You are here

Home

KYF_000662-T1, KYF_000662-T1 (mRNA) Aspergillus niger KYF3

Overview
NameKYF_000662-T1
Unique NameKYF_000662-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger KYF3
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at ch1:1512644..1514280+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>KYF_000662-T1 ID=KYF_000662-T1|Name=KYF_000662-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1637bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:1512644..1514280+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGATGCTGTCGCGGTCTACTTTCAGCCGAAATGCGCCCCGTGCGCTCCA
GAAGCAGTGCTCTGCTACTGGCGTCAGCAGCCGTCGGGGCATGGCCTCTG
CTGCCACTCCTGGTCTCCAGTACGATGTCTCTGAGTCTGCTGGTGTGAAG
GTCGCCAACCGGGAAGTTGCTGGCCCTACCAGCACTCTTGCTCTGGTTGC
AAAGGCCGGTCCCCGTTACCAGCCCGTCCCTGGCTTCTCCGATGCCCTCG
AACAGTTCGCTTTCAAGGTTCGTCCTTCCTGGCTTCGATCCCACGTCCAC
ACTCTCTACCACATTCCTCTTTAAGGCAAATACTAACCCATTCTTCTTCT
CAATTGACAGTCTACTCTGAAGCGCTCGGCACTGCGGATCAATCGGGAAG
TCGAACTGCTGGGCGGTGAAGTTTCCTCTACACACTCTCGCGAGAACGTC
GTCCTCAAGGCCAAGTTCCTCTCGGGCGATCTCCCCTACTTCGCTGAGCT
TCTCGCCGAGGTTGCTTCTCAGACCAAGTTTGCAGGTGAGTAAGGAGACA
ACGGGAACAAGCCGCCACCCCTTCCCCCCTCCAAAAGTCAGACGAACCGG
TCTAATTCGGCTTCTCAGCCCACGAGTTGAGCGAGGTTGTCCTCAAGACC
CTCAAGTACAGACAACAGGCCCTTGCCGCCAACCCCGAGGCCGTCGCTGT
CGATGCCGCTCACGCCGTCGCTTTCCACCGGGGCCTGGGTGAAAGCATCA
CCCCCTCGACCACCGTTCCCCTCGAGAAGTACCTCTCCGCTGAGGCTCTG
GCTGAGTACGCTCAGCAGGCCTTTGCCAAGTCCAACATCGCTCTTGTTGG
CAGCGGTGCCAGCTCCGCCGACGTCTCCAAGTGGGTTGGTGACTTCTTCA
AGGCTGTCCCCAGCGGTGCCCAGCTCCAGAGCGCTGCCTCCAAGTACTAC
GGTGGTGAGCAGCGTATCTCCACCAAGGCCGGCAACGCCCTTGTGATTGC
CTTCCCTGGCTCTGGTGCTTTCGGAACCTCTGCCTACAAGCCCGAGGCCT
CTGTCCTTGCTGCCCTCTTGGGTGGTGAGTCCTCCATCAAGTGGACCCCC
GGTTTCTCCCTCCTCGCCCAGGCCACCCAGGGCTTCTCCCAGGTCCGTGC
CTCGACCCAGAACCTTACCTACTCGGACGCTGGTCTCTTCACCATCGCTC
TCTCCGGTAAGGCCGACCAGATCACTTCTGCTGGTAAGAACGCCGTCGAC
CTTCTCAAGAAGGTTGCCGCTGGTGAGATTGCCGGTGAGGAGATCAAGAA
GGCCGTTGCCCTCGCCAAGTTCCGCGCTCTCGAGTCCGCCCAGACCCTTG
AGACTGGTCTCGAGGCTACCGGATCCGCTCTCATCAACGGCAGCAAGCCT
TACCAGATTGGTGAGGTTGCTCAGAGCATTGATGCCGTCACTGAGGCTCA
GGTTAAGGATGTAAGTTTACCTATTTACCTTCCCTTGTCTTCTCTGGGAT
CAATTTCTTTGGAGAGTAACGGCTAATGTTTTTGTACACAGGTTGCCAAG
TCCTTCCTGTCTGGCAAGGCCTCCGTCGCCACAGTTGGAGATCTCTTCCA
GCTCCCCTACGGCGAGGACCTTGGTCTGACTGTTTAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at ch1:1512644..1514280+

>KYF_000662-T1 ID=KYF_000662-T1|Name=KYF_000662-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=5520bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:1512644..1514280+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGATGCTGTCGCGGTCTACTTTCAGCCGAAATGCGCCCCGTGCGCTCCA
GAAGCAGTGCTCTGCTACTGGCGTCAGCAGCCGTCGGGGCATGGCCTCTG
CTGCCACTCCTGGTCTCCAGTACGATGTCTCTGAGTCTGCTGGTGTGAAG
GTCGCCAACCGGGAAGTTGCTGGCCCTACCAGCACTCTTGCTCTGGTTGC
AAAGGCCGGTCCCCGTTACCAGCCCGTCCCTGGCTTCTCCGATGCCCTCG
AACAGTTCGCTTTCAAGTCTACTCTGAAGCGCTCGGCACTGCGGATCAAT
CGGGAAGTCGAACTGCTGGGCGGTGAAGTTTCCTCTACACACTCTCGCGA
GAACGTCGTCCTCAAGGCCAAGTTCCTCTCGGGCGATCTCCCCTACTTCG
CTGAGCTTCTCGCCGAGGTTGCTTCTCAGACCAAGTTTGCAGCCCACGAG
TTGAGCGAGGTTGTCCTCAAGACCCTCAAGTACAGACAACAGGCCCTTGC
CGCCAACCCCGAGGCCGTCGCTGTCGATGCCGCTCACGCCGTCGCTTTCC
ACCGGGGCCTGGGTGAAAGCATCACCCCCTCGACCACCGTTCCCCTCGAG
AAGTACCTCTCCGCTGAGGCTCTGGCTGAGTACGCTCAGCAGGCCTTTGC
CAAGTCCAACATCGCTCTTGTTGGCAGCGGTGCCAGCTCCGCCGACGTCT
CCAAGTGGGTTGGTGACTTCTTCAAGGCTGTCCCCAGCGGTGCCCAGCTC
CAGAGCGCTGCCTCCAAGTACTACGGTGGTGAGCAGCGTATCTCCACCAA
GGCCGGCAACGCCCTTGTGATTGCCTTCCCTGGCTCTGGTGCTTTCGGAA
CCTCTGCCTACAAGCCCGAGGCCTCTGTCCTTGCTGCCCTCTTGGGTGGT
GAGTCCTCCATCAAGTGGACCCCCGGTTTCTCCCTCCTCGCCCAGGCCAC
CCAGGGCTTCTCCCAGGTCCGTGCCTCGACCCAGAACCTTACCTACTCGG
ACGCTGGTCTCTTCACCATCGCTCTCTCCGGTAAGGCCGACCAGATCACT
TCTGCTGGTAAGAACGCCGTCGACCTTCTCAAGAAGGTTGCCGCTGGTGA
GATTGCCGGTGAGGAGATCAAGAAGGCCGTTGCCCTCGCCAAGTTCCGCG
CTCTCGAGTCCGCCCAGACCCTTGAGACTGGTCTCGAGGCTACCGGATCC
GCTCTCATCAACGGCAGCAAGCCTTACCAGATTGGTGAGGTTGCTCAGAG
CATTGATGCCGTCACTGAGGCTCAGGTTAAGGATGTTGCCAAGTCCTTCC
TGTCTGGCAAGGCCTCCGTCGCCACAGTTGGAGATCTCTTCCAGCTCCCC
TACGGCGAGGACCTTGGTCTGACTGTTTAAATGATGCTGTCGCGGTCTAC
TTTCAGCCGAAATGCGCCCCGTGCGCTCCAGAAGCAGTGCTCTGCTACTG
GCGTCAGCAGCCGTCGGGGCATGGCCTCTGCTGCCACTCCTGGTCTCCAG
TACGATGTCTCTGAGTCTGCTGGTGTGAAGGTCGCCAACCGGGAAGTTGC
TGGCCCTACCAGCACTCTTGCTCTGGTTGCAAAGGCCGGTCCCCGTTACC
AGCCCGTCCCTGGCTTCTCCGATGCCCTCGAACAGTTCGCTTTCAAGTCT
ACTCTGAAGCGCTCGGCACTGCGGATCAATCGGGAAGTCGAACTGCTGGG
CGGTGAAGTTTCCTCTACACACTCTCGCGAGAACGTCGTCCTCAAGGCCA
AGTTCCTCTCGGGCGATCTCCCCTACTTCGCTGAGCTTCTCGCCGAGGTT
GCTTCTCAGACCAAGTTTGCAGCCCACGAGTTGAGCGAGGTTGTCCTCAA
GACCCTCAAGTACAGACAACAGGCCCTTGCCGCCAACCCCGAGGCCGTCG
CTGTCGATGCCGCTCACGCCGTCGCTTTCCACCGGGGCCTGGGTGAAAGC
ATCACCCCCTCGACCACCGTTCCCCTCGAGAAGTACCTCTCCGCTGAGGC
TCTGGCTGAGTACGCTCAGCAGGCCTTTGCCAAGTCCAACATCGCTCTTG
TTGGCAGCGGTGCCAGCTCCGCCGACGTCTCCAAGTGGGTTGGTGACTTC
TTCAAGGCTGTCCCCAGCGGTGCCCAGCTCCAGAGCGCTGCCTCCAAGTA
CTACGGTGGTGAGCAGCGTATCTCCACCAAGGCCGGCAACGCCCTTGTGA
TTGCCTTCCCTGGCTCTGGTGCTTTCGGAACCTCTGCCTACAAGCCCGAG
GCCTCTGTCCTTGCTGCCCTCTTGGGTGGTGAGTCCTCCATCAAGTGGAC
CCCCGGTTTCTCCCTCCTCGCCCAGGCCACCCAGGGCTTCTCCCAGGTCC
GTGCCTCGACCCAGAACCTTACCTACTCGGACGCTGGTCTCTTCACCATC
GCTCTCTCCGGTAAGGCCGACCAGATCACTTCTGCTGGTAAGAACGCCGT
CGACCTTCTCAAGAAGGTTGCCGCTGGTGAGATTGCCGGTGAGGAGATCA
AGAAGGCCGTTGCCCTCGCCAAGTTCCGCGCTCTCGAGTCCGCCCAGACC
CTTGAGACTGGTCTCGAGGCTACCGGATCCGCTCTCATCAACGGCAGCAA
GCCTTACCAGATTGGTGAGGTTGCTCAGAGCATTGATGCCGTCACTGAGG
CTCAGGTTAAGGATGTTGCCAAGTCCTTCCTGTCTGGCAAGGCCTCCGTC
GCCACAGTTGGAGATCTCTTCCAGCTCCCCTACGGCGAGGACCTTGGTCT
GACTGTTTAAATGATGCTGTCGCGGTCTACTTTCAGCCGAAATGCGCCCC
GTGCGCTCCAGAAGCAGTGCTCTGCTACTGGCGTCAGCAGCCGTCGGGGC
ATGGCCTCTGCTGCCACTCCTGGTCTCCAGTACGATGTCTCTGAGTCTGC
TGGTGTGAAGGTCGCCAACCGGGAAGTTGCTGGCCCTACCAGCACTCTTG
CTCTGGTTGCAAAGGCCGGTCCCCGTTACCAGCCCGTCCCTGGCTTCTCC
GATGCCCTCGAACAGTTCGCTTTCAAGTCTACTCTGAAGCGCTCGGCACT
GCGGATCAATCGGGAAGTCGAACTGCTGGGCGGTGAAGTTTCCTCTACAC
ACTCTCGCGAGAACGTCGTCCTCAAGGCCAAGTTCCTCTCGGGCGATCTC
CCCTACTTCGCTGAGCTTCTCGCCGAGGTTGCTTCTCAGACCAAGTTTGC
AGCCCACGAGTTGAGCGAGGTTGTCCTCAAGACCCTCAAGTACAGACAAC
AGGCCCTTGCCGCCAACCCCGAGGCCGTCGCTGTCGATGCCGCTCACGCC
GTCGCTTTCCACCGGGGCCTGGGTGAAAGCATCACCCCCTCGACCACCGT
TCCCCTCGAGAAGTACCTCTCCGCTGAGGCTCTGGCTGAGTACGCTCAGC
AGGCCTTTGCCAAGTCCAACATCGCTCTTGTTGGCAGCGGTGCCAGCTCC
GCCGACGTCTCCAAGTGGGTTGGTGACTTCTTCAAGGCTGTCCCCAGCGG
TGCCCAGCTCCAGAGCGCTGCCTCCAAGTACTACGGTGGTGAGCAGCGTA
TCTCCACCAAGGCCGGCAACGCCCTTGTGATTGCCTTCCCTGGCTCTGGT
GCTTTCGGAACCTCTGCCTACAAGCCCGAGGCCTCTGTCCTTGCTGCCCT
CTTGGGTGGTGAGTCCTCCATCAAGTGGACCCCCGGTTTCTCCCTCCTCG
CCCAGGCCACCCAGGGCTTCTCCCAGGTCCGTGCCTCGACCCAGAACCTT
ACCTACTCGGACGCTGGTCTCTTCACCATCGCTCTCTCCGGTAAGGCCGA
CCAGATCACTTCTGCTGGTAAGAACGCCGTCGACCTTCTCAAGAAGGTTG
CCGCTGGTGAGATTGCCGGTGAGGAGATCAAGAAGGCCGTTGCCCTCGCC
AAGTTCCGCGCTCTCGAGTCCGCCCAGACCCTTGAGACTGGTCTCGAGGC
TACCGGATCCGCTCTCATCAACGGCAGCAAGCCTTACCAGATTGGTGAGG
TTGCTCAGAGCATTGATGCCGTCACTGAGGCTCAGGTTAAGGATGTTGCC
AAGTCCTTCCTGTCTGGCAAGGCCTCCGTCGCCACAGTTGGAGATCTCTT
CCAGCTCCCCTACGGCGAGGACCTTGGTCTGACTGTTTAAATGATGCTGT
CGCGGTCTACTTTCAGCCGAAATGCGCCCCGTGCGCTCCAGAAGCAGTGC
TCTGCTACTGGCGTCAGCAGCCGTCGGGGCATGGCCTCTGCTGCCACTCC
TGGTCTCCAGTACGATGTCTCTGAGTCTGCTGGTGTGAAGGTCGCCAACC
GGGAAGTTGCTGGCCCTACCAGCACTCTTGCTCTGGTTGCAAAGGCCGGT
CCCCGTTACCAGCCCGTCCCTGGCTTCTCCGATGCCCTCGAACAGTTCGC
TTTCAAGTCTACTCTGAAGCGCTCGGCACTGCGGATCAATCGGGAAGTCG
AACTGCTGGGCGGTGAAGTTTCCTCTACACACTCTCGCGAGAACGTCGTC
CTCAAGGCCAAGTTCCTCTCGGGCGATCTCCCCTACTTCGCTGAGCTTCT
CGCCGAGGTTGCTTCTCAGACCAAGTTTGCAGCCCACGAGTTGAGCGAGG
TTGTCCTCAAGACCCTCAAGTACAGACAACAGGCCCTTGCCGCCAACCCC
GAGGCCGTCGCTGTCGATGCCGCTCACGCCGTCGCTTTCCACCGGGGCCT
GGGTGAAAGCATCACCCCCTCGACCACCGTTCCCCTCGAGAAGTACCTCT
CCGCTGAGGCTCTGGCTGAGTACGCTCAGCAGGCCTTTGCCAAGTCCAAC
ATCGCTCTTGTTGGCAGCGGTGCCAGCTCCGCCGACGTCTCCAAGTGGGT
TGGTGACTTCTTCAAGGCTGTCCCCAGCGGTGCCCAGCTCCAGAGCGCTG
CCTCCAAGTACTACGGTGGTGAGCAGCGTATCTCCACCAAGGCCGGCAAC
GCCCTTGTGATTGCCTTCCCTGGCTCTGGTGCTTTCGGAACCTCTGCCTA
CAAGCCCGAGGCCTCTGTCCTTGCTGCCCTCTTGGGTGGTGAGTCCTCCA
TCAAGTGGACCCCCGGTTTCTCCCTCCTCGCCCAGGCCACCCAGGGCTTC
TCCCAGGTCCGTGCCTCGACCCAGAACCTTACCTACTCGGACGCTGGTCT
CTTCACCATCGCTCTCTCCGGTAAGGCCGACCAGATCACTTCTGCTGGTA
AGAACGCCGTCGACCTTCTCAAGAAGGTTGCCGCTGGTGAGATTGCCGGT
GAGGAGATCAAGAAGGCCGTTGCCCTCGCCAAGTTCCGCGCTCTCGAGTC
CGCCCAGACCCTTGAGACTGGTCTCGAGGCTACCGGATCCGCTCTCATCA
ACGGCAGCAAGCCTTACCAGATTGGTGAGGTTGCTCAGAGCATTGATGCC
GTCACTGAGGCTCAGGTTAAGGATGTTGCCAAGTCCTTCCTGTCTGGCAA
GGCCTCCGTCGCCACAGTTGGAGATCTCTTCCAGCTCCCCTACGGCGAGG
ACCTTGGTCTGACTGTTTAA
back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0046872metal ion binding
GO:0003824catalytic activity
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_000662KYF_000662Aspergillus niger KYF3gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_000662-T1.exon1KYF_000662-T1.exon1Aspergillus niger KYF3exon
KYF_000662-T1.exon2KYF_000662-T1.exon2Aspergillus niger KYF3exon
KYF_000662-T1.exon3KYF_000662-T1.exon3Aspergillus niger KYF3exon
KYF_000662-T1.exon4KYF_000662-T1.exon4Aspergillus niger KYF3exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_000662-T1.cdsKYF_000662-T1.cdsAspergillus niger KYF3CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_000662-T1KYF_000662-T1-proteinAspergillus niger KYF3polypeptide


Properties
Property NameValue
NoteMEROPS:MER0003544
DBxrefInterPro:IPR011249
DBxrefInterPro:IPR011765
DBxrefInterPro:IPR007863
DBxrefPFAM:PF05193
DBxrefPFAM:PF00675
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Aspergillus Aspergillus niger KYF32020-10-09
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
ch1supercontigch1:1512644..1514280 +
Powered by Drupal