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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000017.1:2876643..2878265+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_104770-T1 ID=ATCC64974_104770-T1|Name=ATCC64974_104770-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1623bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:2876643..2878265+ (Aspergillus niger N402) ATGGCTGCCCCCGCCCAGAAGTTCAAGGTCGCCGACATCGTACGTACCCC
CCCGTCCAACCCTCTATCATGATCGCAATTCTCATTCATTGCCTCTAGTC
CCTGGCTGCCTTTGGCCGCCGCGAGATCGAGCTCGCCGAGATTGAGATGC
CCGGTCTCATGTCCATCCGCCGCAGATATGGTCCCGACCAGCCCCTCAAG
GGTGCCCGTATTGCCGGTTGCCTGCACATGAGTATGTCGGCCTGATTATT
TCTCACTCTGAAACCTCTCTAATTCCCTGCAGCCATCCAGACTGCCGTCC
TCATCGAGACCCTCGTTGCCCTCGGTGCCGAGGTTACCTGGACCAGCTGC
AACATCTTCTCCACCCAGGACCACGCCGCTGCCGCCATTGCCGCCGCCGG
TGTCCCTGTGTAAGTTCTGCTGTTCACCGGTCTATCAGCTCGTCCTAACA
ATTGATAGCTTCGCCTGGAAGGGTGAGACCGAGGAGGAGTACAACTGGTG
CTTGGACCAGCAGCTCTCCGCCTTCAAGGATGGCAAGAAGCTCAACCTCA
TCCTCGACGACGGTGGTGACCTGACCTCCCTCGTCCACGAGAAGTACCCC
GAGCAGCTCAAGGACTGCTACGGTCTGTCCGAGGAGACCACCACTGGTGT
CCACCACCTCTACCGCATGCTCAAGGAGGGCAAGCTCCTTGTTCCCGCCA
TCAACGTCAACGACTCCGTCACCAAGTCCAAGTTCGACAACCTGTACGGT
TGCCGTGAGTCCCTCATCGATGGTATCAAGCGCGCTACCGATGTCATGAT
CGCCGGTAAGGTTGCCGTTGTCGCCGGTTACGGTGATGTCGGCAAGGGCT
GTGCCGATGCTCTCCGCAGCATGGGTGCCCGCGTCCTGGTCACCGAGATC
GACCCCATCAACGCCCTCCAGGCTGCCGTCCAGGGCTACCAGGTCACCAC
CATGGAGGAGGCTGCTCCCCAGGGTCAGATCTTCGTCACCACCACTGGTT
GCCGTGACATCCTCGTTGGCCGTCACTTTGAGGTGATGCGCAACGACGCC
ATTGTTTGCAGTAAGTCCTCCGTTACAATTCCTCTTGTTTCATTTGCTGA
CGAGTTAAGACATCGGTCACTTCGACATTGAGATCGACGTTGCCTGGCTC
AAGGCCAACGCCAAGTCGGTCCAGAACATCAAGCCCCAGGTTGACCGCTA
CACCATGGCCAACGGCCGCCACATCATCCTGTTGGCCGAGGGTCGTCTCG
TCAACCTTGGCTGTGCCACCGGCCACTCTTCCTTCGTCATGTCCTGCTCT
TTCTCCAACCAGGTCCTTGCCCAGATTGCTCTGTTCAAGGCCGAGGACGC
CGAGTTCGGCAAGAAGTACGTCGAGTTCGGCACCACCGGCAAGAAGCCCG
TCGGTGTCTACGTTCTCCCCAAGGCTCTCGATGAGCAGGTCGCTCTCCAG
CACTTGGAGCACGTCAACGCCAAGCTGTCTCAGCTCACCCCCGTCCAGGC
TGAGTACCTTGGCTTGGAGGTCACTGGACCTTTCAAGGCTGACCAGTAAG
CCCACCCTTCGCTTGCCCCATTTTTACAAAGTGATATAACACAGGCTAAC
TGAAATCTAGCTACCGCTACTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000017.1:2876643..2878265+ >ATCC64974_104770-T1 ID=ATCC64974_104770-T1|Name=ATCC64974_104770-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=8100bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:2876643..2878265+ (Aspergillus niger N402) ATGGCTGCCCCCGCCCAGAAGTTCAAGGTCGCCGACATCTCCCTGGCTGC CTTTGGCCGCCGCGAGATCGAGCTCGCCGAGATTGAGATGCCCGGTCTCA TGTCCATCCGCCGCAGATATGGTCCCGACCAGCCCCTCAAGGGTGCCCGT ATTGCCGGTTGCCTGCACATGACCATCCAGACTGCCGTCCTCATCGAGAC CCTCGTTGCCCTCGGTGCCGAGGTTACCTGGACCAGCTGCAACATCTTCT CCACCCAGGACCACGCCGCTGCCGCCATTGCCGCCGCCGGTGTCCCTGTC TTCGCCTGGAAGGGTGAGACCGAGGAGGAGTACAACTGGTGCTTGGACCA GCAGCTCTCCGCCTTCAAGGATGGCAAGAAGCTCAACCTCATCCTCGACG ACGGTGGTGACCTGACCTCCCTCGTCCACGAGAAGTACCCCGAGCAGCTC AAGGACTGCTACGGTCTGTCCGAGGAGACCACCACTGGTGTCCACCACCT CTACCGCATGCTCAAGGAGGGCAAGCTCCTTGTTCCCGCCATCAACGTCA ACGACTCCGTCACCAAGTCCAAGTTCGACAACCTGTACGGTTGCCGTGAG TCCCTCATCGATGGTATCAAGCGCGCTACCGATGTCATGATCGCCGGTAA GGTTGCCGTTGTCGCCGGTTACGGTGATGTCGGCAAGGGCTGTGCCGATG CTCTCCGCAGCATGGGTGCCCGCGTCCTGGTCACCGAGATCGACCCCATC AACGCCCTCCAGGCTGCCGTCCAGGGCTACCAGGTCACCACCATGGAGGA GGCTGCTCCCCAGGGTCAGATCTTCGTCACCACCACTGGTTGCCGTGACA TCCTCGTTGGCCGTCACTTTGAGGTGATGCGCAACGACGCCATTGTTTGC AACATCGGTCACTTCGACATTGAGATCGACGTTGCCTGGCTCAAGGCCAA CGCCAAGTCGGTCCAGAACATCAAGCCCCAGGTTGACCGCTACACCATGG CCAACGGCCGCCACATCATCCTGTTGGCCGAGGGTCGTCTCGTCAACCTT GGCTGTGCCACCGGCCACTCTTCCTTCGTCATGTCCTGCTCTTTCTCCAA CCAGGTCCTTGCCCAGATTGCTCTGTTCAAGGCCGAGGACGCCGAGTTCG GCAAGAAGTACGTCGAGTTCGGCACCACCGGCAAGAAGCCCGTCGGTGTC TACGTTCTCCCCAAGGCTCTCGATGAGCAGGTCGCTCTCCAGCACTTGGA GCACGTCAACGCCAAGCTGTCTCAGCTCACCCCCGTCCAGGCTGAGTACC TTGGCTTGGAGGTCACTGGACCTTTCAAGGCTGACCACTACCGCTACTAA ATGGCTGCCCCCGCCCAGAAGTTCAAGGTCGCCGACATCTCCCTGGCTGC CTTTGGCCGCCGCGAGATCGAGCTCGCCGAGATTGAGATGCCCGGTCTCA TGTCCATCCGCCGCAGATATGGTCCCGACCAGCCCCTCAAGGGTGCCCGT ATTGCCGGTTGCCTGCACATGACCATCCAGACTGCCGTCCTCATCGAGAC CCTCGTTGCCCTCGGTGCCGAGGTTACCTGGACCAGCTGCAACATCTTCT 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TACGTTCTCCCCAAGGCTCTCGATGAGCAGGTCGCTCTCCAGCACTTGGA GCACGTCAACGCCAAGCTGTCTCAGCTCACCCCCGTCCAGGCTGAGTACC TTGGCTTGGAGGTCACTGGACCTTTCAAGGCTGACCACTACCGCTACTAA ATGGCTGCCCCCGCCCAGAAGTTCAAGGTCGCCGACATCTCCCTGGCTGC CTTTGGCCGCCGCGAGATCGAGCTCGCCGAGATTGAGATGCCCGGTCTCA TGTCCATCCGCCGCAGATATGGTCCCGACCAGCCCCTCAAGGGTGCCCGT ATTGCCGGTTGCCTGCACATGACCATCCAGACTGCCGTCCTCATCGAGAC CCTCGTTGCCCTCGGTGCCGAGGTTACCTGGACCAGCTGCAACATCTTCT CCACCCAGGACCACGCCGCTGCCGCCATTGCCGCCGCCGGTGTCCCTGTC TTCGCCTGGAAGGGTGAGACCGAGGAGGAGTACAACTGGTGCTTGGACCA GCAGCTCTCCGCCTTCAAGGATGGCAAGAAGCTCAACCTCATCCTCGACG ACGGTGGTGACCTGACCTCCCTCGTCCACGAGAAGTACCCCGAGCAGCTC AAGGACTGCTACGGTCTGTCCGAGGAGACCACCACTGGTGTCCACCACCT CTACCGCATGCTCAAGGAGGGCAAGCTCCTTGTTCCCGCCATCAACGTCA ACGACTCCGTCACCAAGTCCAAGTTCGACAACCTGTACGGTTGCCGTGAG TCCCTCATCGATGGTATCAAGCGCGCTACCGATGTCATGATCGCCGGTAA GGTTGCCGTTGTCGCCGGTTACGGTGATGTCGGCAAGGGCTGTGCCGATG CTCTCCGCAGCATGGGTGCCCGCGTCCTGGTCACCGAGATCGACCCCATC AACGCCCTCCAGGCTGCCGTCCAGGGCTACCAGGTCACCACCATGGAGGA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0004013 | adenosylhomocysteinase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_104770-T1 | ATCC64974_104770-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG09262LYR |
DBxref | InterPro:IPR036291 |
DBxref | InterPro:IPR020082 |
DBxref | InterPro:IPR042172 |
DBxref | InterPro:IPR015878 |
DBxref | InterPro:IPR000043 |
DBxref | PFAM:PF00670 |
DBxref | PFAM:PF02826 |
Product | S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000017.1 | supercontig | OGUI01000017.1:2876643..2878265 + |
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