You are here

ATCC64974_108400-T1, ATCC64974_108400-T1 (mRNA) Aspergillus niger N402

Overview
NameATCC64974_108400-T1
Unique NameATCC64974_108400-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger N402
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at OGUI01000017.1:3988979..3990502+

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>ATCC64974_108400-T1 ID=ATCC64974_108400-T1|Name=ATCC64974_108400-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1524bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:3988979..3990502+ (Aspergillus niger N402)
ATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCC CGTAAGTTCCTACTTGTCCCCTACGAGCTGAGAGGCCAGGTTGTCGGATG TCGCGCTCTCGACGGAATCGGTTCAAATTGGTCTTGAATATTAAAGATCG AGTACTACGTTCCTTGGAGACTCGACAGTCTGACGATTTGGCCGGGCTCA ATGGTGTTGTTGCTGGACTAGGTGGCTAATGAAAATTTTTCACAGGGATT CGTCGTCGACTTCCTGAGTATGTGCATTCCGGCTCGCCCCGAATGATCGA TCATTGCACTACGATCGATCAATTCCCATCCCAACGAGCAACACGAATTG TGCGATGTTGATTTGAAATTGATACTAACTACTGGTACAGTGGGTGGTGT CTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGC TCCTCATCCAGAACCAGGTTGGTTAAGCCTCAACACCAATGTCTTGCACT GGCGGAACGAAAATACTTTGCACGATCTGCGGTTGCGTCTTCGAAACGAC ATTGCTCCGACCGAAGATTGCCAATTCAGCCGGGCGCAAAAATTTTCACT CCGGACAGTCGGGACGTGAGATCGGCCCAAACAGATGCTAATACGATTGT CCTTCAGGATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACG GTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCC CTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGC TCTTAACTTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGA AGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGCCTCCGGT GGTGTATGTATCCCTATATCCAGTTTGATACTCGAGCGATCCCGCTAACA ATCGGTTCAGGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCG ACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGT GGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGC CTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTG GTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAG CCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCT GCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGG ACACCATCCGTCGTCGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTAC AAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAA GTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTG CTGGTGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAG AAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000017.1:3988979..3990502+

>ATCC64974_108400-T1 ID=ATCC64974_108400-T1|Name=ATCC64974_108400-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=4800bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:3988979..3990502+ (Aspergillus niger N402)
ATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCC
CGGATTCGTCGTCGACTTCCTGATGGGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCA
AGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAG
GATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCAT
GGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGC
GTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAAC
TTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCG
TGATGGATACACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGCCTCCGGTGGTGCTG
CTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACC
CGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTT
CAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTG
CCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTAC
CGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGT
TGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTG
TCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGT
CGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGA
TGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGG
GTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCT
ATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGG
CTCTGGCTAAATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCT
TCGGCATGCCCGGATTCGTCGTCGACTTCCTGATGGGTGGTGTCTCCGCT
GCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCAT
CCAGAACCAGGATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACA
ACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTT
TCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCA
GGCTCTTAACTTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACA
AGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGCCTCC
GGTGGTGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTA
CGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTG
ACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGCCTCC
GACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTAT
TGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAGCCCG
TTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCTGCTC
GGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACAC
CATCCGTCGTCGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGT
CCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAAGTCT
CTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGG
TGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGT
ACAAGGGTGGCTCTGGCTAAATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGAC
AAGACCGTCTTCGGCATGCCCGGATTCGTCGTCGACTTCCTGATGGGTGG
TGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCA
AGCTCCTCATCCAGAACCAGGATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGAC
CGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGA
GGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACT
TCCCCACCCAGGCTCTTAACTTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATG
TTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATGGGTAA
CCTTGCCTCCGGTGGTGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACT
CCCTCGACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAG
GGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGAAGAC
CCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTG
TTGCTGGTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCC
ATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTC
TTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACC
CTCTGGACACCATCCGTCGTCGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTC
AAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGG
TGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTG
CCGGTGCTGGTGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTC
GGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAAATGGCCAAGGGTGATGTTAA
CCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGGATTCGTCGTCGACTTCC
TGATGGGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATC
GAGCGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAGGATGAGATGCTTCGCGCTGG
TCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCG
CTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTT
ATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAACTTCGCCTTCCGTGACACCTA
CAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGA
TGATGGGTAACCTTGCCTCCGGTGGTGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTC
TTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACGCCAA
GTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCT
ACAAGAAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTC
GGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCGGCAT
GTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACT
TCCTTGCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATC
GCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGTCGTATGATGATGACCTCCGG
TGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCG
CCAAGGAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTC
CGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCCAGCT
CATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAAATGGCCAAGG
GTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGGATTCGTC
GTCGACTTCCTGATGGGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGC
CGCCCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAGGATGAGATGC
TTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTC
CGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACAC
TGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAACTTCGCCTTCC
GTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATAC
ACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGCCTCCGGTGGTGCTGCTGGTGCCAC
TTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCA
ACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTC
GTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTA
CCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGT
ACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTC
GAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGG
TGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGTCGTATGATGA
TGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGC
CAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGC
TAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCTATCTACGACC
AGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAA
back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0005743mitochondrial inner membrane
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0022857transmembrane transporter activity
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0055085transmembrane transport
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC64974_108400ATCC64974_108400Aspergillus niger N402gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC64974_108400-T1ATCC64974_108400-T1-proteinAspergillus niger N402polypeptide


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC64974_108400-T1.exon1ATCC64974_108400-T1.exon1Aspergillus niger N402exon
ATCC64974_108400-T1.exon2ATCC64974_108400-T1.exon2Aspergillus niger N402exon
ATCC64974_108400-T1.exon3ATCC64974_108400-T1.exon3Aspergillus niger N402exon
ATCC64974_108400-T1.exon4ATCC64974_108400-T1.exon4Aspergillus niger N402exon
ATCC64974_108400-T1.exon5ATCC64974_108400-T1.exon5Aspergillus niger N402exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC64974_108400-T1.cdsATCC64974_108400-T1.cdsAspergillus niger N402CDS


Properties
Property NameValue
DBxrefInterPro:IPR023395
DBxrefInterPro:IPR018108
DBxrefInterPro:IPR002067
DBxrefInterPro:IPR002113
DBxrefPFAM:PF00153
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger N402 whole genome analysis2021-11-01
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
OGUI01000017.1supercontigOGUI01000017.1:3988979..3990502 +