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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch5:3264060..3266457- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_007300-T1 ID=KYF_007300-T1|Name=KYF_007300-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=2398bp|location=Sequence derived from alignment at ch5:3264060..3266457- (Aspergillus niger KYF3) ATGCTATGTGAGTGAATACCGCTCCAACCTAGGGATGTCGGCGAGCTCAC
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AACTTACGGACTCTCTGAAGCGTTGCAACTGCCCTGCCCACCCTTGGTGC
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GGCCGGAAGGTAAGTCTCCCAAATGCGGGAACTAAGCAGTCCTATCACTT
ATGCAGCATTTGACGGAGCATTAAACTTCAGGTGATTCTCTTGGGCTCGC
TCTTCCTTTTCCTGATAGGAAGTGTCATTTCCGGTGTCTCGAGGGGCATG
ACCATGCTGATCATAGCGCGTGAGTCATGGTAACTGAATTGATCTCGCCG
GCCTCCACGCTAATACCATTCAAACTCAGGGGCGGTAGCGGGAATCGGTG
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CTTCAGGACAGAGGGAAGTACCAAGGAATTATTGGAATCGTCGTGGCAGC
CGGAACTGCCCTGGGCCCTTTGATTGGCGGTCTTTTCACCGAGAAGATTT
CCTGGAGGTGGTGTTTTGTACGTTCTCTCCGGCATACCTGTTTTGGATGA
CCATCGCTAAGCGTTACCAGTACATCAGTGTGCCCTTATCCGGGGTTGCT
ATGGTCGTTGTTGCCTTTGCCCTACCCCTCCGGAAGGTTGAAGGCCATGC
GTTAGAGAAGATCAAGCAGATTGACGGCTGGGGATGTTTGATCAGTTTCT
CTGCGTCAATTGCGATCTTGCTTCCCATCTCATGGTATGCCCAACAGTTC
TTCCACCCACCCTCAGTATGGTTCCTCCCGGGGTATAATAACCACTCGCA
ATTTATTAGGGCTGGCACCCAGTATTCTTGGACTTCGGCGGCTGTTATAG
CGCCGCTTTTACTCGGTGTAGCGCTCATTGGAGTCTTTCTCTTTGTCGAG
TTCAAAGTGGCCAGGTTGCCCTTGTAAGTTATGCCTTGGTTAACGAAGAT
CACCAGTTATTGCGTGTAACACTGACCCTTCCCTGCAGGATTCCACGTTA
GTACTCGCCGCCTCTTCTACCATCGTTCGCCGTTGTTCTTGCATGGCTGA
TCTCTTCTCAGTGCATATGTTCAAAAACTCGCACGTCTCCATCTGTATCC
TGACATCCTTCCTCACCGGATTCATGACTTTTGTTAACCTCTACTATGTT
GGGTTTCCCCCAGGTCTTCTTCTATGTTTCCATCTCATACTAACATCCCG
CCTCAGCTGCCTCAGTTTTATCAAGTCGCCCGGGGCGACTCCGCGCTCCG
GTCGGGTATCCTGATTCTTCCACTTATCCTCTCGCAGATTGTCACATCAT
TTACCTCGGGCTTCCTGGTGTCGAAGTATTCATGTTATCGAATCAACCTA
ATTGTCGGTTATGCTCTTTGGACAATTGCGTCGGGGTTGTTCACGATGGT
CACTCCATCAACGTCGGCAGCGGTACTGGTGGTCTTCCAGCTACTGACGG
GGCTCGGCAGTGGGCAGACACTTCAGACAACCTTGGTTGCTATTCAAGCC
GCAGTCAAGAGGGAAGAGATGGCGGTTATCACTGGTGCTCGTAATTATCT
ACGAATGATGGGCTCGACTTTGGCTGTTGCAGCCAGTGCGGCTATTGTCA
ACAACATTGTCCGGTGAGTGAAAATTCATTTGCGTTTACCCGAGCATCAC
TGCCTAGCTTTTCTGGTTTTCTTTCTCCCTTAGCACTTCGCTCCCAGGTA
AGCTTTGTTGACAGGGTTTGATAGGACGAAGCTCGAAGCAATCAACTTTC
CGCGATCAATCATTTCCGAAATCATCGCCGATCCCACAAAAATTGCCTCC
ATGTCACTATCCGCGGCACAAAAAACGGACGCACTAAATGCGTACGGTGC
GTTGCCCCTCACCTCCATCGTGCTTTACCCACCTTCTTCATTTACATCCT
AACCAACCATATGTCCAACGTCTTCTGTTTGGCGGACCGGCTCAATGACT
AATTCTTTGCTGAGACAGCCCACGGAGTGCAGGTCACATATTATATGATG
ACTGCCCTAGCCGGCATTCAATTCTTTCTCTGCGTTTTCTTCGTCAAGGA
CTACACATTGAAGAGAGACGATGATCAACAGAAAAAGGAGGCTGCTAGAG
CTTGGCTGATGCAAAAAAAGAACAAGAGGGCGGGCGGTAACCACAATGCA
GAACCATCACCTGCTGAAGCCCGACAGCACGTTGAGGACAAGGTCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch5:3264060..3266457- >KYF_007300-T1 ID=KYF_007300-T1|Name=KYF_007300-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=18150bp|location=Sequence derived from alignment at ch5:3264060..3266457- (Aspergillus niger KYF3) CCCACGGAGTGCAGGTCACATATTATATGATGACTGCCCTAGCCGGCATT CAATTCTTTCTCTGCGTTTTCTTCGTCAAGGACTACACATTGAAGAGAGA CGATGATCAACAGAAAAAGGAGGCTGCTAGAGCTTGGCTGATGCAAAAAA AGAACAAGAGGGCGGGCGGTAACCACAATGCAGAACCATCACCTGCTGAA GCCCGACAGCACGTTGAGGACAAGGTCTAAGACGAAGCTCGAAGCAATCA ACTTTCCGCGATCAATCATTTCCGAAATCATCGCCGATCCCACAAAAATT GCCTCCATGTCACTATCCGCGGCACAAAAAACGGACGCACTAAATGCGTA CGCTGCCTCAGTTTTATCAAGTCGCCCGGGGCGACTCCGCGCTCCGGTCG GGTATCCTGATTCTTCCACTTATCCTCTCGCAGATTGTCACATCATTTAC CTCGGGCTTCCTGGTGTCGAAGTATTCATGTTATCGAATCAACCTAATTG TCGGTTATGCTCTTTGGACAATTGCGTCGGGGTTGTTCACGATGGTCACT CCATCAACGTCGGCAGCGGTACTGGTGGTCTTCCAGCTACTGACGGGGCT CGGCAGTGGGCAGACACTTCAGACAACCTTGGTTGCTATTCAAGCCGCAG 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ACGGACATCTTTGGCCGGAAGGCTCGATGCTCAACCAGACTATATGCTAT CCCACGGAGTGCAGGTCACATATTATATGATGACTGCCCTAGCCGGCATT CAATTCTTTCTCTGCGTTTTCTTCGTCAAGGACTACACATTGAAGAGAGA CGATGATCAACAGAAAAAGGAGGCTGCTAGAGCTTGGCTGATGCAAAAAA AGAACAAGAGGGCGGGCGGTAACCACAATGCAGAACCATCACCTGCTGAA GCCCGACAGCACGTTGAGGACAAGGTCTAAGACGAAGCTCGAAGCAATCA ACTTTCCGCGATCAATCATTTCCGAAATCATCGCCGATCCCACAAAAATT GCCTCCATGTCACTATCCGCGGCACAAAAAACGGACGCACTAAATGCGTA CGCTGCCTCAGTTTTATCAAGTCGCCCGGGGCGACTCCGCGCTCCGGTCG GGTATCCTGATTCTTCCACTTATCCTCTCGCAGATTGTCACATCATTTAC CTCGGGCTTCCTGGTGTCGAAGTATTCATGTTATCGAATCAACCTAATTG TCGGTTATGCTCTTTGGACAATTGCGTCGGGGTTGTTCACGATGGTCACT CCATCAACGTCGGCAGCGGTACTGGTGGTCTTCCAGCTACTGACGGGGCT CGGCAGTGGGCAGACACTTCAGACAACCTTGGTTGCTATTCAAGCCGCAG TCAAGAGGGAAGAGATGGCGGTTATCACTGGTGCTCGTAATTATCTACGA ATGATGGGCTCGACTTTGGCTGTTGCAGCCAGTGCGGCTATTGTCAACAA CATTGTCCGTGCATATGTTCAAAAACTCGCACGTCTCCATCTGTATCCTG ACATCCTTCCTCACCGGATTCATGACTTTTGTTAACCTCTACTATGATTC CACTACATCAGTGTGCCCTTATCCGGGGTTGCTATGGTCGTTGTTGCCTT 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CAATTCTTTCTCTGCGTTTTCTTCGTCAAGGACTACACATTGAAGAGAGA CGATGATCAACAGAAAAAGGAGGCTGCTAGAGCTTGGCTGATGCAAAAAA AGAACAAGAGGGCGGGCGGTAACCACAATGCAGAACCATCACCTGCTGAA GCCCGACAGCACGTTGAGGACAAGGTCTAAGACGAAGCTCGAAGCAATCA ACTTTCCGCGATCAATCATTTCCGAAATCATCGCCGATCCCACAAAAATT GCCTCCATGTCACTATCCGCGGCACAAAAAACGGACGCACTAAATGCGTA CGCTGCCTCAGTTTTATCAAGTCGCCCGGGGCGACTCCGCGCTCCGGTCG GGTATCCTGATTCTTCCACTTATCCTCTCGCAGATTGTCACATCATTTAC CTCGGGCTTCCTGGTGTCGAAGTATTCATGTTATCGAATCAACCTAATTG TCGGTTATGCTCTTTGGACAATTGCGTCGGGGTTGTTCACGATGGTCACT CCATCAACGTCGGCAGCGGTACTGGTGGTCTTCCAGCTACTGACGGGGCT CGGCAGTGGGCAGACACTTCAGACAACCTTGGTTGCTATTCAAGCCGCAG TCAAGAGGGAAGAGATGGCGGTTATCACTGGTGCTCGTAATTATCTACGA ATGATGGGCTCGACTTTGGCTGTTGCAGCCAGTGCGGCTATTGTCAACAA CATTGTCCGTGCATATGTTCAAAAACTCGCACGTCTCCATCTGTATCCTG ACATCCTTCCTCACCGGATTCATGACTTTTGTTAACCTCTACTATGATTC CACTACATCAGTGTGCCCTTATCCGGGGTTGCTATGGTCGTTGTTGCCTT TGCCCTACCCCTCCGGAAGGTTGAAGGCCATGCGTTAGAGAAGATCAAGC AGATTGACGGCTGGGGATGTTTGATCAGTTTCTCTGCGTCAATTGCGATC TTGCTTCCCATCTCATGGTATGCCCAACAGTTCTTCCACCCACCCTCAGT ATGGTTCCTCCCGGGGTATAATAACCACTCGCAATTTATTAGGGCTGGCA CCCAGTATTCTTGGACTTCGGCGGCTGTTATAGCGCCGCTTTTACTCGGT GTAGCGCTCATTGGAGTCTTTCTCTTTGTCGAGTTCAAAGTGGCCAGGTT GCCCTTGGGCGGTAGCGGGAATCGGTGGTGGAGGCATTGTTACCGTGGTC AGTATCGTCGTGTCTGACGTCGTGTCTCTTCAGGACAGAGGGAAGTACCA AGGAATTATTGGAATCGTCGTGGCAGCCGGAACTGCCCTGGGCCCTTTGA TTGGCGGTCTTTTCACCGAGAAGATTTCCTGGAGGTGGTGTTTTGTGATT CTCTTGGGCTCGCTCTTCCTTTTCCTGATAGGAAGTGTCATTTCCGGTGT CTCGAGGGGCATGACCATGCTGATCATAGCGCCGTTGCAACTGCCCTGCC CACCCTTGGTGCTGTATTCAATCAAGCTGATATCGTTTCCTGGGTTGGTA CAGCGTACCTCCTAACTTGTACGGCATGTCAACCACTATATGGCCGGTTG ACGGACATCTTTGGCCGGAAGGCTCGATGCTCAACCAGACTATATGCTAT CCCACGGAGTGCAGGTCACATATTATATGATGACTGCCCTAGCCGGCATT CAATTCTTTCTCTGCGTTTTCTTCGTCAAGGACTACACATTGAAGAGAGA CGATGATCAACAGAAAAAGGAGGCTGCTAGAGCTTGGCTGATGCAAAAAA AGAACAAGAGGGCGGGCGGTAACCACAATGCAGAACCATCACCTGCTGAA GCCCGACAGCACGTTGAGGACAAGGTCTAAGACGAAGCTCGAAGCAATCA ACTTTCCGCGATCAATCATTTCCGAAATCATCGCCGATCCCACAAAAATT 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AGTATCGTCGTGTCTGACGTCGTGTCTCTTCAGGACAGAGGGAAGTACCA AGGAATTATTGGAATCGTCGTGGCAGCCGGAACTGCCCTGGGCCCTTTGA TTGGCGGTCTTTTCACCGAGAAGATTTCCTGGAGGTGGTGTTTTGTGATT CTCTTGGGCTCGCTCTTCCTTTTCCTGATAGGAAGTGTCATTTCCGGTGT CTCGAGGGGCATGACCATGCTGATCATAGCGCCGTTGCAACTGCCCTGCC CACCCTTGGTGCTGTATTCAATCAAGCTGATATCGTTTCCTGGGTTGGTA CAGCGTACCTCCTAACTTGTACGGCATGTCAACCACTATATGGCCGGTTG ACGGACATCTTTGGCCGGAAGGCTCGATGCTCAACCAGACTATATGCTAT back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0005887 | integral component of plasma membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR036259 |
DBxref | InterPro:IPR020846 |
DBxref | InterPro:IPR011701 |
DBxref | PFAM:PF07690 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch5 | supercontig | ch5:3264060..3266457 - |
|