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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000013.1:1489455..1490449+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_78160-T1 ID=ATCC64974_78160-T1|Name=ATCC64974_78160-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=995bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000013.1:1489455..1490449+ (Aspergillus niger N402)
ATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGGTGAGTTAATCGGATCCTTCCCT
TTCGTGTTCATATCAGCTTGTATACACATGTTCGCGTGACTAACTCTTTA
TTCTTCATTTTTGAGTAGCAAAACCTCGTAAGTTACTGACGATACAAGTT
TCACTCGCGCGTCAAACCTGACAGTATCCTCAGATCAACTACCGGATGAG
AGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCG
ATAAGGTATATATATCTGGGTCTTTCAGTGGCCATCGGATAACACTTGTG
GTCGGCTGGTCGCTGATGCAGAATTATAGCACATGAACCTTGTCCTCGCC
GATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGG
TTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCC
TTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCAGTTGATGGACCT
CCTCCTGCCGATCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGC
TGCCGCTGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTG
GACGTGGTCTGCCGGTCGGTCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGC
CCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGCTTCCCTCCTGGTGGTAGTTT
CCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTG
GACCTCGTAAGTTTGCACTTTCGAGCTCGATGTTGAACTTGGTTACTGAC
TTAGGATATTAGCTGGCTTTGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCCCAGGGT
GCTCCTCGTAAGTATCCTTGAATAGCGTGTTATGGTTATAGAGCTAACTG
ATGCTGTTGTAGCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCT
GGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000013.1:1489455..1490449+ >ATCC64974_78160-T1 ID=ATCC64974_78160-T1|Name=ATCC64974_78160-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=3315bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000013.1:1489455..1490449+ (Aspergillus niger N402)
ATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGTATCCTCAGATCAACTACCGGAT
GAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTT
TCGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGC
GTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGT
TGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACAC
ATGTCGTCTCTTGCTCAGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGATCCCTCTGCC
CGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCTGCTGCCACTCTCGC
TGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGTC
TGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGT
TTTCCCGGCTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGG
CTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTTGCTCCTC
CCCCGGGATTCGCTCCCCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCCCA
CCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTT
TGGTGGACGGTGAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGTATCCTCAGA
TCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGA
CAGATGCTCGCTTTCGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGA
AGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCA
ACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATT
GTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCAGTTGATGGACCTCCTCCTGC
CGATCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCTG
CTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGT
CTGCCGGTCGGTCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCC
GCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGCTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAG
TGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCT
GGCTTTGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCCCAGGGTGCTCCTCCGGGTGC
CTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCC
CTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAG
ATGTATCCTCAGATCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCG
ACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGCACATGAACCTTGTCC
TCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCC
GCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCT
GGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCAGTTGATG
GACCTCCTCCTGCCGATCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGC
GCAGCTGCCGCTGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACC
CGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGTCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTG
GTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGCTTCCCTCCTGGTGGT
AGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCC
TGGTGGACCTCCTGGCTTTGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCCCAGGGTG
CTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAA
GGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGAATGGCGGCTAA
TAAGCAGGGCAAGATGTATCCTCAGATCAACTACCGGATGAGAGTCACCC
TCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGCAC
ATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAA
GTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAG
AAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCT
TGCTCAGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGATCCCTCTGCCCGACTCGGTGC
TGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCTGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTG
GAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGTCTGGGAGGCCCT
GCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGCTT
CCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTC
GTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTTGCTCCTCCCCCGGGATTC
GCTCCCCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCA
GCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGT
GAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGTATCCTCAGATCAACTACCGG
ATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGC
TTTCGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTC
GCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTT
GTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTAC
ACATGTCGTCTCTTGCTCAGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGATCCCTCTG
CCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCTGCTGCCACTCTC
GCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGG
TCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCG
GTTTTCCCGGCTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCG
GGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTTGCTCC
TCCCCCGGGATTCGCTCCCCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCC
CACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGC
TTTGGTGGACGGTGA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| ATCC64974_78160-T1 | ATCC64974_78160-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR010920 |
| DBxref | InterPro:IPR001163 |
| DBxref | PFAM:PF01423 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| OGUI01000013.1 | supercontig | OGUI01000013.1:1489455..1490449 + |
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