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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch6:4308019..4310208- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_008590-T1 ID=KYF_008590-T1|Name=KYF_008590-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=2190bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:4308019..4310208- (Aspergillus niger KYF3) ATGGCGATCACGCAGAGGCGAATTTCCCTGGCGATAGAGGTAGTTGCGGG
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GCAGTGCGCCATCGTTGCGACAGCATTCAAAATCCTTTTGTTCCCCGCAT
AGTACGTTTGCCCGCAAATGGTCTAGAACAGCACCGCGAGGTTGCAGAAC
TCACAGCTGAATTGTGGCTGGAACGTGCAGCAAATCCACCGATTTTGAGG
TCCATCGAAACTGGCTCGCAATTACACACTCGTTGCCGGTCAAGGAATGG
TACTACGAGGTACGTACTCGCCAGCGCATACCGTTTCAAGCGTGCATAAT
ACTAAATTGCGCGAATCCGGTTAGAAAACGTCGGAATGGACTCTCGACTA
CCCTCCCTTCTTCGCGGCATTCGAATGGGTACTCTCCCAGGCGGCACGTT
ATGCGGATCCGGCGATGTTGATTGTCAACAACCTCAATCATGATTCATGG
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AACAAACACCTTGCGCACATCGCCAGCCTGTCCATCTTTCTGTCGCCCGG
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GCATCTTGATTCTTTCAATCGTTTTGGCACGGAAGCAGTCGACTCTTCTC
TACAGTGGGATCAGCTTCGCGGTTTTGCTGTGCCTGAAGCACATCTATCT
GTACCTTGCCTTGGCATACTTCGTCTACTTGCTGAGGGTCTACTGTCTGG
ATCCGAAGTCAATTTTCCGCCCTCGGTTCTTTAACATTATCAAGCTCGGC
GTGTGCGTGGTTGGCGTCTTTGCCTTGGCTTTCGGGCCGTTCGCCTCCTG
GGGTCAACTGCTTCAATTGAAGGACAGGCTCTTCCCCTTTTCTCGAGGGT
TGTGCCATGCATACTGGGCACCCAACGTGTGGGCGATGTACTCCTTTACT
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GTTCAGAGGCACTAAATAATGCAGTTGCTCCGCGGTTGGGCCTTCCGGTT
AACCAGGACGCCCTGGTTAGCGTCACTCGTGGTCTTGTGGGAGACACGTC
ATTCGCCGTACTGCCTGAGGTCACCAAGGAGCACACTTTTATCTTGACCT
TCTTGTTCCAGTTGGTAAGTGCTTAGTTTTTATTGAATCCGGCAGACAAT
CCTAACGGTTACTAGCTCCCGTTGATTAAGCTCTGGCGCAACCCTGAATG
GGAGACTTTCGTTGGTGCCATCACCCTGTGCGGATATGCATCGTTCCTGT
TCGGCTGGCATGTCCATGAGAAAGCGGTACTTCTGATCATCATCCCGTTC
AGTCTCATCGCGCTCAAAGACCGGCGGTACTTTAGCGCGTTCCGCCCCCT
GGCTGTAGCCGGACACGTCTCTTTGTTCCCCTTACTCTTTACCGCCGCCG
AATTCCCGATCAAAACGGTCTACACAGTCCTGTGGCTCGTGCTGTTCCTC
TACGTATTTGATCAGGTGGCACCTGTCTCCGAGCGGCGCCGGATCTTCGT
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TTCCTGCCCCTGATGTTCATGAGCAGTTACTCTGCAGTCGGGGTGGTGGG
TAGTTGGATTGGATTTATGGTAGTTTACTTTACAGCATGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch6:4308019..4310208- >KYF_008590-T1 ID=KYF_008590-T1|Name=KYF_008590-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=12201bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:4308019..4310208- (Aspergillus niger KYF3) CTCCCGTTGATTAAGCTCTGGCGCAACCCTGAATGGGAGACTTTCGTTGG TGCCATCACCCTGTGCGGATATGCATCGTTCCTGTTCGGCTGGCATGTCC ATGAGAAAGCGGTACTTCTGATCATCATCCCGTTCAGTCTCATCGCGCTC AAAGACCGGCGGTACTTTAGCGCGTTCCGCCCCCTGGCTGTAGCCGGACA CGTCTCTTTGTTCCCCTTACTCTTTACCGCCGCCGAATTCCCGATCAAAA CGGTCTACACAGTCCTGTGGCTCGTGCTGTTCCTCTACGTATTTGATCAG GTGGCACCTGTCTCCGAGCGGCGCCGGATCTTCGTCGCCGATCGGTTCTC TTTACTGTACCTTACTATTGCCATTCCGCTGATCATCTACTGCTCCCTCC TTCACCAGCTCATTTTCGGACTGGAGCGGTTGCAATTCCTGCCCCTGATG TTCATGAGCAGTTACTCTGCAGTCGGGGTGGTGGGTAGTTGGATTGGATT TATGGTAGTTTACTTTACAGCATGATTGCTCCGCGGTTGGGCCTTCCGGT TAACCAGGACGCCCTGGTTAGCGTCACTCGTGGTCTTGTGGGAGACACGT CATTCGCCGTACTGCCTGAGGTCACCAAGGAGCACACTTTTATCTTGACC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0016758 | transferase activity, transferring hexosyl groups |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | CAZy:GT57 |
DBxref | InterPro:IPR004856 |
DBxref | PFAM:PF03155 |
Product | glycosyl transferase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch6 | supercontig | ch6:4308019..4310208 - |
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