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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch8:2124448..2126384- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_011960-T1 ID=KJC3_011960-T1|Name=KJC3_011960-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=1937bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:2124448..2126384- (Aspergillus niger KJC3) CTTTTATTTCTCTTCTTCCCCCTCTACTTTTATTCCCTTCCACTCTCCAT
CTTTCCTCACTTATCCTCCTCCCCCCTTTTCTCTGTAAGCCATCTCTCTC
TCTCTATTTTTCTCACTCTTCTCACTGTCAGTTTGGCTGTGTCTAACCAT
TGCATCTCTAGTATCTTCACCACACACAACCATGGCTGCCCCCGCCCAGA
AGTTCAAGGTCGCCGACATCGTACGTACCCCCCCGTCCAACCCTCTATCA
TGATCGCAATTCTCATTCATTGCCTCTAGTCCCTGGCTGCCTTTGGCCGC
CGCGAGATCGAGCTCGCCGAGATTGAGATGCCCGGTCTCATGTCCATCCG
CCGCAGATATGGTCCCGACCAGCCCCTCAAGGGTGCCCGTATTGCCGGTT
GCCTGCACATGAGTATGTCGGCCTGATTATTTCTCACTCTGAAACCTCTC
TAATTCCCTGCAGCCATCCAGACTGCCGTCCTCATCGAGACCCTCGTTGC
CCTCGGTGCCGAGGTTACCTGGACCAGCTGCAACATCTTCTCCACCCAGG
ACCACGCCGCTGCCGCCATTGCCGCCGCCGGTGTCCCTGTGTAAGTTCTG
CTGTTCACCGGTCTATCAGCTCGTCCTAACAATTGATAGCTTCGCCTGGA
AGGGTGAGACCGAGGAGGAGTACAACTGGTGCTTGGACCAGCAGCTCTCC
GCCTTCAAGGATGGCAAGAAGCTCAACCTCATCCTCGACGACGGTGGTGA
CCTGACCTCCCTCGTCCACGAGAAGTACCCCGAGCAGCTCAAGGACTGCT
ACGGTCTGTCCGAGGAGACCACCACTGGTGTCCACCACCTCTACCGCATG
CTCAAGGAGGGCAAGCTCCTTGTTCCCGCCATCAACGTCAACGACTCCGT
CACCAAGTCCAAGTTCGACAACCTGTACGGTTGCCGTGAGTCCCTCATCG
ATGGTATCAAGCGCGCTACCGATGTCATGATCGCCGGTAAGGTTGCCGTT
GTCGCCGGTTACGGTGATGTCGGCAAGGGCTGTGCCGATGCTCTCCGCAG
CATGGGTGCCCGCGTCCTGGTCACCGAGATCGACCCCATCAACGCCCTCC
AGGCTGCCGTCCAGGGCTACCAGGTCACCACCATGGAGGAGGCTGCTCCC
CAGGGTCAGATCTTCGTCACCACCACTGGTTGCCGTGACATCCTCGTTGG
CCGTCACTTTGAGGTGATGCGCAACGACGCCATTGTTTGCAGTAAGTCCT
CCGTTACAATTCCTCTTGTTTCATTTGCTGACGAGTTAAGACATCGGTCA
CTTCGACATTGAGATCGACGTTGCCTGGCTCAAGGCCAACGCCAAGTCGG
TCCAGAACATCAAGCCCCAGGTTGACCGCTACACCATGGCCAACGGCCGC
CACATCATCCTGTTGGCCGAGGGTCGTCTCGTCAACCTTGGCTGTGCCAC
CGGCCACTCTTCCTTCGTCATGTCCTGCTCTTTCTCCAACCAGGTCCTTG
CCCAGATTGCTCTGTTCAAGGCCGAGGACGCCGAGTTCGGCAAGAAGTAC
GTCGAGTTCGGCACCACCGGCAAGAAGCCCGTCGGTGTCTACGTTCTCCC
CAAGGCTCTCGATGAGCAGGTCGCTCTCCAGCACTTGGAGCACGTCAACG
CCAAGCTGTCTCAGCTCACCCCCGTCCAGGCTGAGTACCTTGGCTTGGAG
GTCACTGGACCTTTCAAGGCTGACCAGTAAGCCCACCCTTCGCTTGCCCC
ATTTTTACAAAGTGATATAACACAGGCTAACTGAAATCTAGCTACCGCTA
CTAAATGTCGAAATCCTACTGCTAGACTTCAACATTCACGATGTTACGAC
GACATATACAGGGTTCTTTATCAACATGGGGCTCAAAAGCATTGTCTTCA
ACGGCAAATAAAAGTGGCTGGGTATGGCTAGGGTTGC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch8:2124448..2126384- >KJC3_011960-T1 ID=KJC3_011960-T1|Name=KJC3_011960-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=8100bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:2124448..2126384- (Aspergillus niger KJC3) CTACCGCTACTAAACATCGGTCACTTCGACATTGAGATCGACGTTGCCTG GCTCAAGGCCAACGCCAAGTCGGTCCAGAACATCAAGCCCCAGGTTGACC GCTACACCATGGCCAACGGCCGCCACATCATCCTGTTGGCCGAGGGTCGT CTCGTCAACCTTGGCTGTGCCACCGGCCACTCTTCCTTCGTCATGTCCTG CTCTTTCTCCAACCAGGTCCTTGCCCAGATTGCTCTGTTCAAGGCCGAGG ACGCCGAGTTCGGCAAGAAGTACGTCGAGTTCGGCACCACCGGCAAGAAG CCCGTCGGTGTCTACGTTCTCCCCAAGGCTCTCGATGAGCAGGTCGCTCT CCAGCACTTGGAGCACGTCAACGCCAAGCTGTCTCAGCTCACCCCCGTCC AGGCTGAGTACCTTGGCTTGGAGGTCACTGGACCTTTCAAGGCTGACCAC TTCGCCTGGAAGGGTGAGACCGAGGAGGAGTACAACTGGTGCTTGGACCA GCAGCTCTCCGCCTTCAAGGATGGCAAGAAGCTCAACCTCATCCTCGACG ACGGTGGTGACCTGACCTCCCTCGTCCACGAGAAGTACCCCGAGCAGCTC AAGGACTGCTACGGTCTGTCCGAGGAGACCACCACTGGTGTCCACCACCT CTACCGCATGCTCAAGGAGGGCAAGCTCCTTGTTCCCGCCATCAACGTCA ACGACTCCGTCACCAAGTCCAAGTTCGACAACCTGTACGGTTGCCGTGAG TCCCTCATCGATGGTATCAAGCGCGCTACCGATGTCATGATCGCCGGTAA GGTTGCCGTTGTCGCCGGTTACGGTGATGTCGGCAAGGGCTGTGCCGATG CTCTCCGCAGCATGGGTGCCCGCGTCCTGGTCACCGAGATCGACCCCATC AACGCCCTCCAGGCTGCCGTCCAGGGCTACCAGGTCACCACCATGGAGGA GGCTGCTCCCCAGGGTCAGATCTTCGTCACCACCACTGGTTGCCGTGACA TCCTCGTTGGCCGTCACTTTGAGGTGATGCGCAACGACGCCATTGTTTGC ACCATCCAGACTGCCGTCCTCATCGAGACCCTCGTTGCCCTCGGTGCCGA GGTTACCTGGACCAGCTGCAACATCTTCTCCACCCAGGACCACGCCGCTG CCGCCATTGCCGCCGCCGGTGTCCCTGTTCCCTGGCTGCCTTTGGCCGCC GCGAGATCGAGCTCGCCGAGATTGAGATGCCCGGTCTCATGTCCATCCGC CGCAGATATGGTCCCGACCAGCCCCTCAAGGGTGCCCGTATTGCCGGTTG CCTGCACATGAATGGCTGCCCCCGCCCAGAAGTTCAAGGTCGCCGACATC CTACCGCTACTAAACATCGGTCACTTCGACATTGAGATCGACGTTGCCTG GCTCAAGGCCAACGCCAAGTCGGTCCAGAACATCAAGCCCCAGGTTGACC GCTACACCATGGCCAACGGCCGCCACATCATCCTGTTGGCCGAGGGTCGT CTCGTCAACCTTGGCTGTGCCACCGGCCACTCTTCCTTCGTCATGTCCTG CTCTTTCTCCAACCAGGTCCTTGCCCAGATTGCTCTGTTCAAGGCCGAGG 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GCGAGATCGAGCTCGCCGAGATTGAGATGCCCGGTCTCATGTCCATCCGC CGCAGATATGGTCCCGACCAGCCCCTCAAGGGTGCCCGTATTGCCGGTTG CCTGCACATGAATGGCTGCCCCCGCCCAGAAGTTCAAGGTCGCCGACATC CTACCGCTACTAAACATCGGTCACTTCGACATTGAGATCGACGTTGCCTG GCTCAAGGCCAACGCCAAGTCGGTCCAGAACATCAAGCCCCAGGTTGACC GCTACACCATGGCCAACGGCCGCCACATCATCCTGTTGGCCGAGGGTCGT CTCGTCAACCTTGGCTGTGCCACCGGCCACTCTTCCTTCGTCATGTCCTG CTCTTTCTCCAACCAGGTCCTTGCCCAGATTGCTCTGTTCAAGGCCGAGG ACGCCGAGTTCGGCAAGAAGTACGTCGAGTTCGGCACCACCGGCAAGAAG CCCGTCGGTGTCTACGTTCTCCCCAAGGCTCTCGATGAGCAGGTCGCTCT CCAGCACTTGGAGCACGTCAACGCCAAGCTGTCTCAGCTCACCCCCGTCC AGGCTGAGTACCTTGGCTTGGAGGTCACTGGACCTTTCAAGGCTGACCAC TTCGCCTGGAAGGGTGAGACCGAGGAGGAGTACAACTGGTGCTTGGACCA GCAGCTCTCCGCCTTCAAGGATGGCAAGAAGCTCAACCTCATCCTCGACG ACGGTGGTGACCTGACCTCCCTCGTCCACGAGAAGTACCCCGAGCAGCTC AAGGACTGCTACGGTCTGTCCGAGGAGACCACCACTGGTGTCCACCACCT CTACCGCATGCTCAAGGAGGGCAAGCTCCTTGTTCCCGCCATCAACGTCA ACGACTCCGTCACCAAGTCCAAGTTCGACAACCTGTACGGTTGCCGTGAG TCCCTCATCGATGGTATCAAGCGCGCTACCGATGTCATGATCGCCGGTAA 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GGCTGCTCCCCAGGGTCAGATCTTCGTCACCACCACTGGTTGCCGTGACA TCCTCGTTGGCCGTCACTTTGAGGTGATGCGCAACGACGCCATTGTTTGC ACCATCCAGACTGCCGTCCTCATCGAGACCCTCGTTGCCCTCGGTGCCGA GGTTACCTGGACCAGCTGCAACATCTTCTCCACCCAGGACCACGCCGCTG CCGCCATTGCCGCCGCCGGTGTCCCTGTTCCCTGGCTGCCTTTGGCCGCC GCGAGATCGAGCTCGCCGAGATTGAGATGCCCGGTCTCATGTCCATCCGC CGCAGATATGGTCCCGACCAGCCCCTCAAGGGTGCCCGTATTGCCGGTTG CCTGCACATGAATGGCTGCCCCCGCCCAGAAGTTCAAGGTCGCCGACATC CTACCGCTACTAAACATCGGTCACTTCGACATTGAGATCGACGTTGCCTG GCTCAAGGCCAACGCCAAGTCGGTCCAGAACATCAAGCCCCAGGTTGACC GCTACACCATGGCCAACGGCCGCCACATCATCCTGTTGGCCGAGGGTCGT CTCGTCAACCTTGGCTGTGCCACCGGCCACTCTTCCTTCGTCATGTCCTG CTCTTTCTCCAACCAGGTCCTTGCCCAGATTGCTCTGTTCAAGGCCGAGG ACGCCGAGTTCGGCAAGAAGTACGTCGAGTTCGGCACCACCGGCAAGAAG CCCGTCGGTGTCTACGTTCTCCCCAAGGCTCTCGATGAGCAGGTCGCTCT CCAGCACTTGGAGCACGTCAACGCCAAGCTGTCTCAGCTCACCCCCGTCC AGGCTGAGTACCTTGGCTTGGAGGTCACTGGACCTTTCAAGGCTGACCAC TTCGCCTGGAAGGGTGAGACCGAGGAGGAGTACAACTGGTGCTTGGACCA GCAGCTCTCCGCCTTCAAGGATGGCAAGAAGCTCAACCTCATCCTCGACG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0004013 | adenosylhomocysteinase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
KJC3_011960-T1.utr3p1 | KJC3_011960-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG09262LYR |
DBxref | InterPro:IPR036291 |
DBxref | InterPro:IPR020082 |
DBxref | InterPro:IPR042172 |
DBxref | InterPro:IPR015878 |
DBxref | InterPro:IPR000043 |
DBxref | PFAM:PF00670 |
DBxref | PFAM:PF02826 |
Product | S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch8 | supercontig | ch8:2124448..2126384 - |
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