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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch7:1971385..1974112- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_009970-T1 ID=KJC3_009970-T1|Name=KJC3_009970-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=2728bp|location=Sequence derived from alignment at ch7:1971385..1974112- (Aspergillus niger KJC3) CTTAACTAAGACGCGTGGTCTGTTAACCGGCCTCGCCATGGATGCCGATA
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GCTTTTGCCAGCTGTTGCTGGTATCGCTGGGGCTCAATGCCCCTACCTGT
CGGGTGAAATGAGTTTCACCCAGGAGCAGGACAATGCTGGCGATACCATT
GAGGTCACGGAGCAGCCCATTGACAACACCCTGTATGTCAATGACACCGG
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TCAAGGCCGGGCCCCGTGGTCCTACCCTGTTGGAGGACTTTATCTTCCGT
CAGAAGCTTCAGCGGTTCGACCATGAGCGTGTAAGTACAGTAACTGCTGC
GGTGTGTAGTAACAATAAATTGACCCAGTGGTTTTCAATTAGGTCCCCGA
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AAGGAGACCCCTATGTTCTGTCGCTTCTCTACTGTGGTCGGTTTCCGTGG
TAGTGTTGACACTGCGCGTGATGTTCACGGTCACGCTTGTCGGTTCTACA
CTGACGAGGGTAACTATGGTATGCTTGATATGGTCACCCAACAATAATTC
AATACATGCTAACAGATATGTCTCTACTAGACATCGTCGGTATCAATTTC
GCCCCCTTCTTCATCCAGGACGCCATCCAGTTCCCCGATCTTGTCCACGC
CATCAAGCCCATGCCCAACAATGAGATCCCCCAGGCCGCTACTGCACACA
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TTGTGGCTGATGTCTGGTAACGGTATTCCTCGTTCTTTCCGCCACATGAA
CGGCTACGGAGTCCACAGCTTCCGCTTCGTCGCTGCCAATGGCACTTCCA
AGGTGGTTCGCTACCGCTGGAAGTCCCAACAGGGTGTTGCCAGTCTGGTG
TGGGATGAAGCTCAGGCCGCTGCTGGTAAGAACAGTGACTACCACCGCCA
GGATCTGTACAATGCGATCGCCAATGGCCACTACCCGAAATACGAGGTCA
GCCAATCCCTTGATGTCTATCGATAGAGCCTTTTGCTGACAATCCCCTAG
CTCCAAGCCCAGATCATGGATGAGGCTGACATGCTTCGTTTCGGCTTCGA
CCTTCTGGATCCCACCAAGTTGGTCCCCGAGGAGGTTGTCCCTTACACTC
CTCTCGGAATGATGGAGCTCAATGCCAACCCCACCAACTACTTTGCTGAA
GTTGAACAGGCTGGTGTATGTATTCCCCATTCATCAAATGCCAGACATAA
TCTAACTTCTGCAGTTCCAACCCGGTCACGTCGTTCCTGGCATTGACTTC
ACCGACGACCCCCTGCTGCAAGGCCGTCTCTTCTCCTACCTCGACACTCA
GTTGACCCGTCACGGCGGTCCCAACTTCGAGCAAATCCCCGTCAACCGTC
CTCGCAAGCCCGTTCACAACAACAACCGTGACGGCTTCGGCCAGCAGCAG
ATCCCCACCAACAACTGGGCCTACACCCCCAACAGCATGAGCAACGGTTA
CCCCATGCAAGCCAACCAGACCCAGGGTCATGGTTTCTTCACCGCGCCCT
ACCGCTACGCTTCCGGCCATCTCGTCCGCCAGACCAGCCCGACCTTCAAT
GACCACTGGTCCCAGCCCGCCATGTTCTGGAACTCTCTGATCCCCGCTGA
GCAGCAGATGGTTGTCAACGCCATTGTCTTTGAGAACTCCAAGGTTAACA
GCCCCCACGTTCGGAAGAACGTTGTCAACCAGCTGAACATGGTCAACAAC
AACCTCGCCGTCCGTGTCGCTCGTGGTCTTGGTCTCGATGAGCCCTCCCC
CAACCCGACTTACTACACCTCCAACAAGACCTCCAACGTCGGTACCTTCG
GCAAGCCCCTCCTCAGCATCGAGGGTCTGCAGGTCGGCTTCCTGGCCTCG
AACTCCCACCCCGAATCCATCAAGCAGGGCCAGGCCATGGCCGCGCAGTT
CTCTGCCGCTGGCGTCGACCTGAACATTGTCACCGAGGCCTACGCCGATG
GTGTCAACACCACCTACGCCCTGTCTGATGCCATCGACTTTGACGCCCTC
ATCATCGCCGATGGTGTGCAGAGCCTCTTCGCCTCCCCCGCTCTCGCTAA
CCAGATGAACTCTACCGCCACCTCTACTCTCTACCCTCCTGCCAGACCTT
TCCAGATCCTGGTCGATTCTTTCAGGTACGGTAAGCCCGTGGCTGCTGTC
GGCAGTGGCAGTGTTGCGCTCAAGAACGCTGGTATTGATTCCTCCCGCTC
TGGTGTGTACACTGGCTCGAGCGAGACGACGGAGAAGATCGCCAAGGAGG
TCTTGGAGGGACTCTACACTTTCCGTTTTGTGGACCGGTTTGCGCTGGAT
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ATACATTGATTGATCGATAGATATTTTGTGAGATAGATAGAGTATACTAG
AGTGTACATATCTCTACTGATGAGGTGTTGTGCTGCTGCAACACATATTT
ATGAATATATATTCTCTTCTTTGTGAAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch7:1971385..1974112- >KJC3_009970-T1 ID=KJC3_009970-T1|Name=KJC3_009970-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=10965bp|location=Sequence derived from alignment at ch7:1971385..1974112- (Aspergillus niger KJC3) TTCCAACCCGGTCACGTCGTTCCTGGCATTGACTTCACCGACGACCCCCT GCTGCAAGGCCGTCTCTTCTCCTACCTCGACACTCAGTTGACCCGTCACG GCGGTCCCAACTTCGAGCAAATCCCCGTCAACCGTCCTCGCAAGCCCGTT CACAACAACAACCGTGACGGCTTCGGCCAGCAGCAGATCCCCACCAACAA CTGGGCCTACACCCCCAACAGCATGAGCAACGGTTACCCCATGCAAGCCA ACCAGACCCAGGGTCATGGTTTCTTCACCGCGCCCTACCGCTACGCTTCC GGCCATCTCGTCCGCCAGACCAGCCCGACCTTCAATGACCACTGGTCCCA GCCCGCCATGTTCTGGAACTCTCTGATCCCCGCTGAGCAGCAGATGGTTG TCAACGCCATTGTCTTTGAGAACTCCAAGGTTAACAGCCCCCACGTTCGG AAGAACGTTGTCAACCAGCTGAACATGGTCAACAACAACCTCGCCGTCCG TGTCGCTCGTGGTCTTGGTCTCGATGAGCCCTCCCCCAACCCGACTTACT ACACCTCCAACAAGACCTCCAACGTCGGTACCTTCGGCAAGCCCCTCCTC AGCATCGAGGGTCTGCAGGTCGGCTTCCTGGCCTCGAACTCCCACCCCGA 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TCTTCTCCTACCTCGACACTCAGTTGACCCGTCACGGCGGTCCCAACTTC GAGCAAATCCCCGTCAACCGTCCTCGCAAGCCCGTTCACAACAACAACCG TGACGGCTTCGGCCAGCAGCAGATCCCCACCAACAACTGGGCCTACACCC CCAACAGCATGAGCAACGGTTACCCCATGCAAGCCAACCAGACCCAGGGT CATGGTTTCTTCACCGCGCCCTACCGCTACGCTTCCGGCCATCTCGTCCG CCAGACCAGCCCGACCTTCAATGACCACTGGTCCCAGCCCGCCATGTTCT GGAACTCTCTGATCCCCGCTGAGCAGCAGATGGTTGTCAACGCCATTGTC TTTGAGAACTCCAAGGTTAACAGCCCCCACGTTCGGAAGAACGTTGTCAA CCAGCTGAACATGGTCAACAACAACCTCGCCGTCCGTGTCGCTCGTGGTC TTGGTCTCGATGAGCCCTCCCCCAACCCGACTTACTACACCTCCAACAAG ACCTCCAACGTCGGTACCTTCGGCAAGCCCCTCCTCAGCATCGAGGGTCT GCAGGTCGGCTTCCTGGCCTCGAACTCCCACCCCGAATCCATCAAGCAGG GCCAGGCCATGGCCGCGCAGTTCTCTGCCGCTGGCGTCGACCTGAACATT GTCACCGAGGCCTACGCCGATGGTGTCAACACCACCTACGCCCTGTCTGA TGCCATCGACTTTGACGCCCTCATCATCGCCGATGGTGTGCAGAGCCTCT TCGCCTCCCCCGCTCTCGCTAACCAGATGAACTCTACCGCCACCTCTACT CTCTACCCTCCTGCCAGACCTTTCCAGATCCTGGTCGATTCTTTCAGGTA CGGTAAGCCCGTGGCTGCTGTCGGCAGTGGCAGTGTTGCGCTCAAGAACG CTGGTATTGATTCCTCCCGCTCTGGTGTGTACACTGGCTCGAGCGAGACG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055114 | oxidation-reduction process |
GO:0006979 | response to oxidative stress |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0004096 | catalase activity |
GO:0020037 | heme binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
KJC3_009970-T1.utr3p1 | KJC3_009970-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
KJC3_009970-T1.utr5p1 | KJC3_009970-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
Properties
Property Name | Value |
Note | SECRETED:SignalP(1-16) |
DBxref | InterPro:IPR020835 |
DBxref | InterPro:IPR024708 |
DBxref | InterPro:IPR002226 |
DBxref | InterPro:IPR010582 |
DBxref | InterPro:IPR041399 |
DBxref | InterPro:IPR037060 |
DBxref | InterPro:IPR024712 |
DBxref | InterPro:IPR043156 |
DBxref | InterPro:IPR029062 |
DBxref | InterPro:IPR011614 |
DBxref | InterPro:IPR018028 |
DBxref | PFAM:PF18011 |
DBxref | PFAM:PF06628 |
DBxref | PFAM:PF00199 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch7 | supercontig | ch7:1971385..1974112 - |
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