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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An16:556761..558476- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_009994-T1 ID=CBS51388_009994-T1|Name=CBS51388_009994-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1716bp|location=Sequence derived from alignment at An16:556761..558476- (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGTCAAGGGAGGTGTTGCGTTCCTGGCCTTTGCTGGCCCAGCTCTGGC
AGGAGTCATTGCCCGCGGTGGAGAGGTATGATGGAACTCCGTCTGACATA
AATCGCCTTGCCCATACTGACATGAAAAAGCCTGGTGGTGAGCCTCAAGT
CGGGACCATTGTCGGCACCAACTACCCGGGTAAGAGATCTGCTCGACTAT
CCTACTGCTTATAATCGTCTCTAATAATTGGATAGTGGCTACTGGCACGG
CCCTCCTCCCCCTCCCCCTCCCATCCAGTTTCCTACTGGTACTGCGCCTC
AACCCAAGCCTACCACCAGCCATGGGACCGCTCCTATTAAGCCAACCACC
AGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCC
TATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCA
GTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCT
ATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAG
TATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTA
TCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGT
ATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTCAAGGAACGGCTCCTAT
CAGGCCTACTACCAGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACTACCAGCT
CTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACGGCTCCTATC
AGGCCGGGCACTACTGAAACCACTGTCGGCCCCATCCCCACCAACGGTAC
AACGGTGATCCCACCTGCAACCGTTACTACTCATACGCCTGTACCAATCC
AGAACAGCACTGTTATCCCCACTCAGTCCACCCAGCCGCCATTCCAGAAC
ACCACGGTTCCTGTTGTTCCTGTTGTCCCCACTCAGTCCCCTCAGCCGCC
AGTCCAGAACACCACGGTCCCTGTTGTTCCCGTTGTTCCTGGTCAGAGCA
CTGTCCCCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAG
AGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGG
TCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTTC
CTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCCCTCTGGTGTCTCGCCCGTC
TCCCCTGGAGAAACCGCTCCCTCTGGCGTCTCGCCAGTCTCCCCTGGAGA
GACTGCTCCCTCTGGAGTGTCTCCCGTCACTCCTGGAGAAACTGCTGGTC
CCTCTGGTGTCTCGCCCGTCTCCCCTGGAGAAACCGCTCCCTCTGGCGTC
TCGCCAGTCTCCCCTGGAGAGACTGCTCCCTCTGGAGTGTCTCCCGTCAC
TCCTGGAGAAACTGCTGGTCCCTCTGGTGTCTCTCCCGTTACACCTGGCG
AGACCAGTGCGGGCGCGACGGGCGTCTCCCCAGCCTTCACTGGCGCCGCC
TCCTCCAACATGCAACCCGCGGCTGGCTTCCTGGCCGCCGTCATGGGTAT
CATGGCTCTCCTCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An16:556761..558476- >CBS51388_009994-T1 ID=CBS51388_009994-T1|Name=CBS51388_009994-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=4041bp|location=Sequence derived from alignment at An16:556761..558476- (Aspergillus niger CBS 513.88)
TCTCCCCTGGAGAGACTGCTCCCTCTGGAGTGTCTCCCGTCACTCCTGGA
GAAACTGCTGGTCCCTCTGGTGTCTCGCCCGTCTCCCCTGGAGAAACCGC
TCCCTCTGGCGTCTCGCCAGTCTCCCCTGGAGAGACTGCTCCCTCTGGAG
TGTCTCCCGTCACTCCTGGAGAAACTGCTGGTCCCTCTGGTGTCTCTCCC
GTTACACCTGGCGAGACCAGTGCGGGCGCGACGGGCGTCTCCCCAGCCTT
CACTGGCGCCGCCTCCTCCAACATGCAACCCGCGGCTGGCTTCCTGGCCG
CCGTCATGGGTATCATGGCTCTCCTCTAATTTCCTACTGGTACTGCGCCT
CAACCCAAGCCTACCACCAGCCATGGGACCGCTCCTATTAAGCCAACCAC
CAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCC
CTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACC
AGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCC
TATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCA
GTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCT
ATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAG
TATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTCAAGGAACGGCTCCTA
TCAGGCCTACTACCAGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACTACCAGC
TCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACGGCTCCTAT
CAGGCCGGGCACTACTGAAACCACTGTCGGCCCCATCCCCACCAACGGTA
CAACGGTGATCCCACCTGCAACCGTTACTACTCATACGCCTGTACCAATC
CAGAACAGCACTGTTATCCCCACTCAGTCCACCCAGCCGCCATTCCAGAA
CACCACGGTTCCTGTTGTTCCTGTTGTCCCCACTCAGTCCCCTCAGCCGC
CAGTCCAGAACACCACGGTCCCTGTTGTTCCCGTTGTTCCTGGTCAGAGC
ACTGTCCCCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCA
GAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTG
GTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTT
CCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGATGGTCAAGGGAGGTGTTGCGTTCCTGG
CCTTTGCTGGCCCAGCTCTGGCAGGAGTCATTGCCCGCGGTGGAGAGTCT
CCCCTGGAGAGACTGCTCCCTCTGGAGTGTCTCCCGTCACTCCTGGAGAA
ACTGCTGGTCCCTCTGGTGTCTCGCCCGTCTCCCCTGGAGAAACCGCTCC
CTCTGGCGTCTCGCCAGTCTCCCCTGGAGAGACTGCTCCCTCTGGAGTGT
CTCCCGTCACTCCTGGAGAAACTGCTGGTCCCTCTGGTGTCTCTCCCGTT
ACACCTGGCGAGACCAGTGCGGGCGCGACGGGCGTCTCCCCAGCCTTCAC
TGGCGCCGCCTCCTCCAACATGCAACCCGCGGCTGGCTTCCTGGCCGCCG
TCATGGGTATCATGGCTCTCCTCTAATTTCCTACTGGTACTGCGCCTCAA
CCCAAGCCTACCACCAGCCATGGGACCGCTCCTATTAAGCCAACCACCAG
TATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTA
TCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGT
ATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTAT
CAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTA
TTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATC
AGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTAT
TGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTCAAGGAACGGCTCCTATCA
GGCCTACTACCAGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACTACCAGCTCT
GGTACGGCTCCGATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACGGCTCCTATCAG
GCCGGGCACTACTGAAACCACTGTCGGCCCCATCCCCACCAACGGTACAA
CGGTGATCCCACCTGCAACCGTTACTACTCATACGCCTGTACCAATCCAG
AACAGCACTGTTATCCCCACTCAGTCCACCCAGCCGCCATTCCAGAACAC
CACGGTTCCTGTTGTTCCTGTTGTCCCCACTCAGTCCCCTCAGCCGCCAG
TCCAGAACACCACGGTCCCTGTTGTTCCCGTTGTTCCTGGTCAGAGCACT
GTCCCCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAG
CACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTC
AGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTTCCT
GGTCAGAGCACTGTCCCTGATGGTCAAGGGAGGTGTTGCGTTCCTGGCCT
TTGCTGGCCCAGCTCTGGCAGGAGTCATTGCCCGCGGTGGAGAGTCTCCC
CTGGAGAGACTGCTCCCTCTGGAGTGTCTCCCGTCACTCCTGGAGAAACT
GCTGGTCCCTCTGGTGTCTCGCCCGTCTCCCCTGGAGAAACCGCTCCCTC
TGGCGTCTCGCCAGTCTCCCCTGGAGAGACTGCTCCCTCTGGAGTGTCTC
CCGTCACTCCTGGAGAAACTGCTGGTCCCTCTGGTGTCTCTCCCGTTACA
CCTGGCGAGACCAGTGCGGGCGCGACGGGCGTCTCCCCAGCCTTCACTGG
CGCCGCCTCCTCCAACATGCAACCCGCGGCTGGCTTCCTGGCCGCCGTCA
TGGGTATCATGGCTCTCCTCTAATTTCCTACTGGTACTGCGCCTCAACCC
AAGCCTACCACCAGCCATGGGACCGCTCCTATTAAGCCAACCACCAGTAT
TGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCA
GGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATT
GGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAG
GCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTG
GAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGG
CCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGG
AACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTCAAGGAACGGCTCCTATCAGGC
CTACTACCAGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACTACCAGCTCTGGT
ACGGCTCCGATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACGGCTCCTATCAGGCC
GGGCACTACTGAAACCACTGTCGGCCCCATCCCCACCAACGGTACAACGG
TGATCCCACCTGCAACCGTTACTACTCATACGCCTGTACCAATCCAGAAC
AGCACTGTTATCCCCACTCAGTCCACCCAGCCGCCATTCCAGAACACCAC
GGTTCCTGTTGTTCCTGTTGTCCCCACTCAGTCCCCTCAGCCGCCAGTCC
AGAACACCACGGTCCCTGTTGTTCCCGTTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTC
CCCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCAC
TGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGA
GCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTTCCTGGT
CAGAGCACTGTCCCTGATGGTCAAGGGAGGTGTTGCGTTCCTGGCCTTTG
CTGGCCCAGCTCTGGCAGGAGTCATTGCCCGCGGTGGAGAG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-17) |
| DBxref | InterPro:IPR032059 |
| DBxref | PFAM:PF16058 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An16 | supercontig | An16:556761..558476 - |
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