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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:5618335..5621787- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_006417-T1 ID=KJC3_006417-T1|Name=KJC3_006417-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=3453bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:5618335..5621787- (Aspergillus niger KJC3)
TTCTGCTTCATCCTTTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCTTTTTCTCTCCTTCC
TCTCTTTCTCCCTCCTCCATCTCCTCGTCTTTGAAGGTTGTGTTACTACC
TTCAGACTTCTCTTTGTTGATTCCCTCGCTCCAGTCCCGTCTCCTCGTGG
TCTTGTTGGACGCCCCCGGTTTCTTCTAACCTCATAAAAAAAAACTTGTT
TTTTTCTTCCTTCACATAACATCATTATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGC
GGCTACCAGCGCGACTCCTACCGGTAAGCTATCCCTTTGCAATCAGAGCA
CTGGTCTAGATGGATTGCTGGAGCGCAAACCAGCCTTGTGGCTGTGCGAC
ATGAATCGCGACTCTGATCGCTTCCTGGCTATTCCAGCCTGCCTTGCGGT
CCGGTCTGTCACGCGATCCGGTCAACCTTCAACCCATCTAGTCCTATCGG
CTCTTCTCAACACTGCGTCGTGAATCTGTACCTCTCAAACGAACATGCTT
GCTAACTTGCCATATAGCTCCAGAAACGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGG
TAACGGTAACGGTTACTCCAACGGCGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTG
GTGGTGGTTACGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGC
GGCTATGGTGGCAGAGGTGGTGGTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCAT
GTCCAACCTGGGCGCCGGTCTGAAGAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCC
TGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAG
CGCTCTCAGCGTGATGTTGACGAGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGT
TCAGGGAAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTT
TCCCTCAATACGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCT
ACCGCTATTCAGTCTCAGGGTTGGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGT
TGTCGGTATCGCTGAGACGGGTTCCGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTC
CTGCCATTGTTCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGC
CCCATTGTCCTTATCCTCGCCCCCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCA
AGCCGAAATCTCCAAGTTCGGAAAGTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTG
TCTACGGTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAGATCCGTGACCTGAGCCGTGGT
GTGGAAGTCTGCATTGCGACTCCCGGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGC
TGGTCGCACCAACCTTCGTCGTGTCACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCG
ATCGCATGCTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCC
CAGATTCGCCCTGACCGTCAGACCTGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAA
GGAGGTCCGTCAGCTTGCGTCTGACTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTA
ACATTGGTTCCATGGATCTGTCGGCCAACCACCGTATCACTCAGATCGTC
GAGGTCGTCTCGGACTTCGAGAAGCGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGA
GAAGATCATGGAGAACCGTGCCAACAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCA
AGCGCATCGCTGACGAAATCACTCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCG
GCACTTTGTAAGCTTCCTTGGATCCCAATACTGAAACAGCTATTTGCTAA
CCTGCGTTCCAGCTATTCACGGTGATAAGCAACAGCAAGAAAGAGATTGG
GTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAATCATGGTGGCTACTGA
TGTGGCTTCCCGTGGTATCGGTATGAATAAATCGCAAACTCCCCCCTCCC
CTTCCCCCCCTTCCTCCCTTCCTTTCTTGCCTCCCGAGTCACCCTCACCC
ATATTGAGGTTGTGTGACCATGGCACGGTGCTTAACTCTCTTCCACCAAT
TGTTGGTGTGTATGACTCTTCCAGGCTTTGTCGGGTCTCCTGAAATGGTT
CTCAAGCCAGGAGAGCCTTGGACTCACAGTGCAGTGTAGCAGACGTATTA
CTCTTCTGTTTTGATTCACCATATCTACCTTTTGAAACTTGGCCGGTAGA
GGGAGGGAAAGCTCCTCTCTTACCGACTTGTTGAAGCTGCATTCCAAGGT
TGCTCTAGGACCACGATATCTGCCACCCTCGGACTCGTCTGTCACGGATC
TTTTGATGATTTAAGTCCGAGCGAGAGAGAGAGATGCATCAAGTCTCACG
ACTGAGAAAGGGCTCCTAAGCCACGTTGCTCATTTGACTAATGCTCTGTA
TGCTAACGTTACATATGTTTGAAGATGTGCGCGACATCACACACGTTCTC
AACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTAG
AACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACTG
ACAGTAAGTCGTTTCTTCCCTTATGAAACGCCTCTTCAGTACTAACATGT
CCATCTTGCAGACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCTCACTG
AGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCTACAGT
GGCGGCGGTGGTCATGGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGG
TGGTGGCCGTGGCCGCGGCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTGCTCCTC
TTGGTGGCAACCGTCGCTGGTAACCTGACCTCGCTGCTCAGTTCACTCAC
TGAGCTTGTATTCCATTCTCACATCGGTAGACGTTCTTTTTCCTTCGCAT
GATTCCTTTTTCGTAACCACGGTACGGGCGGCGTTCGTCGATATCACGAT
AGACTATTCGCGTGTTTTGCTCAGTTTACAACAACAGGCTCCCCCGACAT
AGGGTGACCTCGAAACCTACACGATTGTGCACTGATATTTCTCATGGATA
CACGTTAATTATCTCATTCTTTGTTGTGGTTTATCAAACAAAAAAGTTAT
GTATCACTTGGCTTGTTCCCGGAACGGATGGGACTAGATAGTGTGTAGCT
TCACTTGCATGCTGATAATTGGAGAGAAACTGTACCTATCTGCTTCTGGT
TTTTTTAGCTTTATGAAATGGTCAATCGTTTTACCTCTTGACAAAATTGC
TGGGAGCACACCTTTACACCATCACAAGTTACCCTCTCAAGTCACCTACA
TGAAGTCCATGCACTTAGATAGTAATCTACAGGCTTGATCCCTGCTATCC
AGCCTCGATCTGCAACACCCCCTCCATCCACCAAGAAAAAGCAAAGGGAA
TACAACAGCAGCAGCAGCAGCACAAAGCACGCCCGAATGAAACAGGCGGT
AGCTGCATAACACCGCAGCAGCCACGCAGGAAGCAGAGACACCGGGTGAG
CGG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:5618335..5621787- >KJC3_006417-T1 ID=KJC3_006417-T1|Name=KJC3_006417-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=8430bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:5618335..5621787- (Aspergillus niger KJC3)
ACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCTCACTGAGGCCAAGCAG
CAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCTACAGTGGCGGCGGTGG
TCATGGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTG
GCCGCGGCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTGCTCCTCTTGGTGGCAAC
CGTCGCTGGTAAATGTGCGCGACATCACACACGTTCTCAACTATGACTAC
CCCAACAACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGC
CGGTGCTAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACTGACACTATTCACG
GTGATAAGCAACAGCAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAACGAGTTCAAGACG
GGCAAGAGCCCAATCATGGTGGCTACTGATGTGGCTTCCCGTGGTATCGC
TCCAGAAACGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGGTAACGGTTACTC
CAACGGCGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTACGGCGGTG
GTGGCTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGCGGCTATGGTGGCAGAGGT
GGTGGTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCATGTCCAACCTGGGCGCCGG
TCTGAAGAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGT
CCTTCTACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTT
GACGAGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCC
TCGCCCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCA
GCGAGGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCTACCGCTATTCAGTCTCAG
GGTTGGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCGGTATCGCTGAGAC
GGGTTCCGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTCCTGCCATTGTTCACATCA
ACGCCCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTC
GCCCCCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCGAAATCTCCAAGTT
CGGAAAGTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCA
AGGGTCCTCAGATCCGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCG
ACTCCCGGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCG
TCGTGTCACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGG
GTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCCCAGATTCGCCCTGACCGT
CAGACCTGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGC
GTCTGACTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTAACATTGGTTCCATGGATC
TGTCGGCCAACCACCGTATCACTCAGATCGTCGAGGTCGTCTCGGACTTC
GAGAAGCGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCG
TGCCAACAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAA
TCACTCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCGGCACTTTATGTCTTCCTA
CGGCGGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCCTACCGACTCCAAGCAGGCT
CGTGACTTGGTCACCATTCTCACTGAGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCG
TCTCGCCGAGATGGTCCGCTACAGTGGCGGCGGTGGTCATGGCCACGGTG
GCTATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGCCGCGGCAACCAC
TTCACTGCTTCCAATGCTGCTCCTCTTGGTGGCAACCGTCGCTGGTAAAT
GTGCGCGACATCACACACGTTCTCAACTATGACTACCCCAACAACTCGGA
GGACTACGTTCACCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTA
CCGCCATCACCTTCTTTACCACTGACACTATTCACGGTGATAAGCAACAG
CAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAAT
CATGGTGGCTACTGATGTGGCTTCCCGTGGTATCGCTCCAGAAACGGTGG
CGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGGTAACGGTTACTCCAACGGCGGAGGCT
ACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTACGGCGGTGGTGGCTATGGCGGC
GGCGGCTACGGCGGCGGCGGCTATGGTGGCAGAGGTGGTGGTGCCGGCGG
TGCTGGCGGAGACCGCATGTCCAACCTGGGCGCCGGTCTGAAGAAGCAGG
AATGGGATCTTGACTCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAA
CACGCCGATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGACGAGTTCCGTAA
GAAGCACGAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCGAGA
CCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCC
CAGGGCTTCGACCGCCCTACCGCTATTCAGTCTCAGGGTTGGCCCATGGC
CCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCGGTATCGCTGAGACGGGTTCCGGAAAGA
CCCTGACCTACTGTCTTCCTGCCATTGTTCACATCAACGCCCAGCCCCTC
CTCGCCCCCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCCCCCACCCGTGA
ATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCGAAATCTCCAAGTTCGGAAAGTCTTCCC
GTATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAGATC
CGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACTCCCGGTCGTCT
GATTGACATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCGTGTCACCTACC
TCGTTCTGGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAG
ATCCGCAAGATCATCTCCCAGATTCGCCCTGACCGTCAGACCTGCATGTG
GTCCGCTACATGGCCCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGCGTCTGACTTCCTCA
ACGACTACATCCAGGTTAACATTGGTTCCATGGATCTGTCGGCCAACCAC
CGTATCACTCAGATCGTCGAGGTCGTCTCGGACTTCGAGAAGCGCGACAA
GATGATCAAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGCCAACAAGTGCC
TTATCTTCACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAATCACTCGCTTCCTC
CGCCAGGACGGATGGCCGGCACTTTATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGCG
GCTACCAGCGCGACTCCTACCGACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCAC
CATTCTCACTGAGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGG
TCCGCTACAGTGGCGGCGGTGGTCATGGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGG
GGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGCCGCGGCAACCACTTCACTGCTTCCAA
TGCTGCTCCTCTTGGTGGCAACCGTCGCTGGTAAATGTGCGCGACATCAC
ACACGTTCTCAACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTACGTTCACC
GTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCATCACCTTC
TTTACCACTGACACTATTCACGGTGATAAGCAACAGCAAGAAAGAGATTG
GGTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAATCATGGTGGCTACTG
ATGTGGCTTCCCGTGGTATCGCTCCAGAAACGGTGGCGGCGGCGGCGGCT
ACGGTAACGGTAACGGTTACTCCAACGGCGGAGGCTACGGTGGTGGTGGT
GGTGGTGGTGGTTACGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGG
CGGCGGCTATGGTGGCAGAGGTGGTGGTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACC
GCATGTCCAACCTGGGCGCCGGTCTGAAGAAGCAGGAATGGGATCTTGAC
TCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAACACGCCGATGTCGC
CGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGACGAGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGG
CTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCC
GGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCG
CCCTACCGCTATTCAGTCTCAGGGTTGGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCG
ACGTTGTCGGTATCGCTGAGACGGGTTCCGGAAAGACCCTGACCTACTGT
CTTCCTGCCATTGTTCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGA
CGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCCCCCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGA
TTCAAGCCGAAATCTCCAAGTTCGGAAAGTCTTCCCGTATCCGCAACACC
TGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAGATCCGTGACCTGAGCCG
TGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACTCCCGGTCGTCTGATTGACATGCTCG
AGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCGTGTCACCTACCTCGTTCTGGATGAG
GCCGATCGCATGCTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATCAT
CTCCCAGATTCGCCCTGACCGTCAGACCTGCATGTGGTCCGCTACATGGC
CCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGCGTCTGACTTCCTCAACGACTACATCCAG
GTTAACATTGGTTCCATGGATCTGTCGGCCAACCACCGTATCACTCAGAT
CGTCGAGGTCGTCTCGGACTTCGAGAAGCGCGACAAGATGATCAAGCACC
TCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGCCAACAAGTGCCTTATCTTCACCGGC
ACCAAGCGCATCGCTGACGAAATCACTCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATG
GCCGGCACTTTATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGAC
TCCTACCGACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCTCACTGAGG
CCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCTACAGTGGC
GGCGGTGGTCATGGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGGTGG
TGGCCGTGGCCGCGGCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTGCTCCTCTTG
GTGGCAACCGTCGCTGGTAAATGTGCGCGACATCACACACGTTCTCAACT
ATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTAGAACT
GGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACTGACAC
TATTCACGGTGATAAGCAACAGCAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAACGAGT
TCAAGACGGGCAAGAGCCCAATCATGGTGGCTACTGATGTGGCTTCCCGT
GGTATCGCTCCAGAAACGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGGTAAC
GGTTACTCCAACGGCGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTA
CGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGCGGCTATGGTG
GCAGAGGTGGTGGTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCATGTCCAACCTG
GGCGCCGGTCTGAAGAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCCTGCCCAAGTT
CGAGAAGTCCTTCTACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAGCGCTCTCAGC
GTGATGTTGACGAGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGTTCAGGGAAGA
AACGTCCCTCGCCCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCTCAATA
CGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCTACCGCTATTC
AGTCTCAGGGTTGGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCGGTATC
GCTGAGACGGGTTCCGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTCCTGCCATTGT
TCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGCCCCATTGTCC
TTATCCTCGCCCCCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCGAAATC
TCCAAGTTCGGAAAGTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGG
TGTCCCCAAGGGTCCTCAGATCCGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCT
GCATTGCGACTCCCGGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGCTGGTCGCACC
AACCTTCGTCGTGTCACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCGATCGCATGCT
GGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCCCAGATTCGCC
CTGACCGTCAGACCTGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAAGGAGGTCCGT
CAGCTTGCGTCTGACTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTAACATTGGTTC
CATGGATCTGTCGGCCAACCACCGTATCACTCAGATCGTCGAGGTCGTCT
CGGACTTCGAGAAGCGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGAGAAGATCATG
GAGAACCGTGCCAACAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCAAGCGCATCGC
TGACGAAATCACTCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCGGCACTTTATG
TCTTCCTACGGCGGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCCTACCGACTCCA
AGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCTCACTGAGGCCAAGCAGCAGATT
GACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCTACAGTGGCGGCGGTGGTCATGG
CCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGCCGCG
GCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTGCTCCTCTTGGTGGCAACCGTCGC
TGGTAAATGTGCGCGACATCACACACGTTCTCAACTATGACTACCCCAAC
AACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGGTGC
TAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACTGACACTATTCACGGTGATA
AGCAACAGCAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCAAG
AGCCCAATCATGGTGGCTACTGATGTGGCTTCCCGTGGTATCGCTCCAGA
AACGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGGTAACGGTTACTCCAACGG
CGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTACGGCGGTGGTGGCT
ATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGCGGCTATGGTGGCAGAGGTGGTGGT
GCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCATGTCCAACCTGGGCGCCGGTCTGAA
GAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCT
ACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGACGAG
TTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCGCCC
TGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCGAGG
TCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCTACCGCTATTCAGTCTCAGGGTTGG
CCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCGGTATCGCTGAGACGGGTTC
CGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTCCTGCCATTGTTCACATCAACGCCC
AGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCCCCC
ACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCGAAATCTCCAAGTTCGGAAA
GTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGGGTC
CTCAGATCCGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACTCCC
GGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCGTGT
CACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGGGTTTCG
AGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCCCAGATTCGCCCTGACCGTCAGACC
TGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGCGTCTGA
CTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTAACATTGGTTCCATGGATCTGTCGG
CCAACCACCGTATCACTCAGATCGTCGAGGTCGTCTCGGACTTCGAGAAG
CGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGCCAA
CAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAATCACTC
GCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCGGCACTTTATGTCTTCCTACGGCGG
CGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCCTACCG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0003676 | nucleic acid binding |
| GO:0005524 | ATP binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_006417-T1.utr3p1 | KJC3_006417-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_006417-T1.utr5p1 | KJC3_006417-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR027417 |
| DBxref | InterPro:IPR014014 |
| DBxref | InterPro:IPR000629 |
| DBxref | InterPro:IPR011545 |
| DBxref | InterPro:IPR014001 |
| DBxref | InterPro:IPR001650 |
| DBxref | PFAM:PF00271 |
| DBxref | PFAM:PF00270 |
| Product | ATP-dependent RNA helicase dbp2 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch4 | supercontig | ch4:5618335..5621787 - |
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