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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch8:4695174..4696748+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_012834-T1 ID=KJC3_012834-T1|Name=KJC3_012834-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=1575bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:4695174..4696748+ (Aspergillus niger KJC3) CCCGCTCGTGTGCGACCGTCCATCATGGCTGCCAAATCCCAATTGCCGAC
CGTCAACACGCCTGTGTCTGCGGAGCCTTCCAAGGCCGCCATGCACCCGG
CTTTCTACATCGCGTACGACTCTTATGTCTGTGGTAGCTGCCTGTGGATG
TTCGTTAATCTCTCTCTAGTACCTGGATTGCTCTCAGTTCCGGTGTGATC
ATTTTCAACAAGTGGATTCTCCATACCGCTGGATTCAGTGAGTGACCTCA
TCTTCTGTTCTGCTCCAGCATGCGATTAGTGAACTGACCGTTGTTACTTC
TCTTCTACAGGTTTCCGTACGTCAATTCCAATATTCACGCCGAGAAAGTC
CGTCGCAAACGACTAACATGCTGCAGCCCTCTTCCTGACCACATGGCATC
TCGTTTTCGCTACCATCATGACCCGCCTCATGGCGCGGTTCACCACTCTG
CTCGACTCTCGTCACCAGGTCCCTATGACCTCTCGTGTCTACATGTCAGT
TGGATCGTGCTGGAAATCAACAATCAACGGTCGTGTCTAATCAGTTTTGT
CCTTGCAGGCGTGCCATCGTCCCCATTGGTGCATTCTTCTCTCTCAGTTT
GATCTGCGGTAACCTCGCATATCTCTACCTCAGTGTGTCCTTCATCCAGA
TGCTCAAGGTGAATAACTTCGACTCCGTGTGTAAGACTGCCGCTAATTTG
ATCAGGCTACCAACTCTGTGGCTACGCTGCTTGCTACTTGGGCCATGGGC
ATTGCGCCGGTGAAGCTCAGCTTGCTCGGAAATATTTCCTTCATCGTCCT
CGGTGTTATCATTGCCTCTATTGGTGAAATCAAGTTCACCATGATTGGAT
TCATCTGTAGGTTTTTATTCTACTCTCGGCGCCTGGCCGGTTTTTTAACA
CCTCATTAGGCCAGTTCTTCGCGACCATCTTCGAGTCCGTACGTCTGGTT
ATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCTGCCGAATTCAAGATGGATCCGTTGGT
TTCCCTGTACTACTTCGCACCTGCTTGCGCCGTCATGAACGCCGTCGTCA
CTGCGGTTGTCGAGCTCCCCACACTGCACATGTCTGACATCTACCAACTC
GGCATGGGTACTCTGTTCCTCAACGCCGCCGTGGCTTTCGGACTGAACGT
TGCTGTCGTCTTTCTGGTACGTCTTCGCGACAGTGGTCTTGTGAGCATCA
GTTCGCTAACGCTTTCCAGATTGGCAAAACCTCCGCCCTTGTCCTTACCC
TGTCCGGAGTCCTCAAGGATATCCTCCTCGTCGTTGCCTCGATGGTCATC
TTCCGCGATCCCGTTACTCCTCTCCAGGCCTTCGGATACGCGATCGCCCT
TGGCGGTCTGGTCTACTACAAGCTTGGAAGGGACGGTGTCAACAACCTTC
TGGCCCAGGTGCGGTACCAGGTGCTTGGTGGCCCCCGCCCCGAGAACTAG
AGTCGATTGTACATATGGTATGTTGGGAGTGGTTGTTGGTTGGCAGATTT
AGAACGTAAATAGAATCGGGCAGGGCCCCAATTGTATCTTTATTTTATGA
GGTTTAATTGCGAAAAGTGCGTGAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch8:4695174..4696748+ >KJC3_012834-T1 ID=KJC3_012834-T1|Name=KJC3_012834-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=8160bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:4695174..4696748+ (Aspergillus niger KJC3) ATGGCTGCCAAATCCCAATTGCCGACCGTCAACACGCCTGTGTCTGCGGA GCCTTCCAAGGCCGCCATGCACCCGGCTTTCTACATCGCTACCTGGATTG CTCTCAGTTCCGGTGTGATCATTTTCAACAAGTGGATTCTCCATACCGCT GGATTCAGTTTCCCCCTCTTCCTGACCACATGGCATCTCGTTTTCGCTAC CATCATGACCCGCCTCATGGCGCGGTTCACCACTCTGCTCGACTCTCGTC ACCAGGTCCCTATGACCTCTCGTGTCTACATGCGTGCCATCGTCCCCATT GGTGCATTCTTCTCTCTCAGTTTGATCTGCGGTAACCTCGCATATCTCTA CCTCAGTGTGTCCTTCATCCAGATGCTCAAGGCTACCAACTCTGTGGCTA CGCTGCTTGCTACTTGGGCCATGGGCATTGCGCCGGTGAAGCTCAGCTTG CTCGGAAATATTTCCTTCATCGTCCTCGGTGTTATCATTGCCTCTATTGG TGAAATCAAGTTCACCATGATTGGATTCATCTGCCAGTTCTTCGCGACCA TCTTCGAGTCCGTACGTCTGGTTATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCTGCC GAATTCAAGATGGATCCGTTGGTTTCCCTGTACTACTTCGCACCTGCTTG CGCCGTCATGAACGCCGTCGTCACTGCGGTTGTCGAGCTCCCCACACTGC ACATGTCTGACATCTACCAACTCGGCATGGGTACTCTGTTCCTCAACGCC GCCGTGGCTTTCGGACTGAACGTTGCTGTCGTCTTTCTGATTGGCAAAAC CTCCGCCCTTGTCCTTACCCTGTCCGGAGTCCTCAAGGATATCCTCCTCG TCGTTGCCTCGATGGTCATCTTCCGCGATCCCGTTACTCCTCTCCAGGCC TTCGGATACGCGATCGCCCTTGGCGGTCTGGTCTACTACAAGCTTGGAAG GGACGGTGTCAACAACCTTCTGGCCCAGGTGCGGTACCAGGTGCTTGGTG GCCCCCGCCCCGAGAACTAGATGGCTGCCAAATCCCAATTGCCGACCGTC AACACGCCTGTGTCTGCGGAGCCTTCCAAGGCCGCCATGCACCCGGCTTT CTACATCGCTACCTGGATTGCTCTCAGTTCCGGTGTGATCATTTTCAACA AGTGGATTCTCCATACCGCTGGATTCAGTTTCCCCCTCTTCCTGACCACA TGGCATCTCGTTTTCGCTACCATCATGACCCGCCTCATGGCGCGGTTCAC CACTCTGCTCGACTCTCGTCACCAGGTCCCTATGACCTCTCGTGTCTACA TGCGTGCCATCGTCCCCATTGGTGCATTCTTCTCTCTCAGTTTGATCTGC GGTAACCTCGCATATCTCTACCTCAGTGTGTCCTTCATCCAGATGCTCAA GGCTACCAACTCTGTGGCTACGCTGCTTGCTACTTGGGCCATGGGCATTG CGCCGGTGAAGCTCAGCTTGCTCGGAAATATTTCCTTCATCGTCCTCGGT GTTATCATTGCCTCTATTGGTGAAATCAAGTTCACCATGATTGGATTCAT CTGCCAGTTCTTCGCGACCATCTTCGAGTCCGTACGTCTGGTTATGGTTC AGCGCCTGCTCAGCTCTGCCGAATTCAAGATGGATCCGTTGGTTTCCCTG TACTACTTCGCACCTGCTTGCGCCGTCATGAACGCCGTCGTCACTGCGGT TGTCGAGCTCCCCACACTGCACATGTCTGACATCTACCAACTCGGCATGG GTACTCTGTTCCTCAACGCCGCCGTGGCTTTCGGACTGAACGTTGCTGTC GTCTTTCTGATTGGCAAAACCTCCGCCCTTGTCCTTACCCTGTCCGGAGT CCTCAAGGATATCCTCCTCGTCGTTGCCTCGATGGTCATCTTCCGCGATC CCGTTACTCCTCTCCAGGCCTTCGGATACGCGATCGCCCTTGGCGGTCTG GTCTACTACAAGCTTGGAAGGGACGGTGTCAACAACCTTCTGGCCCAGGT GCGGTACCAGGTGCTTGGTGGCCCCCGCCCCGAGAACTAGATGGCTGCCA AATCCCAATTGCCGACCGTCAACACGCCTGTGTCTGCGGAGCCTTCCAAG GCCGCCATGCACCCGGCTTTCTACATCGCTACCTGGATTGCTCTCAGTTC CGGTGTGATCATTTTCAACAAGTGGATTCTCCATACCGCTGGATTCAGTT TCCCCCTCTTCCTGACCACATGGCATCTCGTTTTCGCTACCATCATGACC CGCCTCATGGCGCGGTTCACCACTCTGCTCGACTCTCGTCACCAGGTCCC TATGACCTCTCGTGTCTACATGCGTGCCATCGTCCCCATTGGTGCATTCT TCTCTCTCAGTTTGATCTGCGGTAACCTCGCATATCTCTACCTCAGTGTG TCCTTCATCCAGATGCTCAAGGCTACCAACTCTGTGGCTACGCTGCTTGC TACTTGGGCCATGGGCATTGCGCCGGTGAAGCTCAGCTTGCTCGGAAATA TTTCCTTCATCGTCCTCGGTGTTATCATTGCCTCTATTGGTGAAATCAAG TTCACCATGATTGGATTCATCTGCCAGTTCTTCGCGACCATCTTCGAGTC CGTACGTCTGGTTATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCTGCCGAATTCAAGA TGGATCCGTTGGTTTCCCTGTACTACTTCGCACCTGCTTGCGCCGTCATG AACGCCGTCGTCACTGCGGTTGTCGAGCTCCCCACACTGCACATGTCTGA CATCTACCAACTCGGCATGGGTACTCTGTTCCTCAACGCCGCCGTGGCTT TCGGACTGAACGTTGCTGTCGTCTTTCTGATTGGCAAAACCTCCGCCCTT GTCCTTACCCTGTCCGGAGTCCTCAAGGATATCCTCCTCGTCGTTGCCTC GATGGTCATCTTCCGCGATCCCGTTACTCCTCTCCAGGCCTTCGGATACG CGATCGCCCTTGGCGGTCTGGTCTACTACAAGCTTGGAAGGGACGGTGTC AACAACCTTCTGGCCCAGGTGCGGTACCAGGTGCTTGGTGGCCCCCGCCC CGAGAACTAGATGGCTGCCAAATCCCAATTGCCGACCGTCAACACGCCTG TGTCTGCGGAGCCTTCCAAGGCCGCCATGCACCCGGCTTTCTACATCGCT ACCTGGATTGCTCTCAGTTCCGGTGTGATCATTTTCAACAAGTGGATTCT CCATACCGCTGGATTCAGTTTCCCCCTCTTCCTGACCACATGGCATCTCG TTTTCGCTACCATCATGACCCGCCTCATGGCGCGGTTCACCACTCTGCTC GACTCTCGTCACCAGGTCCCTATGACCTCTCGTGTCTACATGCGTGCCAT CGTCCCCATTGGTGCATTCTTCTCTCTCAGTTTGATCTGCGGTAACCTCG CATATCTCTACCTCAGTGTGTCCTTCATCCAGATGCTCAAGGCTACCAAC TCTGTGGCTACGCTGCTTGCTACTTGGGCCATGGGCATTGCGCCGGTGAA GCTCAGCTTGCTCGGAAATATTTCCTTCATCGTCCTCGGTGTTATCATTG CCTCTATTGGTGAAATCAAGTTCACCATGATTGGATTCATCTGCCAGTTC TTCGCGACCATCTTCGAGTCCGTACGTCTGGTTATGGTTCAGCGCCTGCT CAGCTCTGCCGAATTCAAGATGGATCCGTTGGTTTCCCTGTACTACTTCG CACCTGCTTGCGCCGTCATGAACGCCGTCGTCACTGCGGTTGTCGAGCTC CCCACACTGCACATGTCTGACATCTACCAACTCGGCATGGGTACTCTGTT CCTCAACGCCGCCGTGGCTTTCGGACTGAACGTTGCTGTCGTCTTTCTGA TTGGCAAAACCTCCGCCCTTGTCCTTACCCTGTCCGGAGTCCTCAAGGAT ATCCTCCTCGTCGTTGCCTCGATGGTCATCTTCCGCGATCCCGTTACTCC TCTCCAGGCCTTCGGATACGCGATCGCCCTTGGCGGTCTGGTCTACTACA AGCTTGGAAGGGACGGTGTCAACAACCTTCTGGCCCAGGTGCGGTACCAG GTGCTTGGTGGCCCCCGCCCCGAGAACTAGATGGCTGCCAAATCCCAATT GCCGACCGTCAACACGCCTGTGTCTGCGGAGCCTTCCAAGGCCGCCATGC ACCCGGCTTTCTACATCGCTACCTGGATTGCTCTCAGTTCCGGTGTGATC ATTTTCAACAAGTGGATTCTCCATACCGCTGGATTCAGTTTCCCCCTCTT CCTGACCACATGGCATCTCGTTTTCGCTACCATCATGACCCGCCTCATGG CGCGGTTCACCACTCTGCTCGACTCTCGTCACCAGGTCCCTATGACCTCT CGTGTCTACATGCGTGCCATCGTCCCCATTGGTGCATTCTTCTCTCTCAG TTTGATCTGCGGTAACCTCGCATATCTCTACCTCAGTGTGTCCTTCATCC AGATGCTCAAGGCTACCAACTCTGTGGCTACGCTGCTTGCTACTTGGGCC ATGGGCATTGCGCCGGTGAAGCTCAGCTTGCTCGGAAATATTTCCTTCAT CGTCCTCGGTGTTATCATTGCCTCTATTGGTGAAATCAAGTTCACCATGA TTGGATTCATCTGCCAGTTCTTCGCGACCATCTTCGAGTCCGTACGTCTG GTTATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCTGCCGAATTCAAGATGGATCCGTT GGTTTCCCTGTACTACTTCGCACCTGCTTGCGCCGTCATGAACGCCGTCG TCACTGCGGTTGTCGAGCTCCCCACACTGCACATGTCTGACATCTACCAA CTCGGCATGGGTACTCTGTTCCTCAACGCCGCCGTGGCTTTCGGACTGAA CGTTGCTGTCGTCTTTCTGATTGGCAAAACCTCCGCCCTTGTCCTTACCC TGTCCGGAGTCCTCAAGGATATCCTCCTCGTCGTTGCCTCGATGGTCATC TTCCGCGATCCCGTTACTCCTCTCCAGGCCTTCGGATACGCGATCGCCCT TGGCGGTCTGGTCTACTACAAGCTTGGAAGGGACGGTGTCAACAACCTTC TGGCCCAGGTGCGGTACCAGGTGCTTGGTGGCCCCCGCCCCGAGAACTAG ATGGCTGCCAAATCCCAATTGCCGACCGTCAACACGCCTGTGTCTGCGGA GCCTTCCAAGGCCGCCATGCACCCGGCTTTCTACATCGCTACCTGGATTG CTCTCAGTTCCGGTGTGATCATTTTCAACAAGTGGATTCTCCATACCGCT GGATTCAGTTTCCCCCTCTTCCTGACCACATGGCATCTCGTTTTCGCTAC CATCATGACCCGCCTCATGGCGCGGTTCACCACTCTGCTCGACTCTCGTC ACCAGGTCCCTATGACCTCTCGTGTCTACATGCGTGCCATCGTCCCCATT GGTGCATTCTTCTCTCTCAGTTTGATCTGCGGTAACCTCGCATATCTCTA CCTCAGTGTGTCCTTCATCCAGATGCTCAAGGCTACCAACTCTGTGGCTA CGCTGCTTGCTACTTGGGCCATGGGCATTGCGCCGGTGAAGCTCAGCTTG CTCGGAAATATTTCCTTCATCGTCCTCGGTGTTATCATTGCCTCTATTGG TGAAATCAAGTTCACCATGATTGGATTCATCTGCCAGTTCTTCGCGACCA TCTTCGAGTCCGTACGTCTGGTTATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCTGCC GAATTCAAGATGGATCCGTTGGTTTCCCTGTACTACTTCGCACCTGCTTG CGCCGTCATGAACGCCGTCGTCACTGCGGTTGTCGAGCTCCCCACACTGC ACATGTCTGACATCTACCAACTCGGCATGGGTACTCTGTTCCTCAACGCC GCCGTGGCTTTCGGACTGAACGTTGCTGTCGTCTTTCTGATTGGCAAAAC CTCCGCCCTTGTCCTTACCCTGTCCGGAGTCCTCAAGGATATCCTCCTCG TCGTTGCCTCGATGGTCATCTTCCGCGATCCCGTTACTCCTCTCCAGGCC TTCGGATACGCGATCGCCCTTGGCGGTCTGGTCTACTACAAGCTTGGAAG GGACGGTGTCAACAACCTTCTGGCCCAGGTGCGGTACCAGGTGCTTGGTG GCCCCCGCCCCGAGAACTAGATGGCTGCCAAATCCCAATTGCCGACCGTC AACACGCCTGTGTCTGCGGAGCCTTCCAAGGCCGCCATGCACCCGGCTTT CTACATCGCTACCTGGATTGCTCTCAGTTCCGGTGTGATCATTTTCAACA AGTGGATTCTCCATACCGCTGGATTCAGTTTCCCCCTCTTCCTGACCACA TGGCATCTCGTTTTCGCTACCATCATGACCCGCCTCATGGCGCGGTTCAC CACTCTGCTCGACTCTCGTCACCAGGTCCCTATGACCTCTCGTGTCTACA TGCGTGCCATCGTCCCCATTGGTGCATTCTTCTCTCTCAGTTTGATCTGC GGTAACCTCGCATATCTCTACCTCAGTGTGTCCTTCATCCAGATGCTCAA GGCTACCAACTCTGTGGCTACGCTGCTTGCTACTTGGGCCATGGGCATTG CGCCGGTGAAGCTCAGCTTGCTCGGAAATATTTCCTTCATCGTCCTCGGT GTTATCATTGCCTCTATTGGTGAAATCAAGTTCACCATGATTGGATTCAT CTGCCAGTTCTTCGCGACCATCTTCGAGTCCGTACGTCTGGTTATGGTTC AGCGCCTGCTCAGCTCTGCCGAATTCAAGATGGATCCGTTGGTTTCCCTG TACTACTTCGCACCTGCTTGCGCCGTCATGAACGCCGTCGTCACTGCGGT TGTCGAGCTCCCCACACTGCACATGTCTGACATCTACCAACTCGGCATGG GTACTCTGTTCCTCAACGCCGCCGTGGCTTTCGGACTGAACGTTGCTGTC GTCTTTCTGATTGGCAAAACCTCCGCCCTTGTCCTTACCCTGTCCGGAGT CCTCAAGGATATCCTCCTCGTCGTTGCCTCGATGGTCATCTTCCGCGATC CCGTTACTCCTCTCCAGGCCTTCGGATACGCGATCGCCCTTGGCGGTCTG GTCTACTACAAGCTTGGAAGGGACGGTGTCAACAACCTTCTGGCCCAGGT GCGGTACCAGGTGCTTGGTGGCCCCCGCCCCGAGAACTAGATGGCTGCCA AATCCCAATTGCCGACCGTCAACACGCCTGTGTCTGCGGAGCCTTCCAAG GCCGCCATGCACCCGGCTTTCTACATCGCTACCTGGATTGCTCTCAGTTC CGGTGTGATCATTTTCAACAAGTGGATTCTCCATACCGCTGGATTCAGTT TCCCCCTCTTCCTGACCACATGGCATCTCGTTTTCGCTACCATCATGACC CGCCTCATGGCGCGGTTCACCACTCTGCTCGACTCTCGTCACCAGGTCCC TATGACCTCTCGTGTCTACATGCGTGCCATCGTCCCCATTGGTGCATTCT TCTCTCTCAGTTTGATCTGCGGTAACCTCGCATATCTCTACCTCAGTGTG TCCTTCATCCAGATGCTCAAGGCTACCAACTCTGTGGCTACGCTGCTTGC TACTTGGGCCATGGGCATTGCGCCGGTGAAGCTCAGCTTGCTCGGAAATA TTTCCTTCATCGTCCTCGGTGTTATCATTGCCTCTATTGGTGAAATCAAG TTCACCATGATTGGATTCATCTGCCAGTTCTTCGCGACCATCTTCGAGTC CGTACGTCTGGTTATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCTGCCGAATTCAAGA TGGATCCGTTGGTTTCCCTGTACTACTTCGCACCTGCTTGCGCCGTCATG AACGCCGTCGTCACTGCGGTTGTCGAGCTCCCCACACTGCACATGTCTGA CATCTACCAACTCGGCATGGGTACTCTGTTCCTCAACGCCGCCGTGGCTT TCGGACTGAACGTTGCTGTCGTCTTTCTGATTGGCAAAACCTCCGCCCTT GTCCTTACCCTGTCCGGAGTCCTCAAGGATATCCTCCTCGTCGTTGCCTC GATGGTCATCTTCCGCGATCCCGTTACTCCTCTCCAGGCCTTCGGATACG CGATCGCCCTTGGCGGTCTGGTCTACTACAAGCTTGGAAGGGACGGTGTC AACAACCTTCTGGCCCAGGTGCGGTACCAGGTGCTTGGTGGCCCCCGCCC CGAGAACTAG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| KJC3_012834-T1.utr5p1 | KJC3_012834-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| KJC3_012834-T1.utr3p1 | KJC3_012834-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR004853 |
| DBxref | PFAM:PF03151 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| ch8 | supercontig | ch8:4695174..4696748 + |
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