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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000011.1:458494..461135- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_73080-T1 ID=ATCC64974_73080-T1|Name=ATCC64974_73080-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=2642bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000011.1:458494..461135- (Aspergillus niger N402) ATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCA
CAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAATGCTGTATGTTGCCTCTCCCA
TGCTGCTGTTGCTGCTGATCTACCTTTCACGTGGACCACTACTGACGGAT
GGTTGTGGTTGATGCAGGTCAATGTTGGGTTTAGCGTTTGCCATTCTAAA
TGTATGTCGGCAAATCAACGCCTCCGCTTGATGTCGATAAGAGACCGTCT
CTGGTACTAGGCCACACCAGGAAGTTGGTAGCTAATTAAGTCTGCACGCA
GTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTCTCAGTCTGCCGTCTGGTG
GCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGTAAGTCATTGGTGCTTTGGGTTCATCCC
TGCTTCTACTCTGCAAGGCGGATATGTTTCTTGCTTTGATCGTGTCGGTA
GTAGGTGAGATCCTTCTGCTAACTCCTGTTTTCTCTAGGGTTGATCACGG
CTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGTTCTTGTCG
GCCTATCCTACGTAGGTGCTTCTGGTTGTGCTTCTTGGGCTTTGGACTAA
TTTGGCTAGTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGGTGAGTATTCTT
GATTCATACTCCATGACTATTTCGGTACGGTGCTGACTATTCTTCCTCTA
CAGTTAGTAGGTTTTCCATAACCTGTTCGATATCACTTCCTTGCTGACGA
TAGATGAAAGTTTCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTAC
AGGATGGGCGAACGTGACTGGCTGGGTATGTGTACAAGACTTATTTGTGC
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TCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCGTAAGT
CCTTTGCTGGCTTTTAGACCCGAACACTTTACTCACAGCCCAACAGTCAT
ATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTCATCTACATCGCCTATAACGTT
ATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCCAAGGTTAC
TAAGGGTGCCTGTAAGTAGAATTGTCCGTCTGGGGATATCGATCTAAAGC
TGACGTGTCTCTAGTTATCTGGTCCCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCA
TCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCCAACTACAACTCTGGCGAGTGAGTA
ATGCCGTTAGCTGACTTCCATTGGACGTGTTGCTGACTCAATAGGTTCGT
CTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATGTAAGGCAGACCACACCCCTT
TCTGATCGGCCAATGCTAACATTTCTTAGGGCCTGATGGACTTGCTTGGC
TGCTCGGAGTATGTTTCACTACCTAAATTCTGTGTGAAGATTGTTACTCA
TACCATCTAGCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTTTGTAAGTC
TTCCGAGCTCTACTATGCATCCTGGTACTAACCGCTATAAGGACGGTGTC
GCGCACATGATCGAAGGTAAATCTGCCAAATACTACCGGCCTCGTCGCAT
ACTAAACATGCATAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATC
ATGATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGAT
CGTTCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGG
CTACGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGT
GCTATTTGCCTTCTCGTGTAAGTTGTTCCTAAGATTTCGGTCCGCATTTA
CTGACATGCTTAAGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCAC
GATCATGACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCG
GTCTCCCCGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTT
CCTCTGAATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTG
TATTTTCCTTGGCTCGTCAAGGTACGTAAACTACAAAAAGGCAATAATAC
ATCTTGCGGTATGCTAACCTTAACAGTGCATTCAACGCTATTGTATCTGC
ATCGGTGGTCATGCTTGATATAGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACT
GCATTCGCGGGCGGAAGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAAC
GTTGTGGGCTGGATTGCAAACTTGGTACGTCTCACTTGGTGACTACGCAT
GCACAGAATTCTTACATGTTTCCTGAATAGATCTCGCTAGCCTACGTTTC
TCTCACGACCGTACTTTTCCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGCAACTGGAA
GCAACATGAGTAAGTTGTTTTTCATCCGGCATCCACTTTACGAAGTTGCT
AACGTGTCTACTCTAGACTACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCT
GGTGTCGATTTTCCAATGGTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGC
CGCGGATGGATGTAGATATCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGC
GGAGAAGAAGTTGTGGTGCCTAGCAACTTTCATGAGAAATAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000011.1:458494..461135- >ATCC64974_73080-T1 ID=ATCC64974_73080-T1|Name=ATCC64974_73080-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=27216bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000011.1:458494..461135- (Aspergillus niger N402) ACTACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCTGGTGTCGATTTTCCAA TGGTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGCCGCGGATGGATGTAGA TATCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGCGGAGAAGAAGTTGTGG TGCCTAGCAACTTTCATGAGAAATAAATCTCGCTAGCCTACGTTTCTCTC ACGACCGTACTTTTCCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGCAACTGGAAGCAA CATGATGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGATAT AGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGC TACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAAC TTGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATGACGA CCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCCCGCT TCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGAATGC TTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTCCTTG GCTCGTCAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATCATGAT CGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGATCGTTC TCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGGCTACG CCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGTGCTAT TTGCCTTCTCGTGACGGTGTCGCGCACATGATCGAAGCTCCTTCAAGGAG GACTGGGTCTCACAGGCTTTGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTCGGAG TTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATTTATCTGGTCCCTTAC CGGGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCCAACT ACAACTCTGGCGATCATATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTCATCT ACATCGCCTATAACGTTATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGGCTCA CTCCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGCCTGTTGCCTTGACTGCAACTGGTG GTCTTCTCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCC GATGGGCGAACGTGACTGGCTGGTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGC AGGGTTGATCACGGCTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTG CCGAGTTCTTGTCGGCCTATCCTACTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTT TATCTCTCAGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGTCAA TGTTGGGTTTAGCGTTTGCCATTCTAAATATGAAAGACTTTCGGGGAGAT GATGACGCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCAA TTTCTCAATGCTACTACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCTGGTG TCGATTTTCCAATGGTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGCCGCG GATGGATGTAGATATCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGCGGAG AAGAAGTTGTGGTGCCTAGCAACTTTCATGAGAAATAAATCTCGCTAGCC TACGTTTCTCTCACGACCGTACTTTTCCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGC AACTGGAAGCAACATGATGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGT CATGCTTGATATAGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCG GGCGGAAGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGC TGGATTGCAAACTTGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCA CGATCATGACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGC GGTCTCCCCGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGT TCCTCTGAATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGT GTATTTTCCTTGGCTCGTCAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCC CAAGATCATGATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCT TCCTGATCGTTCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAAC TCCGCGGCTACGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAA CGCCGGTGCTATTTGCCTTCTCGTGACGGTGTCGCGCACATGATCGAAGC TCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTTTGGCCTGATGGACTTGCTT GGCTGCTCGGAGTTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATTTAT CTGGTCCCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCT 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TTGCCGCTATCACGATCATGACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTT GCAAGAGATGGCGGTCTCCCCGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACAC CAAGCTTGAGGTTCCTCTGAATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCA TCATTTTCGGGTGTATTTTCCTTGGCTCGTCAAGAAATTCCAAACCCCTC GGTGGTTGGGCCCAAGATCATGATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTA CTGGCACAATCTTCCTGATCGTTCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTAC GAAGATATCAACTCCGCGGCTACGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGC AACGAAAAACAACGCCGGTGCTATTTGCCTTCTCGTGACGGTGTCGCGCA CATGATCGAAGCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTTTGGCCTG ATGGACTTGCTTGGCTGCTCGGAGTTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGA AACAGGATTTATCTGGTCCCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCATCACCC TGCTGGCATGCTCGTCGCCCAACTACAACTCTGGCGATCATATGTGTCGC AACGCTGGCATCAGTTCCTCATCTACATCGCCTATAACGTTATTGCATTC CTCATCAATGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGC CTGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGGTCTTCTCGGAAGTGAATTGATCTTG GGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCGATGGGCGAACGTGACTGGCTGGTGC TGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGGGTTGATCACGGCTGGTGTCTGTA ATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGTTCTTGTCGGCCTATCCTACT CATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTCTCAGTCTGCCGTCTGGTGGC TGCGTTAGTGTCATCTGGGGTCAATGTTGGGTTTAGCGTTTGCCATTCTA AATATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCCAGTTGGCGGCCATGGG CCACAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAATGCTACTACTGTGTAGCC GTGTTTGGCATCGTTTTCCTGGTGTCGATTTTCCAATGGTTTGTGGACGG ACGTAAGAACTTCACCGGGCCGCGGATGGATGTAGATATCATCAGTGGCC AGGTAGCCCCCGGTGATGGCGGAGAAGAAGTTGTGGTGCCTAGCAACTTT CATGAGAAATAAATCTCGCTAGCCTACGTTTCTCTCACGACCGTACTTTT CCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGCAACTGGAAGCAACATGATGCATTCAA CGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGATATAGCGTACGGCATCC CTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGCTACCGGAGAGGTCC TTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAACTTGCTTCCCTCTCG TGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATGACGACCAGTAGTCGTATG ATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCCCGCTTCTCCTTTCTTCAG CAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGAATGCTTTGTACCTTACCA ACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTCCTTGGCTCGTCAAGAAAT TCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATCATGATCGGTTGCGTCGGTA TTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGATCGTTCTCCTCTTTGTGGCT GGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGGCTACGCCTTTGCTGCAAAT TTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGTGCTATTTGCCTTCTCGTGA CGGTGTCGCGCACATGATCGAAGCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACA GGCTTTGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTCGGAGTTCGTCTTCGGAGA ATTCATCAACGAAACAGGATTTATCTGGTCCCTTACCGGGTTCACTATAA TCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCCAACTACAACTCTGGCGAT CATATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTCATCTACATCGCCTATAAC GTTATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCCAAGGT TACTAAGGGTGCCTGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGGTCTTCTCGGAAGT GAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCGATGGGCGAACGTG ACTGGCTGGTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGGGTTGATCACGG CTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGTTCTTGTCG GCCTATCCTACTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTCTCAGTCTG CCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGTCAATGTTGGGTTTAGCG TTTGCCATTCTAAATATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCCAGTT GGCGGCCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAATGCTAC TACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCTGGTGTCGATTTTCCAATG GTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGCCGCGGATGGATGTAGATA TCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGCGGAGAAGAAGTTGTGGTG CCTAGCAACTTTCATGAGAAATAAATCTCGCTAGCCTACGTTTCTCTCAC GACCGTACTTTTCCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGCAACTGGAAGCAACA TGATGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGATATAG CGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGCTA CCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAACTT GCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATGACGACC AGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCCCGCTTC TCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGAATGCTT TGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTCCTTGGC TCGTCAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATCATGATCG GTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGATCGTTCTC CTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGGCTACGCC TTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGTGCTATTT GCCTTCTCGTGACGGTGTCGCGCACATGATCGAAGCTCCTTCAAGGAGGA CTGGGTCTCACAGGCTTTGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTCGGAGTT CGTCTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATTTATCTGGTCCCTTACCG GGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCCAACTAC AACTCTGGCGATCATATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTCATCTAC ATCGCCTATAACGTTATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGGCTCACT CCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGCCTGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGGT CTTCTCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCGA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_73080-T1 | ATCC64974_73080-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR002293 |
DBxref | PFAM:PF13520 |
DBxref | PFAM:PF00324 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000011.1 | supercontig | OGUI01000011.1:458494..461135 - |
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