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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000017.1:2572710..2574460+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_103890-T1 ID=ATCC64974_103890-T1|Name=ATCC64974_103890-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1751bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:2572710..2574460+ (Aspergillus niger N402) ATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGG
TAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCGTATGTCTTCCCT
AGATATGTGACGCAGGCTATGACTGGGCTCATCCCCACTAACTGATTCCA
GTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGA
TGATTCCTGGTGTCGGGTATGATACCACCTGTCAACCTCCAAGCCATTGA
GCCCCTCCAACTGACGGCAACAGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACG
CAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGG
TGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACC
GCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTT
GGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTG
TCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACGTGAGTGTCCCCAAATCCGAAG
CAACCTTCATGATTGATAACTGATAACGGAGATAGGGTTGCCCTTGCTGT
TGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCT
TCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAAC
TCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTAC
TCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGC
TCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCAC
AACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTT
CGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGG
CAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGC
ATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTC
CGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGA
CACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAAC
TACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATAT
CTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTC
TTTTTGCTGCGTAAGGCCCCCTGATCTCTAAAGAAAACAGACAACCTCAA
ACCGGTGGGCACTCAACTAACGCTTGCTCTGATAATAGTGACTACATCGC
CCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACT
ACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTAC
TCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGG
TCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACG
CTGAAATTGGTGAATTTGCCGTAAGTGCCTTCCCATATCATCGAAGTAAA
CGACTCTCCCTCTAACAAAAACTAGTACGACTACGTGGAAATCACCCGCG
ATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGC
ACCATGACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTG
A back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000017.1:2572710..2574460+ >ATCC64974_103890-T1 ID=ATCC64974_103890-T1|Name=ATCC64974_103890-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=8640bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:2572710..2574460+ (Aspergillus niger N402) ATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGG TAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTCTGGAGATATCG CTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTC GGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAAT ATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCT GGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGAC CTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAG CTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTG CTATTACGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATG CTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCC AATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTG GACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCT GCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCA CGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCG TCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGC GCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTC CGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGT GGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATC ACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGT TGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTC GTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTC GTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCTGACTACATCGCCCACCT GGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCC AGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTC TTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCA CCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAA TTGGTGAATTTGCCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGT GGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCC TCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGAATGTCGGAAT ACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTG ACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTCTGGAGATATCGCTTGGGTTAT CACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGCTTCTTCT ACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCA ATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTC GCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATT TTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTC CCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACGGT TGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCA TGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGC TGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTT CGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCAT ACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAAC TACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTG GGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGC GGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGT GTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGT CGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCT CTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCC GCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGA CGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACC TGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCTGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCT ACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTA CCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCT GCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATC CCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATT TGCCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTC CCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGC AACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGAATGTCGGAATACCCTGTCGC CTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAGATC TTAACATCTACTACAGCTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACG GCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGCTTCTTCTACTCAGGTCT CGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTG TCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTT TCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAA GGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTC TCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACGGTTGCCCTTGCT GTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAG CTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGA ACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGT ACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGAT 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TGTTGATGATTCCTGGTGTCGGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGC AAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGT GTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCG CTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTG GCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGT CTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAG TCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGG TCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGG CTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCC ACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAG CGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCAC ACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCA ATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTT GTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGA TTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCA TCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGG GCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCAC GAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAG TGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCT GCTGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTG GATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCT CCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATC AACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCT CGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCTACGACTACGTGGAAA TCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCC TCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGAC AAAGGCTTGAATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATG GGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTCT GGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGAT TCCTGGTGTCGGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCAT TGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAA TGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTA CATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTT CAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGA ATGTTCGCTGCTATTACGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACG CGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTA TCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTAC AAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTC CGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGAC ATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTC ATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTC TGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACC TGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTG GAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCT CGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCA TCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAG TATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCAT TGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCTGACTACA TCGCCCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCAC CACTACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGC CTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCC CTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGAT GACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGA TGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCA CCATGACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGA ATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGG TAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTCTGGAGATATCG CTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTC GGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAAT ATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCT GGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGAC CTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAG CTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTG CTATTACGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATG CTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCC AATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTG GACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCT GCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCA CGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCG TCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGC GCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTC CGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGT GGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATC ACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGT TGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTC GTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTC GTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCTGACTACATCGCCCACCT GGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCC AGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTC TTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCA CCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAA TTGGTGAATTTGCCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGT GGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCC TCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0015696 | ammonium transport |
GO:0072488 | ammonium transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0008519 | ammonium transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_103890-T1 | ATCC64974_103890-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR018047 |
DBxref | InterPro:IPR024041 |
DBxref | InterPro:IPR029020 |
DBxref | InterPro:IPR001905 |
DBxref | InterPro:IPR002229 |
DBxref | PFAM:PF00909 |
Product | ammonium transporter Amt1 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000017.1 | supercontig | OGUI01000017.1:2572710..2574460 + |
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