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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch6:574708..576681- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_007528-T1 ID=KYF_007528-T1|Name=KYF_007528-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1974bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:574708..576681- (Aspergillus niger KYF3) ATGTGGCCTGAGAAAGGGAGCAAGTCGGTCGCCTACACCACTGCACCGGA
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GAGGTGGCTGCAATCCGGCTTCCTAGCTAATTAGCACAGCGAAATTTTCG
ATTCCTCTCGGTCCTGGGTTTCAGCGCTGTGCTGATGTGCACCTGGGAGG
CAGTGTTGTTGTAAGTTAATGCAATACGAACAAGACACCGCGATAGAGGT
ACTGATAACTGAACAGCGGTGCCTCATATGGTCTGACCGATGGAGGGAAA
GGTGGGATGATCTACACCTACCTCGGTGTCCTCTGCGGATTCAGTTTCGT
AATTCTCTCCATGGCGGAGATGGCATCCATGTGTGATACCCTCAAACACC
AAGCTTTGCTTTTTCTCTCTTCATGCTATGTGCTTTGATAATTGTAGCTG
CTTCTAGGGAATTGGCTGTTAACAATTGGCATATAGGGCCCCAACCTCCG
GTGGCCAATACCACTGGGTGTCCGAATTCGCCCCGCCCAGTTGCCAGTGC
CTGTTGAGTTATATTACAGGCTGGGTATGTGTGCTTGGATGGCATACAGG
CATTGCTGGCTGCAGCTACACCGTAGCAAACATGCTAGTCGGTCTCTTGG
CAATCAACTACCCAGATTCCTATGAATATAAGCCGTGGCACGTCACGTTG
TTAGTCATTGCAGTGGCGTTGGCTGCATTGCTCTTCAACACGTTGCTGGC
ACAAAAGCTGCCGCTGATTGAGGGAATAATCCTGATCGTCCACTGCTTTG
GTTTCTTTGGCATTCTGATTCCGCTGTGGGTGCTGTCTCCATCCGTGCCA
CCATCAGACGTCTTTGGCTCTATTGTCGACCGTGGCGGATGGGGCAGCAA
CGGACTATCCTGCTTGGTTGGGGTGGTTGGGCCAATCTATGCTTTGATCG
GTACGTCGCATTGACCAAGAGAAGCGAAGTATATCGCGCCTTGAAGCGAT
ACTGACTGATGCTCAGGCCCTGACTCGGCCGTGCACATGTGTATGTCTCT
TCTTGCTGCGACGAGGCTTCTTGCATGACCAACTAACCCAGTAACAAAGC
CGAGGAGATTCGTGATGCATCACGTGTGCTTCCCCTAGGCATGGTTTGGA
CGCTTATATTGAATGGTGCCACCGGGTTCGTCATGATTGTTACTTTCGCC
TTTTGCGTGGGAGACATCGACGAGGTCATGGCCTCGACCACCGGTTTTGC
CTTTATCCAGGTGTTCCTGAATTCGACGGGCTCGGTGCCCGCAGCAACGG
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GTGGCCACCACTTCCCGACAGATCTACTCATTCGCTCGTGACCAAGGCGT
CCCATTCTCTAGGTTCTTCTCTCAGGTGGCGTTCCCTTTGGTGATTCACC
ACTTCTGGCGATTGATATCAAACTGACCCCATAGATCAGGTCAACAAGAC
ATTTACAGTACCACTGAACGCCCTCTGCGTCAGCTTGGTGATAGTCTCCC
TTCTATCCTTGATCAACATTGGATCCTCCATCGCCTTCAATGCCATCATG
TCGCTAGGGACGGCTGCCCTGCTGTCATCATACCTGATCTCCATAAGTTG
CGTGCGGCTGCGACGATGGCGCAAACAGCCTCTCCCACCGGCGCGCTGGA
GCATGGGTCGGTTCACTCCATTCGTTGATACGGTGTCTCTGCTGGTGCTG
ATGGTCGTCTTCGTCTTTACCTTCTTTCCCCTAACAAACGATACTGCACC
GTCAGAATTTAACTGGGCGATTGTCATTTTTGGTGCCGTCGTGGTGTTTG
CCTTGGTATATTATGCTCTCTATGCCCGGAAGGTATACAAGGGGCCGGTG
ACGCGGGTGCGGGTGGCACAATAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch6:574708..576681- >KYF_007528-T1 ID=KYF_007528-T1|Name=KYF_007528-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=11088bp|location=Sequence derived from alignment at ch6:574708..576681- (Aspergillus niger KYF3) GTCAACAAGACATTTACAGTACCACTGAACGCCCTCTGCGTCAGCTTGGT GATAGTCTCCCTTCTATCCTTGATCAACATTGGATCCTCCATCGCCTTCA ATGCCATCATGTCGCTAGGGACGGCTGCCCTGCTGTCATCATACCTGATC TCCATAAGTTGCGTGCGGCTGCGACGATGGCGCAAACAGCCTCTCCCACC GGCGCGCTGGAGCATGGGTCGGTTCACTCCATTCGTTGATACGGTGTCTC TGCTGGTGCTGATGGTCGTCTTCGTCTTTACCTTCTTTCCCCTAACAAAC GATACTGCACCGTCAGAATTTAACTGGGCGATTGTCATTTTTGGTGCCGT CGTGGTGTTTGCCTTGGTATATTATGCTCTCTATGCCCGGAAGGTATACA AGGGGCCGGTGACGCGGGTGCGGGTGGCACAATAACCGAGGAGATTCGTG ATGCATCACGTGTGCTTCCCCTAGGCATGGTTTGGACGCTTATATTGAAT GGTGCCACCGGGTTCGTCATGATTGTTACTTTCGCCTTTTGCGTGGGAGA CATCGACGAGGTCATGGCCTCGACCACCGGTTTTGCCTTTATCCAGGTGT TCCTGAATTCGACGGGCTCGGTGCCCGCAGCAACGGGAATGACGGTGGTA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR002293 |
DBxref | PFAM:PF13520 |
DBxref | PFAM:PF00324 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch6 | supercontig | ch6:574708..576681 - |
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