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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000017.1:2575747..2577748- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_103900-T1 ID=ATCC64974_103900-T1|Name=ATCC64974_103900-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=2002bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:2575747..2577748- (Aspergillus niger N402) ATGCGTGAGATCGTATGTTTGCCCTCCCCGTCCCTCGTCCGTCAGGAGAC
GCGTCGTTGGTTGGCATCTCTTTTGCTCGGGACCCCACCGGTTCTTCGAC
CAACTCATTCTTGTGCTAACTGCATGTCTTCTTCGCTTCATAGGTTCACC
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ACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTACCATG
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GCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGG
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AGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCCC
AAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCCA
CCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGTAT
GATTCCAGACCCAGCACAAGTGAGAAGAAGATTGGTGCTCGAGAACTAAC
GAATTGGCCAATCTAGGCTCTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGC
TCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATG
TCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCT
TCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCA
TGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCC
GTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGAT
GGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCT
TGTGAGTTTTCCTACTGCATCGATTGCACAATATGCCAGCTAACAGGTAT
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ATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACAT
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TGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGA
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TTCTAACCAATTCTACAGCGTCGAGGAGGAGCCCCTTGAGGCTGAGGAGT
AA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000017.1:2575747..2577748- >ATCC64974_103900-T1 ID=ATCC64974_103900-T1|Name=ATCC64974_103900-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=12096bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:2575747..2577748- (Aspergillus niger N402) CGTCGAGGAGGAGCCCCTTGAGGCTGAGGAGTAACCGTGGACGTGTCTCC ATGAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGAC CTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCA TTCCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACC TCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTT CCGTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGA TGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTAC CAGCAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGAGGGTGAGGAGGAATAGCTCTG TACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACGGTGA CCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGCCTCC GTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAACATG GTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCTGAC CAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTGACCC 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CTGCTTTCTGGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTATGCGTGAGATC back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0005874 | microtubule |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0007017 | microtubule-based process |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003924 | GTPase activity |
GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton |
GO:0005525 | GTP binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_103900-T1 | ATCC64974_103900-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR008280 |
DBxref | InterPro:IPR013838 |
DBxref | InterPro:IPR017975 |
DBxref | InterPro:IPR036525 |
DBxref | InterPro:IPR037103 |
DBxref | InterPro:IPR023123 |
DBxref | InterPro:IPR018316 |
DBxref | InterPro:IPR003008 |
DBxref | InterPro:IPR000217 |
DBxref | InterPro:IPR002453 |
DBxref | PFAM:PF03953 |
DBxref | PFAM:PF00091 |
Product | Tubulin beta chain |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000017.1 | supercontig | OGUI01000017.1:2575747..2577748 - |
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