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KYF_005961-T1, KYF_005961-T1 (mRNA) Aspergillus niger KYF3

Overview
NameKYF_005961-T1
Unique NameKYF_005961-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger KYF3
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at ch4:5346661..5348463+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>KYF_005961-T1 ID=KYF_005961-T1|Name=KYF_005961-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1803bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:5346661..5348463+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTC
TGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACTCCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCG
AGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGG
CGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGG
TTACTCTACTGGTATGGTGACATCGATTCTCTGCAGCTAGTCCCCTCGGT
TGCTAACCTTTTCCACCACCAGGTCAAATCTCTGGTTTCGAGACTATGGA
TGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATGCTT
TCAGCAACGTCCGTAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGGTAAGTGGCATACAT
CATGGACTGTCCCTAGAGACCAACCCGACTAACAATCTCTTCAGCTGTGT
ATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGACCGCAT
GGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATCCACATCGTCGGTA
TCATCATTCAGATTGCCACCGACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCTATGGGT
CGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGTCCCCAT
GTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGTGCCATGGTCAGTG
CCTTCCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTATCTTCATCTCCTACATCATCAAC
TTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCGTATCACCATGGG
CATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGC
CCGAGTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCAGGGTCGTATCGATGAGGCCCGT
GAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGTCATCGC
CCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAGGAGAAGGCCGCCG
GTCAGGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTCTACCGT
ACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGGTGCCAA
CTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCCACTGGTCTGAGCA
ACAGCTACGTCACTCAGATCATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGTATGACC
CTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAGTCTGAT
GGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATCTGGGCTTCCGTTG
GTCACTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCCGCTGGT
AAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGCCACCAC
CTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATGTACCCCGCCCGCT
ACCGTGCTCTCTGCATTGGTATTGCCACCGCTGCCAACTGGACCTGGAAC
TTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGACTTCGC
CTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCCATCTTCGTTGTCT
TCTTCTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTTGACACC
ATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGTTCCCCC
GGAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGG
AGGGTCAGGCTGAGATGGCTGAGCACACCGAGCCCACTGAGCTCCGCGAG
TAA
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Coding sequence (CDS) from alignment at ch4:5346661..5348463+

>KYF_005961-T1 ID=KYF_005961-T1|Name=KYF_005961-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=5049bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:5346661..5348463+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTC
TGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACTCCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCG
AGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGG
CGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGG
TTACTCTACTGGTCAAATCTCTGGTTTCGAGACTATGGATGACTTCCTCC
AACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTC
CGTAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGCTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGC
CCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGACCGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCT
GTCTCTGGTCTGTCATCCACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACC
GACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGG
TGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGTCCCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTC
CCCGTCAGGTCCGTGGTGCCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCC
TTCGGTATCTTCATCTCCTACATCATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCA
GTCGACTGCTTCCTGGCGTATCACCATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCT
TGATTCTGGCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCC
TACCGTCAGGGTCGTATCGATGAGGCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTA
CGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGTCATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGA
AGGACAAGCTCGACGAGGAGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAG
CTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTCTACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCT
GCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGGTGCCAACTTTATCTTCTACTACGGAA
ACAGTATCTTCACCTCCACTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATC
ATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGTATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGT
CGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAGTCTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGT
TCATTTGCTTCATGATCTGGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTT
GCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCCGCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCAC
TTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGCCACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGG
CCATCTGTGGTGAGATGTACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGT
ATTGCCACCGCTGCCAACTGGACCTGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCAC
CCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGACTTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTG
GATGCTGTTTCGCCGCCATCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACC
CAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTTGACACCATGTACGTGCTCCACGTCAA
GCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGTTCCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACA
TGCACCGCCCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGAGATGGCT
GAGCACACCGAGCCCACTGAGCTCCGCGAGTAAATGGGTGTCTCTAATAT
GATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTCTGAGTCCTCCACTGAGG
CTCCTACTCCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCGAGAAGGACAATGTCTTG
CTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGGCGCTCCTTCATCCTGGG
TATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGGTTACTCTACTGGTCAAA
TCTCTGGTTTCGAGACTATGGATGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAA
CAGGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTCCGTAGTGGTCTCATTGT
CGGTCTGCTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTA
TCGCAGACCGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATC
CACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACCGACTCCAACTGGGTCCA
GGTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCA
GCATTGTCCCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGT
GCCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTATCTTCATCTC
CTACATCATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGC
GTATCACCATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGC
TCTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCAGGGTCGTAT
CGATGAGGCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACC
ACCGCGTCATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAG
GAGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCACCGGCCCTCG
CATGCTCTACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGC
TGACCGGTGCCAACTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCC
ACTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATCATTCTGGGTGCTGTCAA
CTTCGGTATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTC
GTAACAGTCTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATC
TGGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCCTCAGGCCAC
TCCTGCCGCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCG
GTTTCGCCACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATG
TACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGTATTGCCACCGCTGCCAA
CTGGACCTGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCT
CCATTGACTTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCC
ATCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCGCACTCTTGA
GGAGGTTGACACCATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCA
GCTGGGTTCCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCCCCCTTCC
TCTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGAGATGGCTGAGCACACCGAGCCCAC
TGAGCTCCGCGAGTAAATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGC
CTCAGGCGGACCACTCTGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACTCCTGCTCGC
TCCAACTCCGCCGTCGAGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGT
CAAGTACTTGACCTGGCGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGG
GTGGTTTCATCTTCGGTTACTCTACTGGTCAAATCTCTGGTTTCGAGACT
ATGGATGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTA
TGCTTTCAGCAACGTCCGTAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGCTGTGTATCG
GTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGACCGCATGGGC
CGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATCCACATCGTCGGTATCAT
CATTCAGATTGCCACCGACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCTATGGGTCGTT
GGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGTCCCCATGTAC
CAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGTGCCATGGTCAGTGCCTT
CCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTATCTTCATCTCCTACATCATCAACTTCG
GTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCGTATCACCATGGGCATT
GGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGCCCGA
GTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCAGGGTCGTATCGATGAGGCCCGTGAGG
TTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGTCATCGCCCAG
GAGATGAAGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAGGAGAAGGCCGCCGGTCA
GGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTCTACCGTACCC
TGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGGTGCCAACTTT
ATCTTCTACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCCACTGGTCTGAGCAACAG
CTACGTCACTCAGATCATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGTATGACCCTGC
CCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAGTCTGATGGTT
GGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATCTGGGCTTCCGTTGGTCA
CTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCCGCTGGTAAGG
CCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGCCACCACCTGG
GGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATGTACCCCGCCCGCTACCG
TGCTCTCTGCATTGGTATTGCCACCGCTGCCAACTGGACCTGGAACTTCC
TCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGACTTCGCCTAC
GGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCCATCTTCGTTGTCTTCTT
CTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTTGACACCATGT
ACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGTTCCCCCGGAG
GGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGGAGGG
TCAGGCTGAGATGGCTGAGCACACCGAGCCCACTGAGCTCCGCGAGTAA
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0016021integral component of membrane
GO:0016020membrane
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0022857transmembrane transporter activity
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0055085transmembrane transport
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_005961KYF_005961Aspergillus niger KYF3gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_005961-T1.exon1KYF_005961-T1.exon1Aspergillus niger KYF3exon
KYF_005961-T1.exon2KYF_005961-T1.exon2Aspergillus niger KYF3exon
KYF_005961-T1.exon3KYF_005961-T1.exon3Aspergillus niger KYF3exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_005961-T1.cdsKYF_005961-T1.cdsAspergillus niger KYF3CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_005961-T1KYF_005961-T1-proteinAspergillus niger KYF3polypeptide


Properties
Property NameValue
DBxrefInterPro:IPR036259
DBxrefInterPro:IPR020846
DBxrefInterPro:IPR005829
DBxrefInterPro:IPR005828
DBxrefInterPro:IPR003663
DBxrefPFAM:PF00083
DBxrefPFAM:PF07690
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Aspergillus Aspergillus niger KYF32020-10-09
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
ch4supercontigch4:5346661..5348463 +
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