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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:3078296..3080558- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_005238-T1 ID=KYF_005238-T1|Name=KYF_005238-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=2263bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:3078296..3080558- (Aspergillus niger KYF3) ATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGGTCTGTAT
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ATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTC
TGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTC
CCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACC
GAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTT
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AACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGA
GTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTT
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TTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGT
CGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACC
CCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGT
GAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTA
CGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCA
TGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCAC
ATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCT
GCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCA
AGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATC
CCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGA
CCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCG
TCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTC
TTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAA
GCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACC
TGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGC
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TCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTT
GTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCGTATGTATTCCT
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ACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCG
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GAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAA
GCGTGTTTACTAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:3078296..3080558- >KYF_005238-T1 ID=KYF_005238-T1|Name=KYF_005238-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=11646bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:3078296..3080558- (Aspergillus niger KYF3) TTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCC ACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCAC ACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCG CGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTC CCTTCAAGCGTGTTTACTAGCATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACAT GTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTC ACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTAC GGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTT CGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCT GCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGA CAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGA CCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGG AGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACC GGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCAC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle |
GO:0022900 | electron transport chain |
GO:0055114 | oxidation-reduction process |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0016491 | oxidoreductase activity |
GO:0016627 | oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors |
GO:0050660 | flavin adenine dinucleotide binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR037099 |
DBxref | InterPro:IPR003952 |
DBxref | InterPro:IPR027477 |
DBxref | InterPro:IPR011281 |
DBxref | InterPro:IPR015939 |
DBxref | InterPro:IPR014006 |
DBxref | InterPro:IPR036188 |
DBxref | InterPro:IPR003953 |
DBxref | PFAM:PF02910 |
DBxref | PFAM:PF00890 |
Product | succinate dehydrogenase flavoprotein subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch4 | supercontig | ch4:3078296..3080558 - |
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