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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000004.1:1755315..1757220- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_32290-T1 ID=ATCC64974_32290-T1|Name=ATCC64974_32290-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1906bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000004.1:1755315..1757220- (Aspergillus niger N402) ATGGAAGGTAAGGGCTTCCTGCCACCTTGCGTCTTGCTCGCTTCCCAAGC
TTCTCACTCCCCCTCCCCCCTCCGTTACCCCCCTCAACGCCCACCTTCAC
AACTTGGCTAACATCTTATTTTTCCATCATCTAGAGGAAGTTGCTGCTCT
CGTCATTGACAATGGGTATGTTACTTTGGGTTCTCGATGATTTTGGCGAT
GGATTCGTCCTGCTTGTTGTGGTTTCTCGCCAGCTCCAGGGGAGATGGTG
CAAAACATACGTCCCCTTTTGGGGCTTGGTCGCGATGATGAACTTGAATG
GGATTCTCGCGGGCGTTGCTCTATTACTCCCTCTGGCGCTTATGGAAAGA
AACTAGGACAGCTCGATCGATTGGCACGCGAGGCTGTAGTCTGCTCGATT
ATACTGACTTCTGTGTTCTCAGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCC
GGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCGTAAGTCAACCCCCTCCTCATA
TCCGCTGTGCTGGATATCCTTCCTCCTGGCTTGATGGGTTCTTCCCACTC
TTCATAGCAATTGCCACCCATTGCGTCCTTGCGCTGGGTTGCTAGCTTAT
GTGGGGGCGGTGAATTACCCGTCATGTTAGCACCGGTTCGAATAGTCAAC
TAACTTGCGGTACAGCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGGTAA
AGCTCCCCTTTGTTTCCCCCAAGTTGGCCTGTTAGGCTGGGTGATCGGTT
TTATCTAATGCCGCCCGCAGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTC
CTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGAT
ACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATC
TGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCC
CGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGA
TGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCC
ATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGT
TCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTT
TCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTG
ACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCAC
TACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACG
TCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGC
CTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAA
CGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTC
TGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGT
GATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGGTATGTTT
TTTCCTCGGCCCCTTGATGAACACGGAGTGGCCTGATCACTAACCCACCT
CTAGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGA
AGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCT
CCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTC
CCTGTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGA
GCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAGGTATGTGCTTATCA
TCCAGAGATCACGTCGTATCTTGCTAACGGGGTTTCTATCTAGCTCTTGC
GCGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000004.1:1755315..1757220- >ATCC64974_32290-T1 ID=ATCC64974_32290-T1|Name=ATCC64974_32290-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=8688bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000004.1:1755315..1757220- (Aspergillus niger N402) CTCTTGCGCGTGAGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCA AGTGCTTCTAAGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCG TATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGA TCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGTATCATGATTG GTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGT GGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTG GGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTG TCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCC AAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGC CCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCG GTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTT GTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGA CATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGC GTGGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATC AAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGAC CGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTC AGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTC GCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTT CAACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCA ACATTGTCATGCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTTCGGGTA TGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCAG GAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGGATGGAAGCTCTTGCGCGTGAG AGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAGTC TGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGA TCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCC GAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAG GACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCT CAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGA AGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAG CACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGA GAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACG TCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGT ATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGA GGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTG ACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTC TCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTG CTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCT CCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATC GGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCT GGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGA AGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGCCT CCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGT TTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCAGGAAGTTGCTGCTCT CGTCATTGACAATGGATGGAAGCTCTTGCGCGTGAGAGTACGACGAGAGC GGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAGTCTGGTGGTACTACCA TGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCT CCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTC CGTCTGGATCGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGG TGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTG AGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCAC ACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTT GACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGA TCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCC GTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTC TGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTC CCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTAC CTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGA GCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCG ACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAG TCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTT CCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCG GTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGAT GTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGCCTCCATTGTCGGTCGT CCCCGTCACCATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGA TGCTCCCCGTGCCGTCTTCCAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATG GATGGAAGCTCTTGCGCGTGAGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGT CCACCGCAAGTGCTTCTAAGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATC TCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAA GGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGTAT CATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGT CCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTC ACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGA ACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCA TCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACC TTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTA CGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCA CCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCC CGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCT GGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCC GTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAG ATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCC CGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGG CTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAG ACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCT GTACGGCAACATTGTCATGCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGG TTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCG TCTTCCAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGGATGGAAGCTCTTG CGCGTGAGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCT TCTAAGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCA GAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTG CTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGTATCATGATTGGTATGG GTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATC CTCACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGA CATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTC CTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCC AACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGC CTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTA CCACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCC ATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGC TGGTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTT ACACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAG AAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTC CCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCA TCACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCT AGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTC CATCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTG TCATGCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTTCGGGTATGTGCA AGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCAGGAAGTT GCTGCTCTCGTCATTGACAATGGATGGAAGCTCTTGCGCGTGAGAGTACG ACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAGTCTGGTGG TACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTG CTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGC AAGTACTCCGTCTGGATCGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCC TACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATA CCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCT GGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCC GTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGAT GACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCA TCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTT CTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTT CGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGA CGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACT ACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGT CGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCC TCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAAC GAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCT GGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTG ATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGCCTCCATTG TCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCC GGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCAT TGACAATGGATGGAAGCTCTTGCGCGTGAGAGTACGACGAGAGCGGTCCC TCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAGTCTGGTGGTACTACCATGTACC CCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCT TCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTG GATCGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGA GGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAGCACG GTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTC TACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGA AGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCT TCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTG TCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGA CGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACG CCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCTCATG AAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGA AATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCG AGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTAC GAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGC TCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTA TCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGT AAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGT CACCATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCC CCGTGCCGTCTTCCAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGGATGGA AGCTCTTGCGCGTGAGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCG CAAGTGCTTCTAAGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGAC CGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAA GATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGTATCATGAT TGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGC GTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAAC TGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCG TGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACC CCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAAC GCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTC CGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACG TTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTC GACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGA 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Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| ATCC64974_32290-T1 | ATCC64974_32290-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR004001 |
| DBxref | InterPro:IPR020902 |
| DBxref | InterPro:IPR004000 |
| DBxref | PFAM:PF00022 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| OGUI01000004.1 | supercontig | OGUI01000004.1:1755315..1757220 - |
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