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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An02:2133188..2135090- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_001921-T1 ID=CBS51388_001921-T1|Name=CBS51388_001921-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1903bp|location=Sequence derived from alignment at An02:2133188..2135090- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGACCCACCCCGATATGTAAGGAGACCTTTCCCCCCTCCCACCAACGGC
GAGCTTGCCTTGCACTACAACAAAGAACTCATTGGAACCTTTACTGACCG
TTGTCTTTGTGCTTGAATTCAGCTCCGTCGACGTTCTCGTCATTGGTGCC
GGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGATTGTACGAAT
TGCGCGCCCCCTATCGTATACTATCACTCAAATAACGGCTAATTGGACAA
TTCTCGGGTGTAGGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGA
CTCCTGGTGGTCTTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCGTATGT
TGAATCCTACTTTCCCCTCAATGGATAGACATTGCACTTGTCAAGCGAAC
AACGACTGACTCGTGACAATCGCAGCTCTTCGATGTTGGTGGTCACGTCA
TCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGCTCTCCCC
AAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTCGCTGCCA
GGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATGCTTCCCA
AGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGCTCTCGAG
GCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGATCGTTCG
CCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTACAACTTCA
AGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGGTAAGATGCTCTGGATCACATGGC
AAGTAACGGCGTGCTAATTCCCATTAGATGCAATGTGCCTGGTTGGGTGA
GCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTTATCCTTA
ACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTTCCCCGCC
CGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTCTCCCCAA
GGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTCAATGCCA
ACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTACAAGAAG
CTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTGGCGACCA
GGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACTCACGTCA
TTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGACAAGTGC
TGGGTAAGTTATCTACCTTGGATGCAGACTTCAATGGCCCTTTAAACTAA
TACGATTTCCTCTAGCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCG
TGCCACCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCA
AGAAGCTCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACT
GAGGCTCAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTC
TTCGATGAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGG
GTCTCGTCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACC
TACCACCGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGA
GGGCGCTCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGA
CCCGTGGCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCAC
TCTTTCATGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGT
CGAGCTGACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCG
AGCGTCGGCTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAG
TAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An02:2133188..2135090- >CBS51388_001921-T1 ID=CBS51388_001921-T1|Name=CBS51388_001921-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=9198bp|location=Sequence derived from alignment at An02:2133188..2135090- (Aspergillus niger CBS 513.88) CTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACCGTGCCACCATCTTCTC CAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAGCTCCCCACTC TGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCACTGAGGCTCAGGAGGGT CCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGATGAAGCCTGT CAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAGGGTCTCGTCAACACCG AGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCACCTACCACCGCCGCTTC GACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTGAGGGCGCTCTTACCCA GATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGGACCCGTGGCCGCTTCG GTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCACTCTTTCATGCTCGGT GTTGAGGCTGTGGACAACATTGTCAACGGCGCTGTCGAGCTGACCCTCAA CTACCCTGACTTCGTCAACGGTAGACAGAACACCGAGCGTCGGCTGGTTG ACGGCGCCCAGGTTTTTGCTAAGAGCCAGGCGCAGTAAATGCAATGTGCC TGGTTGGGTGAGCGTGTTGCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAA CGTTATCCTTAACAAGACCGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCC GTTTCCCCGCCCGTGGTGGTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGAC ACTCTCCCCAAGGAGAAGACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAA GGTCAATGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCG GCTACAAGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAG ATTGGCGACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTC CACTCACGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCG GTGACAAGTGCTGGCTCTTCGATGTTGGTGGTCACGTCATCTTCTCCCAC TACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGCTCTCCCCAAGGACGACGA CTGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTCGCTGCCAGGGCCAATGGG TTCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATGCTTCCCAAGCATGAGCAG GTCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGCTCTCGAGGCTCGTGTTGC CAACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGATCGTTCGCCAGATGGGTG TCGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTACAACTTCAAGGTTTGGGCT GTGCCTACGACCAAGGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGA GACTCCTGGTGGTCTTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCC GTCGACGTTCTCGTCATTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAA GCGTCTTAACCAGATTATGACCCACCCCGATATCTCTACTTCCCTGAGGA CAACTGCCCCTTCTACCGTGCCACCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACA 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TTCGATGTTGGTGGTCACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGA CTGCATCAACGAGGCTCTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGC GTATCTCCTACGTTCGCTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAG AACAACATTTCCATGCTTCCCAAGCATGAGCAGGTCCGCTGTATTGATGG CCTGATCGATGCTGCTCTCGAGGCTCGTGTTGCCAACACCAAGCCCCAGA ACTTCGATGAGTGGATCGTTCGCCAGATGGGTGTCGGTATCGCCGACCTT TTCATGAGACCCTACAACTTCAAGGTTTGGGCTGTGCCTACGACCAAGGA TGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAGACTCCTGGTGGTCTTG CTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCCGTCGACGTTCTCGTCAT TGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAGCGTCTTAACCAGATTA TGACCCACCCCGATATCTCTACTTCCCTGAGGACAACTGCCCCTTCTACC GTGCCACCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAACCAGCCCGAGGGCTCC AAGAAGCTCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCTCCAAGCCCCAGAGCAC TGAGGCTCAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATGTTGGAGGTTTCCGAGT CTTCGATGAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCTGGCTGATTGCATCCAG GGTCTCGTCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTGATGAGATTGTCTCCAC CTACCACCGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACCCCCTCCCTGGAGCGTG AGGGCGCTCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCAGGAGAAGGACATCTGG ACCCGTGGCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGGTCGGTAACCAGGACCA 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GTCAATGCCAACAACAAGACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGG CTACAAGAAGCTCGTCTCCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGA TTGGCGACCAGGAGCTCGTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCC ACTCACGTCATTGGTGTTGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGG TGACAAGTGCTGGCTCTTCGATGTTGGTGGTCACGTCATCTTCTCCCACT ACAAGTACTTCGACGACTGCATCAACGAGGCTCTCCCCAAGGACGACGAC TGGTACACCCACCAGCGTATCTCCTACGTTCGCTGCCAGGGCCAATGGGT TCCCTACCCCTTCCAGAACAACATTTCCATGCTTCCCAAGCATGAGCAGG TCCGCTGTATTGATGGCCTGATCGATGCTGCTCTCGAGGCTCGTGTTGCC AACACCAAGCCCCAGAACTTCGATGAGTGGATCGTTCGCCAGATGGGTGT CGGTATCGCCGACCTTTTCATGAGACCCTACAACTTCAAGGTTTGGGCTG TGCCTACGACCAAGGATGGCCCCTCTTGGTTGATCGTTGACAGCAACGAG ACTCCTGGTGGTCTTGCTTCCACCGATGTGACCCCCGAAGGTTTCCTCCG TCGACGTTCTCGTCATTGGTGCCGGTCCTACTGGTCTCGGTGCCGCAAAG CGTCTTAACCAGATTATGACCCACCCCGATATCTCTACTTCCCTGAGGAC AACTGCCCCTTCTACCGTGCCACCATCTTCTCCAACTACTCCCCCTACAA CCAGCCCGAGGGCTCCAAGAAGCTCCCCACTCTGCAGCTTGCGGATGGCT CCAAGCCCCAGAGCACTGAGGCTCAGGAGGGTCCTTACTGGTCCATCATG TTGGAGGTTTCCGAGTCTTCGATGAAGCCTGTCAACTACGAGACTCTCCT GGCTGATTGCATCCAGGGTCTCGTCAACACCGAGATGCTGAAGCCCACTG ATGAGATTGTCTCCACCTACCACCGCCGCTTCGACCACGGCTACCCCACC CCCTCCCTGGAGCGTGAGGGCGCTCTTACCCAGATCCTGCCCAGACTCCA GGAGAAGGACATCTGGACCCGTGGCCGCTTCGGTAGCTGGCGCTACGAGG TCGGTAACCAGGACCACTCTTTCATGCTCGGTGTTGAGGCTGTGGACAAC ATTGTCAACGGCGCTGTCGAGCTGACCCTCAACTACCCTGACTTCGTCAA CGGTAGACAGAACACCGAGCGTCGGCTGGTTGACGGCGCCCAGGTTTTTG CTAAGAGCCAGGCGCAGTAAATGCAATGTGCCTGGTTGGGTGAGCGTGTT GCTGCCCCTAATGTCAAGGCCGTGACGACCAACGTTATCCTTAACAAGAC CGCCGGTAACTGGGGTCCTAACGCTACTTTCCGTTTCCCCGCCCGTGGTG GTACCGGTGGTATCTGGATTGCCGTCGCCGACACTCTCCCCAAGGAGAAG ACTCGCTACGGTGAGAAGGGCAAGGTCGTCAAGGTCAATGCCAACAACAA GACCGTTACCCTGGGTGACGGTACCACTGTCGGCTACAAGAAGCTCGTCT CCACCATGGCTGTGGACTACCTCGCGGAGCAGATTGGCGACCAGGAGCTC GTTGGCCTCACCAAGCAGCTCTTCTACTCCTCCACTCACGTCATTGGTGT TGGTATCCGTGGTACCCGCCCCGAGAGAATCGGTGACAAGTGCTGGCTCT TCGATGTTGGTGGTCACGTCATCTTCTCCCACTACAAGTACTTCGACGAC TGCATCAACGAGGCTCTCCCCAAGGACGACGACTGGTACACCCACCAGCG TATCTCCTACGTTCGCTGCCAGGGCCAATGGGTTCCCTACCCCTTCCAGA 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Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR036188 |
| DBxref | PFAM:PF13450 |
| DBxref | PFAM:PF01593 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| An02 | supercontig | An02:2133188..2135090 - |
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