You are here

KYF_008074-T1, KYF_008074-T1 (mRNA) Aspergillus niger KYF3

Overview
NameKYF_008074-T1
Unique NameKYF_008074-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger KYF3
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at ch6:2616515..2617509+

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>KYF_008074-T1 ID=KYF_008074-T1|Name=KYF_008074-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=995bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:2616515..2617509+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGGTGAGTTAATCGGATCCTTCCCT TTCGTGTTCATATCAGCTTGTATACACATGTTCGCGTGGCTAACTCTTTA TTCTTCATTTTTGAGTAGCAAAACCTCGTAAGTTACTGACGATACATGTT TCACTCGCGCGTCAAACCTGACAATATCCTCAGATCAACTACCGGATGAG AGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCG ATAAGGTATATATTTCTGGGTCTTTCAGTGGCCATCGGATAACACTTGTG GTCGGCTGGTCGCTGATGCAGAATTATAGCACATGAACCTTGTCCTCGCC GATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGG TTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCC TTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCT CCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGC TGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTG GACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGC CCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTT CCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTG GACCTCGTAAGTTTGCACTTTCGAGCTCGATGTTGAACTTGGTTACTGAC TTAGGATATTAGCTGGCTTCGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGT GCTCCTCGTAAGTATCCTTGAATGGCGTGTTATGGTTATAGAGCTAACTG ATGCTGTTGTAGCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCT GGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at ch6:2616515..2617509+

>KYF_008074-T1 ID=KYF_008074-T1|Name=KYF_008074-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=3978bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:2616515..2617509+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGCAAAACCTCATCAACTACCGGAT
GAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTT
TCGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGC
GTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGT
TGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACAC
ATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCC
CGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGC
TGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCC
TGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGT
TTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGG
CTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTCGCTCCTC
CCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCCCA
CCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTT
TGGTGGACGGTGAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGCAAAACCTCA
TCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGA
CAGATGCTCGCTTTCGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGA
AGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCA
ACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATT
GTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCTGC
CGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAG
CTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGT
CTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCC
GCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAG
TGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCT
GGCTTCGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGTGC
CTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCC
CTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAG
ATGCAAAACCTCATCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCG
ACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGCACATGAACCTTGTCC
TCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCC
GCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCT
GGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATG
GACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGC
GCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACC
CGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTG
GTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGT
AGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCC
TGGTGGACCTCCTGGCTTCGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTG
CTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAA
GGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGAATGGCGGCTAA
TAAGCAGGGCAAGATGCAAAACCTCATCAACTACCGGATGAGAGTCACCC
TCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGCAC
ATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAA
GTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAG
AAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCT
TGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGC
TGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTG
GAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCT
GCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTT
CCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTC
GTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTCGCTCCTCCCCCGGGATTC
GCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCA
GCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGT
GAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGCAAAACCTCATCAACTACCGG
ATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGC
TTTCGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTC
GCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTT
GTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTAC
ACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTG
CCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTC
GCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGG
CCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCG
GTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCG
GGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTCGCTCC
TCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCC
CACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGC
TTTGGTGGACGGTGAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGCAAAACCT
CATCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGG
GACAGATGCTCGCTTTCGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACA
GAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGAC
CAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCA
TTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCT
GCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGC
AGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTG
GTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCC
CCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGG
AGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTC
CTGGCTTCGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGT
GCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATT
CCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGA
back to top
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_008074KYF_008074Aspergillus niger KYF3gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_008074-T1KYF_008074-T1-proteinAspergillus niger KYF3polypeptide


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_008074-T1.exon1KYF_008074-T1.exon1Aspergillus niger KYF3exon
KYF_008074-T1.exon2KYF_008074-T1.exon2Aspergillus niger KYF3exon
KYF_008074-T1.exon3KYF_008074-T1.exon3Aspergillus niger KYF3exon
KYF_008074-T1.exon4KYF_008074-T1.exon4Aspergillus niger KYF3exon
KYF_008074-T1.exon5KYF_008074-T1.exon5Aspergillus niger KYF3exon
KYF_008074-T1.exon6KYF_008074-T1.exon6Aspergillus niger KYF3exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_008074-T1.cdsKYF_008074-T1.cdsAspergillus niger KYF3CDS


Properties
Property NameValue
DBxrefInterPro:IPR010920
DBxrefInterPro:IPR001163
DBxrefPFAM:PF01423
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Aspergillus Aspergillus niger KYF32020-10-09
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
ch6supercontigch6:2616515..2617509 +