You are here

KJC3_005892-T1, KJC3_005892-T1 (mRNA) Aspergillus niger KJC3

Overview
NameKJC3_005892-T1
Unique NameKJC3_005892-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger KJC3
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at ch4:4046553..4049515+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>KJC3_005892-T1 ID=KJC3_005892-T1|Name=KJC3_005892-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=2963bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:4046553..4049515+ (Aspergillus niger KJC3)
GATCGATGGTGATTGCATGAATCGATCAGCCCCGACCCATGCGTCCTCCA GGCGTTTAAGATGAGGGATGATTTGGATTGATTGGGGTTGGAAATTAGCT TTGTCCCCTTTGCCCCTTTTCCAAGGCTCCGCGACTGGGGCTTCGGCGAC ACGTATTGCTATTAATTATTAGTCGACTTTTTTTGGGGAAATCCGATAAT CCGATTGCTTGATCTATTAGGGCCTAAACTTGAAACCGATTCCAAGCGCC CCCCACCGCTTGCTTGTCACGTTTCGCTTTCCCGACCGACCGCAGGACGG ATACACCTATACCTTCCCGCCCATCTCCCTCCCCTTCTTGCTCGTCCTCT CCCTCATCACCAACCTCCCTTCTTCCTCTCTCTCTCCCCTCATCTCTCTC GCCTTATAACTCTACTGTCCCTGCAGCTTCACAAGGCTCGTTTTCTATGC TCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGATATT CTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATGTAAGGAGACCTTTCCCCCCT CCCACCAACGGCGAGCTTGCCTTGCACTACAACAAAGAACTCATTGGAAC CTTTACTGACCGTTGTCTTTGTGCTTGAATTCAGCTCCGTCGACGTTCTC GTCATTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCA GATTGTACGAATTGCGCGCCCCCTATCGTATACTATCACTCGAATAACGG CTAATTGGACAATTCTCGGGTGTAGGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTG ACAGCAACGAGACTCCTGGTGGTCTTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAA GGTTTCGTATGTTGAATCCTACTTTCCCCTCAATGGATAGACATTGCACT TGTCAAGCGAACAACGACTGACTCGTGACAATCGCAGCTCTTCGATGTTG GTGGTCACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAAC GAGGCTCTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTA CGTTCGCTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTT CCATGCTTCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGAT GCTGCTCTCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGA GTGGATCGTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGAC CCTACAACTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGGTAAGATGCTCT GGATCACATGGCAAGTAACGGCGTGCTAATTCCCATTAGATGCAATGTGC CTGGTTGGGTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCA ACGTTATCCTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTC CGTTTCCCCGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGA CACTCTCCCCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCA AGGTCAATGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTC GGCTACAAGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCA GATTGGCGACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCT CCACTCACGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATC GGTGACAAGTGCTGGGTAAGTTATCTACCTTGGATGCAGACTTCAATGGC CCTTTAAACTAATACGATTTCCTCTAGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTG CCCCTTCTACCGTGCCACCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGC CCGAGGGCTCCAAGAAGCTCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAG CCCCAGAGCACTGAGGCTCAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGA GGTTTCCGAGTCTTCGATGAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTG ATTGCATCCAGGGTCTCGTCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAG ATTGTCTCCACCTACCACCGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTC CCTGGAGCGTGAGGGCGCTCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGA AGGACATCTGGACCCGTGGCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGT AACCAGGACCACTCTTTCATGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGT CAACGGCGCTGTCGAGCTGACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTA GACAGAACACCGAGCGTCGGCTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAG AGCCAGGCGCAGTAAAGGGTTGAAATGTTAATAGAATTACACGGGTTTTA ATTTCTTTTTTCTTGAATGATTCCAGGCAAGGGGCAAAAGATTTGTTTAG AGATCTGATTACGATCAACGGGAGCCATATTTCATCATTTTTTTTTTCTT CTTGTCCTATCTATTTAACTTATCTTACCAAGTTTTTTTTCTTTTTTTTA CTCTTGGCTCATTGACAGCGATGTATGGGAGATGTTCTTGGCATTGTGAT GCGTATCATCATCCACTTTTCTAGCCGCCTTTTGCTCCATCCACTAGACA TGAATAGAAGTTGCTTATCGAACGCGTGTTTTTCTTTGGGGACTTAATTT ATTGCTTTACGTATGCTGGTTACATGTCTCACGGCGGATTTTGCTGATGA CCACCCCGTGGAGATCGAATCCGGCTTCATGACAGATGACACATGTATCA CCCACCGAAGTGAGGCAGTGTTTGTAGCACAACAGCCCATGCAGTCCGTT TCTATTTTCGCTCCATCCTATCCCGATCTAGTATATAAAATATGATATAT ACGTCCCAAGTGC
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at ch4:4046553..4049515+

>KJC3_005892-T1 ID=KJC3_005892-T1|Name=KJC3_005892-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=9594bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:4046553..4049515+ (Aspergillus niger KJC3)
ATGCTCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGA
TATTCTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCG
TCATTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAG
ATTGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGG
TCTTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTG
GTCACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAG
GCTCTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGT
TCGCTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCA
TGCTTCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCT
GCTCTCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTG
GATCGTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCT
ACAACTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGG
TTGGGTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGT
TATCCTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTT
TCCCCGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACT
CTCCCCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGT
CAATGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCT
ACAAGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATT
GGCGACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCAC
TCACGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTG
ACAAGTGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCC
ACCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAA
GCTCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGG
CTCAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCG
ATGAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCT
CGTCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACC
ACCGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGC
GCTCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCG
TGGCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTT
TCATGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAG
CTGACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCG
TCGGCTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAAA
TGCTCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGAT
ATTCTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCGT
CATTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGA
TTGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGT
CTTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTGG
TCACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGG
CTCTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTT
CGCTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCAT
GCTTCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTG
CTCTCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGG
ATCGTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTA
CAACTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGGT
TGGGTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTT
ATCCTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTT
CCCCGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTC
TCCCCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTC
AATGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTA
CAAGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTG
GCGACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACT
CACGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGA
CAAGTGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCA
CCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAG
CTCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGC
TCAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGA
TGAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTC
GTCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACCA
CCGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGCG
CTCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCGT
GGCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTTT
CATGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAGC
TGACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCGT
CGGCTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAAAT
GCTCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGATA
TTCTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCGTC
ATTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGAT
TGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGTC
TTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTGGT
CACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGC
TCTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTC
GCTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATG
CTTCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGC
TCTCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGA
TCGTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTAC
AACTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGGTT
GGGTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTTA
TCCTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTTC
CCCGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTCT
CCCCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTCA
ATGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTAC
AAGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTGG
CGACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACTC
ACGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGAC
AAGTGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCAC
CATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAGC
TCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGCT
CAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGAT
GAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTCG
TCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACCAC
CGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGCGC
TCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCGTG
GCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTTTC
ATGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAGCT
GACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCGTC
GGCTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAAATG
CTCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGATAT
TCTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCGTCA
TTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGATT
GATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGTCT
TGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTGGTC
ACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGCT
CTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTCG
CTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATGC
TTCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGCT
CTCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGAT
CGTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTACA
ACTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGGTTG
GGTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTTAT
CCTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTTCC
CCGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTCTC
CCCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTCAA
TGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTACA
AGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTGGC
GACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACTCA
CGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGACA
AGTGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCACC
ATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAGCT
CCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGCTC
AGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGATG
AAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTCGT
CAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACCACC
GCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGCGCT
CTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCGTGG
CCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTTTCA
TGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAGCTG
ACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCGTCG
GCTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAAATGC
TCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGATATT
CTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCGTCAT
TGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGATTG
ATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGTCTT
GCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTGGTCA
CGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGCTC
TCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTCGC
TGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATGCT
TCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGCTC
TCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGATC
GTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTACAA
CTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGGTTGG
GTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTTATC
CTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTTCCC
CGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTCTCC
CCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTCAAT
GCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTACAA
GAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTGGCG
ACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACTCAC
GTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGACAA
GTGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCACCA
TCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAGCTC
CCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGCTCA
GGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGATGA
AGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTCGTC
AACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACCACCG
CCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGCGCTC
TTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCGTGGC
CGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTTTCAT
GCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAGCTGA
CCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCGTCGG
CTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAAATGCT
CAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGATATTC
TACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCGTCATT
GGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGATTGA
TGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGTCTTG
CTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTGGTCAC
GTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGCTCT
CCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTCGCT
GCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATGCTT
CCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGCTCT
CGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGATCG
TTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTACAAC
TTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGGTTGGG
TGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTTATCC
TTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTTCCCC
GCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTCTCCC
CAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTCAATG
CCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTACAAG
AAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTGGCGA
CCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACTCACG
TCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGACAAG
TGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCACCAT
CTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAGCTCC
CCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGCTCAG
GAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGATGAA
GCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTCGTCA
ACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACCACCGC
CGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGCGCTCT
TACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCGTGGCC
GCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTTTCATG
CTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAGCTGAC
CCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCGTCGGC
TGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAA
back to top
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
KJC3_005892KJC3_005892Aspergillus niger KJC3gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KJC3_005892-T1KJC3_005892-T1-proteinAspergillus niger KJC3polypeptide


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KJC3_005892-T1.utr5p1KJC3_005892-T1.utr5p1Aspergillus niger KJC3five_prime_UTR


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KJC3_005892-T1.exon1KJC3_005892-T1.exon1Aspergillus niger KJC3exon
KJC3_005892-T1.exon2KJC3_005892-T1.exon2Aspergillus niger KJC3exon
KJC3_005892-T1.exon3KJC3_005892-T1.exon3Aspergillus niger KJC3exon
KJC3_005892-T1.exon4KJC3_005892-T1.exon4Aspergillus niger KJC3exon
KJC3_005892-T1.exon5KJC3_005892-T1.exon5Aspergillus niger KJC3exon
KJC3_005892-T1.exon6KJC3_005892-T1.exon6Aspergillus niger KJC3exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KJC3_005892-T1.cdsKJC3_005892-T1.cdsAspergillus niger KJC3CDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KJC3_005892-T1.utr3p1KJC3_005892-T1.utr3p1Aspergillus niger KJC3three_prime_UTR


Properties
Property NameValue
DBxrefInterPro:IPR036188
DBxrefPFAM:PF13450
DBxrefPFAM:PF01593
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Aspergillus Aspergillus niger KJC32021-10-31
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
ch4supercontigch4:4046553..4049515 +