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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch1:1772251..1774049+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_000717-T1 ID=KYF_000717-T1|Name=KYF_000717-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1799bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:1772251..1774049+ (Aspergillus niger KYF3) ATGTTTAAGCTTGCCCGCAGCAAACCGGTTACGGCAGCTTTGAGGGCTGC
GACGGTAAGCATCCCTGGGCCCCGTTGCCCTTCACTCCTGTTAAATCTCC
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TTCAGTCCCGTGTTGCTCAGCAACAGAGAAACCTGTCGATTCACGAATAC
CTGTCTGCGAACCTGCTCAAGTCGGTGCGTCGGGCATCCAAAAATCTCTT
GTAAAACTTCGCCTTGCAACCTTCACTAATACGATACTACAGTATGGCAT
CGGCATGCCCAAGGGTGAAGTCGCCCGCTCCGCGGAGGAGGCTGAGGCCG
TTGCCAAGTCCCTCGGTACGTTTTTGTGATCCGCCATCCAACCCCAAAGT
TCGCGACGGCTACTAAGACGAGGACGTTTAGGTAATGACGACATGGTCAT
CAAGGCCCAGGTTCTTGCTGGTGGTCGTGGTAAGGGTACTTTCGACAATG
GCCTTAAGGGTGGTGTGCGCGTGATCTACTCGTGAGTGTGACCCGCGTTA
TTCCGAGTCTTCGCTTGCGCTGACATGTATAAAATTTTAGGCCTACCGAG
GCCAAGATGTTCGCTAGCCAGATGATCGGACAGAAGCTCATCACCAAGCA
GACTGGCGCTGCTGGTCGTCTTTGCAATTCTGTCTACATCTGTGAGCGCA
AGTTTGCTCGCCGCGAGTTCTACCTTGCTGTCCTCATGGACCGCGCCTCT
CAGAGCCCCGTCATTGTCGCCTCGTCGCAAGGTGGTATGGACATTGAGGC
CGTCGCTAAGGAGAACCCTGAGGCCATCATCACCACTCCCATTGACATCA
AGGTCGGTGTGACCGATGCCATTGCTCACAAGATCGTCACCGAGCTCGGC
TTCTCCGAGCAGTGCGTCGAGGAGGCCAAGGACACCATCCAGAAGCTCTA
CAAGGTCTTCATGGAGAAGGATGCTACCCAGATTGAGATCAACCCTCTGT
CTGAGACCTCCGACCACAAGGTCATGGCCATGGATGCCAAGCTTGGCTTC
GATGACAACGCCGAATTCCGCCAGAAGGAGGTCTTCTCCTGGAGAGACAC
CACTCAGGAAGATGCCGATGAGGTCAAGGCCGCTGAGTAAGATCCTCCTG
GTCCTTGCATCTATACAACGCTCGAAAGCATTCTAATCTACGGCATAGGC
ACGGTCTGAACTTCATCAAGCTTGACGGTGACATTGGATGCCTGGGTATG
GATCCATCGAAATCGACTGATATGGTTTATGCTAACGGTCACCATAGTTA
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GGTGCCCCCGCCAACTTCCTCGATGTCGGTGGTGGTGCCACCCCTGCCGC
CATCAAGTCCGCTTTCGAGCTCATCACCAGCGACCCCAAGGTGACTGCTA
TCTTCGTCAACATCTTCGGTGGTATCGTTCGCTGCGATGCTATCGCCCAG
GGTTTGATCAACGTCGTGCAGGAGATGGGTCTGCGCACTCCCATCGTTGC
CCGTCTGCAGGGTACCAACATGGAGCAGGCTCACAAGCTGGTATGTTCTT
ACCGTCTATGCGAACCAGCATAATGAAATCCACGCGAACACAAGTTAACT
GACGTGAATTGCAGATCAACGAGTCTGGCCTCAAGATCTTCTCCATTGAG
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GATGGCCCGCGAGATCGACGTTGGCGTTGAGTTCACTCTTGGTATCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch1:1772251..1774049+ >KYF_000717-T1 ID=KYF_000717-T1|Name=KYF_000717-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=10656bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:1772251..1774049+ (Aspergillus niger KYF3) ATGTTTAAGCTTGCCCGCAGCAAACCGGTTACGGCAGCTTTGAGGGCTGC GACGGAGTCTTCCGTTCAGTCCCGTGTTGCTCAGCAACAGAGAAACCTGT CGATTCACGAATACCTGTCTGCGAACCTGCTCAAGTCGTATGGCATCGGC ATGCCCAAGGGTGAAGTCGCCCGCTCCGCGGAGGAGGCTGAGGCCGTTGC CAAGTCCCTCGGTAATGACGACATGGTCATCAAGGCCCAGGTTCTTGCTG GTGGTCGTGGTAAGGGTACTTTCGACAATGGCCTTAAGGGTGGTGTGCGC GTGATCTACTCGCCTACCGAGGCCAAGATGTTCGCTAGCCAGATGATCGG ACAGAAGCTCATCACCAAGCAGACTGGCGCTGCTGGTCGTCTTTGCAATT CTGTCTACATCTGTGAGCGCAAGTTTGCTCGCCGCGAGTTCTACCTTGCT GTCCTCATGGACCGCGCCTCTCAGAGCCCCGTCATTGTCGCCTCGTCGCA AGGTGGTATGGACATTGAGGCCGTCGCTAAGGAGAACCCTGAGGCCATCA TCACCACTCCCATTGACATCAAGGTCGGTGTGACCGATGCCATTGCTCAC AAGATCGTCACCGAGCTCGGCTTCTCCGAGCAGTGCGTCGAGGAGGCCAA 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ATCTTCTCCATTGAGGATCTCCAGAGCGCTGCTGAGAAGTCTGTTCAGTT CTCCAAGGTCGTCAAGATGGCCCGCGAGATCGACGTTGGCGTTGAGTTCA CTCTTGGTATCTAAATGTTTAAGCTTGCCCGCAGCAAACCGGTTACGGCA GCTTTGAGGGCTGCGACGGAGTCTTCCGTTCAGTCCCGTGTTGCTCAGCA ACAGAGAAACCTGTCGATTCACGAATACCTGTCTGCGAACCTGCTCAAGT CGTATGGCATCGGCATGCCCAAGGGTGAAGTCGCCCGCTCCGCGGAGGAG GCTGAGGCCGTTGCCAAGTCCCTCGGTAATGACGACATGGTCATCAAGGC CCAGGTTCTTGCTGGTGGTCGTGGTAAGGGTACTTTCGACAATGGCCTTA AGGGTGGTGTGCGCGTGATCTACTCGCCTACCGAGGCCAAGATGTTCGCT AGCCAGATGATCGGACAGAAGCTCATCACCAAGCAGACTGGCGCTGCTGG TCGTCTTTGCAATTCTGTCTACATCTGTGAGCGCAAGTTTGCTCGCCGCG AGTTCTACCTTGCTGTCCTCATGGACCGCGCCTCTCAGAGCCCCGTCATT GTCGCCTCGTCGCAAGGTGGTATGGACATTGAGGCCGTCGCTAAGGAGAA CCCTGAGGCCATCATCACCACTCCCATTGACATCAAGGTCGGTGTGACCG ATGCCATTGCTCACAAGATCGTCACCGAGCTCGGCTTCTCCGAGCAGTGC GTCGAGGAGGCCAAGGACACCATCCAGAAGCTCTACAAGGTCTTCATGGA GAAGGATGCTACCCAGATTGAGATCAACCCTCTGTCTGAGACCTCCGACC ACAAGGTCATGGCCATGGATGCCAAGCTTGGCTTCGATGACAACGCCGAA TTCCGCCAGAAGGAGGTCTTCTCCTGGAGAGACACCACTCAGGAAGATGC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0046872 | metal ion binding |
GO:0003824 | catalytic activity |
GO:0005524 | ATP binding |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG09262GXD |
DBxref | InterPro:IPR011761 |
DBxref | InterPro:IPR017866 |
DBxref | InterPro:IPR005811 |
DBxref | InterPro:IPR013815 |
DBxref | InterPro:IPR016102 |
DBxref | InterPro:IPR013650 |
DBxref | InterPro:IPR005809 |
DBxref | PFAM:PF00549 |
DBxref | PFAM:PF13549 |
DBxref | PFAM:PF08442 |
Product | mitochondrial |
Product | Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch1 | supercontig | ch1:1772251..1774049 + |
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