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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000016.1:1575294..1577189- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_91830-T1 ID=ATCC64974_91830-T1|Name=ATCC64974_91830-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1896bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000016.1:1575294..1577189- (Aspergillus niger N402)
ATGGGTGCGCCGACGTTAAAGGACCTCGAAGAGTCCAAGACCGAGGTGAC
ATCTCCAGTATATGTTGATGAAGACCCCGAGGCCCTCAAGGGCGAGATCC
ACCATGGGCCAAACACAGACACTCAGCGTGGATTGTCTTCCCGACAGCTG
CAGCTGCTTGCTCTTGGAGGTTGTATTGGGACCGGTCTATTCGTAGGTTC
GGGATCCACGCTGTCGACGGTGGGCCCAGCACCACTGTTCATGGGCTACT
GTGCCATGTCGTCGGTGGTGTGGTTTGTGATGAACGTGCTGGGCGAGATG
ACCACCTATTTGCCCATCAAGGGCATTTCGGTGCCTTATATGATAGGCCG
CTATACGGAGCCGAGTATTGGATTCGCTGCTGGTATGTCTCTTGCACTGT
ACCTGGCAGCTCCCATATTTCTCTTGCAGTGATATGCTAACTCAATTTAG
GATATAATTATTGGTAGGCTCACATTATCTTCCGCTCACCAACTTACTCT
GATCCTCATGTGTATTAGGTACTCTTTTGCCATGTTACTGGCAAGTGAAG
TGACGGCTGCCGGGATCATCATCCAGTACTGGACCACCTCCATCAATGTC
GGGGTGTGGATCACAATCATCCTCCTCGGTACGTATTCACCTCAACCTCC
ATCATCAGTAGGACATGATGAACGCTAACAACCACAGTGATTCTGCTACT
CAACATTATTGCGGTGTCATGGTACGGAGAAGCCGAGTTCTGGTTTGCAA
CGTTAAAGATCCTAGCCATCATTGGCCTGATTATCCTGGGTGTGGTGCTC
TTCTTCGGCGGTGGTCCCAACCATGATCGGCTAGGCTTCCGCTATTGGGA
TAACCCGGGCGCGTTCAATCCCTACTTGGTCGGTGGAAACACCGGTCGCT
TCCTGGACTTCTGGACAGCTTTCATCAAGTCTGGCTTCTCCTTCATTTTC
TCCCCCGAACTTATCACCACTGCCGCTGGTGAAGTTGAAGCACCCCGTCG
CAATATCCCGAAAGCCACCAACCGGTTCATCTACCGAGTCTTTGCCTTCT
ACATTCTGGGCACCCTCGTGATCGGTGTCACAGTCGCTTATAATGATCCT
AAACTCATGTCCGCGGTTGCCAGCGGTAGCTCTAGCGCCAGTGCCAGTCC
TTTTGTTATTGCCATCCAGAATGCGGGTATCTCTGGGCTGAACCACGTCG
TCAACGCTGCTATCCTGATCTCAGCCTGGTCCTCGGGTAATGCATGGTTG
TTCGCTGGTTCTCGAACCCTGTACTCGCTCGCCTGCGGCGGCCAGGCCCC
CAAGATCTTCACCCGGTGCAACCGCAACGGCGTGCCTTACGTAGCCGTGC
TGATCACCTGGGTGGTCGGCTTGCTGTCCTTCCTGAACCTGTCTGACTCA
GGAGAGACTGTCTTCTACTGGTTCACGAACATCACCACAGTGGGAGGGTT
TATTAACTGGGTGCTCATTGGTATCACCTATCTGGTAAGTTATTTCCTTC
GAGCTTTCTGCAGACCCGACTGACGAAATTCAGCGATTCCGCAAAGCCTT
GACCTACCATGGACTGCTGGACACGCTCACTTTCAAGACCCCTCTGCAGC
CCTACGGCACATACTACGTTATTGTCGTCGTGTCCCTCCTGACCATCACG
AACGGATATGCAGTTTTCTTCCCTGGCAACTTCACCGCCGCCGATTTCCT
GGTGTCGTATATTGTGGTGGCCATCTTCCTGGCCCTCTATGTGGGCCACA
AATTGTGGTACCGGACTCCATGGATGACAAAGGTGTCGGAGATTGACGTG
TTCACGGGCAAAGAGGAGATTGACCAGCTCTGCGCGAACGACTTTGAACG
GAAGCCACGCAATTGGCTGGAGAGGGTGTGGTGGTGGATTGCTTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000016.1:1575294..1577189- >ATCC64974_91830-T1 ID=ATCC64974_91830-T1|Name=ATCC64974_91830-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=8325bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000016.1:1575294..1577189- (Aspergillus niger N402)
CGATTCCGCAAAGCCTTGACCTACCATGGACTGCTGGACACGCTCACTTT
CAAGACCCCTCTGCAGCCCTACGGCACATACTACGTTATTGTCGTCGTGT
CCCTCCTGACCATCACGAACGGATATGCAGTTTTCTTCCCTGGCAACTTC
ACCGCCGCCGATTTCCTGGTGTCGTATATTGTGGTGGCCATCTTCCTGGC
CCTCTATGTGGGCCACAAATTGTGGTACCGGACTCCATGGATGACAAAGG
TGTCGGAGATTGACGTGTTCACGGGCAAAGAGGAGATTGACCAGCTCTGC
GCGAACGACTTTGAACGGAAGCCACGCAATTGGCTGGAGAGGGTGTGGTG
GTGGATTGCTTGATGATTCTGCTACTCAACATTATTGCGGTGTCATGGTA
CGGAGAAGCCGAGTTCTGGTTTGCAACGTTAAAGATCCTAGCCATCATTG
GCCTGATTATCCTGGGTGTGGTGCTCTTCTTCGGCGGTGGTCCCAACCAT
GATCGGCTAGGCTTCCGCTATTGGGATAACCCGGGCGCGTTCAATCCCTA
CTTGGTCGGTGGAAACACCGGTCGCTTCCTGGACTTCTGGACAGCTTTCA
TCAAGTCTGGCTTCTCCTTCATTTTCTCCCCCGAACTTATCACCACTGCC
GCTGGTGAAGTTGAAGCACCCCGTCGCAATATCCCGAAAGCCACCAACCG
GTTCATCTACCGAGTCTTTGCCTTCTACATTCTGGGCACCCTCGTGATCG
GTGTCACAGTCGCTTATAATGATCCTAAACTCATGTCCGCGGTTGCCAGC
GGTAGCTCTAGCGCCAGTGCCAGTCCTTTTGTTATTGCCATCCAGAATGC
GGGTATCTCTGGGCTGAACCACGTCGTCAACGCTGCTATCCTGATCTCAG
CCTGGTCCTCGGGTAATGCATGGTTGTTCGCTGGTTCTCGAACCCTGTAC
TCGCTCGCCTGCGGCGGCCAGGCCCCCAAGATCTTCACCCGGTGCAACCG
CAACGGCGTGCCTTACGTAGCCGTGCTGATCACCTGGGTGGTCGGCTTGC
TGTCCTTCCTGAACCTGTCTGACTCAGGAGAGACTGTCTTCTACTGGTTC
ACGAACATCACCACAGTGGGAGGGTTTATTAACTGGGTGCTCATTGGTAT
CACCTATCTGGTACTCTTTTGCCATGTTACTGGCAAGTGAAGTGACGGCT
GCCGGGATCATCATCCAGTACTGGACCACCTCCATCAATGTCGGGGTGTG
GATCACAATCATCCTCCTCGGATATAATTATTGATGGGTGCGCCGACGTT
AAAGGACCTCGAAGAGTCCAAGACCGAGGTGACATCTCCAGTATATGTTG
ATGAAGACCCCGAGGCCCTCAAGGGCGAGATCCACCATGGGCCAAACACA
GACACTCAGCGTGGATTGTCTTCCCGACAGCTGCAGCTGCTTGCTCTTGG
AGGTTGTATTGGGACCGGTCTATTCGTAGGTTCGGGATCCACGCTGTCGA
CGGTGGGCCCAGCACCACTGTTCATGGGCTACTGTGCCATGTCGTCGGTG
GTGTGGTTTGTGATGAACGTGCTGGGCGAGATGACCACCTATTTGCCCAT
CAAGGGCATTTCGGTGCCTTATATGATAGGCCGCTATACGGAGCCGAGTA
TTGGATTCGCTGCTGCGATTCCGCAAAGCCTTGACCTACCATGGACTGCT
GGACACGCTCACTTTCAAGACCCCTCTGCAGCCCTACGGCACATACTACG
TTATTGTCGTCGTGTCCCTCCTGACCATCACGAACGGATATGCAGTTTTC
TTCCCTGGCAACTTCACCGCCGCCGATTTCCTGGTGTCGTATATTGTGGT
GGCCATCTTCCTGGCCCTCTATGTGGGCCACAAATTGTGGTACCGGACTC
CATGGATGACAAAGGTGTCGGAGATTGACGTGTTCACGGGCAAAGAGGAG
ATTGACCAGCTCTGCGCGAACGACTTTGAACGGAAGCCACGCAATTGGCT
GGAGAGGGTGTGGTGGTGGATTGCTTGATGATTCTGCTACTCAACATTAT
TGCGGTGTCATGGTACGGAGAAGCCGAGTTCTGGTTTGCAACGTTAAAGA
TCCTAGCCATCATTGGCCTGATTATCCTGGGTGTGGTGCTCTTCTTCGGC
GGTGGTCCCAACCATGATCGGCTAGGCTTCCGCTATTGGGATAACCCGGG
CGCGTTCAATCCCTACTTGGTCGGTGGAAACACCGGTCGCTTCCTGGACT
TCTGGACAGCTTTCATCAAGTCTGGCTTCTCCTTCATTTTCTCCCCCGAA
CTTATCACCACTGCCGCTGGTGAAGTTGAAGCACCCCGTCGCAATATCCC
GAAAGCCACCAACCGGTTCATCTACCGAGTCTTTGCCTTCTACATTCTGG
GCACCCTCGTGATCGGTGTCACAGTCGCTTATAATGATCCTAAACTCATG
TCCGCGGTTGCCAGCGGTAGCTCTAGCGCCAGTGCCAGTCCTTTTGTTAT
TGCCATCCAGAATGCGGGTATCTCTGGGCTGAACCACGTCGTCAACGCTG
CTATCCTGATCTCAGCCTGGTCCTCGGGTAATGCATGGTTGTTCGCTGGT
TCTCGAACCCTGTACTCGCTCGCCTGCGGCGGCCAGGCCCCCAAGATCTT
CACCCGGTGCAACCGCAACGGCGTGCCTTACGTAGCCGTGCTGATCACCT
GGGTGGTCGGCTTGCTGTCCTTCCTGAACCTGTCTGACTCAGGAGAGACT
GTCTTCTACTGGTTCACGAACATCACCACAGTGGGAGGGTTTATTAACTG
GGTGCTCATTGGTATCACCTATCTGGTACTCTTTTGCCATGTTACTGGCA
AGTGAAGTGACGGCTGCCGGGATCATCATCCAGTACTGGACCACCTCCAT
CAATGTCGGGGTGTGGATCACAATCATCCTCCTCGGATATAATTATTGAT
GGGTGCGCCGACGTTAAAGGACCTCGAAGAGTCCAAGACCGAGGTGACAT
CTCCAGTATATGTTGATGAAGACCCCGAGGCCCTCAAGGGCGAGATCCAC
CATGGGCCAAACACAGACACTCAGCGTGGATTGTCTTCCCGACAGCTGCA
GCTGCTTGCTCTTGGAGGTTGTATTGGGACCGGTCTATTCGTAGGTTCGG
GATCCACGCTGTCGACGGTGGGCCCAGCACCACTGTTCATGGGCTACTGT
GCCATGTCGTCGGTGGTGTGGTTTGTGATGAACGTGCTGGGCGAGATGAC
CACCTATTTGCCCATCAAGGGCATTTCGGTGCCTTATATGATAGGCCGCT
ATACGGAGCCGAGTATTGGATTCGCTGCTGCGATTCCGCAAAGCCTTGAC
CTACCATGGACTGCTGGACACGCTCACTTTCAAGACCCCTCTGCAGCCCT
ACGGCACATACTACGTTATTGTCGTCGTGTCCCTCCTGACCATCACGAAC
GGATATGCAGTTTTCTTCCCTGGCAACTTCACCGCCGCCGATTTCCTGGT
GTCGTATATTGTGGTGGCCATCTTCCTGGCCCTCTATGTGGGCCACAAAT
TGTGGTACCGGACTCCATGGATGACAAAGGTGTCGGAGATTGACGTGTTC
ACGGGCAAAGAGGAGATTGACCAGCTCTGCGCGAACGACTTTGAACGGAA
GCCACGCAATTGGCTGGAGAGGGTGTGGTGGTGGATTGCTTGATGATTCT
GCTACTCAACATTATTGCGGTGTCATGGTACGGAGAAGCCGAGTTCTGGT
TTGCAACGTTAAAGATCCTAGCCATCATTGGCCTGATTATCCTGGGTGTG
GTGCTCTTCTTCGGCGGTGGTCCCAACCATGATCGGCTAGGCTTCCGCTA
TTGGGATAACCCGGGCGCGTTCAATCCCTACTTGGTCGGTGGAAACACCG
GTCGCTTCCTGGACTTCTGGACAGCTTTCATCAAGTCTGGCTTCTCCTTC
ATTTTCTCCCCCGAACTTATCACCACTGCCGCTGGTGAAGTTGAAGCACC
CCGTCGCAATATCCCGAAAGCCACCAACCGGTTCATCTACCGAGTCTTTG
CCTTCTACATTCTGGGCACCCTCGTGATCGGTGTCACAGTCGCTTATAAT
GATCCTAAACTCATGTCCGCGGTTGCCAGCGGTAGCTCTAGCGCCAGTGC
CAGTCCTTTTGTTATTGCCATCCAGAATGCGGGTATCTCTGGGCTGAACC
ACGTCGTCAACGCTGCTATCCTGATCTCAGCCTGGTCCTCGGGTAATGCA
TGGTTGTTCGCTGGTTCTCGAACCCTGTACTCGCTCGCCTGCGGCGGCCA
GGCCCCCAAGATCTTCACCCGGTGCAACCGCAACGGCGTGCCTTACGTAG
CCGTGCTGATCACCTGGGTGGTCGGCTTGCTGTCCTTCCTGAACCTGTCT
GACTCAGGAGAGACTGTCTTCTACTGGTTCACGAACATCACCACAGTGGG
AGGGTTTATTAACTGGGTGCTCATTGGTATCACCTATCTGGTACTCTTTT
GCCATGTTACTGGCAAGTGAAGTGACGGCTGCCGGGATCATCATCCAGTA
CTGGACCACCTCCATCAATGTCGGGGTGTGGATCACAATCATCCTCCTCG
GATATAATTATTGATGGGTGCGCCGACGTTAAAGGACCTCGAAGAGTCCA
AGACCGAGGTGACATCTCCAGTATATGTTGATGAAGACCCCGAGGCCCTC
AAGGGCGAGATCCACCATGGGCCAAACACAGACACTCAGCGTGGATTGTC
TTCCCGACAGCTGCAGCTGCTTGCTCTTGGAGGTTGTATTGGGACCGGTC
TATTCGTAGGTTCGGGATCCACGCTGTCGACGGTGGGCCCAGCACCACTG
TTCATGGGCTACTGTGCCATGTCGTCGGTGGTGTGGTTTGTGATGAACGT
GCTGGGCGAGATGACCACCTATTTGCCCATCAAGGGCATTTCGGTGCCTT
ATATGATAGGCCGCTATACGGAGCCGAGTATTGGATTCGCTGCTGCGATT
CCGCAAAGCCTTGACCTACCATGGACTGCTGGACACGCTCACTTTCAAGA
CCCCTCTGCAGCCCTACGGCACATACTACGTTATTGTCGTCGTGTCCCTC
CTGACCATCACGAACGGATATGCAGTTTTCTTCCCTGGCAACTTCACCGC
CGCCGATTTCCTGGTGTCGTATATTGTGGTGGCCATCTTCCTGGCCCTCT
ATGTGGGCCACAAATTGTGGTACCGGACTCCATGGATGACAAAGGTGTCG
GAGATTGACGTGTTCACGGGCAAAGAGGAGATTGACCAGCTCTGCGCGAA
CGACTTTGAACGGAAGCCACGCAATTGGCTGGAGAGGGTGTGGTGGTGGA
TTGCTTGATGATTCTGCTACTCAACATTATTGCGGTGTCATGGTACGGAG
AAGCCGAGTTCTGGTTTGCAACGTTAAAGATCCTAGCCATCATTGGCCTG
ATTATCCTGGGTGTGGTGCTCTTCTTCGGCGGTGGTCCCAACCATGATCG
GCTAGGCTTCCGCTATTGGGATAACCCGGGCGCGTTCAATCCCTACTTGG
TCGGTGGAAACACCGGTCGCTTCCTGGACTTCTGGACAGCTTTCATCAAG
TCTGGCTTCTCCTTCATTTTCTCCCCCGAACTTATCACCACTGCCGCTGG
TGAAGTTGAAGCACCCCGTCGCAATATCCCGAAAGCCACCAACCGGTTCA
TCTACCGAGTCTTTGCCTTCTACATTCTGGGCACCCTCGTGATCGGTGTC
ACAGTCGCTTATAATGATCCTAAACTCATGTCCGCGGTTGCCAGCGGTAG
CTCTAGCGCCAGTGCCAGTCCTTTTGTTATTGCCATCCAGAATGCGGGTA
TCTCTGGGCTGAACCACGTCGTCAACGCTGCTATCCTGATCTCAGCCTGG
TCCTCGGGTAATGCATGGTTGTTCGCTGGTTCTCGAACCCTGTACTCGCT
CGCCTGCGGCGGCCAGGCCCCCAAGATCTTCACCCGGTGCAACCGCAACG
GCGTGCCTTACGTAGCCGTGCTGATCACCTGGGTGGTCGGCTTGCTGTCC
TTCCTGAACCTGTCTGACTCAGGAGAGACTGTCTTCTACTGGTTCACGAA
CATCACCACAGTGGGAGGGTTTATTAACTGGGTGCTCATTGGTATCACCT
ATCTGGTACTCTTTTGCCATGTTACTGGCAAGTGAAGTGACGGCTGCCGG
GATCATCATCCAGTACTGGACCACCTCCATCAATGTCGGGGTGTGGATCA
CAATCATCCTCCTCGGATATAATTATTGATGGGTGCGCCGACGTTAAAGG
ACCTCGAAGAGTCCAAGACCGAGGTGACATCTCCAGTATATGTTGATGAA
GACCCCGAGGCCCTCAAGGGCGAGATCCACCATGGGCCAAACACAGACAC
TCAGCGTGGATTGTCTTCCCGACAGCTGCAGCTGCTTGCTCTTGGAGGTT
GTATTGGGACCGGTCTATTCGTAGGTTCGGGATCCACGCTGTCGACGGTG
GGCCCAGCACCACTGTTCATGGGCTACTGTGCCATGTCGTCGGTGGTGTG
GTTTGTGATGAACGTGCTGGGCGAGATGACCACCTATTTGCCCATCAAGG
GCATTTCGGTGCCTTATATGATAGGCCGCTATACGGAGCCGAGTATTGGA
TTCGCTGCTGCGATTCCGCAAAGCCTTGACCTACCATGGACTGCTGGACA
CGCTCACTTTCAAGACCCCTCTGCAGCCCTACGGCACATACTACGTTATT
GTCGTCGTGTCCCTCCTGACCATCACGAACGGATATGCAGTTTTCTTCCC
TGGCAACTTCACCGCCGCCGATTTCCTGGTGTCGTATATTGTGGTGGCCA
TCTTCCTGGCCCTCTATGTGGGCCACAAATTGTGGTACCGGACTCCATGG
ATGACAAAGGTGTCGGAGATTGACGTGTTCACGGGCAAAGAGGAGATTGA
CCAGCTCTGCGCGAACGACTTTGAACGGAAGCCACGCAATTGGCTGGAGA
GGGTGTGGTGGTGGATTGCTTGATGATTCTGCTACTCAACATTATTGCGG
TGTCATGGTACGGAGAAGCCGAGTTCTGGTTTGCAACGTTAAAGATCCTA
GCCATCATTGGCCTGATTATCCTGGGTGTGGTGCTCTTCTTCGGCGGTGG
TCCCAACCATGATCGGCTAGGCTTCCGCTATTGGGATAACCCGGGCGCGT
TCAATCCCTACTTGGTCGGTGGAAACACCGGTCGCTTCCTGGACTTCTGG
ACAGCTTTCATCAAGTCTGGCTTCTCCTTCATTTTCTCCCCCGAACTTAT
CACCACTGCCGCTGGTGAAGTTGAAGCACCCCGTCGCAATATCCCGAAAG
CCACCAACCGGTTCATCTACCGAGTCTTTGCCTTCTACATTCTGGGCACC
CTCGTGATCGGTGTCACAGTCGCTTATAATGATCCTAAACTCATGTCCGC
GGTTGCCAGCGGTAGCTCTAGCGCCAGTGCCAGTCCTTTTGTTATTGCCA
TCCAGAATGCGGGTATCTCTGGGCTGAACCACGTCGTCAACGCTGCTATC
CTGATCTCAGCCTGGTCCTCGGGTAATGCATGGTTGTTCGCTGGTTCTCG
AACCCTGTACTCGCTCGCCTGCGGCGGCCAGGCCCCCAAGATCTTCACCC
GGTGCAACCGCAACGGCGTGCCTTACGTAGCCGTGCTGATCACCTGGGTG
GTCGGCTTGCTGTCCTTCCTGAACCTGTCTGACTCAGGAGAGACTGTCTT
CTACTGGTTCACGAACATCACCACAGTGGGAGGGTTTATTAACTGGGTGC
TCATTGGTATCACCTATCTGGTACTCTTTTGCCATGTTACTGGCAAGTGA
AGTGACGGCTGCCGGGATCATCATCCAGTACTGGACCACCTCCATCAATG
TCGGGGTGTGGATCACAATCATCCTCCTCGGATATAATTATTGATGGGTG
CGCCGACGTTAAAGGACCTCGAAGAGTCCAAGACCGAGGTGACATCTCCA
GTATATGTTGATGAAGACCCCGAGGCCCTCAAGGGCGAGATCCACCATGG
GCCAAACACAGACACTCAGCGTGGATTGTCTTCCCGACAGCTGCAGCTGC
TTGCTCTTGGAGGTTGTATTGGGACCGGTCTATTCGTAGGTTCGGGATCC
ACGCTGTCGACGGTGGGCCCAGCACCACTGTTCATGGGCTACTGTGCCAT
GTCGTCGGTGGTGTGGTTTGTGATGAACGTGCTGGGCGAGATGACCACCT
ATTTGCCCATCAAGGGCATTTCGGTGCCTTATATGATAGGCCGCTATACG
GAGCCGAGTATTGGATTCGCTGCTG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| ATCC64974_91830-T1 | ATCC64974_91830-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR004841 |
| DBxref | InterPro:IPR002293 |
| DBxref | PFAM:PF13520 |
| DBxref | PFAM:PF00324 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| OGUI01000016.1 | supercontig | OGUI01000016.1:1575294..1577189 - |
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