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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000007.1:49740..51857+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_214837-T1 ID=ASPNIDRAFT_214837-T1|Name=ASPNIDRAFT_214837-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2118bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000007.1:49740..51857+ (Aspergillus niger ATCC 1015) CGTTGCAGTGGACTAGGTGGCCAGTTGTCTGTTATATTAAACGGTCGCTC
CCTGGACGCCGCGCTGCGTCTGCAACTCTCCGCCCTCACGCCGGTCGTGG
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ATTCCCCTCGAAAAGTCGGTTATTCCATGTACAGCCCTTGATCGTACCAT
GGGTGTAGCTGACTGAACAAACAGTGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACT
CTTTTATTTTTGCATGGACGGGAACGGCCTGCTGTTTCGTGCTGTTGTCC
GAAATGGCGTCCATGTAAGTGGAAATCAAAAGATCCATCTCCTGGTGGTA
TACTGACCTGCCAAGGGCGCCGACTTCCGGAGGCCAATATCACTGGTGTG
CCATGCTTGCGCCTTATAAGCATATGAAGTTCCTAAGTTACATCACAGGT
GCGCTCTTCCGTTCCCCTGTTACAGCAACCGTGTAATGTACTGATCATCA
CTGCAGGATGGTTGACCGTGATCGGATGGCAGGCCGCCTTCGCATCGTCG
TCCTACATGGCTGGCACTGAGATCCTGGGTGCCATTATCTTGGGCCGGAA
CACCTTCAACTCTCAGCCCTACCAGGGTACCCTTCTAATGTGGGCGGTTG
TGGTCGTGGCCCTCATTGTGAATATTATCGGAGGAAAGTTCCTGCCTCGC
CTGGAAACCCTCATCCTCATGATCCACATTCTGGGATACTTTGGTGTGCT
CATCCCCATGACTTATATGTCCGACCACAAGTCGACCGAGGAGGTCTTCA
AGGACTTTACCAATGGCGGACACCTCTACACCGACGGTCTGTCCTTTTTC
GTCGGTATGACCGGTTGTGTGTTTGCCTTTGCGGGCGGTGATGCTGCCGT
GCATGTAAGTTGCTATCCCTAGCAGAAAAGACTGAGTCTAACTCGTATAG
ATGGCCGAAGAAGTGAATCATGCCACGGTCGTCATTCCCCGTGCCATTCT
TCTCAGTGTTGCAATCAACGGCACCTTGGGCTTCACCATGCTGATCGCCA
CTCTCTTCTGCATGGGCAGTGTTGATGCGGCCCTGGAGTCTCCCACAGGC
TACCCTTTCATGGAGATCTTCCAGCAAGCCACCGGTTCGGTCGCAGGTGG
ATTGGGCTTGTCCTCCATCCTCGTCATCGTCGGTATTTGCGCCGCCCTGG
CCATGTTGACTGCCACCTCCCGCCAGTTCTGGTCGTTTGCTCGCGACCGT
GGTGTCCCTGGCTGGCGAGTCTGGAGCCACGTATGTCCCGCCTATCTCTT
ACCCCATACTACAGAGAACATCGCTAATATCAACACAGGTCTCCAATCGT
ACCTTCCTCCCCACTTACTCCATCCTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCT
GCTCGGTCTGATTAACATCGGCTCCGCCGTCGCCCTCAACGACGTCGTCT
CCATGGCTGTCTCGGGTCTGTACTCCTCCTATCTGATCGTGGCGGTTCTT
CTTCTCTGGCGTCGCTGCACCGGCGCCATCAACAACTACAACGCCAGCGA
CGACACCGTCGTCAATGTCCCCGGCGCCAAGCTCATGTGGGGTCCGTTCC
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ATCGTTATCGTCATCTTCTTCAGTTACTGGCCCACCGAGTTGCCGGTGTC
GGTAACGACGATGAACTACAGTGTGGTGGGTACGATGGGAGTCGTCATTC
TGGCTATTATCTATTATGTGGTGAGGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCT
GTTATTGAGATCTCGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000007.1:49740..51857+ >ASPNIDRAFT_214837-T1 ID=ASPNIDRAFT_214837-T1|Name=ASPNIDRAFT_214837-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=12792bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000007.1:49740..51857+ (Aspergillus niger ATCC 1015) ATGGCGTCCTACGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGT AAACGGTACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAATTTGGCTCTTGCACGTT TGGGCAAGAAGCCTGTCCTGAAGCGGAACTTTGGTATCCTCTCGATCATC GGTCTCAGTTGTACCATTCTCGGCACATGGGAGGGTATTCTATCGACGTT CACCATTCCCCTCGAAAATGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACTCTTTTA TTTTTGCATGGACGGGAACGGCCTGCTGTTTCGTGCTGTTGTCCGAAATG GCGTCCATGGCGCCGACTTCCGGAGGCCAATATCACTGGTGTGCCATGCT TGCGCCTTATAAGCATATGAAGTTCCTAAGTTACATCACAGGATGGTTGA CCGTGATCGGATGGCAGGCCGCCTTCGCATCGTCGTCCTACATGGCTGGC ACTGAGATCCTGGGTGCCATTATCTTGGGCCGGAACACCTTCAACTCTCA GCCCTACCAGGGTACCCTTCTAATGTGGGCGGTTGTGGTCGTGGCCCTCA TTGTGAATATTATCGGAGGAAAGTTCCTGCCTCGCCTGGAAACCCTCATC CTCATGATCCACATTCTGGGATACTTTGGTGTGCTCATCCCCATGACTTA TATGTCCGACCACAAGTCGACCGAGGAGGTCTTCAAGGACTTTACCAATG GCGGACACCTCTACACCGACGGTCTGTCCTTTTTCGTCGGTATGACCGGT TGTGTGTTTGCCTTTGCGGGCGGTGATGCTGCCGTGCATATGGCCGAAGA AGTGAATCATGCCACGGTCGTCATTCCCCGTGCCATTCTTCTCAGTGTTG CAATCAACGGCACCTTGGGCTTCACCATGCTGATCGCCACTCTCTTCTGC ATGGGCAGTGTTGATGCGGCCCTGGAGTCTCCCACAGGCTACCCTTTCAT GGAGATCTTCCAGCAAGCCACCGGTTCGGTCGCAGGTGGATTGGGCTTGT CCTCCATCCTCGTCATCGTCGGTATTTGCGCCGCCCTGGCCATGTTGACT GCCACCTCCCGCCAGTTCTGGTCGTTTGCTCGCGACCGTGGTGTCCCTGG CTGGCGAGTCTGGAGCCACGTCTCCAATCGTACCTTCCTCCCCACTTACT CCATCCTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCTGCTCGGTCTGATTAACATC GGCTCCGCCGTCGCCCTCAACGACGTCGTCTCCATGGCTGTCTCGGGTCT GTACTCCTCCTATCTGATCGTGGCGGTTCTTCTTCTCTGGCGTCGCTGCA CCGGCGCCATCAACAACTACAACGCCAGCGACGACACCGTCGTCAATGTC CCCGGCGCCAAGCTCATGTGGGGTCCGTTCCACGTCCCGGGCATCTGGGG TATTCTCATCAACACTTATGCGGTGATCTACATCGTTATCGTCATCTTCT TCAGTTACTGGCCCACCGAGTTGCCGGTGTCGGTAACGACGATGAACTAC AGTGTGGTGGGTACGATGGGAGTCGTCATTCTGGCTATTATCTATTATGT GGTGAGGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCTGTTATTGAGATCTCGTGAA 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GAGGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCTGTTATTGAGATCTCGTGAATGG CGTCCTACGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGTAAAC GGTACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAATTTGGCTCTTGCACGTTTGGG CAAGAAGCCTGTCCTGAAGCGGAACTTTGGTATCCTCTCGATCATCGGTC TCAGTTGTACCATTCTCGGCACATGGGAGGGTATTCTATCGACGTTCACC ATTCCCCTCGAAAATGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACTCTTTTATTTT TGCATGGACGGGAACGGCCTGCTGTTTCGTGCTGTTGTCCGAAATGGCGT CCATGGCGCCGACTTCCGGAGGCCAATATCACTGGTGTGCCATGCTTGCG CCTTATAAGCATATGAAGTTCCTAAGTTACATCACAGGATGGTTGACCGT GATCGGATGGCAGGCCGCCTTCGCATCGTCGTCCTACATGGCTGGCACTG AGATCCTGGGTGCCATTATCTTGGGCCGGAACACCTTCAACTCTCAGCCC TACCAGGGTACCCTTCTAATGTGGGCGGTTGTGGTCGTGGCCCTCATTGT GAATATTATCGGAGGAAAGTTCCTGCCTCGCCTGGAAACCCTCATCCTCA TGATCCACATTCTGGGATACTTTGGTGTGCTCATCCCCATGACTTATATG TCCGACCACAAGTCGACCGAGGAGGTCTTCAAGGACTTTACCAATGGCGG ACACCTCTACACCGACGGTCTGTCCTTTTTCGTCGGTATGACCGGTTGTG TGTTTGCCTTTGCGGGCGGTGATGCTGCCGTGCATATGGCCGAAGAAGTG AATCATGCCACGGTCGTCATTCCCCGTGCCATTCTTCTCAGTGTTGCAAT CAACGGCACCTTGGGCTTCACCATGCTGATCGCCACTCTCTTCTGCATGG GCAGTGTTGATGCGGCCCTGGAGTCTCCCACAGGCTACCCTTTCATGGAG ATCTTCCAGCAAGCCACCGGTTCGGTCGCAGGTGGATTGGGCTTGTCCTC CATCCTCGTCATCGTCGGTATTTGCGCCGCCCTGGCCATGTTGACTGCCA CCTCCCGCCAGTTCTGGTCGTTTGCTCGCGACCGTGGTGTCCCTGGCTGG CGAGTCTGGAGCCACGTCTCCAATCGTACCTTCCTCCCCACTTACTCCAT CCTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCTGCTCGGTCTGATTAACATCGGCT CCGCCGTCGCCCTCAACGACGTCGTCTCCATGGCTGTCTCGGGTCTGTAC TCCTCCTATCTGATCGTGGCGGTTCTTCTTCTCTGGCGTCGCTGCACCGG CGCCATCAACAACTACAACGCCAGCGACGACACCGTCGTCAATGTCCCCG GCGCCAAGCTCATGTGGGGTCCGTTCCACGTCCCGGGCATCTGGGGTATT CTCATCAACACTTATGCGGTGATCTACATCGTTATCGTCATCTTCTTCAG TTACTGGCCCACCGAGTTGCCGGTGTCGGTAACGACGATGAACTACAGTG TGGTGGGTACGATGGGAGTCGTCATTCTGGCTATTATCTATTATGTGGTG AGGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCTGTTATTGAGATCTCGTGAATGGC GTCCTACGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGTAAACG GTACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAATTTGGCTCTTGCACGTTTGGGC AAGAAGCCTGTCCTGAAGCGGAACTTTGGTATCCTCTCGATCATCGGTCT CAGTTGTACCATTCTCGGCACATGGGAGGGTATTCTATCGACGTTCACCA TTCCCCTCGAAAATGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACTCTTTTATTTTT GCATGGACGGGAACGGCCTGCTGTTTCGTGCTGTTGTCCGAAATGGCGTC CATGGCGCCGACTTCCGGAGGCCAATATCACTGGTGTGCCATGCTTGCGC CTTATAAGCATATGAAGTTCCTAAGTTACATCACAGGATGGTTGACCGTG ATCGGATGGCAGGCCGCCTTCGCATCGTCGTCCTACATGGCTGGCACTGA GATCCTGGGTGCCATTATCTTGGGCCGGAACACCTTCAACTCTCAGCCCT ACCAGGGTACCCTTCTAATGTGGGCGGTTGTGGTCGTGGCCCTCATTGTG AATATTATCGGAGGAAAGTTCCTGCCTCGCCTGGAAACCCTCATCCTCAT GATCCACATTCTGGGATACTTTGGTGTGCTCATCCCCATGACTTATATGT CCGACCACAAGTCGACCGAGGAGGTCTTCAAGGACTTTACCAATGGCGGA CACCTCTACACCGACGGTCTGTCCTTTTTCGTCGGTATGACCGGTTGTGT GTTTGCCTTTGCGGGCGGTGATGCTGCCGTGCATATGGCCGAAGAAGTGA ATCATGCCACGGTCGTCATTCCCCGTGCCATTCTTCTCAGTGTTGCAATC AACGGCACCTTGGGCTTCACCATGCTGATCGCCACTCTCTTCTGCATGGG CAGTGTTGATGCGGCCCTGGAGTCTCCCACAGGCTACCCTTTCATGGAGA TCTTCCAGCAAGCCACCGGTTCGGTCGCAGGTGGATTGGGCTTGTCCTCC ATCCTCGTCATCGTCGGTATTTGCGCCGCCCTGGCCATGTTGACTGCCAC CTCCCGCCAGTTCTGGTCGTTTGCTCGCGACCGTGGTGTCCCTGGCTGGC GAGTCTGGAGCCACGTCTCCAATCGTACCTTCCTCCCCACTTACTCCATC CTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCTGCTCGGTCTGATTAACATCGGCTC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
| GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | antiSMASH:Cluster_10000071.1 |
| Note | EggNog:ENOG41 |
| Note | SMCOG1038:phenylalanine-specific permease |
| DBxref | InterPro:IPR002293 |
| DBxref | PFAM:PF13520 |
| DBxref | PFAM:PF00324 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| ACJE01000007.1 | supercontig | ACJE01000007.1:49740..51857 + |
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