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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000003.1:2293965..2295750- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_18820-T1 ID=ATCC64974_18820-T1|Name=ATCC64974_18820-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1786bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000003.1:2293965..2295750- (Aspergillus niger N402) ATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGGTGTGTGCCCAGTCCCTCCCTCGCC
GCCGCTTGATTTTTCGCGTGGTCACTAATGTTTGTGTTTTCCCCTCACAG
TTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTGCTGGGAGGTATGTTTA
GACACGGGGGAATCGACCCCTCCTTTCCTGAAACAGTCATCAGAAAATCA
AACAACATCGGCATATGCCATATATTCTTGGGATAAACAGTGGACTAACG
GTGTTGTTTAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGTATGTGAAAAC
AAACGCCTAGGCACGCCTCTGTCGAGAGTTGCCACTCCACACCGATGAGC
AATCCCACTGATCTTTGTTTGTTGATGCCAGGCCGACGGTTACTTGACCG
AGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTCTCC
GAGACTGGTACGTTCCCATAGCCTTTCCCCCCGTGTATCCCGCTCCTCCG
TTTGCCCGCAGCACACCCTAACATGAAATTGGGCTATAGGTCAGGGCAAG
TATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGA
GGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCA
CTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTC
GGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGA
CAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTG
GTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGAC
TACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCGTTTACCCTGCTCCCCAGAA
CGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCTATCCTCACCACCCACACCA
CCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTAC
GACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGCGCCCTAGCTATGAGAACCT
CAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTT
TCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTC
CCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTC
CGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGA
GCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGC
AAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGA
GACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCG
TCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCC
CAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTGTAAGT
TCTTCTCCATCTGATATGCGACGTTTTCAAGACATAAGAAAGCTAACGGA
AGGTCAAATGTAGCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCC
TGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTT
CGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGG
CCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGC
GACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000003.1:2293965..2295750- >ATCC64974_18820-T1 ID=ATCC64974_18820-T1|Name=ATCC64974_18820-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=8082bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000003.1:2293965..2295750- (Aspergillus niger N402) CTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCG ACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTAC GTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCT GGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGG AGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCA TTTACTGCGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACC TACCGCAGTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGC CTCGAACAACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCG ACCAGGTCCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTC CAGGGTTTCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTT CGGTGCTCTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCA AGCTGGAATTCTGCGTTTACCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTT GAGCCCTACAACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGA CTGCAGCTTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCA ACCTCGGCATCGAGCGCCCTAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCC CAGGTTGTCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAA CGTCGATCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTC ACTTCCCTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCC CACGAGTCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAA TAACCAGATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTT GCCTGCTGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTG GCCACCCTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTAC TGGTTTCAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACG GCGACCTTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGG AGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTCTCCGAG ACTGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCA GATTGCCAACTCCTGCTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGCTG CATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACC ACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTT GGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGC TGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGG AGGTTGAGGCCGAGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTT ACTGCGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTAC CGCAGTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTC GAACAACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACC AGGTCCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAG GGTTTCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGG TGCTCTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGC TGGAATTCTGCGTTTACCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAG CCCTACAACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTG CAGCTTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACC TCGGCATCGAGCGCCCTAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAG GTTGTCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGT CGATCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACT TCCCTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCAC GAGTCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAA CCAGATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCC TGCTGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCC ACCCTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGG TTTCAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCG ACCTTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGGAGC GCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTCTCCGAGACT GCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGAT TGCCAACTCCTGCTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGCTGCAT GCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACA AGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGT GAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGC CCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGG TTGAGGCCGAGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACT GCGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGC AGTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAA CAACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGG TCCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGT TTCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGC TCTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGG AATTCTGCGTTTACCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCC TACAACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAG CTTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCG GCATCGAGCGCCCTAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTT GTCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGA TCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCC CTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAG TCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCA GATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGC TGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACC CTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTT CAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACC TTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGGAGCGCA AGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTCTCCGAGACTGCT CTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGC CAACTCCTGCTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGCTGCATGCT GTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGT TCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAG GGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCT TGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTG AGGCCGAGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCG ATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGT CTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAA 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CTCCTGCTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGCTGCATGCTGTC CAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCG ACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGT ATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGA GCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGG CCGAGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATC TGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTT TTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTA TGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCG ACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTG GTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCT GATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCT GCGTTTACCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAAC TCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCAT GGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCG AGCGCCCTAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCT TCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAA CGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGG TGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAAC TCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGT CAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACC GTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAG ACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGAT CGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCA ACCTCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGGAGCGCAAGAAGG ATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTCTCCGAGACTGCTCTACTG CCTTGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTC CTGCTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGCTGCATGCTGTCCAA CACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACC TCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATG GAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCG CGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCG AGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGG AACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTC CACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGC CCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACA AGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTC TTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGAT GGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCG TTTACCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCT ATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGT TGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGC GCCCTAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCC ATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGA GTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGG CCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCC GTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAA GTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTG GTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACT AAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGG TATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACC TCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGGAGCGCAAGAAGGATG ACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTCTCCGAGACTGCTCTACTGCCT TGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTG CTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0005874 | microtubule |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0007017 | microtubule-based process |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003924 | GTPase activity |
GO:0005525 | GTP binding |
GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_18820-T1 | ATCC64974_18820-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR008280 |
DBxref | InterPro:IPR017975 |
DBxref | InterPro:IPR037103 |
DBxref | InterPro:IPR036525 |
DBxref | InterPro:IPR023123 |
DBxref | InterPro:IPR003008 |
DBxref | InterPro:IPR018316 |
DBxref | InterPro:IPR000217 |
DBxref | InterPro:IPR002452 |
DBxref | PFAM:PF03953 |
DBxref | PFAM:PF00091 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000003.1 | supercontig | OGUI01000003.1:2293965..2295750 - |
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