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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000017.1:594621..596656- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_97750-T1 ID=ATCC64974_97750-T1|Name=ATCC64974_97750-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=2036bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:594621..596656- (Aspergillus niger N402) ATGTCTCCGTCTGCCTTCGACGACACTGACCACGCACAGCGCGAGAGGTC
TCGTTCTCCCCGTCGTCGTTCTCGTAGCCCTCGACGCAGCCGTCGCTCGT
ACTCTCCCCGCAGTCGCTCTCGCAGCCGTGACGACTATCGCCGCTCCGAC
CGTCATTCTCGTTCGCCTATGAGTACGACCCAAGGCGCTCCCGGTGGTCA
TTCTGCTTCTGGTTACGGTGGGCGCGGCAGCTACCCACCTCCCCCCCGTT
CGTTCGAAGATCGCGCAGTCGCCAAAGAACAAATGATGCAAGCCGTGCGC
GAGTCGTCCCAGCAAGACCGTCGCGTCTATGTGGGCAACCTCTCCTACGA
TGTCAAGTGGCATCATCTGAAAGACTTTATGAGACAGGGTGAGCAGGGTC
ATATCGTGTTGCCGGGCGTGTGATAGCGTTTGTGCGGGTCTGGAATCTGT
GGCTGACTTTGGAGGGGGACGTTCCGCGCTCGAACAGCTGGAGAAGTCAT
CTTTGCCGATGTCTTACTGCTTCCCAATGGAATGTCGAAGGTGGGCGCCA
ATGCGTAGTGTGGCTGGTTTCCTTTCCCTTTTTTGTGTTTCTGGATTTTT
CTCTCCCCCGTTGGTTCGCTTGTTATGGACTGTTTGGGTTGACGGGCTGG
GCCTGGCCGTCCGGGATACTGTAGGGATGCGGGTGAGTCGATTCCGTTGG
TCTTTGATCGCCAGTATGTTGTTACTGACGGTGCGCAATAGGATTGTGGA
ATACGCGACCAGGGAACAAGCGCAAAATGCGGTAAACACCCTCAGCAACC
AGAACTTGATGGGAAGACTCGTCTACGTCCGTGAGGTATAATCCACCCTT
TTCCCTCCAGGTCACTGAAAACTTGATCGGTTCCTGACCAAAGCGCAGGA
TCGTGAGCCCGAGCCTCGTTTCACGGGAGGTCCCTCTCGTGGTGACTTCG
GAGGTGGTGGTCGCGGCGGCTTCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCCTGCCGGC
GGCGGCGCTGGTGGCCGTCAGCTTTATGTCTCGAATGTTGGTTTACTCCC
ATCCATTATTGACATTTTGATATCGTGCTCGACCGGAATTAGGTATTGAC
GCTGGGGATGTTTAGCTTCCATTCAACGTTGGCTGGCAAGACTTGAAGGA
TCTTTTCCGCCAAGCTGGTAAGTATGGGACGGCAGAGCCTCTATTCAACC
GCCATCTCTGCCTCCTCCCCATCGCAAGCTGTCTTCAGGACTAACATTGA
CTTCTCATTTAGCTCAGCAGGGTGCTGTGATCCGTGCCGATGTCCACACC
GATGCCACTGGCCGTCCCAAGGGCTCTGGTATTGTCGCCTTCGAGTCCCC
TGAGGATGCCCGGAATGCCATTCAGCAGTTCAACGGATACGACTGGCAAG
GACGCCAGCTGGAGGTTCGTGAGGATCGCTTCGCTGGTGCCGGACCTGGG
TTCGGTGGCCGTGGTGGTTTCGGCGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGTGGCTT
CGGCGGCCGCGGTGGCTTTGGTGGCCGTGGCGGTTTCGGCGGAGGCTTCC
GTGGTGGTTATGGCGGTGCTCCTGGCGGTTTCGGCGGTGCTCCTGGTGGT
TTCGAGGGCGTGCCCTCTGGACCTCCTAACCCGTTCACCGATTTCGCTAC
TTCTGGCGGCGACAAGAGCGCTGTCATTTACGTGCGCAACCTGCCTTGGT
CGACTTGCAACGAGGATCTGGTGGATCTGTTCTCGACTATTGGCAAAGTC
GATCGCGCGGAGATCCAGTACGAACCCAATGGTCGTTCCCGCGGCACTGG
TGTGGTTCAGTTCGATAGTGCGGACACTGCGGAGACGGCTATCGGTAGGT
CTTGTGATTTAATTAGCAAGGAAGACAGCTACTAACTGCACTACAGCTAA
GTTCACCGGCTACCAGTATGGCGGTCGTCCCCTGGGCATTACGTTTGTCA
AGTACATGAACGCCGGCCCAGGGCCTGGTGATGCGATGGATGGCACCGAG
CCGACTGCTCCGATCACGCAGGATCAGATCATGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000017.1:594621..596656- >ATCC64974_97750-T1 ID=ATCC64974_97750-T1|Name=ATCC64974_97750-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=11640bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:594621..596656- (Aspergillus niger N402) CTAAGTTCACCGGCTACCAGTATGGCGGTCGTCCCCTGGGCATTACGTTT GTCAAGTACATGAACGCCGGCCCAGGGCCTGGTGATGCGATGGATGGCAC CGAGCCGACTGCTCCGATCACGCAGGATCAGATCATGTAACTCAGCAGGG TGCTGTGATCCGTGCCGATGTCCACACCGATGCCACTGGCCGTCCCAAGG GCTCTGGTATTGTCGCCTTCGAGTCCCCTGAGGATGCCCGGAATGCCATT CAGCAGTTCAACGGATACGACTGGCAAGGACGCCAGCTGGAGGTTCGTGA GGATCGCTTCGCTGGTGCCGGACCTGGGTTCGGTGGCCGTGGTGGTTTCG GCGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGTGGCTTCGGCGGCCGCGGTGGCTTTGGT GGCCGTGGCGGTTTCGGCGGAGGCTTCCGTGGTGGTTATGGCGGTGCTCC TGGCGGTTTCGGCGGTGCTCCTGGTGGTTTCGAGGGCGTGCCCTCTGGAC CTCCTAACCCGTTCACCGATTTCGCTACTTCTGGCGGCGACAAGAGCGCT GTCATTTACGTGCGCAACCTGCCTTGGTCGACTTGCAACGAGGATCTGGT GGATCTGTTCTCGACTATTGGCAAAGTCGATCGCGCGGAGATCCAGTACG AACCCAATGGTCGTTCCCGCGGCACTGGTGTGGTTCAGTTCGATAGTGCG GACACTGCGGAGACGGCTATCGCTTCCATTCAACGTTGGCTGGCAAGACT TGAAGGATCTTTTCCGCCAAGCTGGATCGTGAGCCCGAGCCTCGTTTCAC GGGAGGTCCCTCTCGTGGTGACTTCGGAGGTGGTGGTCGCGGCGGCTTCG GCGGCGGCTTCGGCGGGCCTGCCGGCGGCGGCGCTGGTGGCCGTCAGCTT TATGTCTCGAATGATTGTGGAATACGCGACCAGGGAACAAGCGCAAAATG CGGTAAACACCCTCAGCAACCAGAACTTGATGGGAAGACTCGTCTACGTC CGTGAGGGATGCGGCTGGAGAAGTCATCTTTGCCGATGTCTTACTGCTTC CCAATGGAATGTCGAAGATGTCTCCGTCTGCCTTCGACGACACTGACCAC GCACAGCGCGAGAGGTCTCGTTCTCCCCGTCGTCGTTCTCGTAGCCCTCG ACGCAGCCGTCGCTCGTACTCTCCCCGCAGTCGCTCTCGCAGCCGTGACG ACTATCGCCGCTCCGACCGTCATTCTCGTTCGCCTATGAGTACGACCCAA GGCGCTCCCGGTGGTCATTCTGCTTCTGGTTACGGTGGGCGCGGCAGCTA CCCACCTCCCCCCCGTTCGTTCGAAGATCGCGCAGTCGCCAAAGAACAAA TGATGCAAGCCGTGCGCGAGTCGTCCCAGCAAGACCGTCGCGTCTATGTG GGCAACCTCTCCTACGATGTCAAGTGGCATCATCTGAAAGACTTTATGAG ACAGGCTAAGTTCACCGGCTACCAGTATGGCGGTCGTCCCCTGGGCATTA CGTTTGTCAAGTACATGAACGCCGGCCCAGGGCCTGGTGATGCGATGGAT GGCACCGAGCCGACTGCTCCGATCACGCAGGATCAGATCATGTAACTCAG CAGGGTGCTGTGATCCGTGCCGATGTCCACACCGATGCCACTGGCCGTCC CAAGGGCTCTGGTATTGTCGCCTTCGAGTCCCCTGAGGATGCCCGGAATG CCATTCAGCAGTTCAACGGATACGACTGGCAAGGACGCCAGCTGGAGGTT CGTGAGGATCGCTTCGCTGGTGCCGGACCTGGGTTCGGTGGCCGTGGTGG TTTCGGCGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGTGGCTTCGGCGGCCGCGGTGGCT TTGGTGGCCGTGGCGGTTTCGGCGGAGGCTTCCGTGGTGGTTATGGCGGT GCTCCTGGCGGTTTCGGCGGTGCTCCTGGTGGTTTCGAGGGCGTGCCCTC TGGACCTCCTAACCCGTTCACCGATTTCGCTACTTCTGGCGGCGACAAGA GCGCTGTCATTTACGTGCGCAACCTGCCTTGGTCGACTTGCAACGAGGAT CTGGTGGATCTGTTCTCGACTATTGGCAAAGTCGATCGCGCGGAGATCCA GTACGAACCCAATGGTCGTTCCCGCGGCACTGGTGTGGTTCAGTTCGATA GTGCGGACACTGCGGAGACGGCTATCGCTTCCATTCAACGTTGGCTGGCA AGACTTGAAGGATCTTTTCCGCCAAGCTGGATCGTGAGCCCGAGCCTCGT TTCACGGGAGGTCCCTCTCGTGGTGACTTCGGAGGTGGTGGTCGCGGCGG CTTCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCCTGCCGGCGGCGGCGCTGGTGGCCGTC AGCTTTATGTCTCGAATGATTGTGGAATACGCGACCAGGGAACAAGCGCA AAATGCGGTAAACACCCTCAGCAACCAGAACTTGATGGGAAGACTCGTCT ACGTCCGTGAGGGATGCGGCTGGAGAAGTCATCTTTGCCGATGTCTTACT GCTTCCCAATGGAATGTCGAAGATGTCTCCGTCTGCCTTCGACGACACTG ACCACGCACAGCGCGAGAGGTCTCGTTCTCCCCGTCGTCGTTCTCGTAGC CCTCGACGCAGCCGTCGCTCGTACTCTCCCCGCAGTCGCTCTCGCAGCCG TGACGACTATCGCCGCTCCGACCGTCATTCTCGTTCGCCTATGAGTACGA CCCAAGGCGCTCCCGGTGGTCATTCTGCTTCTGGTTACGGTGGGCGCGGC AGCTACCCACCTCCCCCCCGTTCGTTCGAAGATCGCGCAGTCGCCAAAGA ACAAATGATGCAAGCCGTGCGCGAGTCGTCCCAGCAAGACCGTCGCGTCT ATGTGGGCAACCTCTCCTACGATGTCAAGTGGCATCATCTGAAAGACTTT ATGAGACAGGCTAAGTTCACCGGCTACCAGTATGGCGGTCGTCCCCTGGG CATTACGTTTGTCAAGTACATGAACGCCGGCCCAGGGCCTGGTGATGCGA TGGATGGCACCGAGCCGACTGCTCCGATCACGCAGGATCAGATCATGTAA CTCAGCAGGGTGCTGTGATCCGTGCCGATGTCCACACCGATGCCACTGGC CGTCCCAAGGGCTCTGGTATTGTCGCCTTCGAGTCCCCTGAGGATGCCCG GAATGCCATTCAGCAGTTCAACGGATACGACTGGCAAGGACGCCAGCTGG AGGTTCGTGAGGATCGCTTCGCTGGTGCCGGACCTGGGTTCGGTGGCCGT GGTGGTTTCGGCGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGTGGCTTCGGCGGCCGCGG TGGCTTTGGTGGCCGTGGCGGTTTCGGCGGAGGCTTCCGTGGTGGTTATG GCGGTGCTCCTGGCGGTTTCGGCGGTGCTCCTGGTGGTTTCGAGGGCGTG CCCTCTGGACCTCCTAACCCGTTCACCGATTTCGCTACTTCTGGCGGCGA 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CTGGGCATTACGTTTGTCAAGTACATGAACGCCGGCCCAGGGCCTGGTGA TGCGATGGATGGCACCGAGCCGACTGCTCCGATCACGCAGGATCAGATCA TGTAACTCAGCAGGGTGCTGTGATCCGTGCCGATGTCCACACCGATGCCA CTGGCCGTCCCAAGGGCTCTGGTATTGTCGCCTTCGAGTCCCCTGAGGAT GCCCGGAATGCCATTCAGCAGTTCAACGGATACGACTGGCAAGGACGCCA GCTGGAGGTTCGTGAGGATCGCTTCGCTGGTGCCGGACCTGGGTTCGGTG GCCGTGGTGGTTTCGGCGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGTGGCTTCGGCGGC CGCGGTGGCTTTGGTGGCCGTGGCGGTTTCGGCGGAGGCTTCCGTGGTGG TTATGGCGGTGCTCCTGGCGGTTTCGGCGGTGCTCCTGGTGGTTTCGAGG GCGTGCCCTCTGGACCTCCTAACCCGTTCACCGATTTCGCTACTTCTGGC GGCGACAAGAGCGCTGTCATTTACGTGCGCAACCTGCCTTGGTCGACTTG CAACGAGGATCTGGTGGATCTGTTCTCGACTATTGGCAAAGTCGATCGCG CGGAGATCCAGTACGAACCCAATGGTCGTTCCCGCGGCACTGGTGTGGTT CAGTTCGATAGTGCGGACACTGCGGAGACGGCTATCGCTTCCATTCAACG TTGGCTGGCAAGACTTGAAGGATCTTTTCCGCCAAGCTGGATCGTGAGCC CGAGCCTCGTTTCACGGGAGGTCCCTCTCGTGGTGACTTCGGAGGTGGTG GTCGCGGCGGCTTCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCCTGCCGGCGGCGGCGCT GGTGGCCGTCAGCTTTATGTCTCGAATGATTGTGGAATACGCGACCAGGG AACAAGCGCAAAATGCGGTAAACACCCTCAGCAACCAGAACTTGATGGGA 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CGAGGGCGTGCCCTCTGGACCTCCTAACCCGTTCACCGATTTCGCTACTT CTGGCGGCGACAAGAGCGCTGTCATTTACGTGCGCAACCTGCCTTGGTCG ACTTGCAACGAGGATCTGGTGGATCTGTTCTCGACTATTGGCAAAGTCGA TCGCGCGGAGATCCAGTACGAACCCAATGGTCGTTCCCGCGGCACTGGTG TGGTTCAGTTCGATAGTGCGGACACTGCGGAGACGGCTATCGCTTCCATT CAACGTTGGCTGGCAAGACTTGAAGGATCTTTTCCGCCAAGCTGGATCGT GAGCCCGAGCCTCGTTTCACGGGAGGTCCCTCTCGTGGTGACTTCGGAGG TGGTGGTCGCGGCGGCTTCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCCTGCCGGCGGCG GCGCTGGTGGCCGTCAGCTTTATGTCTCGAATGATTGTGGAATACGCGAC CAGGGAACAAGCGCAAAATGCGGTAAACACCCTCAGCAACCAGAACTTGA TGGGAAGACTCGTCTACGTCCGTGAGGGATGCGGCTGGAGAAGTCATCTT TGCCGATGTCTTACTGCTTCCCAATGGAATGTCGAAGATGTCTCCGTCTG CCTTCGACGACACTGACCACGCACAGCGCGAGAGGTCTCGTTCTCCCCGT CGTCGTTCTCGTAGCCCTCGACGCAGCCGTCGCTCGTACTCTCCCCGCAG TCGCTCTCGCAGCCGTGACGACTATCGCCGCTCCGACCGTCATTCTCGTT CGCCTATGAGTACGACCCAAGGCGCTCCCGGTGGTCATTCTGCTTCTGGT TACGGTGGGCGCGGCAGCTACCCACCTCCCCCCCGTTCGTTCGAAGATCG CGCAGTCGCCAAAGAACAAATGATGCAAGCCGTGCGCGAGTCGTCCCAGC AAGACCGTCGCGTCTATGTGGGCAACCTCTCCTACGATGTCAAGTGGCAT CATCTGAAAGACTTTATGAGACAGGCTAAGTTCACCGGCTACCAGTATGG CGGTCGTCCCCTGGGCATTACGTTTGTCAAGTACATGAACGCCGGCCCAG GGCCTGGTGATGCGATGGATGGCACCGAGCCGACTGCTCCGATCACGCAG GATCAGATCATGTAACTCAGCAGGGTGCTGTGATCCGTGCCGATGTCCAC ACCGATGCCACTGGCCGTCCCAAGGGCTCTGGTATTGTCGCCTTCGAGTC CCCTGAGGATGCCCGGAATGCCATTCAGCAGTTCAACGGATACGACTGGC AAGGACGCCAGCTGGAGGTTCGTGAGGATCGCTTCGCTGGTGCCGGACCT GGGTTCGGTGGCCGTGGTGGTTTCGGCGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGTGG CTTCGGCGGCCGCGGTGGCTTTGGTGGCCGTGGCGGTTTCGGCGGAGGCT TCCGTGGTGGTTATGGCGGTGCTCCTGGCGGTTTCGGCGGTGCTCCTGGT GGTTTCGAGGGCGTGCCCTCTGGACCTCCTAACCCGTTCACCGATTTCGC TACTTCTGGCGGCGACAAGAGCGCTGTCATTTACGTGCGCAACCTGCCTT GGTCGACTTGCAACGAGGATCTGGTGGATCTGTTCTCGACTATTGGCAAA GTCGATCGCGCGGAGATCCAGTACGAACCCAATGGTCGTTCCCGCGGCAC TGGTGTGGTTCAGTTCGATAGTGCGGACACTGCGGAGACGGCTATCGCTT CCATTCAACGTTGGCTGGCAAGACTTGAAGGATCTTTTCCGCCAAGCTGG ATCGTGAGCCCGAGCCTCGTTTCACGGGAGGTCCCTCTCGTGGTGACTTC GGAGGTGGTGGTCGCGGCGGCTTCGGCGGCGGCTTCGGCGGGCCTGCCGG CGGCGGCGCTGGTGGCCGTCAGCTTTATGTCTCGAATGATTGTGGAATAC GCGACCAGGGAACAAGCGCAAAATGCGGTAAACACCCTCAGCAACCAGAA CTTGATGGGAAGACTCGTCTACGTCCGTGAGGGATGCGGCTGGAGAAGTC ATCTTTGCCGATGTCTTACTGCTTCCCAATGGAATGTCGAAGATGTCTCC GTCTGCCTTCGACGACACTGACCACGCACAGCGCGAGAGGTCTCGTTCTC CCCGTCGTCGTTCTCGTAGCCCTCGACGCAGCCGTCGCTCGTACTCTCCC CGCAGTCGCTCTCGCAGCCGTGACGACTATCGCCGCTCCGACCGTCATTC TCGTTCGCCTATGAGTACGACCCAAGGCGCTCCCGGTGGTCATTCTGCTT CTGGTTACGGTGGGCGCGGCAGCTACCCACCTCCCCCCCGTTCGTTCGAA GATCGCGCAGTCGCCAAAGAACAAATGATGCAAGCCGTGCGCGAGTCGTC CCAGCAAGACCGTCGCGTCTATGTGGGCAACCTCTCCTACGATGTCAAGT GGCATCATCTGAAAGACTTTATGAGACAGGCTAAGTTCACCGGCTACCAG TATGGCGGTCGTCCCCTGGGCATTACGTTTGTCAAGTACATGAACGCCGG CCCAGGGCCTGGTGATGCGATGGATGGCACCGAGCCGACTGCTCCGATCA CGCAGGATCAGATCATGTAACTCAGCAGGGTGCTGTGATCCGTGCCGATG TCCACACCGATGCCACTGGCCGTCCCAAGGGCTCTGGTATTGTCGCCTTC GAGTCCCCTGAGGATGCCCGGAATGCCATTCAGCAGTTCAACGGATACGA CTGGCAAGGACGCCAGCTGGAGGTTCGTGAGGATCGCTTCGCTGGTGCCG GACCTGGGTTCGGTGGCCGTGGTGGTTTCGGCGGTCGTGGTGGCTTTGGT GGTGGCTTCGGCGGCCGCGGTGGCTTTGGTGGCCGTGGCGGTTTCGGCGG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0003676 | nucleic acid binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| ATCC64974_97750-T1 | ATCC64974_97750-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | EggNog:ENOG41 |
| DBxref | InterPro:IPR035979 |
| DBxref | InterPro:IPR012677 |
| DBxref | InterPro:IPR000504 |
| DBxref | PFAM:PF00076 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| OGUI01000017.1 | supercontig | OGUI01000017.1:594621..596656 - |
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