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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:4046553..4049515+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_005892-T1 ID=KJC3_005892-T1|Name=KJC3_005892-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=2963bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:4046553..4049515+ (Aspergillus niger KJC3) GATCGATGGTGATTGCATGAATCGATCAGCCCCGACCCATGCGTCCTCCA
GGCGTTTAAGATGAGGGATGATTTGGATTGATTGGGGTTGGAAATTAGCT
TTGTCCCCTTTGCCCCTTTTCCAAGGCTCCGCGACTGGGGCTTCGGCGAC
ACGTATTGCTATTAATTATTAGTCGACTTTTTTTGGGGAAATCCGATAAT
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CCTTTAAACTAATACGATTTCCTCTAGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTG
CCCCTTCTACCGTGCCACCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGC
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GGTTTCCGAGTCTTCGATGAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTG
ATTGCATCCAGGGTCTCGTCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAG
ATTGTCTCCACCTACCACCGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTC
CCTGGAGCGTGAGGGCGCTCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGA
AGGACATCTGGACCCGTGGCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGT
AACCAGGACCACTCTTTCATGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGT
CAACGGCGCTGTCGAGCTGACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTA
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AGCCAGGCGCAGTAAAGGGTTGAAATGTTAATAGAATTACACGGGTTTTA
ATTTCTTTTTTCTTGAATGATTCCAGGCAAGGGGCAAAAGATTTGTTTAG
AGATCTGATTACGATCAACGGGAGCCATATTTCATCATTTTTTTTTTCTT
CTTGTCCTATCTATTTAACTTATCTTACCAAGTTTTTTTTCTTTTTTTTA
CTCTTGGCTCATTGACAGCGATGTATGGGAGATGTTCTTGGCATTGTGAT
GCGTATCATCATCCACTTTTCTAGCCGCCTTTTGCTCCATCCACTAGACA
TGAATAGAAGTTGCTTATCGAACGCGTGTTTTTCTTTGGGGACTTAATTT
ATTGCTTTACGTATGCTGGTTACATGTCTCACGGCGGATTTTGCTGATGA
CCACCCCGTGGAGATCGAATCCGGCTTCATGACAGATGACACATGTATCA
CCCACCGAAGTGAGGCAGTGTTTGTAGCACAACAGCCCATGCAGTCCGTT
TCTATTTTCGCTCCATCCTATCCCGATCTAGTATATAAAATATGATATAT
ACGTCCCAAGTGC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:4046553..4049515+ >KJC3_005892-T1 ID=KJC3_005892-T1|Name=KJC3_005892-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=9594bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:4046553..4049515+ (Aspergillus niger KJC3) ATGCTCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGA TATTCTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCG TCATTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAG ATTGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGG TCTTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTG GTCACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAG GCTCTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGT TCGCTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCA TGCTTCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCT GCTCTCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTG GATCGTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCT ACAACTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGG TTGGGTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGT TATCCTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTT TCCCCGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACT CTCCCCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGT CAATGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCT ACAAGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATT GGCGACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCAC TCACGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTG ACAAGTGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCC ACCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAA GCTCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGG CTCAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCG ATGAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCT CGTCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACC ACCGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGC GCTCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCG TGGCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTT TCATGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAG CTGACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCG TCGGCTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAAA TGCTCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGAT ATTCTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCGT CATTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGA TTGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGT CTTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTGG TCACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGG CTCTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTT CGCTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCAT GCTTCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTG CTCTCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGG ATCGTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTA CAACTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGGT TGGGTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTT ATCCTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTT CCCCGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTC TCCCCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTC AATGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTA CAAGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTG GCGACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACT CACGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGA CAAGTGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCA CCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAG CTCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGC TCAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGA TGAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTC GTCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACCA CCGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGCG CTCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCGT GGCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTTT CATGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAGC TGACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCGT CGGCTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAAAT GCTCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGATA TTCTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCGTC ATTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGAT TGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGTC TTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTGGT CACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGC TCTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTC GCTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATG CTTCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGC TCTCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGA TCGTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTAC AACTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGGTT GGGTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTTA TCCTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTTC CCCGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTCT CCCCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTCA ATGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTAC AAGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTGG CGACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACTC ACGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGAC AAGTGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCAC CATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAGC TCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGCT CAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGAT GAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTCG TCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACCAC 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TCAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGATATT CTACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCGTCAT TGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGATTG ATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGTCTT GCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTGGTCA CGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGCTC TCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTCGC TGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATGCT TCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGCTC TCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGATC GTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTACAA CTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGGTTGG GTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTTATC CTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTTCCC CGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTCTCC CCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTCAAT GCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTACAA GAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTGGCG ACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACTCAC GTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGACAA GTGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCACCA TCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAGCTC CCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGCTCA GGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGATGA AGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTCGTC AACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACCACCG CCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGCGCTC TTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCGTGGC CGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTTTCAT GCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAGCTGA CCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCGTCGG CTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAAATGCT CAGCCTCGCCCGCAGGACTTTGAACCGTGTCCCCAGCTTTCAGGATATTC TACAAGGCAGGATGACCCACCCCGATATCTCCGTCGACGTTCTCGTCATT GGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGATTGA TGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGTCTTG CTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCTTCGATGTTGGTGGTCAC GTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGCTCT CCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTCGCT GCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATGCTT CCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGCTCT CGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGATCG TTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTACAAC TTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGATGCAATGTGCCTGGTTGGG TGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTTATCC TTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTTCCCC GCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTCTCCC CAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTCAATG CCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTACAAG AAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTGGCGA CCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACTCACG TCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGACAAG TGCTGGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCACCAT CTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAGCTCC CCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGCTCAG GAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGATGAA GCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTCGTCA 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Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| KJC3_005892-T1.utr5p1 | KJC3_005892-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| KJC3_005892-T1.utr3p1 | KJC3_005892-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR036188 |
| DBxref | PFAM:PF13450 |
| DBxref | PFAM:PF01593 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| ch4 | supercontig | ch4:4046553..4049515 + |
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