTTGTCCTCAGCTCTTCTTTCCAGTCTACT
CTGTCTACTTTCCTGTCCGGATCCGTTGGTGTCGAATTGGATGCCGACAT
CAAGGCTGGTCTTTCCCTCTGTGCTGGTGGTGGTGTCGTCGCCGACCTTG
CTTCGGACATCGAGGCCTCCCTGAAGGTCTGGCTTTCCGGCTCTGAGTGC
TCTCTGAGTGCCTCCCTCAAGGCTGCTGTCCTTGCTTGGTTGGAGGGCAA
GGCTAGTGTGTCTGGCGTTGTTACCATCGGCACTGTGCCCACTGCTGGTC
TCACCACTGTCTCCGTCGGTGCCGCCATTAACGCCCTTGTCGAAACCTCC
GGTGCCCTCACCGCTAGCGCCCAGGCCTACCTCTCTGCCTTCCTCAAGTC
CTCCCTCGCCGCCGACATTGAGGCCGATGTTAAGGTCGTTCTGGAGGCCT
GTATCTCGGGCAAGCTTGCCACTTCCGTCAGCGCCGATGCCCGTGCTGCC
CTGGCAGTCTGGCTCTCTGGCGATAGCTGCCAGCTGGGCGTTGAGCTGAA
GGCCGTTCTCTACTTCTGGCTTTCCTTTGCCCTGAGCGGCGACGTCACCG
TCGACTTGTCCACCGACATCATTACCGAACTCGAGACTTTCATCACCGGT
ACCATCGACACTCTCATCGGTGTCAACATTAGCGGCGTGCTCTCCCTTCT
GCTGTCTGGCGAGAGTCTGGCCTCCCTTTCCCTGGAGTCTCGTGCTGAGC
TGTCTGCTGTCATCGGTGGCTGCGCTGGTGTTGATATCAGCTCCTCCATT
GAGATCATCGTCATTGAATGGCTTACCGGCTGCAGCATCCCCGGCGGTCC
TTCCATCGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCTCCGGATCTTCGTCTAAGCTCA
TCCCCAGCGCCTCCAGCATTCCTGCCGTCGCTTCGACCCCCGCTGTCAGC
GTTCCTGCTGTTCCCACCGTCTCGGTTCCCACTGGCGGTTCTAGCCCCAG
CAAGCCTGCTCAGTCCGGTGCCCCTGGTGTCCCCTCCGGTGGTGTTGTTC
CCTCCTCTCCCGCTCAGTCCGGCGCTCCCGGATCCCCCAACGGTGTCAGC
CCTACCGACACTCCTTCGGTTCCCTCCTCCCCTGCCCAGTCTGGTGCTCC
TGGCTCTCCATCTGGCGGCGTCCCCGCTCCCAGCGGTGGCGTCGTTCCCT
CGTCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCCGGCGCCCCTAGCGGCGGTGTTGTC
CCCACTGCCTCTGTTCCGGAAGGCGCCAGTGCCGGTGCCTCCACTACTCC
CTGCGACACTATCACCGGCGAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTATGACCG
AGGGCGGTTCTGCTCCTAGTGCCCCCGCTCAGTCTGGTGCTCCTAGCGTT
ACCCCCATCGTCGGTGGTGGTGCTGGCGGCTCTACTGGTGGTTCTACTGG
CGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCTGGCTCCGGCTCTGGCTCTG
GCTCTGGCTCTGGTTCCGGCTCTGGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGC
TCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTC
TGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTG
GCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGC
TCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCCGGCTCCTGGTCCGGCTC
TGGCTCTGGAGGTGCTGCTCCCTCTGGTAGCGTTGTTCCCGCCGGTCCCT
CCGGCTCTGTCCCTGCTGTTCCTACCGCTAGCGTCCCCGAGGGCGCCAGC
GCTGGTGCCTCCACCACCCCCTGTGACACCATCACCGGCCAGACTGTTGT
TCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGCTCTGCCCCCAGTGTCCCTGCTC
AGTCTGGCGGTGTTGTTCCCTCTGCTCCCGCTCAGTCCGGTGCTCCTGGT
GCTCCCTCCGGTGCTCCTGCTCCCAGCGGTGGTGTCGTTCCCTCGTCTCC
TGCTCAGTCTGGTGCCCCCGGTGCTCCCTCCGGTGGTGCTAGCGTCCCTG
CTGTCCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGTGCCAGCGCTGGTGCCTCTACC
ACCCCCTGTGACACTCTCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTAT
GACCGAGGGTGGCTCTGCCCCTAGTGCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCTG
CTCCCTCCGGTGGCGCTCCTGCCCCCAGCGGCGGTGTCGTTCCCTCCGGT
GGTGCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGCGCCAG
CGCTGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCCTCACCGGCCAGACTGTTG
TTCCCGTTGCTACCATGACCGAGGGCGGTTCTGCCCCCAGTGCCCCTGCT
GAGTCTGGCGCCCCTGGTGCCCCCAGCGGTGTCAGCCCCTCCGAGACCCC
TGCCGCTCCCGCTCAGTCTGGCTCTGGCAACGCTCCCAGCGGTGGCTCTC
CCGCCCCCAGCGGTGGTGTCGTCCCCTCCGGCGCTGCTAGCGTCCCTGCT
GTTCCCACTGCCAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACCAC
TCCCTGCGACACCATCACCGGCCAGACTGTCGTCCCTGTCGCTACCGAGA
CCGTGACTCCTGTCCCCGTTGCCACCTCGGCTACTGAGGGCGGTTCCTCT
CCTCAGATCACCACCGCTCCCGTCGCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTC
TGGCTCTGAGACTGAGGTGGTTACTGTCACCGTCACTGCTACTGTGAGCG
TTTCGGCTTGCGACTGGTAAGCTTCCAACAGCAGCCTACAAGTTACGACG
ATAGCAACGGCATCAATGGTGAATAGTCCTCCTGTATATACCTAATTTTC
TAATTCTAATTATTGTGAAGATTGTCTTGAATATCTGCTCGAATTTGTAC
AAGGCGAGGGAAGCAGGATGTCTATAGTGGCGAAGCAGGTACAAATCTTT
ATTTTCTGGCTTGATTGTTTGATACTATCCCACCTTTCCCTCCAATGGAG
TCCATTCGCCTTGCCGATGCAATGATGTGTTATTTGAATACCTGTACAGT
ACTTATGATGGAGGATTGAGCGAAAGCCAGCCTCGTCTTGAATGTTCATT
TCTTTCTTTTTCTTAATCTCGATTCGATATGCCAAAC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:3317486..3324022- >KJC3_005648-T1 ID=KJC3_005648-T1|Name=KJC3_005648-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=3339bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:3317486..3324022- (Aspergillus niger KJC3)
ATGCGTTCCGACAAGCTTCTCGTGCTCGCCGGTCTGGCGAGCTATGCTCT
CGCTCTCCCCACGAAGGACTTGGACCCCCGTACCTTCGGCCTCGTCGCCG
AGATCCTCACTGACCTTGGTGAGGACCTGACCGGTTTCATCGAGGCCCTC
CTTGGCGGCGGTGTCAAGAGCTCCGCAAGCCTCCTCACTGGTATCAGCGC
TCAGGCAGCTGCTGTCCTTGAAGGTGGTGCCCTGGGTTGCACTGCTGGCA
AGATCGAGGCCTCCGCTCGTGCGGAGCTGGCTGCGTGGATCCGGGCTCAT
GCCAGCTTCGATGCCTCCCTCAAGTCGTCTCTGTTGGCCTGGTGTGAGGG
TGAGGACTCTGCCACCTTGTCCGTCGATGTCCGTGCTGGTCTCGCTCTGT
TCATTCCCACCTGCGCCGAGGTCGCTGCCAAGGGCGACATTTACGTGACT
GTCGACGGTATCTTCTCCGTTTCCGAACTCGAGGCCGCTGTTGTCCTCAG
CTCTTCTTTCCAGTCTACTCTGTCTACTTTCCTGTCCGGATCCGTTGGTG
TCGAATTGGATGCCGACATCAAGGCTGGTCTTTCCCTCTGTGCTGGTGGT
GGTGTCGTCGCCGACCTTGCTTCGGACATCGAGGCCTCCCTGAAGGTCTG
GCTTTCCGGCTCTGAGTGCTCTCTGAGTGCCTCCCTCAAGGCTGCTGTCC
TTGCTTGGTTGGAGGGCAAGGCTAGTGTGTCTGGCGTTGTTACCATCGGC
ACTGTGCCCACTGCTGGTCTCACCACTGTCTCCGTCGGTGCCGCCATTAA
CGCCCTTGTCGAAACCTCCGGTGCCCTCACCGCTAGCGCCCAGGCCTACC
TCTCTGCCTTCCTCAAGTCCTCCCTCGCCGCCGACATTGAGGCCGATGTT
AAGGTCGTTCTGGAGGCCTGTATCTCGGGCAAGCTTGCCACTTCCGTCAG
CGCCGATGCCCGTGCTGCCCTGGCAGTCTGGCTCTCTGGCGATAGCTGCC
AGCTGGGCGTTGAGCTGAAGGCCGTTCTCTACTTCTGGCTTTCCTTTGCC
CTGAGCGGCGACGTCACCGTCGACTTGTCCACCGACATCATTACCGAACT
CGAGACTTTCATCACCGGTACCATCGACACTCTCATCGGTGTCAACATTA
GCGGCGTGCTCTCCCTTCTGCTGTCTGGCGAGAGTCTGGCCTCCCTTTCC
CTGGAGTCTCGTGCTGAGCTGTCTGCTGTCATCGGTGGCTGCGCTGGTGT
TGATATCAGCTCCTCCATTGAGATCATCGTCATTGAATGGCTTACCGGCT
GCAGCATCCCCGGCGGTCCTTCCATCGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCTCC
GGATCTTCGTCTAAGCTCATCCCCAGCGCCTCCAGCATTCCTGCCGTCGC
TTCGACCCCCGCTGTCAGCGTTCCTGCTGTTCCCACCGTCTCGGTTCCCA
CTGGCGGTTCTAGCCCCAGCAAGCCTGCTCAGTCCGGTGCCCCTGGTGTC
CCCTCCGGTGGTGTTGTTCCCTCCTCTCCCGCTCAGTCCGGCGCTCCCGG
ATCCCCCAACGGTGTCAGCCCTACCGACACTCCTTCGGTTCCCTCCTCCC
CTGCCCAGTCTGGTGCTCCTGGCTCTCCATCTGGCGGCGTCCCCGCTCCC
AGCGGTGGCGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCCGGCGC
CCCTAGCGGCGGTGTTGTCCCCACTGCCTCTGTTCCGGAAGGCGCCAGTG
CCGGTGCCTCCACTACTCCCTGCGACACTATCACCGGCGAGACTGTTGTT
CCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGTTCTGCTCCTAGTGCCCCCGCTCA
GTCTGGTGCTCCTAGCGTTACCCCCATCGTCGGTGGTGGTGCTGGCGGCT
CTACTGGTGGTTCTACTGGCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCT
GGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCCGGCTCTGGCTCCGG
CTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCT
CTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCT
GGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGG
CTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTT
CCGGCTCCTGGTCCGGCTCTGGCTCTGGAGGTGCTGCTCCCTCTGGTAGC
GTTGTTCCCGCCGGTCCCTCCGGCTCTGTCCCTGCTGTTCCTACCGCTAG
CGTCCCCGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCCTCCACCACCCCCTGTGACACCA
TCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGCTCT
GCCCCCAGTGTCCCTGCTCAGTCTGGCGGTGTTGTTCCCTCTGCTCCCGC
TCAGTCCGGTGCTCCTGGTGCTCCCTCCGGTGCTCCTGCTCCCAGCGGTG
GTGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCTCAGTCTGGTGCCCCCGGTGCTCCCTCC
GGTGGTGCTAGCGTCCCTGCTGTCCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGTGC
CAGCGCTGGTGCCTCTACCACCCCCTGTGACACTCTCACCGGCCAGACTG
TTGTTCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGTGGCTCTGCCCCTAGTGCTCCT
GCCCAGTCTGGTGCTCCTGCTCCCTCCGGTGGCGCTCCTGCCCCCAGCGG
CGGTGTCGTTCCCTCCGGTGGTGCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCTA
GCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACC
CTCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACCATGACCGAGGGCGGTTC
TGCCCCCAGTGCCCCTGCTGAGTCTGGCGCCCCTGGTGCCCCCAGCGGTG
TCAGCCCCTCCGAGACCCCTGCCGCTCCCGCTCAGTCTGGCTCTGGCAAC
GCTCCCAGCGGTGGCTCTCCCGCCCCCAGCGGTGGTGTCGTCCCCTCCGG
CGCTGCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCCAGCGTCCCTGAGGGCGCCA
GCGCTGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCATCACCGGCCAGACTGTC
GTCCCTGTCGCTACCGAGACCGTGACTCCTGTCCCCGTTGCCACCTCGGC
TACTGAGGGCGGTTCCTCTCCTCAGATCACCACCGCTCCCGTCGCTGGCT
CCGGCTCCGGCTCCGGCTCTGGCTCTGAGACTGAGGTGGTTACTGTCACC
GTCACTGCTACTGTGAGCGTTTCGGCTTGCGACTGGTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-18) |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch4 | supercontig | ch4:3317486..3324022 - |
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