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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000007.1:4046468..4047963- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_55590-T1 ID=ATCC64974_55590-T1|Name=ATCC64974_55590-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1496bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000007.1:4046468..4047963- (Aspergillus niger N402) ATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGA
GCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGA
AGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGGTAAGCTACTCAAAAGAGT
GAGGCAATGGAATTGAATAGAGTACTGATACCAAGAGCAGTGTCTGGATC
ACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGC
TCAGTTCCGTAAGTTCTCCACGTGGTGGCTACAAATCAAGGTGACCATAT
CGCTAATTGTGCTCTCTGTTGCTAGGTTTCCGTACGTTCCTCATACCCTA
TCTCGATATTGTCCAACAGTCAAAACTAATGGCATTTAGCTATCATTCTC
ACAACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCG
CACCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTG
TCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTG
ATCTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGAT
GCTCAAGGTCAGTCATTCCCTTTCGAGCGTGAGTTTTCCTTGCTCACTCC
CACTCAGGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGG
GCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTG
CTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGG
ATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCA
TGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTC
TCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGC
TCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTG
GTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTT
TCCGTTGTCTTCCTGGTAAGAAGCTCTTGTTCTTGACGTTGCTACATAGG
GATCAAATTACTAACGCACCCACACAGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGT
TATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCA
TGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCG
ATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAA
GGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACC
ACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTC
TTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGC
CAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000007.1:4046468..4047963- >ATCC64974_55590-T1 ID=ATCC64974_55590-T1|Name=ATCC64974_55590-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=7200bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000007.1:4046468..4047963- (Aspergillus niger N402) ATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGA TATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCT TGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTAC AAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGC CTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTT TCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCC AGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGC TACTGCTGGAAATGCCTAAGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTA CTTGGGGTATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTC AGCATTATCGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTT TGTCTTCATCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCA CTCGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATG GACCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAA CGGTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACA TCTACAACGTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTC CTCCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCTGCTATCATTCTCACAACATGGCAT TTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCT GCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTG CTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAAT GTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGGTTTC CTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATC CTTGATTATGCTCAGTTCCATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTG GAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTC GATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGG ATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGA TATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCT TGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTAC AAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGC CTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTT TCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCC AGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGC TACTGCTGGAAATGCCTAAGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTA CTTGGGGTATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTC AGCATTATCGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTT TGTCTTCATCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCA CTCGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATG GACCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAA CGGTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACA TCTACAACGTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTC CTCCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCTGCTATCATTCTCACAACATGGCAT TTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCT GCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTG CTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAAT GTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGGTTTC CTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATC CTTGATTATGCTCAGTTCCATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTG GAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTC GATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGG ATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGA TATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCT TGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTAC AAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGC CTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTT TCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCC AGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGC TACTGCTGGAAATGCCTAAGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTA CTTGGGGTATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTC AGCATTATCGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTT TGTCTTCATCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCA CTCGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATG GACCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAA CGGTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACA TCTACAACGTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTC CTCCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCTGCTATCATTCTCACAACATGGCAT TTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCT GCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTG CTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAAT GTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGGTTTC CTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATC 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CTCGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATG GACCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAA CGGTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACA TCTACAACGTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTC CTCCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCTGCTATCATTCTCACAACATGGCAT TTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCT GCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTG CTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAAT GTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGGTTTC CTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATC CTTGATTATGCTCAGTTCCATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTG GAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTC GATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGG ATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGA TATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCT TGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTAC AAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGC CTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTT TCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCC AGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGC TACTGCTGGAAATGCCTAAGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTA CTTGGGGTATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTC AGCATTATCGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTT TGTCTTCATCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCA CTCGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATG GACCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAA CGGTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACA TCTACAACGTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTC CTCCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCTGCTATCATTCTCACAACATGGCAT TTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCT GCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTG CTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAAT GTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGGTTTC CTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATC CTTGATTATGCTCAGTTCCATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTG GAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTC GATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_55590-T1 | ATCC64974_55590-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR004853 |
DBxref | PFAM:PF03151 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000007.1 | supercontig | OGUI01000007.1:4046468..4047963 - |
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