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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch8:3174382..3175968+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_011067-T1 ID=KYF_011067-T1|Name=KYF_011067-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1587bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:3174382..3175968+ (Aspergillus niger KYF3) ATGTCCAGCCTCGCCAGATCTGCCAACCTCCTTTTCCGCTCTAGCAGGGC
CTCCCTGCTGCGCCCCCGCGCTGTCAACCCCATCCAGCATGTCTTCCTCG
GCGACAAGCTGGCTGCCCGTGGTATGGCAACCGCTTTCGAGCGTACCAAG
CCTCACGTCAACATTGGTAGGTTGCCATCATCATCTCTTATCCATCAATG
CAGTTACTCATCGCTATTTCATAGGTACCATTGGTCACGTCGATCACGGC
AAGGTTAGACCACAATTCCTTCCCCTCTCGCTGCGTTGATGTTTTCCCCG
ATATGGTCCGAAAACTTCTCACACGTTTCCTCTAGACCACCTTGACCGCT
GCCATCACCAAGCACCAGGCCTCCAAGGGTCTCGCTCAGTTCCTTGAGTA
TGGTGCCATTGACAAGGCTCCTGAGGAGCGTAAGCGTGGTATCACCATCT
CCTCTGCCCACATCGAGTACGCTACCGATGCTCGTCACTACTCCCACGTC
GACTGCCCCGGTCACGCCGATTACATCAAGAACATGATCACTGGTGCCGC
CAACATGGACGGTGCTATCATTGTCGTCGCCGCTTCCGACGGTCAGATGT
ACGCTGAAACCCCAACAGAATAATCCCCTCGAGTATATGTGCTTACACTG
GCTATCAACAGGCCCCAGACTCGTGAGCACTTGCTGCTTGCTCGTCAGGT
CGGTGTCCAGAAGATCGTTGTCTTCGTCAACAAGGTCGATGCCATCGATG
ACCCGGAGATGCTGGAGCTCGTCGAGCTGGAAATGCGCGAGCTTCTCAGC
AGCTACGGCTTCGAGGGTGAGGAGACCCCCATCGTCTTCGGCTCTGCTCT
CTGCGCCATTGAGGACCGCCGCCCCGACATCGGTGCCGAGCGTATCGACG
CTCTCCTCGAGGCCGTTGACACCTGGATCCCCACTCCCCAGCGTGACCTT
GACAAGCCTTTCTTGATGTCCATTGAGGAAGTTTTCTCCATCCCTGGTCG
TGGTACCGTCGCTTCCGGCCGTGTTGAGCGTGGTCTCCTGAAGCGTGATA
GCGAGGTTGAGATCATCGGTACGACCAACGAGGTCATCAAGACCAAGGTC
ACCGACATTGAGACCTTCAAGAAGTCCTGCACTGAGTCCCGCGCTGGTGA
CAACTCCGGTCTCCTTCTCCGTGGTGTCCGCCGTGAGGATCTCCGCCGTG
GTATGGTCATTGCCGCTCCTGGCAGCGCCAAGGCCAACAGCAAGTTCATG
GTCTCCATGTACGTCCTCACCGAGGCTGAGGGTGGTCGCCGTACCGGTTT
CGGTGTCCAGTACCGTCCCCAGCTGTTCATCCGCACTGCCGGTAAGTGAT
ATCGTTTTACACTCCGCTACGAGAGAACAGGTTCTGATTTTGTCTGCTGC
AGATGAGGCTGCTGAGTTCAGCTTCCCCGACGGAGACCAGTCCCGCCGTA
TCATGCCCGGTGACAACGTCGAGATGATCGTCAAGACCCACCGCCCCGTC
GCCGCCGAGGCCGGTCAGCGCTTCAACATCCGTGAGGGTGGTCGCACTGT
TGCCACTGGTCTGGTCACTCGTGTCCTGACCGAGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch8:3174382..3175968+ >KYF_011067-T1 ID=KYF_011067-T1|Name=KYF_011067-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=6615bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:3174382..3175968+ (Aspergillus niger KYF3) ATGTCCAGCCTCGCCAGATCTGCCAACCTCCTTTTCCGCTCTAGCAGGGC CTCCCTGCTGCGCCCCCGCGCTGTCAACCCCATCCAGCATGTCTTCCTCG GCGACAAGCTGGCTGCCCGTGGTATGGCAACCGCTTTCGAGCGTACCAAG CCTCACGTCAACATTGGTACCATTGGTCACGTCGATCACGGCAAGACCAC CTTGACCGCTGCCATCACCAAGCACCAGGCCTCCAAGGGTCTCGCTCAGT TCCTTGAGTATGGTGCCATTGACAAGGCTCCTGAGGAGCGTAAGCGTGGT ATCACCATCTCCTCTGCCCACATCGAGTACGCTACCGATGCTCGTCACTA CTCCCACGTCGACTGCCCCGGTCACGCCGATTACATCAAGAACATGATCA CTGGTGCCGCCAACATGGACGGTGCTATCATTGTCGTCGCCGCTTCCGAC GGTCAGATGCCCCAGACTCGTGAGCACTTGCTGCTTGCTCGTCAGGTCGG TGTCCAGAAGATCGTTGTCTTCGTCAACAAGGTCGATGCCATCGATGACC CGGAGATGCTGGAGCTCGTCGAGCTGGAAATGCGCGAGCTTCTCAGCAGC TACGGCTTCGAGGGTGAGGAGACCCCCATCGTCTTCGGCTCTGCTCTCTG CGCCATTGAGGACCGCCGCCCCGACATCGGTGCCGAGCGTATCGACGCTC TCCTCGAGGCCGTTGACACCTGGATCCCCACTCCCCAGCGTGACCTTGAC AAGCCTTTCTTGATGTCCATTGAGGAAGTTTTCTCCATCCCTGGTCGTGG TACCGTCGCTTCCGGCCGTGTTGAGCGTGGTCTCCTGAAGCGTGATAGCG AGGTTGAGATCATCGGTACGACCAACGAGGTCATCAAGACCAAGGTCACC GACATTGAGACCTTCAAGAAGTCCTGCACTGAGTCCCGCGCTGGTGACAA CTCCGGTCTCCTTCTCCGTGGTGTCCGCCGTGAGGATCTCCGCCGTGGTA TGGTCATTGCCGCTCCTGGCAGCGCCAAGGCCAACAGCAAGTTCATGGTC TCCATGTACGTCCTCACCGAGGCTGAGGGTGGTCGCCGTACCGGTTTCGG TGTCCAGTACCGTCCCCAGCTGTTCATCCGCACTGCCGATGAGGCTGCTG AGTTCAGCTTCCCCGACGGAGACCAGTCCCGCCGTATCATGCCCGGTGAC AACGTCGAGATGATCGTCAAGACCCACCGCCCCGTCGCCGCCGAGGCCGG TCAGCGCTTCAACATCCGTGAGGGTGGTCGCACTGTTGCCACTGGTCTGG TCACTCGTGTCCTGACCGAGTAAATGTCCAGCCTCGCCAGATCTGCCAAC CTCCTTTTCCGCTCTAGCAGGGCCTCCCTGCTGCGCCCCCGCGCTGTCAA CCCCATCCAGCATGTCTTCCTCGGCGACAAGCTGGCTGCCCGTGGTATGG CAACCGCTTTCGAGCGTACCAAGCCTCACGTCAACATTGGTACCATTGGT CACGTCGATCACGGCAAGACCACCTTGACCGCTGCCATCACCAAGCACCA GGCCTCCAAGGGTCTCGCTCAGTTCCTTGAGTATGGTGCCATTGACAAGG CTCCTGAGGAGCGTAAGCGTGGTATCACCATCTCCTCTGCCCACATCGAG TACGCTACCGATGCTCGTCACTACTCCCACGTCGACTGCCCCGGTCACGC CGATTACATCAAGAACATGATCACTGGTGCCGCCAACATGGACGGTGCTA TCATTGTCGTCGCCGCTTCCGACGGTCAGATGCCCCAGACTCGTGAGCAC TTGCTGCTTGCTCGTCAGGTCGGTGTCCAGAAGATCGTTGTCTTCGTCAA CAAGGTCGATGCCATCGATGACCCGGAGATGCTGGAGCTCGTCGAGCTGG AAATGCGCGAGCTTCTCAGCAGCTACGGCTTCGAGGGTGAGGAGACCCCC ATCGTCTTCGGCTCTGCTCTCTGCGCCATTGAGGACCGCCGCCCCGACAT CGGTGCCGAGCGTATCGACGCTCTCCTCGAGGCCGTTGACACCTGGATCC CCACTCCCCAGCGTGACCTTGACAAGCCTTTCTTGATGTCCATTGAGGAA GTTTTCTCCATCCCTGGTCGTGGTACCGTCGCTTCCGGCCGTGTTGAGCG TGGTCTCCTGAAGCGTGATAGCGAGGTTGAGATCATCGGTACGACCAACG AGGTCATCAAGACCAAGGTCACCGACATTGAGACCTTCAAGAAGTCCTGC ACTGAGTCCCGCGCTGGTGACAACTCCGGTCTCCTTCTCCGTGGTGTCCG CCGTGAGGATCTCCGCCGTGGTATGGTCATTGCCGCTCCTGGCAGCGCCA AGGCCAACAGCAAGTTCATGGTCTCCATGTACGTCCTCACCGAGGCTGAG GGTGGTCGCCGTACCGGTTTCGGTGTCCAGTACCGTCCCCAGCTGTTCAT CCGCACTGCCGATGAGGCTGCTGAGTTCAGCTTCCCCGACGGAGACCAGT CCCGCCGTATCATGCCCGGTGACAACGTCGAGATGATCGTCAAGACCCAC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006414 | translational elongation |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003746 | translation elongation factor activity |
GO:0003924 | GTPase activity |
GO:0005525 | GTP binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR009000 |
DBxref | InterPro:IPR009001 |
DBxref | InterPro:IPR027417 |
DBxref | InterPro:IPR041709 |
DBxref | InterPro:IPR033720 |
DBxref | InterPro:IPR031157 |
DBxref | InterPro:IPR005225 |
DBxref | InterPro:IPR004161 |
DBxref | InterPro:IPR004160 |
DBxref | InterPro:IPR004541 |
DBxref | InterPro:IPR000795 |
DBxref | PFAM:PF01926 |
DBxref | PFAM:PF03143 |
DBxref | PFAM:PF03144 |
DBxref | PFAM:PF00009 |
Product | translation elongation factor Tu |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch8 | supercontig | ch8:3174382..3175968 + |
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