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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000010.1:1480860..1482959+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_67560-T1 ID=ATCC64974_67560-T1|Name=ATCC64974_67560-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=2100bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000010.1:1480860..1482959+ (Aspergillus niger N402) ATGTTCAGAAACGCTTTGCGGCAGTCTAGCCGCACCGTCGCGGCTGCCTC
TGCCACTGGCAGGATCGCTTCGGTGAGTCCTATCCCTGTCCAGGTCGACC
ATGCCTTCGCCATCTGGCCGATTCCATCCAAGAAGTCATCTCAATGATGC
TTGCTATCGCCTCTCTACACATCGCAATGCTTGCTGCTTCGCTTTGACGC
GTTTTGATTGCGTGGTCGTGATGTTGACAAATTTTGCGTACGACTACAGG
CTCGCGCGGCTGTTCCCGGCCCCCTCTCTGGCGCCTCCAAGCAGATCCGT
TCCTACGCTGCTGAGGCCAAGGCTGCTCCCACTGAGGTCTCTTCCATCCT
TGAGCAGAGAATCCGTGGTGTTCAGGAGGAGGCTGGTCTTGCCGAGACTG
GACGTGTCCTTTCCGTCGGGTACGTGACGAATTCTCCCTCGGTTGAAAAT
TTTGGCCGCCGCTTCAATTCCATCGATATCATCGAAATATTCGAAAATCC
GGCCATTATTTGACGCTCTCCATCGAAATCAATTGAAACTAATATCAAAA
ACAGTGACGGTATCGCTCGTGTCCATGGCATGACCAACGTCCAGGCTGAG
GAGCTGGTCGAGTAGGTGGCCCCGTTTTTTTATATGCCTTGTTTATGTTC
CAATCAATTGACAAATCATCAGGTTCGCCTCCGGCGTCAAGGGTATGTGC
ATGAACCTCGAAGCCGGCCAGGTCGGTGTCGTGCTTTTCGGTTCCGACCG
TCTCGTCAAGGAGGGTGAGACTGTCAAGCGTACCGGAGAGATTGTATGTT
TTTTTTCCACGCCCAGATATCAGCATTTTTTACTTACAGACCCATCTAGG
TCGATGTCCCCGTTGGTCCTGAGATGCTCGGCCGTGTCGTCGACGCTCTC
GGTAACCCCATCGATGGCAAGGGTCCCATTCCCACCAAGGTCAAGAGCCG
TGCTCAGCTCAAGGCCCCTGGTATCCTGCCCCGTCGCTCCGTCAACCAGC
CCGTCCAGACTGGTCTGAAGTGTGTCGACTCCATGGTCCCCATCGGCCGT
GGTCAGCGTGAGTTGATCATTGGTGACCGTCAGACCGGTAAGACCGCTGT
CGCCCTTGATGCCATGCTGAACCAGAAGCGCTGGAACAACACCTCCGACG
AGAGCAAGAAGCTTTACTGCATCTACGTTGCCGTCGGTCAGAAGCGTTCC
ACCGTCGCTCAGCTCGTCAAGACCCTCGAGGAGAACGACGCCATGAAGTA
CTCCATTGTCGTTGCTGCTACTGCTTCCGAGGCTGCTCCTCTGCAGTACC
TTGCTCCCTTCACTGGTTGTGCCATGGGTGAGTGGTTCCGTGACAACGGC
CGCCACGCCGTCATCATCTACGATGACCTTTCCAAGCAGGCCGTCGCCTA
CCGTCAGATGTCCCTGCTGCTCCGTCGTCCCCCTGGTCGTGAGGCCTACC
CCGGTGACGTTTTCTACCTCCACTCTCGTCTCCTTGAGCGTGCCGCCAAG
ATGAACGAGAAGCACGGTGGTGGTTCCCTCACTGCCCTCCCCGTCATTGA
GACCCAGGGTGGTGATGTCTCCGCCTACATTCCCACCAACGTCATCTCCA
TCACTGACGGTCAGATCTTCTTGGAGTCTGAGCTGTTCTACAAGGGTATC
CGTCCCGCCATTAACGTCGGTCTGTCCGTCTCCCGTGTCGGTTCCGCTGC
CCAGGTCAAGGCCATGAAGCAGGTCGCCGGTTCCCTGAAGCTGTTCTTGG
CTCAGTACCGTGAGGTTGCTGCCTTCGCCCAGTTCGGTTCCGATCTCGAT
GCCTCCACCAAGCAGACCCTCAACCGTGGTGAGCGTCTCACCGAGCTCCT
CAAGCAGAAGCAGTACTCCCCCATGGCTGTTTCCGACATGGTTCCCCTGA
TCTTCGCTGGTGTCAACGGTTTCCTTGACAGCATCCCCGTCGCCAAGATC
CTCCAGTGGGAGTCTGACTTCCTTGCTCACCTCAAGAGCAACCACCCCGA
GATCCAGGAGACCATCGAGAAGGAGGGCCAGGTCTCCAAGGAGCTCGAGG
CTCAGCTCAAGGAGATCATCCCCACCTTCAACAAGTCCTTCAACGCATAG
back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000010.1:1480860..1482959+ >ATCC64974_67560-T1 ID=ATCC64974_67560-T1|Name=ATCC64974_67560-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=8355bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000010.1:1480860..1482959+ (Aspergillus niger N402) ATGTTCAGAAACGCTTTGCGGCAGTCTAGCCGCACCGTCGCGGCTGCCTC TGCCACTGGCAGGATCGCTTCGGCTCGCGCGGCTGTTCCCGGCCCCCTCT CTGGCGCCTCCAAGCAGATCCGTTCCTACGCTGCTGAGGCCAAGGCTGCT CCCACTGAGGTCTCTTCCATCCTTGAGCAGAGAATCCGTGGTGTTCAGGA GGAGGCTGGTCTTGCCGAGACTGGACGTGTCCTTTCCGTCGGTGACGGTA TCGCTCGTGTCCATGGCATGACCAACGTCCAGGCTGAGGAGCTGGTCGAG TTCGCCTCCGGCGTCAAGGGTATGTGCATGAACCTCGAAGCCGGCCAGGT CGGTGTCGTGCTTTTCGGTTCCGACCGTCTCGTCAAGGAGGGTGAGACTG TCAAGCGTACCGGAGAGATTGTCGATGTCCCCGTTGGTCCTGAGATGCTC GGCCGTGTCGTCGACGCTCTCGGTAACCCCATCGATGGCAAGGGTCCCAT TCCCACCAAGGTCAAGAGCCGTGCTCAGCTCAAGGCCCCTGGTATCCTGC CCCGTCGCTCCGTCAACCAGCCCGTCCAGACTGGTCTGAAGTGTGTCGAC TCCATGGTCCCCATCGGCCGTGGTCAGCGTGAGTTGATCATTGGTGACCG TCAGACCGGTAAGACCGCTGTCGCCCTTGATGCCATGCTGAACCAGAAGC GCTGGAACAACACCTCCGACGAGAGCAAGAAGCTTTACTGCATCTACGTT GCCGTCGGTCAGAAGCGTTCCACCGTCGCTCAGCTCGTCAAGACCCTCGA GGAGAACGACGCCATGAAGTACTCCATTGTCGTTGCTGCTACTGCTTCCG AGGCTGCTCCTCTGCAGTACCTTGCTCCCTTCACTGGTTGTGCCATGGGT GAGTGGTTCCGTGACAACGGCCGCCACGCCGTCATCATCTACGATGACCT TTCCAAGCAGGCCGTCGCCTACCGTCAGATGTCCCTGCTGCTCCGTCGTC CCCCTGGTCGTGAGGCCTACCCCGGTGACGTTTTCTACCTCCACTCTCGT CTCCTTGAGCGTGCCGCCAAGATGAACGAGAAGCACGGTGGTGGTTCCCT CACTGCCCTCCCCGTCATTGAGACCCAGGGTGGTGATGTCTCCGCCTACA TTCCCACCAACGTCATCTCCATCACTGACGGTCAGATCTTCTTGGAGTCT GAGCTGTTCTACAAGGGTATCCGTCCCGCCATTAACGTCGGTCTGTCCGT CTCCCGTGTCGGTTCCGCTGCCCAGGTCAAGGCCATGAAGCAGGTCGCCG GTTCCCTGAAGCTGTTCTTGGCTCAGTACCGTGAGGTTGCTGCCTTCGCC CAGTTCGGTTCCGATCTCGATGCCTCCACCAAGCAGACCCTCAACCGTGG TGAGCGTCTCACCGAGCTCCTCAAGCAGAAGCAGTACTCCCCCATGGCTG TTTCCGACATGGTTCCCCTGATCTTCGCTGGTGTCAACGGTTTCCTTGAC AGCATCCCCGTCGCCAAGATCCTCCAGTGGGAGTCTGACTTCCTTGCTCA CCTCAAGAGCAACCACCCCGAGATCCAGGAGACCATCGAGAAGGAGGGCC AGGTCTCCAAGGAGCTCGAGGCTCAGCTCAAGGAGATCATCCCCACCTTC AACAAGTCCTTCAACGCATAGATGTTCAGAAACGCTTTGCGGCAGTCTAG CCGCACCGTCGCGGCTGCCTCTGCCACTGGCAGGATCGCTTCGGCTCGCG CGGCTGTTCCCGGCCCCCTCTCTGGCGCCTCCAAGCAGATCCGTTCCTAC GCTGCTGAGGCCAAGGCTGCTCCCACTGAGGTCTCTTCCATCCTTGAGCA GAGAATCCGTGGTGTTCAGGAGGAGGCTGGTCTTGCCGAGACTGGACGTG TCCTTTCCGTCGGTGACGGTATCGCTCGTGTCCATGGCATGACCAACGTC CAGGCTGAGGAGCTGGTCGAGTTCGCCTCCGGCGTCAAGGGTATGTGCAT GAACCTCGAAGCCGGCCAGGTCGGTGTCGTGCTTTTCGGTTCCGACCGTC TCGTCAAGGAGGGTGAGACTGTCAAGCGTACCGGAGAGATTGTCGATGTC CCCGTTGGTCCTGAGATGCTCGGCCGTGTCGTCGACGCTCTCGGTAACCC CATCGATGGCAAGGGTCCCATTCCCACCAAGGTCAAGAGCCGTGCTCAGC TCAAGGCCCCTGGTATCCTGCCCCGTCGCTCCGTCAACCAGCCCGTCCAG ACTGGTCTGAAGTGTGTCGACTCCATGGTCCCCATCGGCCGTGGTCAGCG TGAGTTGATCATTGGTGACCGTCAGACCGGTAAGACCGCTGTCGCCCTTG ATGCCATGCTGAACCAGAAGCGCTGGAACAACACCTCCGACGAGAGCAAG AAGCTTTACTGCATCTACGTTGCCGTCGGTCAGAAGCGTTCCACCGTCGC TCAGCTCGTCAAGACCCTCGAGGAGAACGACGCCATGAAGTACTCCATTG TCGTTGCTGCTACTGCTTCCGAGGCTGCTCCTCTGCAGTACCTTGCTCCC 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TCCCCGTCATTGAGACCCAGGGTGGTGATGTCTCCGCCTACATTCCCACC AACGTCATCTCCATCACTGACGGTCAGATCTTCTTGGAGTCTGAGCTGTT CTACAAGGGTATCCGTCCCGCCATTAACGTCGGTCTGTCCGTCTCCCGTG TCGGTTCCGCTGCCCAGGTCAAGGCCATGAAGCAGGTCGCCGGTTCCCTG AAGCTGTTCTTGGCTCAGTACCGTGAGGTTGCTGCCTTCGCCCAGTTCGG TTCCGATCTCGATGCCTCCACCAAGCAGACCCTCAACCGTGGTGAGCGTC TCACCGAGCTCCTCAAGCAGAAGCAGTACTCCCCCATGGCTGTTTCCGAC ATGGTTCCCCTGATCTTCGCTGGTGTCAACGGTTTCCTTGACAGCATCCC CGTCGCCAAGATCCTCCAGTGGGAGTCTGACTTCCTTGCTCACCTCAAGA GCAACCACCCCGAGATCCAGGAGACCATCGAGAAGGAGGGCCAGGTCTCC AAGGAGCTCGAGGCTCAGCTCAAGGAGATCATCCCCACCTTCAACAAGTC CTTCAACGCATAGATGTTCAGAAACGCTTTGCGGCAGTCTAGCCGCACCG TCGCGGCTGCCTCTGCCACTGGCAGGATCGCTTCGGCTCGCGCGGCTGTT CCCGGCCCCCTCTCTGGCGCCTCCAAGCAGATCCGTTCCTACGCTGCTGA GGCCAAGGCTGCTCCCACTGAGGTCTCTTCCATCCTTGAGCAGAGAATCC GTGGTGTTCAGGAGGAGGCTGGTCTTGCCGAGACTGGACGTGTCCTTTCC GTCGGTGACGGTATCGCTCGTGTCCATGGCATGACCAACGTCCAGGCTGA GGAGCTGGTCGAGTTCGCCTCCGGCGTCAAGGGTATGTGCATGAACCTCG AAGCCGGCCAGGTCGGTGTCGTGCTTTTCGGTTCCGACCGTCTCGTCAAG 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TGCTGCCTTCGCCCAGTTCGGTTCCGATCTCGATGCCTCCACCAAGCAGA CCCTCAACCGTGGTGAGCGTCTCACCGAGCTCCTCAAGCAGAAGCAGTAC TCCCCCATGGCTGTTTCCGACATGGTTCCCCTGATCTTCGCTGGTGTCAA CGGTTTCCTTGACAGCATCCCCGTCGCCAAGATCCTCCAGTGGGAGTCTG ACTTCCTTGCTCACCTCAAGAGCAACCACCCCGAGATCCAGGAGACCATC GAGAAGGAGGGCCAGGTCTCCAAGGAGCTCGAGGCTCAGCTCAAGGAGAT CATCCCCACCTTCAACAAGTCCTTCAACGCATAGATGTTCAGAAACGCTT TGCGGCAGTCTAGCCGCACCGTCGCGGCTGCCTCTGCCACTGGCAGGATC GCTTCGGCTCGCGCGGCTGTTCCCGGCCCCCTCTCTGGCGCCTCCAAGCA GATCCGTTCCTACGCTGCTGAGGCCAAGGCTGCTCCCACTGAGGTCTCTT CCATCCTTGAGCAGAGAATCCGTGGTGTTCAGGAGGAGGCTGGTCTTGCC GAGACTGGACGTGTCCTTTCCGTCGGTGACGGTATCGCTCGTGTCCATGG CATGACCAACGTCCAGGCTGAGGAGCTGGTCGAGTTCGCCTCCGGCGTCA AGGGTATGTGCATGAACCTCGAAGCCGGCCAGGTCGGTGTCGTGCTTTTC GGTTCCGACCGTCTCGTCAAGGAGGGTGAGACTGTCAAGCGTACCGGAGA GATTGTCGATGTCCCCGTTGGTCCTGAGATGCTCGGCCGTGTCGTCGACG CTCTCGGTAACCCCATCGATGGCAAGGGTCCCATTCCCACCAAGGTCAAG AGCCGTGCTCAGCTCAAGGCCCCTGGTATCCTGCCCCGTCGCTCCGTCAA CCAGCCCGTCCAGACTGGTCTGAAGTGTGTCGACTCCATGGTCCCCATCG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0045261 | proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0032559 | adenyl ribonucleotide binding |
GO:0005524 | ATP binding |
GO:0046933 | proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0046034 | ATP metabolic process |
GO:1902600 | proton transmembrane transport |
GO:0015986 | ATP synthesis coupled proton transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_67560-T1 | ATCC64974_67560-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR027417 |
DBxref | InterPro:IPR036121 |
DBxref | InterPro:IPR033732 |
DBxref | InterPro:IPR020003 |
DBxref | InterPro:IPR023366 |
DBxref | InterPro:IPR038376 |
DBxref | InterPro:IPR000194 |
DBxref | InterPro:IPR004100 |
DBxref | InterPro:IPR005294 |
DBxref | InterPro:IPR000793 |
DBxref | PFAM:PF02874 |
DBxref | PFAM:PF00306 |
DBxref | PFAM:PF00006 |
Product | Alpha subunit of the F1 sector of mitochondrial F1F0 ATP synthase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000010.1 | supercontig | OGUI01000010.1:1480860..1482959 + |
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