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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch1:1519603..1521414- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_000664-T1 ID=KYF_000664-T1|Name=KYF_000664-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1812bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:1519603..1521414- (Aspergillus niger KYF3) ATGGCTTCCACCTTGAGACTGGGCACCTCTGCTCTCCGTTCCACCTCCAT
TGCCGCTAAGCCGGTTGTTCAGTCCGCTGCCTTCAATGGCCTGCGCTGCT
ACTCTACCGGCAAGGCCAAGGTTCGTTCTACCTCGATAACAGTCATTCCT
CGGATATTTATACTGATGTCTCTCCCTTCTATAGTCCTTGAAGGAGACTT
TCGCTGAGAAGCTCCCTGCCGAGATCGAGAAGGTCAAGAAGCTCCGCAAG
TACGCACAGCTCCCTATTCGACCCTTTTGTCTACAGCAGGTGTTGTTAAC
CAGTCAATCAATGTGTGTAGGGAGCACGGCAGCAAGGTCATCGGCGAGGT
CACCCTTGACCAGGCCTATGGTGGTGCCCGTGGTGTCAAGTGCCTCGTGT
GGGAGGTATGATGAGGAACTTGGCCAATAATTTTTTTGAGGAGACTATCT
AACTGACTTTCATAGGGTTCCGTCCTCGACTCTGAGGAGGGTATCCGTTT
CCGTGGCCGTACCGTAAGTTGCATGTGACTAAAACACAATTTGAAATGTA
TACTGACAGTACTTTAGATCCCCGAGTGCCAGGAGCTCCTCCCCAAGGCT
CCCGGTGGTCAGGAGCCTCTTCCCGAGGGTCTCTTCTGGCTGCTCTTGAC
TGGCGAGATCCCTACCGAGCAGCAGGTCCGCGATCTGTCTGCTGAGTGGG
CTGCCCGCTCCGACCTCCCCAAGTTCATTGAGGAGCTCATCGACCGCTGC
CCCAGCACTCTGCACCCCATGTCCCAGTTCTCTCTGGCCGTCACCGCTCT
TGAGCACGAGTCTGCTTTCGCCAAGGCCTATGCCAAGGGTATCAACAAGA
AGGACTACTGGAACTACACCTTCGAGGACTCCATGGACCTCATTGCCAAG
CTGCCCACCATCGCTGCCAAGATCTACCGCAACGTCTTCAAGGATGGCAA
GGTCGCTCCTATCCAGAAGGACAAGGATTACTCCTACAACTTGGCCAACC
AGCTCGGCTACGGCGACAACAACGACTTCGTTGAGCTCATGCGTCTTTAC
CTGACCATCCACTCCGACCACGAGGGTGGCAACGTCAGTGCTCACACCAC
CCACCTTGTTGGTAGCGCTCTGAGCTCCCCCATGCTCTCTCTCGCTGCTG
GTCTGAACGGTCTGGCTGGACCTCTCCACGGATTGTGAGTTTTTCAATTC
TTTTAATGTACGTCAGATTGAAGTGCTTTCGCTAATGTTTCTTTTTCCAA
TCGCATAGGGCCAACCAGGAAGTCCTTAACTGGCTCACCAAGATGAAGGC
CGCCATTGGCAACGACCTCAGCGACGAGGCCATCAAGAACTACCTCTGGT
CCACCCTGAACGCCGGCCAGGTCGTTCCCGGATACGGTCACGCCGTCCTT
CGTAAGACCGACCCCCGCTACGTGTCTCAGCGCGAGTTCGCTCTTCGCAA
GCTGCCCGATGACCCCATGTTCAAGCTGGTCAGCCAGGTCTACAAGATCG
CTCCTGGTGTCCTGACCGAGCACGGCAAGACCAAGAACCCCTACCCCAAC
GTCGATGCTGTAAGTTGCCTCATGAATCTGCGCCCCCGTTGCATGCGCGA
CCAGTATACTGACCGGTATGTAGCACTCTGGTGTCCTCCTCCAGTACTAT
GGCCTGACTGAGGCCAACTACTACACCGTCCTCTTCGGTGTTTCCCGTGC
TCTGGGTGTCCTTCCCCAGCTGATCATCGACCGTGCCCTTGGTGCCCCCA
TTGAGCGCCCCAAGTCCTACAGCACCGAGGCCTTCGCCAAGCTTGTTGGT
GCTAAGCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch1:1519603..1521414- >KYF_000664-T1 ID=KYF_000664-T1|Name=KYF_000664-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=9975bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:1519603..1521414- (Aspergillus niger KYF3) CACTCTGGTGTCCTCCTCCAGTACTATGGCCTGACTGAGGCCAACTACTA CACCGTCCTCTTCGGTGTTTCCCGTGCTCTGGGTGTCCTTCCCCAGCTGA TCATCGACCGTGCCCTTGGTGCCCCCATTGAGCGCCCCAAGTCCTACAGC ACCGAGGCCTTCGCCAAGCTTGTTGGTGCTAAGCTGTAAGGCCAACCAGG AAGTCCTTAACTGGCTCACCAAGATGAAGGCCGCCATTGGCAACGACCTC AGCGACGAGGCCATCAAGAACTACCTCTGGTCCACCCTGAACGCCGGCCA GGTCGTTCCCGGATACGGTCACGCCGTCCTTCGTAAGACCGACCCCCGCT ACGTGTCTCAGCGCGAGTTCGCTCTTCGCAAGCTGCCCGATGACCCCATG TTCAAGCTGGTCAGCCAGGTCTACAAGATCGCTCCTGGTGTCCTGACCGA GCACGGCAAGACCAAGAACCCCTACCCCAACGTCGATGCTATCCCCGAGT GCCAGGAGCTCCTCCCCAAGGCTCCCGGTGGTCAGGAGCCTCTTCCCGAG GGTCTCTTCTGGCTGCTCTTGACTGGCGAGATCCCTACCGAGCAGCAGGT CCGCGATCTGTCTGCTGAGTGGGCTGCCCGCTCCGACCTCCCCAAGTTCA TTGAGGAGCTCATCGACCGCTGCCCCAGCACTCTGCACCCCATGTCCCAG 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GAAGGCCGCCATTGGCAACGACCTCAGCGACGAGGCCATCAAGAACTACC TCTGGTCCACCCTGAACGCCGGCCAGGTCGTTCCCGGATACGGTCACGCC GTCCTTCGTAAGACCGACCCCCGCTACGTGTCTCAGCGCGAGTTCGCTCT TCGCAAGCTGCCCGATGACCCCATGTTCAAGCTGGTCAGCCAGGTCTACA AGATCGCTCCTGGTGTCCTGACCGAGCACGGCAAGACCAAGAACCCCTAC CCCAACGTCGATGCTATCCCCGAGTGCCAGGAGCTCCTCCCCAAGGCTCC CGGTGGTCAGGAGCCTCTTCCCGAGGGTCTCTTCTGGCTGCTCTTGACTG GCGAGATCCCTACCGAGCAGCAGGTCCGCGATCTGTCTGCTGAGTGGGCT GCCCGCTCCGACCTCCCCAAGTTCATTGAGGAGCTCATCGACCGCTGCCC CAGCACTCTGCACCCCATGTCCCAGTTCTCTCTGGCCGTCACCGCTCTTG AGCACGAGTCTGCTTTCGCCAAGGCCTATGCCAAGGGTATCAACAAGAAG GACTACTGGAACTACACCTTCGAGGACTCCATGGACCTCATTGCCAAGCT GCCCACCATCGCTGCCAAGATCTACCGCAACGTCTTCAAGGATGGCAAGG TCGCTCCTATCCAGAAGGACAAGGATTACTCCTACAACTTGGCCAACCAG CTCGGCTACGGCGACAACAACGACTTCGTTGAGCTCATGCGTCTTTACCT GACCATCCACTCCGACCACGAGGGTGGCAACGTCAGTGCTCACACCACCC ACCTTGTTGGTAGCGCTCTGAGCTCCCCCATGCTCTCTCTCGCTGCTGGT CTGAACGGTCTGGCTGGACCTCTCCACGGATTGGTTCCGTCCTCGACTCT GAGGAGGGTATCCGTTTCCGTGGCCGTACCGGAGCACGGCAGCAAGGTCA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle |
GO:0006101 | citrate metabolic process |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0004108 | citrate (Si)-synthase activity |
GO:0046912 | transferase activity, transferring acyl groups, acyl groups converted into alkyl on transfer |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR036969 |
DBxref | InterPro:IPR019810 |
DBxref | InterPro:IPR016142 |
DBxref | InterPro:IPR010109 |
DBxref | InterPro:IPR016143 |
DBxref | InterPro:IPR002020 |
DBxref | PFAM:PF00285 |
Product | citrate (Si)-synthase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch1 | supercontig | ch1:1519603..1521414 - |
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