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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch8:2827787..2829788+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_010956-T1 ID=KYF_010956-T1|Name=KYF_010956-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=2002bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:2827787..2829788+ (Aspergillus niger KYF3) ATGCGTGAGATCGTATGTTTGCCCTCCCCGTCCCTCGTCCGTCAGGAGAC
GCGTCGTTGGTTGGCATCTCTTTTGCTCGGGACCCCACCGGTTCTTCGAC
CAACTCATTCTTGTGCTAACTGCATGTCTTCTTCGCTTCATAGGTTCACC
TCCAAACCGGCCAGTGTGTAAGTGCCAATATATGCTTCGGATGATTGCCC
CCAAGGGTCTTGATTGGTGTTTGGTGGACTAAACAATATATCATGGTGGT
TAGGGTAACCAAATTGGTGCTGCTTTCTGGTACGTATACAACTGCCATTG
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GTTGTCCATTAGGTACATGCTATCGGTCTAAGAACACGTCTAACAATTCA
ACAGGCAGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGCTCCGGTGTGTAA
GTGCAACTTTTTCACACCTCTCAATTGGTCAACAATGGGCAAAGGGTTGG
GTCTTCTGACACGCAGGATAGTTACAATGGCACCTCCGACCTCCAGCTGG
AGCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGTGAGATCCATCGGACCTTGGCTT
TTTCACGACAATATCATCAATGTCCTAATCACTTCAGCAGGCTAGCGGTA
ACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTACCATG
GACGCCGTCCGTGCCGGTCCTTTCGGCCAGCTCTTCCGCCCCGACAACTT
CGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACA
CTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTGTCGACGTTGTCCGCCGTGAG
GCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGG
TGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATCCGTG
AGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCCC
AAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCCA
CCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGTAT
GATTCCAGACCCAGCACAAGTGAGAAGAAGATTGGTGCTCGAGAACTAAC
GAATTGGCCAATCTAGGCTCTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGC
TCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATG
TCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCT
TCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCA
TGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCC
GTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGAT
GGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCT
TGTGAGTTTTCCTACTGCATCGATTGCACAATATGCCAGCTAACAGGTAT
CTAGCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAAC
ATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACAT
CCAGACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCA
CCTTCATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGT
GATCAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACAC
TGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGA
ACGACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGAG
GGTGAGGAGGAATAGTAAGTCCACCCAAGAACCTATTGTTTCTGTTTTGG
TTCTAACCAATTCTACAGCGTCGAGGAGGAGCCCCTTGAGGCTGAGGAGT
AA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch8:2827787..2829788+ >KYF_010956-T1 ID=KYF_010956-T1|Name=KYF_010956-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=12096bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:2827787..2829788+ (Aspergillus niger KYF3) ATGCGTGAGATCGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTGGTAACCAAATTGG TGCTGCTTTCTGGCAGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGCTCCG GTGTTTACAATGGCACCTCCGACCTCCAGCTGGAGCGCATGAACGTCTAC TTCAACGAGGCTAGCGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGA CCTCGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCCGGTCCTTTCGGCCAGC TCTTCCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGTAACAAC TGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTGT CGACGTTGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCC AGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCTC CTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTT CTCCGTTGTTCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACA ACGCCACTCTCTCCGTCCACCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTC TGTATCGACAACGAGGCTCTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGCT CTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATGT 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AAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTGTCGACGT TGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCA CCCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATC TCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGT TGTTCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCA CTCTCTCCGTCCACCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATC GACAACGAGGCTCTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGCTCTCCAA CCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATGTCCGGTG TGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCTTCGCAAG CTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGG CTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCCGTCTCCG TTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGATGGCTGCC TCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCTTCCGTGG ACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAACATCCAGAGCA AGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCCAGACCGCC CTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCACCTTCATCGG TAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGATCAGTTCA CTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGT ATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGAACGACCTGGT 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GAGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCC CAAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCC ACCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGCT CTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACGG TGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGCC TCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAAC ATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCT GACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTGA CCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCGC AACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCTTCCGTGGACGTGTCTCCAT GAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGACCT ACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCATT CCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACCTC CATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTTCC GTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGATG GAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTACCA GCAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGAGGGTGAGGAGGAATACGTCGAGG AGGAGCCCCTTGAGGCTGAGGAGTAAATGCGTGAGATCGTTCACCTCCAA ACCGGCCAGTGTGGTAACCAAATTGGTGCTGCTTTCTGGCAGACCATCTC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0005874 | microtubule |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003924 | GTPase activity |
GO:0005525 | GTP binding |
GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0007017 | microtubule-based process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR008280 |
DBxref | InterPro:IPR013838 |
DBxref | InterPro:IPR017975 |
DBxref | InterPro:IPR036525 |
DBxref | InterPro:IPR037103 |
DBxref | InterPro:IPR023123 |
DBxref | InterPro:IPR018316 |
DBxref | InterPro:IPR003008 |
DBxref | InterPro:IPR000217 |
DBxref | InterPro:IPR002453 |
DBxref | PFAM:PF03953 |
DBxref | PFAM:PF00091 |
Product | Tubulin beta chain |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch8 | supercontig | ch8:2827787..2829788 + |
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