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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch6:1260511..1262223- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_007661-T1 ID=KYF_007661-T1|Name=KYF_007661-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1713bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:1260511..1262223- (Aspergillus niger KYF3) ATGAGCGGACGTGAGTCTTGCACGCGATCGCTGCCATCTCCGCGACAGCG
TTCCATCCTTTACCTCAATGGATCAGCAAATGCTGATACTCGATTCTAGT
CCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGG
CCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGG
GTACGTGATACTTGTCCAGCTCGACATGAGCTTCTAAGCTAATGGATTAC
CCCTGCAGTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTG
TACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTAT
GATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCA
TCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGGTATGTAATGGGGAAATTGCAATC
TGATCACGGATATCGGGCATTTGCTAATATGTGGCTTTTGTCTGATAGCT
TCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACC
GTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTC
GGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGA
CCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTG
GCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTT
GGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGT
CTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGT
TTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGAC
AAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACAT
CATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCC
AGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATG
CGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCAT
GCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGT
ACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAG
CCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTA
CATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACA
CCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAG
ACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCT
CAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACA
AGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGC
ATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGG
TACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACGTAAGTCTTCACTTTGGTCTCAGATT
TTCTGAAGTGGATACTAACATTCAAATGCAGGATTATATACGGATACTTT
GAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGT
TCCGGGTAACTAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch6:1260511..1262223- >KYF_007661-T1 ID=KYF_007661-T1|Name=KYF_007661-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=7185bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:1260511..1262223- (Aspergillus niger KYF3) GATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGAT CGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCGCTGGTACCCAC CTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGAC CGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCT ACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATC TGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCT GCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTC TGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCT CCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCAT TGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCC GCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCT ACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGA GATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTG TTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTG TGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGA CAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTG CCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTG AACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCAC CTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTT CCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTC GTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGT CATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCG TCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTT GCCGTTACTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTG TACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTAT GATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCA TCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGC CCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCC TTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGATGAGCGGACGATTATATACGGA TACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGG CCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCA ACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTC TTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGG TCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGA TTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTG CTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGAC CAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCA ACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCAC CTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTA CCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTT TCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAG TCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTA CACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCT TCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTC AAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGC CGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGG CCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTGGTT GCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCC CCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTC ACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCT GCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCT GCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACTTGAC CCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTACGGAATTGTCT CCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGT AACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCATCATCTCCTCTGG CATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCT CCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGT TGATGTGGACGGGGATGAGCGGACGATTATATACGGATACTTTGAAATTG CCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGT AACTAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAA GACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCC TGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAG CCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGT CGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCT ATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAG TCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGG TCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCT GGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTC CCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGAT CTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGC GTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATG 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GGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTG GTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTG GTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAG CGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGA AGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAG GGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCA GCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGA ACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGC TTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGG TTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTC AGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCT CGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCG TGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGT CTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCC GTTTACATCACCTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTG GATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGG ACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAG CTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGG TGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTG GTATCCTCCTTGCCGTTACTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCC AGATGCCCTTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTAC TGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGG TATCACCCCCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGA TCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAA CCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGATGAGCGGACGA TTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCG GGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCGCTGGTACCCACCT CATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCG CTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTAC GTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTG TGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGC TGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTG TTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCC TACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTG CCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGC GAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTAC TCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGA TCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTT CGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTG CTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACA ACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCC CAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAA CTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCT TCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCC GGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGT GATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCA TCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTC GCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGC CGTTACTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTA CGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGA TGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCATC ATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCC TTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTT CAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGATGAGCGGAC back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0015031 | protein transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG092620E4 |
DBxref | InterPro:IPR030659 |
DBxref | InterPro:IPR019561 |
DBxref | InterPro:IPR002208 |
DBxref | InterPro:IPR023201 |
DBxref | PFAM:PF00344 |
DBxref | PFAM:PF10559 |
Product | translocon subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch6 | supercontig | ch6:1260511..1262223 - |
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