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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000010.1:1573845..1575825+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_67820-T1 ID=ATCC64974_67820-T1|Name=ATCC64974_67820-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1981bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000010.1:1573845..1575825+ (Aspergillus niger N402) ATGAAGGGTGCTTTCCTTGCCACTGCGGCTGCCCTCGCCGGTACCGCTCT
GGCTGATGGCGGCGCTCACATGCGTCGTCACGGTCACGACTCTTTCCACC
AGCGTCGTGCCGTTCAGGCTGAGCCCGAGGAGTCTTGCGGCTGCACCACC
GAGGTCATCACCGTCTGGGGAACCCCTACCCGTGAGTAAATTCCTGATTT
CCCCCCGCATTCCAATTGATATGCTAGTACTTGACGATGATGATGATGTG
GACGATAAAACTGACCAATACATAGTCGTGCCCGCTGCTGTCCCTACCAC
CGTGACCTCCGACGTCGTCACCACCCTCCACTCCACCAGCTACACCACCG
TCACCGTTGTCGCTACCCCCGGCGAGTCTACTGCCCCTGCTGAGGCTGCT
ACCACTGCCGAGGGTGCTGGTGCTACTGGCGGTGCTGCTGGCAACGCCTC
CCCCAGCGAGTCCACCCCTGCTGCTGGTGGTGCCACCGGTGGTGCTGCCG
GTGCTGCTTCGGGCACTTCCTCCACCCCCGAGGGTGTCGCTGCCACCGGT
GCTACTGGCGGCAATGTCGGCCAGGTCTCCTCCACCCCTGTCGCTGCTGT
TACCACCTCCAGCCAGGCTGTTCCTACCCCGGAGACCACCACCTTCTCCT
CGACTGGTGTCTACACTATCCCCGCTGCTACCGTGACCGTCTCCGACACC
ACCTCCGTTGTCGCGGGCACCACCACCTCTCTGGCTAGCGGTACTCAGAC
CTACGGTGGTGTCACCACCATCGTCGAGACCTCGACCACCGTCACCTGCC
CCTACGCCACCGTTTCTCCCTCTGGCTCCACCGTCACCAGCATCATCCAG
ACCACCACCTACGTCTGCCCCGAGGCTGGTACCTACACCATTGCTCCCAC
CACCACCTACGTTCCCTCTAATACCGTCGTGACCTACCCCACCGTCTCCA
CGGTCACCCCCGGCACATACACCCACAGTGCTATCACTGTCACCGCCACT
GTTACCGACTACACCTACACTTGCCCCTTCGCCAACGCCAACGAGCCCAC
CAGCACCCCGGCTGCCGCTACCACTAGCGCTGTTGTTGTGACTACCCCCG
CTCCTGCCACCACCACTGCTGCCGCTGTCACTTCCTCCGTCCAGTCCAGC
ACTGTGGCCAGCTCCAGCGCCGCCGCCAGCTCTGGCGTCAGCGCCAGCGG
CAACAGCATGGGAATGACCTACACTCCCTACAGCAACTCCGGTGGTTGCA
AGTCCAAGGCCACCGTTGAGTCGGACATTGAGACCATCGCCAACAAGGGC
TTCACCCACATCCGTCTCTACTCCACCGACTGCAGCACCCTCGAATACGT
TGGTGCCGCTGCCAGCAAGTACGGCCTCAAGCTGATCCTCGGTGTCTACA
TCTCCAGCACCGGCACCTCGGGTGCTCAGGACCAGGTTACTGCAATCACC
GAGTGGGGTCAGTGGTCGATGGTTACCCTCATCGTTGTCGGTAACGAGGC
CATCTCCGACGGCTACGCCACCGCCAGCGAGCTCGCCACCTTCATCTCCT
CCTGCAAGTCTAGCTTCGAGGCTGCCGGCTACACTGGCCAGGTCACCACC
ACTGAGCCCATTGACATCTGGCAGGAGTACGGCAGCAGCACCCTCTGCTC
TGTCGTCGACGTCCTGGGTGCCAACATCCACCCCTTCTTCAACTCGGAGA
CCACTGCCGCTGAGGCCGGTACCTTCGCCGCCTCCGAGGTCGCTCTTCTG
AAGAAGATCTGTACCAACATGGATGTCATCAACCTCGAGACTGGTTGGCC
GAGCAAGGGTAACGCCAACGGTGCTGCCGTCCCCGGTGCCACCGAGCAGG
CTACCGCCATCAAGGGCATCCGCGAGTCCGTTGGTGAGCTGTCGGTCTTC
TTCTCCTACGCCAACGACCTGTGGAAGGACCCCGGCGAGTACGACGTTGA
GCAGTACTGGGGTTGCATTGACCAGTTCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000010.1:1573845..1575825+ >ATCC64974_67820-T1 ID=ATCC64974_67820-T1|Name=ATCC64974_67820-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=3774bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000010.1:1573845..1575825+ (Aspergillus niger N402) ATGAAGGGTGCTTTCCTTGCCACTGCGGCTGCCCTCGCCGGTACCGCTCT GGCTGATGGCGGCGCTCACATGCGTCGTCACGGTCACGACTCTTTCCACC AGCGTCGTGCCGTTCAGGCTGAGCCCGAGGAGTCTTGCGGCTGCACCACC GAGGTCATCACCGTCTGGGGAACCCCTACCCTCGTGCCCGCTGCTGTCCC TACCACCGTGACCTCCGACGTCGTCACCACCCTCCACTCCACCAGCTACA CCACCGTCACCGTTGTCGCTACCCCCGGCGAGTCTACTGCCCCTGCTGAG GCTGCTACCACTGCCGAGGGTGCTGGTGCTACTGGCGGTGCTGCTGGCAA CGCCTCCCCCAGCGAGTCCACCCCTGCTGCTGGTGGTGCCACCGGTGGTG CTGCCGGTGCTGCTTCGGGCACTTCCTCCACCCCCGAGGGTGTCGCTGCC ACCGGTGCTACTGGCGGCAATGTCGGCCAGGTCTCCTCCACCCCTGTCGC TGCTGTTACCACCTCCAGCCAGGCTGTTCCTACCCCGGAGACCACCACCT TCTCCTCGACTGGTGTCTACACTATCCCCGCTGCTACCGTGACCGTCTCC GACACCACCTCCGTTGTCGCGGGCACCACCACCTCTCTGGCTAGCGGTAC TCAGACCTACGGTGGTGTCACCACCATCGTCGAGACCTCGACCACCGTCA CCTGCCCCTACGCCACCGTTTCTCCCTCTGGCTCCACCGTCACCAGCATC ATCCAGACCACCACCTACGTCTGCCCCGAGGCTGGTACCTACACCATTGC TCCCACCACCACCTACGTTCCCTCTAATACCGTCGTGACCTACCCCACCG TCTCCACGGTCACCCCCGGCACATACACCCACAGTGCTATCACTGTCACC GCCACTGTTACCGACTACACCTACACTTGCCCCTTCGCCAACGCCAACGA GCCCACCAGCACCCCGGCTGCCGCTACCACTAGCGCTGTTGTTGTGACTA CCCCCGCTCCTGCCACCACCACTGCTGCCGCTGTCACTTCCTCCGTCCAG TCCAGCACTGTGGCCAGCTCCAGCGCCGCCGCCAGCTCTGGCGTCAGCGC CAGCGGCAACAGCATGGGAATGACCTACACTCCCTACAGCAACTCCGGTG GTTGCAAGTCCAAGGCCACCGTTGAGTCGGACATTGAGACCATCGCCAAC AAGGGCTTCACCCACATCCGTCTCTACTCCACCGACTGCAGCACCCTCGA ATACGTTGGTGCCGCTGCCAGCAAGTACGGCCTCAAGCTGATCCTCGGTG TCTACATCTCCAGCACCGGCACCTCGGGTGCTCAGGACCAGGTTACTGCA ATCACCGAGTGGGGTCAGTGGTCGATGGTTACCCTCATCGTTGTCGGTAA CGAGGCCATCTCCGACGGCTACGCCACCGCCAGCGAGCTCGCCACCTTCA TCTCCTCCTGCAAGTCTAGCTTCGAGGCTGCCGGCTACACTGGCCAGGTC ACCACCACTGAGCCCATTGACATCTGGCAGGAGTACGGCAGCAGCACCCT CTGCTCTGTCGTCGACGTCCTGGGTGCCAACATCCACCCCTTCTTCAACT CGGAGACCACTGCCGCTGAGGCCGGTACCTTCGCCGCCTCCGAGGTCGCT CTTCTGAAGAAGATCTGTACCAACATGGATGTCATCAACCTCGAGACTGG TTGGCCGAGCAAGGGTAACGCCAACGGTGCTGCCGTCCCCGGTGCCACCG AGCAGGCTACCGCCATCAAGGGCATCCGCGAGTCCGTTGGTGAGCTGTCG GTCTTCTTCTCCTACGCCAACGACCTGTGGAAGGACCCCGGCGAGTACGA CGTTGAGCAGTACTGGGGTTGCATTGACCAGTTCTAAATGAAGGGTGCTT TCCTTGCCACTGCGGCTGCCCTCGCCGGTACCGCTCTGGCTGATGGCGGC GCTCACATGCGTCGTCACGGTCACGACTCTTTCCACCAGCGTCGTGCCGT TCAGGCTGAGCCCGAGGAGTCTTGCGGCTGCACCACCGAGGTCATCACCG TCTGGGGAACCCCTACCCTCGTGCCCGCTGCTGTCCCTACCACCGTGACC TCCGACGTCGTCACCACCCTCCACTCCACCAGCTACACCACCGTCACCGT TGTCGCTACCCCCGGCGAGTCTACTGCCCCTGCTGAGGCTGCTACCACTG CCGAGGGTGCTGGTGCTACTGGCGGTGCTGCTGGCAACGCCTCCCCCAGC GAGTCCACCCCTGCTGCTGGTGGTGCCACCGGTGGTGCTGCCGGTGCTGC TTCGGGCACTTCCTCCACCCCCGAGGGTGTCGCTGCCACCGGTGCTACTG GCGGCAATGTCGGCCAGGTCTCCTCCACCCCTGTCGCTGCTGTTACCACC TCCAGCCAGGCTGTTCCTACCCCGGAGACCACCACCTTCTCCTCGACTGG TGTCTACACTATCCCCGCTGCTACCGTGACCGTCTCCGACACCACCTCCG TTGTCGCGGGCACCACCACCTCTCTGGCTAGCGGTACTCAGACCTACGGT GGTGTCACCACCATCGTCGAGACCTCGACCACCGTCACCTGCCCCTACGC CACCGTTTCTCCCTCTGGCTCCACCGTCACCAGCATCATCCAGACCACCA CCTACGTCTGCCCCGAGGCTGGTACCTACACCATTGCTCCCACCACCACC TACGTTCCCTCTAATACCGTCGTGACCTACCCCACCGTCTCCACGGTCAC CCCCGGCACATACACCCACAGTGCTATCACTGTCACCGCCACTGTTACCG ACTACACCTACACTTGCCCCTTCGCCAACGCCAACGAGCCCACCAGCACC CCGGCTGCCGCTACCACTAGCGCTGTTGTTGTGACTACCCCCGCTCCTGC CACCACCACTGCTGCCGCTGTCACTTCCTCCGTCCAGTCCAGCACTGTGG CCAGCTCCAGCGCCGCCGCCAGCTCTGGCGTCAGCGCCAGCGGCAACAGC ATGGGAATGACCTACACTCCCTACAGCAACTCCGGTGGTTGCAAGTCCAA GGCCACCGTTGAGTCGGACATTGAGACCATCGCCAACAAGGGCTTCACCC ACATCCGTCTCTACTCCACCGACTGCAGCACCCTCGAATACGTTGGTGCC GCTGCCAGCAAGTACGGCCTCAAGCTGATCCTCGGTGTCTACATCTCCAG CACCGGCACCTCGGGTGCTCAGGACCAGGTTACTGCAATCACCGAGTGGG GTCAGTGGTCGATGGTTACCCTCATCGTTGTCGGTAACGAGGCCATCTCC GACGGCTACGCCACCGCCAGCGAGCTCGCCACCTTCATCTCCTCCTGCAA GTCTAGCTTCGAGGCTGCCGGCTACACTGGCCAGGTCACCACCACTGAGC CCATTGACATCTGGCAGGAGTACGGCAGCAGCACCCTCTGCTCTGTCGTC GACGTCCTGGGTGCCAACATCCACCCCTTCTTCAACTCGGAGACCACTGC CGCTGAGGCCGGTACCTTCGCCGCCTCCGAGGTCGCTCTTCTGAAGAAGA TCTGTACCAACATGGATGTCATCAACCTCGAGACTGGTTGGCCGAGCAAG GGTAACGCCAACGGTGCTGCCGTCCCCGGTGCCACCGAGCAGGCTACCGC CATCAAGGGCATCCGCGAGTCCGTTGGTGAGCTGTCGGTCTTCTTCTCCT ACGCCAACGACCTGTGGAAGGACCCCGGCGAGTACGACGTTGAGCAGTAC TGGGGTTGCATTGACCAGTTCTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_67820-T1 | ATCC64974_67820-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
Note | SECRETED:SignalP(1-18) |
DBxref | InterPro:IPR017853 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000010.1 | supercontig | OGUI01000010.1:1573845..1575825 + |
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