|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch2:135988..137356+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_001339-T1 ID=KYF_001339-T1|Name=KYF_001339-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1369bp|location=Sequence derived from alignment at ch2:135988..137356+ (Aspergillus niger KYF3) ATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTGTTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGC
CGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCA
CTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTG
GTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGAC
GTGAGTTTTGAATCCAAAGCAGAGAACGAATCGATTCCCGGCTGACCAGT
GTCCGAATTTGCCAGTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGA
CCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATC
AACAAGGACGACTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCAC
CGTCACCTAGTAAGTTGCCTTCTGAGGTAACCTCGAGTATAAGGGAAGAG
AAAATGCTGACAAGAGGATAGCAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCG
TCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAG
GGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGTA
TGCATCGTCCAGGACTACATACATTACTCCCATCGCAAACTAACCATGGA
ATTCCCACAGGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGG
GGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCA
CGTTACCGTAAGTCGCCATCCAGCATCATGATTTTCATCCTTCCACCACT
AATGAATGCTTCAGACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGT
ACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGA
GTCTGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACC
TTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAG
ACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTA
CAACAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCG
GTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTC
CTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTC
CTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACG
GCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGC
GACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGC
TGGTCAGGGTAACCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch2:135988..137356+ >KYF_001339-T1 ID=KYF_001339-T1|Name=KYF_001339-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=5610bp|location=Sequence derived from alignment at ch2:135988..137356+ (Aspergillus niger KYF3) ATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTGTTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGC CGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCA CTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTG GTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGAC TTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTC CCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGG TGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACAC TGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTG AGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGT GTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGA GTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCT GGATTGACCACGTTACCACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTC GGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGG CGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGT ACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTAC AAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACAT CTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCT CCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACC GTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGC CTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCA ACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGC GGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAA CGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTG TTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCC GTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTA CCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCC GTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACT ACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCT GGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCA CCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAAC TCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCG TGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTG CTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACC CTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACGTTACCACTGCCCGCAT TGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCA TCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGAC GGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCAC CTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCC AGGACAACACCTACCTCCACATCTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCG GGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAA CTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTG CTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGC CGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCAC CACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTG CCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAG TACGCTGCTGCTCTCACGGCTGTTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGC TGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTG GTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCT TACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGA CTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGG GTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACC AACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGG TGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTA CCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCC AACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGT CTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTG ACCACGTTACCACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACC GACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTC TGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTG ACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACC TCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTACAA CAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTG GCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTC GAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTC CACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCG GTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGAC ACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGG TCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTGTTGCCG CCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGT TTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTAC CACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCA TTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACG ACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCAT CAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCA CCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAAC AAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCT CCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCA CCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGAC GAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACGTTACCACTGCCCGCATTGGTCG CCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCA ACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCAC CACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAG TGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACA ACACCTACCTCCACATCTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCAC GCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTT CTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCT TCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCC TGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGT CCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCA CCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCT GCTGCTCTCACGGCTGTTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGG TGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTG ATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTC GGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCAC TGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTG CCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTAC GAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACT CGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCG GTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATC ATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGG TGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACG TTACCACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCC GACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTA CTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCT CTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGC CGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTACAACAACTA CTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACG TCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACC GACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTG CGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACC TCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTC CCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGG TAACCTGTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | SECRETED:SignalP(1-19) |
Note | CAZy:PL1 |
Note | CAZy:PL1_4 |
DBxref | InterPro:IPR011050 |
DBxref | InterPro:IPR012334 |
DBxref | InterPro:IPR002022 |
DBxref | PFAM:PF00544 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch2 | supercontig | ch2:135988..137356 + |
|