You are here

Home

ATCC64974_53450-T1, ATCC64974_53450-T1 (mRNA) Aspergillus niger N402

Overview
NameATCC64974_53450-T1
Unique NameATCC64974_53450-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger N402
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at OGUI01000007.1:3314426..3317710-

Legend: CDSpolypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>ATCC64974_53450-T1 ID=ATCC64974_53450-T1|Name=ATCC64974_53450-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=3285bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000007.1:3314426..3317710- (Aspergillus niger N402)
ATGCGTTCCGACAAGCTTCTCGTGCTCGCCGGTCTGGCGAGCTATGCTCT
CGCTCTCCCCACGAAGGACTTGGACCCCCGTACCTTCGGCCTCGTCGCCG
AGATCCTCACTGACCTTGGTGAGGACCTGACCGGTTTCATCGAGGCCCTC
CTTGGCGGCGGTGTCAAGAGCTCCGCAAGCCTCCTCACTGGTATCAGCGC
TCAGGCAGCTGCTGTCCTTGAAGGTGGTGCCCTGGGTTGCACTGCTGGCA
AGATCGAGGCCTCCGCTCGTGCGGAGCTGGCTGCGTGGATCCGGGCTCAT
GCCAGCTTCGATGCCTCCCTCAAGTCGTCTCTGTTGGCCTGGTGTGAGGG
TGAGGACTCTGCCACCTTGTCCGTCGATGTCCGTGCTGGTCTCGCTCTGT
TCATTCCCACCTGCGCCGAGGTCGCTGCCAAGGGCGACATTTACGTGACT
GTCGACGGTATCTTCTCCGTTTCCGAACTCGAGGCCGCTGTTGTCCTCAG
CTCTTCTTTCCAGTCTACTCTGTCTACTTTCCTGTCCGGATCCGTTGGTG
TCGAATTGGATGCCGACATCAAGGCTGGTCTTTCCCTCTGTGCTGGTGGT
GGTGTCGTCGCCGACCTTGCTTCGGACATCGAGGCCTCCCTGAAGGTCTG
GCTTTCCGGCTCTGAGTGCTCTCTGAGTGCCTCCCTCAAGGCTGCTGTCC
TTGCTTGGTTGGAGGGCAAGGCTAGTGTGTCTGGCGTTGTTACCATCGGC
ACTGTGCCCACTGCTGGTCTCACCACTGTCTCCGTCGGTGCCGCCATTAA
CGCCCTTGTCGAAACCTCCGGTGCCCTCACCGCTAGCGCCCAGGCCTACC
TCTCTGCCTTCCTCAAGTCCTCCCTCGCCGCCGACATTGAGGCCGATGTT
AAGGTCGTTCTGGAGGCCTGTATCTCGGGCAAGCTTGCCACTTCCGTCAG
CGCCGATGCCCGTGCTGCCCTGGCAGTCTGGCTCTCTGGCGATAGCTGCC
AGCTGGGCGTTGAGCTGAAGGCCGTTCTCTACTTCTGGCTTTCCTTTGCC
CTGAGCGGCGACGTCACCGTCGACTTGTCCACCGACATCATTACCGAACT
CGAGACTTTCATCACCGGTACCATCGACACTCTCATCGGTGTCAACATTA
GCGGCGTGCTCTCCCTTCTGCTGTCTGGCGAGAGTCTGGCCTCCCTTTCC
CTGGAGTCTCGTGCTGAGCTGTCTGCTGTCATCGGTGGCTGCGCTGGTGT
TGATATAAGCTCCTCCATTGAGATCATCGTCATTGAATGGCTTACCGGCT
GCAGCATCCCCGGCGGTCCTTCCATCGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCTCC
GGATCTTCGTCTAAGCTCATCCCCAGCGCCTCCAGCATTCCTGCCGTCGC
TTCGACCCCCGCTGTCAGCGTTCCTGCTGTTCCCACCGTCTCGGTTCCCA
CTGGCGGTTCTAGCCCCAGCAAGCCTGCTCAGTCCGGTGCCCCTGGTGTC
CCCTCCGGTGGTGTTGTTCCCTCCTCTCCCGCTCAGTCCGGCGCTCCCGG
ATCCCCCAACGGTGTCAGCCCTACCGACACTCCTTCGGTTCCCTCCTCCC
CTGCCCAGTCTGGTGCTCCTGGCTCTCCATCTGGCGGCGTCCCCGCTCCC
AGCGGTGGCGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCCGGCGC
CCCTAGCGGCGGTGTTGTCCCCACTGCCTCTGTTCCGGAAGGCGCCAGTG
CCGGTGCCTCCACTACTCCCTGCGACACTATCACCGGCGAGACTGTTGTT
CCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGTTCTGCTCCTAGTGCCCCCGCTCA
GTCTGGTGCTCCTAGCGTTACCCCCATCGTCGGTGGTGGTGCTGGCGGCT
CTACTGGTGGTTCTACTGGCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCT
GGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCCGGCTCTGGCTCCGG
CTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCT
CTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCT
GGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCCGG
CTCCTGGTCCGGCTCTGGCTCTGGAGGTGCTGCTCCCTCTGGTAGCGTTG
TTCCCGCCGGTCCCTCCGGCTCTGTCCCTGCTGTTCCTACCGCTAGCGTC
CCCGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCCTCCACCACCCCCTGTGACACCATCAC
CGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGCTCTGCCC
CCAGTGTCCCTGCTCAGTCTGGCGGTGTTGTTCCCTCTGCTCCCGCTCAG
TCCGGTGCTCCTGGTGCTCCCTCCGGTGCTCCTGCTCCCAGCGGTGGTGT
CGTTCCCTCGTCTCCTGCTCAGTCTGGTGCCCCCGGTGCTCCCTCCGGTG
GTGCTAGCGTCCCTGCTGTCCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGTGCCAGC
GCTGGTGCCTCTACCACCCCCTGTGACACTCTCACCGGCCAGACTGTTGT
TCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGTGGCTCTGCCCCTAGTGCTCCTGCCC
AGTCTGGTGCTCCTGCTCCCTCCGGTGGCGCTCCTGCCCCCAGCGGCGGT
GTCGTTCCCTCCGGTGGTGCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCTAGCGT
CCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCCTCA
CCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACCATGACCGAGGGCGGTTCTGCC
CCCAGTGCCCCTGCTGAGTCTGGCGCCCCTGGTGCCCCCAGCGGTGTCAG
CCCCTCCGAGACCCCTGCCGCTCCCGCTCAGTCTGGCTCTGGCAACGCTC
CCAGCGGTGGCTCTCCCGCCCCCAGCGGTGGTGTCGTCCCCTCCGGCGCT
GCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCCAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGC
TGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCATCACCGGCCAGACTGTCGTCC
CTGTCGCTACCGAGACCGTGACTCCTGTCCCCGTTGCCACCTCGGCTACT
GAGGGCGGTTCCTCTCCTCAGATCACCACCGCTCCCGTCGCTGGCTCCGG
CTCCGGCTCCGGCTCTGGCTCTGAGACTGAGGTGGTTACTGTCACCGTCA
CTGCTACTGTGAGCGTTTCGGCTTGCGACTGGTAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000007.1:3314426..3317710-

>ATCC64974_53450-T1 ID=ATCC64974_53450-T1|Name=ATCC64974_53450-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=3285bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000007.1:3314426..3317710- (Aspergillus niger N402)
ATGCGTTCCGACAAGCTTCTCGTGCTCGCCGGTCTGGCGAGCTATGCTCT
CGCTCTCCCCACGAAGGACTTGGACCCCCGTACCTTCGGCCTCGTCGCCG
AGATCCTCACTGACCTTGGTGAGGACCTGACCGGTTTCATCGAGGCCCTC
CTTGGCGGCGGTGTCAAGAGCTCCGCAAGCCTCCTCACTGGTATCAGCGC
TCAGGCAGCTGCTGTCCTTGAAGGTGGTGCCCTGGGTTGCACTGCTGGCA
AGATCGAGGCCTCCGCTCGTGCGGAGCTGGCTGCGTGGATCCGGGCTCAT
GCCAGCTTCGATGCCTCCCTCAAGTCGTCTCTGTTGGCCTGGTGTGAGGG
TGAGGACTCTGCCACCTTGTCCGTCGATGTCCGTGCTGGTCTCGCTCTGT
TCATTCCCACCTGCGCCGAGGTCGCTGCCAAGGGCGACATTTACGTGACT
GTCGACGGTATCTTCTCCGTTTCCGAACTCGAGGCCGCTGTTGTCCTCAG
CTCTTCTTTCCAGTCTACTCTGTCTACTTTCCTGTCCGGATCCGTTGGTG
TCGAATTGGATGCCGACATCAAGGCTGGTCTTTCCCTCTGTGCTGGTGGT
GGTGTCGTCGCCGACCTTGCTTCGGACATCGAGGCCTCCCTGAAGGTCTG
GCTTTCCGGCTCTGAGTGCTCTCTGAGTGCCTCCCTCAAGGCTGCTGTCC
TTGCTTGGTTGGAGGGCAAGGCTAGTGTGTCTGGCGTTGTTACCATCGGC
ACTGTGCCCACTGCTGGTCTCACCACTGTCTCCGTCGGTGCCGCCATTAA
CGCCCTTGTCGAAACCTCCGGTGCCCTCACCGCTAGCGCCCAGGCCTACC
TCTCTGCCTTCCTCAAGTCCTCCCTCGCCGCCGACATTGAGGCCGATGTT
AAGGTCGTTCTGGAGGCCTGTATCTCGGGCAAGCTTGCCACTTCCGTCAG
CGCCGATGCCCGTGCTGCCCTGGCAGTCTGGCTCTCTGGCGATAGCTGCC
AGCTGGGCGTTGAGCTGAAGGCCGTTCTCTACTTCTGGCTTTCCTTTGCC
CTGAGCGGCGACGTCACCGTCGACTTGTCCACCGACATCATTACCGAACT
CGAGACTTTCATCACCGGTACCATCGACACTCTCATCGGTGTCAACATTA
GCGGCGTGCTCTCCCTTCTGCTGTCTGGCGAGAGTCTGGCCTCCCTTTCC
CTGGAGTCTCGTGCTGAGCTGTCTGCTGTCATCGGTGGCTGCGCTGGTGT
TGATATAAGCTCCTCCATTGAGATCATCGTCATTGAATGGCTTACCGGCT
GCAGCATCCCCGGCGGTCCTTCCATCGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCTCC
GGATCTTCGTCTAAGCTCATCCCCAGCGCCTCCAGCATTCCTGCCGTCGC
TTCGACCCCCGCTGTCAGCGTTCCTGCTGTTCCCACCGTCTCGGTTCCCA
CTGGCGGTTCTAGCCCCAGCAAGCCTGCTCAGTCCGGTGCCCCTGGTGTC
CCCTCCGGTGGTGTTGTTCCCTCCTCTCCCGCTCAGTCCGGCGCTCCCGG
ATCCCCCAACGGTGTCAGCCCTACCGACACTCCTTCGGTTCCCTCCTCCC
CTGCCCAGTCTGGTGCTCCTGGCTCTCCATCTGGCGGCGTCCCCGCTCCC
AGCGGTGGCGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCCGGCGC
CCCTAGCGGCGGTGTTGTCCCCACTGCCTCTGTTCCGGAAGGCGCCAGTG
CCGGTGCCTCCACTACTCCCTGCGACACTATCACCGGCGAGACTGTTGTT
CCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGTTCTGCTCCTAGTGCCCCCGCTCA
GTCTGGTGCTCCTAGCGTTACCCCCATCGTCGGTGGTGGTGCTGGCGGCT
CTACTGGTGGTTCTACTGGCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCT
GGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCCGGCTCTGGCTCCGG
CTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCT
CTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCT
GGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCCGG
CTCCTGGTCCGGCTCTGGCTCTGGAGGTGCTGCTCCCTCTGGTAGCGTTG
TTCCCGCCGGTCCCTCCGGCTCTGTCCCTGCTGTTCCTACCGCTAGCGTC
CCCGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCCTCCACCACCCCCTGTGACACCATCAC
CGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGCGGCTCTGCCC
CCAGTGTCCCTGCTCAGTCTGGCGGTGTTGTTCCCTCTGCTCCCGCTCAG
TCCGGTGCTCCTGGTGCTCCCTCCGGTGCTCCTGCTCCCAGCGGTGGTGT
CGTTCCCTCGTCTCCTGCTCAGTCTGGTGCCCCCGGTGCTCCCTCCGGTG
GTGCTAGCGTCCCTGCTGTCCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGTGCCAGC
GCTGGTGCCTCTACCACCCCCTGTGACACTCTCACCGGCCAGACTGTTGT
TCCCGTTGCTACTATGACCGAGGGTGGCTCTGCCCCTAGTGCTCCTGCCC
AGTCTGGTGCTCCTGCTCCCTCCGGTGGCGCTCCTGCCCCCAGCGGCGGT
GTCGTTCCCTCCGGTGGTGCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCTAGCGT
CCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCCTCA
CCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACCATGACCGAGGGCGGTTCTGCC
CCCAGTGCCCCTGCTGAGTCTGGCGCCCCTGGTGCCCCCAGCGGTGTCAG
CCCCTCCGAGACCCCTGCCGCTCCCGCTCAGTCTGGCTCTGGCAACGCTC
CCAGCGGTGGCTCTCCCGCCCCCAGCGGTGGTGTCGTCCCCTCCGGCGCT
GCTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCCAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGC
TGGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCATCACCGGCCAGACTGTCGTCC
CTGTCGCTACCGAGACCGTGACTCCTGTCCCCGTTGCCACCTCGGCTACT
GAGGGCGGTTCCTCTCCTCAGATCACCACCGCTCCCGTCGCTGGCTCCGG
CTCCGGCTCCGGCTCTGGCTCTGAGACTGAGGTGGTTACTGTCACCGTCA
CTGCTACTGTGAGCGTTTCGGCTTGCGACTGGTAA
back to top
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC64974_53450ATCC64974_53450Aspergillus niger N402gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC64974_53450-T1.cdsATCC64974_53450-T1.cdsAspergillus niger N402CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC64974_53450-T1.exon1ATCC64974_53450-T1.exon1Aspergillus niger N402exon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC64974_53450-T1ATCC64974_53450-T1-proteinAspergillus niger N402polypeptide


Properties
Property NameValue
NoteEggNog:ENOG41
NoteSECRETED:SignalP(1-18)
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger N402 whole genome analysis2021-11-01
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
OGUI01000007.1supercontigOGUI01000007.1:3314426..3317710 -
Powered by Drupal