|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch6:3271967..3273144- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_008308-T1 ID=KYF_008308-T1|Name=KYF_008308-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1178bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:3271967..3273144- (Aspergillus niger KYF3) ATGCTGTACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATCTCGAG
CTCCAATGCCTCGGTCGCCCGCTCGGCCCTGTCCAACAATGTCTTCAAGG
CTCCCTTGACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCTCTCCC
AGCCTCGCTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTCCGCTA
TGCCTCCACGTCGGCTAAGGTGAGATTGAACTGAAGCAAACTGAGTACTA
TAATTGAGTCAATTGCTGATCAAAGAACCACAGGAAGGCGAGGAGCCCGA
CATGATGGCCGGTATCAAGACCGAGGCTGTATGTGTTTTCCATTCTTCCC
CAGATATCGCTTCCTCTGCGGGGCAATCTAGCCTCTCGGCGGCACATCTG
GGACCCAATGCGCTAATGAGTCTCTTTCCGATGTATAGAAAGTCATCAAG
GACACCTTCAGCCTGGAGGCCGTCCCCAAGGAGGCCCTCTACCTCGGAAT
GGCCGGTGTCATCCCCTACGTCGCTACTTCCCTGCAGACCGTCGCCCTCG
CCTATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGTCTGATCTTCTCC
GGCCAGAGCGCCGAGTTGATGCTGCACATGATCGAGCCCATCCAGGTCGG
CTACGGTGCTGTTGTAAGTAACCCATGAGCCATCTTGAAACCCTTCAACA
ATCCCCCCTGCCCAAGGAGAAACCCTCAAAAGCTAATCAACTTAAACAAT
AACAGATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCACTGGGGTCTCGAGTGGGCC
GGCTACGGCGGCAAGTACGGCTACAAGCGCTACGCTGCCGGTGTTATCGC
CCCTGCCGTCGCCTGGCCCACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTATGCCCTGA
TCTCTCAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTACTACAACGACGCTCGTGCC
GCTGCTTCCGGCCGCGCCCCCGCCTGGTACGGCATGTACCGCTTCGTCCT
CACCTTCATCGTCGGTGCTAGCATTGTTGCCAGCTTGATCGGCCGCGAGC
AGATCGCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACACCATCAAGGACAAGATCAAC
GCTCTGATCTTCCTGCAGAAGAAGGAGAAGGAGGAGGTTGAGGCCCGTCG
TCGTGCCGAGCTCGAGGATGCTGAGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch6:3271967..3273144- >KYF_008308-T1 ID=KYF_008308-T1|Name=KYF_008308-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=3648bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:3271967..3273144- (Aspergillus niger KYF3) ATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCACTGGGGTCTCGAGTGGGCCGGCTA CGGCGGCAAGTACGGCTACAAGCGCTACGCTGCCGGTGTTATCGCCCCTG CCGTCGCCTGGCCCACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTATGCCCTGATCTCT CAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTACTACAACGACGCTCGTGCCGCTGC TTCCGGCCGCGCCCCCGCCTGGTACGGCATGTACCGCTTCGTCCTCACCT TCATCGTCGGTGCTAGCATTGTTGCCAGCTTGATCGGCCGCGAGCAGATC GCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACACCATCAAGGACAAGATCAACGCTCT GATCTTCCTGCAGAAGAAGGAGAAGGAGGAGGTTGAGGCCCGTCGTCGTG CCGAGCTCGAGGATGCTGAGTAAAAAGTCATCAAGGACACCTTCAGCCTG GAGGCCGTCCCCAAGGAGGCCCTCTACCTCGGAATGGCCGGTGTCATCCC CTACGTCGCTACTTCCCTGCAGACCGTCGCCCTCGCCTATGAGGTCAAGA CCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGTCTGATCTTCTCCGGCCAGAGCGCCGAG TTGATGCTGCACATGATCGAGCCCATCCAGGTCGGCTACGGTGCTGTTGA AGGCGAGGAGCCCGACATGATGGCCGGTATCAAGACCGAGGCTATGCTGT ACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATCTCGAGCTCCAAT GCCTCGGTCGCCCGCTCGGCCCTGTCCAACAATGTCTTCAAGGCTCCCTT GACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCTCTCCCAGCCTCG CTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTCCGCTATGCCTCC ACGTCGGCTAAGATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCACTGGGGTCTCGA GTGGGCCGGCTACGGCGGCAAGTACGGCTACAAGCGCTACGCTGCCGGTG TTATCGCCCCTGCCGTCGCCTGGCCCACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTAT GCCCTGATCTCTCAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTACTACAACGACGC TCGTGCCGCTGCTTCCGGCCGCGCCCCCGCCTGGTACGGCATGTACCGCT TCGTCCTCACCTTCATCGTCGGTGCTAGCATTGTTGCCAGCTTGATCGGC CGCGAGCAGATCGCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACACCATCAAGGACAA GATCAACGCTCTGATCTTCCTGCAGAAGAAGGAGAAGGAGGAGGTTGAGG CCCGTCGTCGTGCCGAGCTCGAGGATGCTGAGTAAAAAGTCATCAAGGAC ACCTTCAGCCTGGAGGCCGTCCCCAAGGAGGCCCTCTACCTCGGAATGGC CGGTGTCATCCCCTACGTCGCTACTTCCCTGCAGACCGTCGCCCTCGCCT ATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGTCTGATCTTCTCCGGC CAGAGCGCCGAGTTGATGCTGCACATGATCGAGCCCATCCAGGTCGGCTA CGGTGCTGTTGAAGGCGAGGAGCCCGACATGATGGCCGGTATCAAGACCG AGGCTATGCTGTACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATC TCGAGCTCCAATGCCTCGGTCGCCCGCTCGGCCCTGTCCAACAATGTCTT CAAGGCTCCCTTGACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCT CTCCCAGCCTCGCTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTC CGCTATGCCTCCACGTCGGCTAAGATCCTCTCCTTCCTCGGTGCCATCCA CTGGGGTCTCGAGTGGGCCGGCTACGGCGGCAAGTACGGCTACAAGCGCT ACGCTGCCGGTGTTATCGCCCCTGCCGTCGCCTGGCCCACCCTGCTGCTC CCCGTTGAGTATGCCCTGATCTCTCAGTTCCTTGCCTTCACCTTCCTGTA CTACAACGACGCTCGTGCCGCTGCTTCCGGCCGCGCCCCCGCCTGGTACG GCATGTACCGCTTCGTCCTCACCTTCATCGTCGGTGCTAGCATTGTTGCC AGCTTGATCGGCCGCGAGCAGATCGCTGGTACCCTCAGCACTGAGCACAC CATCAAGGACAAGATCAACGCTCTGATCTTCCTGCAGAAGAAGGAGAAGG AGGAGGTTGAGGCCCGTCGTCGTGCCGAGCTCGAGGATGCTGAGTAAAAA GTCATCAAGGACACCTTCAGCCTGGAGGCCGTCCCCAAGGAGGCCCTCTA CCTCGGAATGGCCGGTGTCATCCCCTACGTCGCTACTTCCCTGCAGACCG TCGCCCTCGCCTATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCCGGTGATGGTCTG ATCTTCTCCGGCCAGAGCGCCGAGTTGATGCTGCACATGATCGAGCCCAT CCAGGTCGGCTACGGTGCTGTTGAAGGCGAGGAGCCCGACATGATGGCCG GTATCAAGACCGAGGCTATGCTGTACAGAACCACTGCTGCCCGCTCTGTC CTCAGGGCTATCTCGAGCTCCAATGCCTCGGTCGCCCGCTCGGCCCTGTC CAACAATGTCTTCAAGGCTCCCTTGACCTCTTCCGCTCGTTTTCCCGCTC GCCCGACCACCTCTCCCAGCCTCGCTCTGGCTGCTCGCAAGCCCGTCACC ACCGCTCTTGTCCGCTATGCCTCCACGTCGGCTAAGATCCTCTCCTTCCT CGGTGCCATCCACTGGGGTCTCGAGTGGGCCGGCTACGGCGGCAAGTACG GCTACAAGCGCTACGCTGCCGGTGTTATCGCCCCTGCCGTCGCCTGGCCC ACCCTGCTGCTCCCCGTTGAGTATGCCCTGATCTCTCAGTTCCTTGCCTT CACCTTCCTGTACTACAACGACGCTCGTGCCGCTGCTTCCGGCCGCGCCC CCGCCTGGTACGGCATGTACCGCTTCGTCCTCACCTTCATCGTCGGTGCT AGCATTGTTGCCAGCTTGATCGGCCGCGAGCAGATCGCTGGTACCCTCAG CACTGAGCACACCATCAAGGACAAGATCAACGCTCTGATCTTCCTGCAGA AGAAGGAGAAGGAGGAGGTTGAGGCCCGTCGTCGTGCCGAGCTCGAGGAT GCTGAGTAAAAAGTCATCAAGGACACCTTCAGCCTGGAGGCCGTCCCCAA GGAGGCCCTCTACCTCGGAATGGCCGGTGTCATCCCCTACGTCGCTACTT CCCTGCAGACCGTCGCCCTCGCCTATGAGGTCAAGACCGCTGCTTTGGCC GGTGATGGTCTGATCTTCTCCGGCCAGAGCGCCGAGTTGATGCTGCACAT GATCGAGCCCATCCAGGTCGGCTACGGTGCTGTTGAAGGCGAGGAGCCCG ACATGATGGCCGGTATCAAGACCGAGGCTATGCTGTACAGAACCACTGCT GCCCGCTCTGTCCTCAGGGCTATCTCGAGCTCCAATGCCTCGGTCGCCCG CTCGGCCCTGTCCAACAATGTCTTCAAGGCTCCCTTGACCTCTTCCGCTC GTTTTCCCGCTCGCCCGACCACCTCTCCCAGCCTCGCTCTGGCTGCTCGC AAGCCCGTCACCACCGCTCTTGTCCGCTATGCCTCCACGTCGGCTAAG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR021836 |
DBxref | PFAM:PF11911 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch6 | supercontig | ch6:3271967..3273144 - |
|