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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000007.1:3073902..3076164- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_52610-T1 ID=ATCC64974_52610-T1|Name=ATCC64974_52610-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=2263bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000007.1:3073902..3076164- (Aspergillus niger N402) ATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGGTCTGTAT
CCGACTTCTTTTGCCGTGATGCCGAATTCTGGCTCACCATATTCTCCTCT
ATCCTCAATGGTCTTACTGACTCCTCTTGTTGGCGCAGATTTCCCGCGCT
TTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGGTACGCATTG
AACTCGCACATCCGCCCCTGCCTACGTTTGCTAACTGGTCCCTCCGCTAG
CCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTC
ATTGCTCAGAAGTACCCTATCATTGTAAGCTACTATGTGGATATATCTTG
TGGGAACGATGGTCGCTAATGCAATTGCAGGACCACGAGTACGATGCCGT
CGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGG
AAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCT
CACACTGTCGCCGCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAAGTGAGT
TGCCCTGTATTGACTCCATTGCGAGTGGCGCTAATGGTCTGGCTTGCAGC
ATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTC
TGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTC
CCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACC
GAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTT
TGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCG
GTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACC
AACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGA
GTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTT
TCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTAC
TTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGT
CGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACC
CCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGT
GAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTA
CGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCA
TGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCAC
ATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCT
GCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCA
AGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATC
CCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGA
CCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCG
TCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTC
TTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAA
GCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACC
TGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGC
AGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCA
GGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGT
TCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTT
GTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCGTATGTATTCCT
GCAGAGTTTTGTAATGTTGGATGTTGGCTAACTCGAGTTATAGTTCCCAA
ACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCG
TGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCA
CCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTC
GAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAA
GCGTGTTTACTAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000007.1:3073902..3076164- >ATCC64974_52610-T1 ID=ATCC64974_52610-T1|Name=ATCC64974_52610-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=11646bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000007.1:3073902..3076164- (Aspergillus niger N402) TTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCC ACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCAC ACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCG CGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTC CCTTCAAGCGTGTTTACTAGCATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACAT GTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTC ACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTAC GGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTT CGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCT GCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGA CAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGA CCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGG AGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACC GGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCAC TGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATC TGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTG ATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGG TGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCC GTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGT GTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGC TAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCT TCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTC CACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGAC CCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCG GTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAAC TCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCG TGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTG GTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCC AAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGA TGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGG TCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGC ATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTT GACCTGCGCGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGC CGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCT GTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGT GGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGC GCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCATTATT TCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGA TGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGTTCCCAAAC CGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTG AGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACC TGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGA GCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGC GTGTTTACTAGCATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACAC CGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGA CCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCC TTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCA GTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCG CTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTC CGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGAT GGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAA 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AACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGC GACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCG TGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTA AGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGTGGTATCAAC GCCGCTCTTGGAAACCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGG AGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCATTATTTCCCGCGCT TTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGATGAGCTCCT TGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGTTCCCAAACCGCCATTGC CGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACC CCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAG AAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACAC TCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACT AGCATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGG TTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAG CTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGT ACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGA GTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTA CCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAAC ACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGG CGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACC GTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCC TACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCAT GGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCC ACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGT GGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCG TTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTT CCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGAC CACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCG TCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCA CCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGT ATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAA CGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCT CCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTT GTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGG CAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCG ACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATC CGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTAC CCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGA 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TTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCG CGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGG CCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGT TGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCG TGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTG GTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGT GGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCC TACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCC TGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTAC CTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGG TATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGC CCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACC AAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGT TGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACG GTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGC CGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCA CAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACT TCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCC ATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAG 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TTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCT ACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCC CTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAA CCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGG CCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACT TGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCA GGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTT GCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCC GAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGC CTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCC GTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTG CCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTC TATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCA CCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTC CTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGC TTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTG CCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGT GTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGA CGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle |
| GO:0055114 | oxidation-reduction process |
| GO:0022900 | electron transport chain |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0016491 | oxidoreductase activity |
| GO:0016627 | oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors |
| GO:0050660 | flavin adenine dinucleotide binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| ATCC64974_52610-T1 | ATCC64974_52610-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR037099 |
| DBxref | InterPro:IPR003952 |
| DBxref | InterPro:IPR027477 |
| DBxref | InterPro:IPR011281 |
| DBxref | InterPro:IPR015939 |
| DBxref | InterPro:IPR014006 |
| DBxref | InterPro:IPR036188 |
| DBxref | InterPro:IPR003953 |
| DBxref | PFAM:PF02910 |
| DBxref | PFAM:PF00890 |
| Product | succinate dehydrogenase flavoprotein subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| OGUI01000007.1 | supercontig | OGUI01000007.1:3073902..3076164 - |
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