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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000013.1:1878721..1880415+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_79560-T1 ID=ATCC64974_79560-T1|Name=ATCC64974_79560-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1695bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000013.1:1878721..1880415+ (Aspergillus niger N402) ATGAAGAACGTTGCGACCCTTGCAGCCTTCGCTGCTGGGGCTAATGCCCT
TGTTGGCCGGAGCGACTCTTGCTGCTTTCACCTGACAGCTTCTGGTGATG
CTTCTGGCACCATTGGCCAGCTGGGTGATGGTCAGAACCGCATTGGTGGT
GGACTGCCCGCCACCCAGTTCTGCATTGACTCCAATGGTGGCATCACTGA
TAGCAGCGGACGCGGTTGTGTCGTGACTAGTAAGCTATCCACATATACAT
AATATCAGGTATGTTACTAACCACACATGTTGACAGGCGATACCACGCAG
TTCCAGTGTGACTTGGGTAAATCTCCTATGTCGGGTTTCTCCATCACCTC
CTCTGGTGAGCTGGAGTACAACGGTGACGCCGATTTTGTTGCCTGCCAAA
CTGGCGACAACAACGAACTGAACCTTTACACCACCGAGAACTCCTCCGTC
ACTGGCTGCGAGAACATCAAGTTGACAGCTGATTCCTGCGCGGGCTCTGG
TGCTGGTTCTGTTGGTTCTAGCTCTGCTCCGGCTTCGACCCCCGCGCCTC
AGTCCAGCACGCCGGCTCCTGCTCCTTCCTCCAGCGCTCCAGGTGTCCCT
GGCGCTGGTGCGTCGACTGGTTGGGTTCCCGGTGGTCCTGCCTCCAGTGC
TTCCGTGCCCTACGGTCCTGGTCCCCAGTCTAGCGGCGCCGTGCAAGTGA
CGACCGTCTATGTGACTGAAACCTACTGTGGTGCTGAGACTACTCCTGTG
GTTTCTGTTCCTGGGGAGAGTACTGTTCCGCTGGTTCCCGTTGGACCCGG
GTCTTCTGCTCCCGCTGGCTCCCAGCCGGCCCCGTCCGGATCCCCTGCTC
CTCAGCCATCCGAGACTCCATCCTACCCTCAGTCGTCCGAAAGCCCTGCT
CCTCAGCCTTCGGAAACTCCTTCGTACCCCCAGTCCTCGGAGACCCCGGC
CCCCCAGCCTTCTGAGACTCCCGCTCCTCAGCCCTCTGGCTCTCCTGCTC
CTCAGCCATCCGGGTCTCCGGCTCCCCAGCCTTCCTCCTACCCCCAGACC
TCTGGAACTCCTGCTCCTCAGCCGTCTGGTACTCCCTCTTACCCCCAGAC
CTCCGCGTCTCCCAGCAGCGCTCAGCCTTCTGGCACGGCTACCCAGTCGT
CCTCTGCCAGCTGCCCCACCGATCTCTCTGGCGACTATGAGTACCCTCAC
TTGATCGTCCCCATCAACTCTTCTACTCCCGACACCGCCTACGGTACTCA
GTACTTCGGCACCGTCTCCTCCACCGTCTCGACCATCTTCAACTTCGATA
TCCCCTCTTCGGACTCTGGAAAGACCTGCAGTCTGATCTTCCTGTTCCCC
ACCAAGGATCAGCTTGAGACCTCTGACTACACCTTCAGCGGAGACGGCAA
GATTGACTTCTCCCAGCTCGAGTCTGCTGCTAGTGAGTCGACGACCTACA
ACAACGCTCCTGGGGTCAAGCAGGACTACGGCGACTTCACCGTCTCGCCT
GGCAACTCCTACCTGATCTCCACGTTCTCCTGCCCGGCTGGCCAGACTGT
CAGCTACGAGATGAAGGAGGCTGGTAGCACCTACCTCAACTTCTTTGAGG
ACTACAACCCCTCTCCGTAAGTATTCTCCATACCATCTTCTATGAACCAT
TGCTAATTGAAATCTAGTCTCGGTCTGTACATCACGGTCTGCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000013.1:1878721..1880415+ >ATCC64974_79560-T1 ID=ATCC64974_79560-T1|Name=ATCC64974_79560-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=4761bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000013.1:1878721..1880415+ (Aspergillus niger N402) ATGAAGAACGTTGCGACCCTTGCAGCCTTCGCTGCTGGGGCTAATGCCCT TGTTGGCCGGAGCGACTCTTGCTGCTTTCACCTGACAGCTTCTGGTGATG CTTCTGGCACCATTGGCCAGCTGGGTGATGGTCAGAACCGCATTGGTGGT GGACTGCCCGCCACCCAGTTCTGCATTGACTCCAATGGTGGCATCACTGA TAGCAGCGGACGCGGTTGTGTCGTGACTAGCGATACCACGCAGTTCCAGT GTGACTTGGGTAAATCTCCTATGTCGGGTTTCTCCATCACCTCCTCTGGT GAGCTGGAGTACAACGGTGACGCCGATTTTGTTGCCTGCCAAACTGGCGA CAACAACGAACTGAACCTTTACACCACCGAGAACTCCTCCGTCACTGGCT GCGAGAACATCAAGTTGACAGCTGATTCCTGCGCGGGCTCTGGTGCTGGT TCTGTTGGTTCTAGCTCTGCTCCGGCTTCGACCCCCGCGCCTCAGTCCAG CACGCCGGCTCCTGCTCCTTCCTCCAGCGCTCCAGGTGTCCCTGGCGCTG GTGCGTCGACTGGTTGGGTTCCCGGTGGTCCTGCCTCCAGTGCTTCCGTG CCCTACGGTCCTGGTCCCCAGTCTAGCGGCGCCGTGCAAGTGACGACCGT CTATGTGACTGAAACCTACTGTGGTGCTGAGACTACTCCTGTGGTTTCTG TTCCTGGGGAGAGTACTGTTCCGCTGGTTCCCGTTGGACCCGGGTCTTCT GCTCCCGCTGGCTCCCAGCCGGCCCCGTCCGGATCCCCTGCTCCTCAGCC ATCCGAGACTCCATCCTACCCTCAGTCGTCCGAAAGCCCTGCTCCTCAGC CTTCGGAAACTCCTTCGTACCCCCAGTCCTCGGAGACCCCGGCCCCCCAG CCTTCTGAGACTCCCGCTCCTCAGCCCTCTGGCTCTCCTGCTCCTCAGCC ATCCGGGTCTCCGGCTCCCCAGCCTTCCTCCTACCCCCAGACCTCTGGAA CTCCTGCTCCTCAGCCGTCTGGTACTCCCTCTTACCCCCAGACCTCCGCG TCTCCCAGCAGCGCTCAGCCTTCTGGCACGGCTACCCAGTCGTCCTCTGC CAGCTGCCCCACCGATCTCTCTGGCGACTATGAGTACCCTCACTTGATCG TCCCCATCAACTCTTCTACTCCCGACACCGCCTACGGTACTCAGTACTTC GGCACCGTCTCCTCCACCGTCTCGACCATCTTCAACTTCGATATCCCCTC TTCGGACTCTGGAAAGACCTGCAGTCTGATCTTCCTGTTCCCCACCAAGG ATCAGCTTGAGACCTCTGACTACACCTTCAGCGGAGACGGCAAGATTGAC TTCTCCCAGCTCGAGTCTGCTGCTAGTGAGTCGACGACCTACAACAACGC TCCTGGGGTCAAGCAGGACTACGGCGACTTCACCGTCTCGCCTGGCAACT CCTACCTGATCTCCACGTTCTCCTGCCCGGCTGGCCAGACTGTCAGCTAC GAGATGAAGGAGGCTGGTAGCACCTACCTCAACTTCTTTGAGGACTACAA CCCCTCTCCTCTCGGTCTGTACATCACGGTCTGCTAAATGAAGAACGTTG CGACCCTTGCAGCCTTCGCTGCTGGGGCTAATGCCCTTGTTGGCCGGAGC GACTCTTGCTGCTTTCACCTGACAGCTTCTGGTGATGCTTCTGGCACCAT TGGCCAGCTGGGTGATGGTCAGAACCGCATTGGTGGTGGACTGCCCGCCA CCCAGTTCTGCATTGACTCCAATGGTGGCATCACTGATAGCAGCGGACGC GGTTGTGTCGTGACTAGCGATACCACGCAGTTCCAGTGTGACTTGGGTAA ATCTCCTATGTCGGGTTTCTCCATCACCTCCTCTGGTGAGCTGGAGTACA ACGGTGACGCCGATTTTGTTGCCTGCCAAACTGGCGACAACAACGAACTG AACCTTTACACCACCGAGAACTCCTCCGTCACTGGCTGCGAGAACATCAA GTTGACAGCTGATTCCTGCGCGGGCTCTGGTGCTGGTTCTGTTGGTTCTA GCTCTGCTCCGGCTTCGACCCCCGCGCCTCAGTCCAGCACGCCGGCTCCT GCTCCTTCCTCCAGCGCTCCAGGTGTCCCTGGCGCTGGTGCGTCGACTGG TTGGGTTCCCGGTGGTCCTGCCTCCAGTGCTTCCGTGCCCTACGGTCCTG GTCCCCAGTCTAGCGGCGCCGTGCAAGTGACGACCGTCTATGTGACTGAA ACCTACTGTGGTGCTGAGACTACTCCTGTGGTTTCTGTTCCTGGGGAGAG TACTGTTCCGCTGGTTCCCGTTGGACCCGGGTCTTCTGCTCCCGCTGGCT CCCAGCCGGCCCCGTCCGGATCCCCTGCTCCTCAGCCATCCGAGACTCCA TCCTACCCTCAGTCGTCCGAAAGCCCTGCTCCTCAGCCTTCGGAAACTCC TTCGTACCCCCAGTCCTCGGAGACCCCGGCCCCCCAGCCTTCTGAGACTC CCGCTCCTCAGCCCTCTGGCTCTCCTGCTCCTCAGCCATCCGGGTCTCCG GCTCCCCAGCCTTCCTCCTACCCCCAGACCTCTGGAACTCCTGCTCCTCA GCCGTCTGGTACTCCCTCTTACCCCCAGACCTCCGCGTCTCCCAGCAGCG CTCAGCCTTCTGGCACGGCTACCCAGTCGTCCTCTGCCAGCTGCCCCACC GATCTCTCTGGCGACTATGAGTACCCTCACTTGATCGTCCCCATCAACTC TTCTACTCCCGACACCGCCTACGGTACTCAGTACTTCGGCACCGTCTCCT CCACCGTCTCGACCATCTTCAACTTCGATATCCCCTCTTCGGACTCTGGA AAGACCTGCAGTCTGATCTTCCTGTTCCCCACCAAGGATCAGCTTGAGAC CTCTGACTACACCTTCAGCGGAGACGGCAAGATTGACTTCTCCCAGCTCG AGTCTGCTGCTAGTGAGTCGACGACCTACAACAACGCTCCTGGGGTCAAG CAGGACTACGGCGACTTCACCGTCTCGCCTGGCAACTCCTACCTGATCTC CACGTTCTCCTGCCCGGCTGGCCAGACTGTCAGCTACGAGATGAAGGAGG CTGGTAGCACCTACCTCAACTTCTTTGAGGACTACAACCCCTCTCCTCTC GGTCTGTACATCACGGTCTGCTAAATGAAGAACGTTGCGACCCTTGCAGC CTTCGCTGCTGGGGCTAATGCCCTTGTTGGCCGGAGCGACTCTTGCTGCT TTCACCTGACAGCTTCTGGTGATGCTTCTGGCACCATTGGCCAGCTGGGT GATGGTCAGAACCGCATTGGTGGTGGACTGCCCGCCACCCAGTTCTGCAT TGACTCCAATGGTGGCATCACTGATAGCAGCGGACGCGGTTGTGTCGTGA CTAGCGATACCACGCAGTTCCAGTGTGACTTGGGTAAATCTCCTATGTCG GGTTTCTCCATCACCTCCTCTGGTGAGCTGGAGTACAACGGTGACGCCGA TTTTGTTGCCTGCCAAACTGGCGACAACAACGAACTGAACCTTTACACCA CCGAGAACTCCTCCGTCACTGGCTGCGAGAACATCAAGTTGACAGCTGAT TCCTGCGCGGGCTCTGGTGCTGGTTCTGTTGGTTCTAGCTCTGCTCCGGC TTCGACCCCCGCGCCTCAGTCCAGCACGCCGGCTCCTGCTCCTTCCTCCA GCGCTCCAGGTGTCCCTGGCGCTGGTGCGTCGACTGGTTGGGTTCCCGGT GGTCCTGCCTCCAGTGCTTCCGTGCCCTACGGTCCTGGTCCCCAGTCTAG CGGCGCCGTGCAAGTGACGACCGTCTATGTGACTGAAACCTACTGTGGTG CTGAGACTACTCCTGTGGTTTCTGTTCCTGGGGAGAGTACTGTTCCGCTG GTTCCCGTTGGACCCGGGTCTTCTGCTCCCGCTGGCTCCCAGCCGGCCCC GTCCGGATCCCCTGCTCCTCAGCCATCCGAGACTCCATCCTACCCTCAGT CGTCCGAAAGCCCTGCTCCTCAGCCTTCGGAAACTCCTTCGTACCCCCAG TCCTCGGAGACCCCGGCCCCCCAGCCTTCTGAGACTCCCGCTCCTCAGCC CTCTGGCTCTCCTGCTCCTCAGCCATCCGGGTCTCCGGCTCCCCAGCCTT CCTCCTACCCCCAGACCTCTGGAACTCCTGCTCCTCAGCCGTCTGGTACT CCCTCTTACCCCCAGACCTCCGCGTCTCCCAGCAGCGCTCAGCCTTCTGG CACGGCTACCCAGTCGTCCTCTGCCAGCTGCCCCACCGATCTCTCTGGCG ACTATGAGTACCCTCACTTGATCGTCCCCATCAACTCTTCTACTCCCGAC ACCGCCTACGGTACTCAGTACTTCGGCACCGTCTCCTCCACCGTCTCGAC CATCTTCAACTTCGATATCCCCTCTTCGGACTCTGGAAAGACCTGCAGTC TGATCTTCCTGTTCCCCACCAAGGATCAGCTTGAGACCTCTGACTACACC TTCAGCGGAGACGGCAAGATTGACTTCTCCCAGCTCGAGTCTGCTGCTAG TGAGTCGACGACCTACAACAACGCTCCTGGGGTCAAGCAGGACTACGGCG ACTTCACCGTCTCGCCTGGCAACTCCTACCTGATCTCCACGTTCTCCTGC CCGGCTGGCCAGACTGTCAGCTACGAGATGAAGGAGGCTGGTAGCACCTA CCTCAACTTCTTTGAGGACTACAACCCCTCTCCTCTCGGTCTGTACATCA CGGTCTGCTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_79560-T1 | ATCC64974_79560-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR018620 |
DBxref | PFAM:PF09792 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000013.1 | supercontig | OGUI01000013.1:1878721..1880415 + |
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