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Sequences
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mRNA from alignment at ACJE01000004.1:1478326..1480325+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_206009-T1 ID=ASPNIDRAFT_206009-T1|Name=ASPNIDRAFT_206009-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2000bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000004.1:1478326..1480325+ (Aspergillus niger ATCC 1015) GTGTTGTGGTGGCTCGTTAGGTTACTAACTTTACCCCTGAAACCCCCGTA
CAGATCGCCCTTGGGTATTTTAATTTTTCCCTCTGTCCACATTCCACGCC
CACTCCGTGTCCCTCCATCAATCCATATCTGAAACTTATCAATTCGACTC
GCCAAAATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGGTGTGTGCCCAGTCCCTCC
CTCGCCGCCGCTTGATTTTTCGCGTGGTCACTAATGTTTGTGTTTTCCCC
TCACAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTGCTGGGAGGTA
TGTTTAGACACGGGGGAATCGACCCCTCCTTTCCTGAAACAGTCATCAGA
AAATCAAACAACATCGGCATATGCCATATATTCTTGGGATAAACAGTGGA
CTAACGGTGTTGTTTAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGTATGT
GAAAACAAACGCCTAGGCACGCCTCTGTCGAGAGTTGCCACTCCACACCG
ATGAGCAATCCCACTGATCTTTGTTTGTTGATGCCAGGCCGACGGTTACT
TGACCGAGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTC
TTCTCCGAGACTGGTACGTTCCCATAGCCTTTCCCCCCGTGTATCCCGCT
CCTCCGTTTGCCCGCAGCACACCCTAACATGAAATTGGGCTATAGGTCAG
GGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGGAACCCAATGTTGT
GGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTCCACCCCGAGAACA
TGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGCCCGTGGTCACTAC
ACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACAAGGTCCGCCGTGT
TGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTCTTCCACTCCTTCG
GTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGATGGAGCGTCTGTCC
GTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCGTTTACCCTGCTCC
CCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCTATCCTCACCACCC
ACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGTTGACAACGAGGCC
ATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGCGCCCTAGCTATGA
GAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCCATCACCGCTTCCC
TCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGAGTTCCAGACCAAC
CTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGGCCTACGCCCCCGT
CATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCCGTCAGCGAGATCA
CCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAAGTGTGATCCCCGC
AACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTGGTGATGTCGTCCC
CAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACTAAGCGCACCATCC
AGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGGTATCTGCTACCAG
CCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACCTCAAGCGCGCTGT
GTAAGTTCTTCTCCATCTGATATGCGACGTTTTCAAGACATAAGAAAGCT
AACGGAAGGTCAAATGTAGCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCC
GAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCG
TGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCT
CCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTT
GCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATCTGACC
GAATTTTGGACCGGAGTCGCGCGGGGGGTCCGGCCGGGCCGTCCGGGTGG
back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000004.1:1478326..1480325+ >ASPNIDRAFT_206009-T1 ID=ASPNIDRAFT_206009-T1|Name=ASPNIDRAFT_206009-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=8082bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000004.1:1478326..1480325+ (Aspergillus niger ATCC 1015) ATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGC CAACTCCTGCTGGGAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACG GTTACTTGACCGAGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGC ACCTTCTTCTCCGAGACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTA CTGCGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACC GCAGTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCG AACAACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCA GGTCCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGG GTTTCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGT GCTCTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCT GGAATTCTGCGTTTACCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGC CCTACAACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGC AGCTTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCT CGGCATCGAGCGCCCTAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGG TTGTCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTC GATCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTT CCCTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACG AGTCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAAC CAGATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCT GCTGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCA CCCTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGT TTCAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGA CCTTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCA TCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCC AAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGA ATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGG AGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATG AGAGAAGTTATTTCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAA CTCCTGCTGGGAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACGGTT ACTTGACCGAGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACC TTCTTCTCCGAGACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTG CGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCA GTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAAC AACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGT CCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTT TCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCT CTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGA ATTCTGCGTTTACCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCT ACAACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGC TTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGG CATCGAGCGCCCTAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTG TCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGAT CTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCC TCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGT CCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAG ATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCT GTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCC TGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTC AAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCT TGCCAACCTCAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCT CCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAG 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GGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCA ACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATG GTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTA CCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGA AGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAG ATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGC CAACCTCAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCG AGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGT GCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTC CGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTG CCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATGAGAGAA GTTATTTCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTG CTGGGAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACGGTTACTTGA CCGAGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTC TCCGAGACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCT GGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTT TCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTAT GCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGA CAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGG TCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTG ATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTG CGTTTACCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACT CTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATG GTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGA GCGCCCTAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTT CCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAAC GAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGT GGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACT CCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTC AAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCG TGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGA CTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATC GGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAA CCTCAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGG CCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCT TTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGA GGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCA GCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATGAGAGAAGTT ATTTCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTGCTG GGAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACGGTTACTTGACCG AGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTCTCC GAGACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGGA ACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTCC ACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGCC CGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACAA GGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTCT TCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGATG GAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCGT TTACCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCTA TCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGTT GACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGCG CCCTAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCCA TCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGAG TTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGGC CTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCCG TCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAAG TGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTGG TGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACTA AGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGGT ATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACCT CAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCT GGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTC GTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGC CCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCG ACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATGAGAGAAGTTATT TCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTGCTGGGA GCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACGGTTACTTGACCGAGG AGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTCTCCGAG ACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGGAACC CAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTCCACC CCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGCCCGT GGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACAAGGT CCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTCTTCC ACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGATGGAG CGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCGTTTA CCCTGCTCCCCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCTATCC TCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGTTGAC AACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGCGCCC TAGCTATGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCCATCA CCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGAGTTC CAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGGCCTA CGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCCGTCA GCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAAGTGT GATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTGGTGA TGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACTAAGC GCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGGTATC TGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACCTCAA GCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGT CCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTC CACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCG TGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACT CCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0005874 | microtubule |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003924 | GTPase activity |
GO:0005525 | GTP binding |
GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0007017 | microtubule-based process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR008280 |
DBxref | InterPro:IPR017975 |
DBxref | InterPro:IPR037103 |
DBxref | InterPro:IPR036525 |
DBxref | InterPro:IPR023123 |
DBxref | InterPro:IPR003008 |
DBxref | InterPro:IPR018316 |
DBxref | InterPro:IPR000217 |
DBxref | InterPro:IPR002452 |
DBxref | PFAM:PF03953 |
DBxref | PFAM:PF00091 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ACJE01000004.1 | supercontig | ACJE01000004.1:1478326..1480325 + |
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