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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:4041248..4042743- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_005890-T1 ID=KJC3_005890-T1|Name=KJC3_005890-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=1496bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:4041248..4042743- (Aspergillus niger KJC3)
ATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGA
GCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGA
AGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGGTAAGCTACTCAAAAGAGT
GAGGCAATGGAATTGAATAGAGTACTGATACCAAGAGCAGTGTCTGGATC
ACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGC
TCAGTTCCGTAAGTTCTCCACGTGGTGGCTACAAATCAAGGTGACCATAT
CGCTAATTGTGCTCTCTGTTGCTAGGTTTCCGTACGTTCCTCATACCCTA
TCTCGATATTGTCCAACAGTCAAAACTAATGGCATTTAGCTATCATTCTC
ACAACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCG
CACCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTG
TCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTG
ATCTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGAT
GCTCAAGGTCAGTCATTCCCTTTCGAGCGTGAGTTTTCCTTGCTCACTCC
CACTCAGGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGG
GCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTG
CTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGG
ATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCA
TGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTC
TCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGC
TCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTG
GTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTT
TCCGTTGTCTTCCTGGTAAGAAGCTCTTGTTCTTGACGTTGCTACATAGG
GATCAAATTACTAACGCACCCACACAGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGT
TATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCA
TGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCG
ATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAA
GGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACC
ACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTC
TTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGC
CAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:4041248..4042743- >KJC3_005890-T1 ID=KJC3_005890-T1|Name=KJC3_005890-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=5970bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:4041248..4042743- (Aspergillus niger KJC3)
ATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGA
TATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCT
TGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTAC
AAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGC
CTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTT
TCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCC
AGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGC
TACTGCTGGAAATGCCTAAGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTA
CTTGGGGTATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTC
AGCATTATCGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTT
TGTCTTCATCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCA
CTCGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATG
GACCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAA
CGGTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACA
TCTACAACGTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTC
CTCCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCTGCTATCATTCTCACAACATGGCAT
TTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCT
GCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTG
CTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAAT
GTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGTGTCT
GGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGAT
TATGCTCAGTTCCATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGG
TCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAG
GCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGATTGGC
AAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCT
TTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCC
AGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTT
GGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGC
TGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCG
CTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTAC
GCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGC
TGGAAATGCCTAAGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGG
GTATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATT
ATCGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTT
CATCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTC
TGGTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCT
CTTGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGT
CACTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACA
ACGTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTC
AACGTTTCCGTTGTCTTCCTGCTATCATTCTCACAACATGGCATTTGGCA
TTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCTGCTCGA
TGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTGCTATTG
TTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAATGTTACT
TATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGTGTCTGGATCA
CTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCT
CAGTTCCATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTC
GTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAG
CCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGATTGGCAAGACC
TCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGT
CGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCT
TCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGT
GACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTA
TGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCC
TCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCC
GAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAA
TGCCTAAGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGG
GCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTG
CTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGG
ATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCA
TGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTC
TCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGC
TCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTG
GTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTT
TCCGTTGTCTTCCTGCTATCATTCTCACAACATGGCATTTGGCATTTGCG
ACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCTGCTCGATGGACG
GAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGA
TCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAATGTTACTTATCTG
TATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGTGTCTGGATCACTCTGA
GTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTC
CATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGG
AGCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCG
AAGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGATTGGCAAGACCTCCTCC
CTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGC
TTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTT
ACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAG
ATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGT
TAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCA
TCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAA
GTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTA
AGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGGGCATGG
CTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTGCTTGGT
GTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGGATTCCT
CTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCATGGTTC
AGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTCTCCCTC
TACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGCTCTCTT
CCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTGGTGTCT
GGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTTTCCGTT
GTCTTCCTGCTATCATTCTCACAACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTC
ATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAAC
CGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTC
TTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTG
AGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCA
GTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCATGTC
CGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTA
CCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCT
GCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTT
ATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCAT
GATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGA
TTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAG
GAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCA
CCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCT
TCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCC
AGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAAGCTAC
CACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGGGCATGGCTCCTG
TCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTGCTTGGTGTCATC
ATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGGATTCCTCTTCCA
GCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCATGGTTCAGCGCC
TGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTCTCCCTCTACTAC
TTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGCTCTCTTCCTCGA
GGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTGGTGTCTGGACAT
TGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTTTCCGTTGTCTTC
CTGCTATCATTCTCACAACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACC
CAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAA
GATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCT
TCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTT
GCTTTCATCCAGATGCTCAAGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTA
TCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCATGTCCGAAGG
CGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGC
CCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTC
CACCCTGCTGTCTATGTCGG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR004853 |
| DBxref | PFAM:PF03151 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch4 | supercontig | ch4:4041248..4042743 - |
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