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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000010.1:2242051..2243788+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_55598-T1 ID=ASPNIDRAFT_55598-T1|Name=ASPNIDRAFT_55598-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=1738bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000010.1:2242051..2243788+ (Aspergillus niger ATCC 1015) CGTTCTATTCTCATTCACTCTCTTACTATCCTTTTCTTGTCCAACTCTCG
TCTCACTCGTTTCCAGACTTTTTAGGCTTCTCGAACCTTTATCCACCTTT
CTCTGCCACCATTCCTTTTTCTCTTTACGTCCCTTGACAACCTTTACCCG
TGGCCTCCGCCAAGTTCGGACAAAGCAGCCTTTTACGGCCGCGACCTTTT
GAATTTCAACGTTTCTTATCCGATCAGACTCGCACTTTCACAATGTCCGA
AGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCC
TGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCC
TTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGGTAAGCTACTCAAAAGAGTGAGGCAAT
GGAATTGAATAGAGTACTGATACCAAGAGCAGTGTCTGGATCACTCTGAG
TTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCC
GTAAGTTCTCCACGTGGTGGCTACAAATCAAGGTGACCATATCGCTAATT
GTGCTCTCTGTTGCTAGGTTTCCGTACGTTCCTCATACCCTATCTCGATA
TTGTCCAACAGTCAAAACTAATGGCATTTAGCTATCATTCTCACAACATG
GCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCA
CTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTT
CGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGG
TAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGG
TCAGTCATTCCCTTTCGAGCGTGAGTTTTCCTTGCTCACTCCCACTCAGG
CTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGGGCATGGCT
CCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTGCTTGGTGT
CATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGGATTCCTCT
TCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCATGGTTCAG
CGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTCTCCCTCTA
CTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGCTCTCTTCC
TCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTGGTGTCTGG
ACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTTTCCGTTGT
CTTCCTGGTAAGAAGCTCTTGTTCTTGACGTTGCTACATAGGGATCAAAT
TACTAACGCACCCACACAGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCC
TGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATC
TGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCT
GGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACA
CCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCT
CAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCT
CATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCA
AGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000010.1:2242051..2243788+ >ASPNIDRAFT_55598-T1 ID=ASPNIDRAFT_55598-T1|Name=ASPNIDRAFT_55598-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=5970bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000010.1:2242051..2243788+ (Aspergillus niger ATCC 1015) ATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGA GCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGA AGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGT TCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCC TATCATTCTCACAACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGC TTCTGGCGCGCACCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATG ACTGGCCGTGTCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAG TCTGAGTTTGATCTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTT TCATCCAGATGCTCAAGGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACT TGGGGTATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAG CATTATCGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTG TCTTCATCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACT CGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGA CCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACG GTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATC TACAACGTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCT CCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCTGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTA TGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATG ATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGAT TGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGG AGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCAC CCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTT CCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCA GCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAAATGTCC GAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTAC CCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTG CCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGT GTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCCTATCAT TCTCACAACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGG CGCGCACCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGC CGTGTCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAG TTTGATCTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCC AGATGCTCAAGGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGT ATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTAT CGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCA TCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTG GTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCT TGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCA CTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAAC GTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAA CGTTTCCGTTGTCTTCCTGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCC TGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATC TGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCT GGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACA CCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCT CAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCT CATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCA AGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAAATGTCCGAAGGC GAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCC CACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCC ACCCTGCTGTCTATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATC TTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCCTATCATTCTCAC AACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCA CCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTC TACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGAT CTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGC TCAAGGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGGGC ATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTGCT TGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGGAT TCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCATG GTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTCTC CCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGCTC TCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTGGT GTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTTTC CGTTGTCTTCCTGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCG GTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAG ACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGG TCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCC AGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGC AAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGG CTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCA TGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAAATGTCCGAAGGCGAAAAA GCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGT CAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTG CTGTCTATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTC AACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCCTATCATTCTCACAACATG GCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCA CTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTT CGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGG TAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGG CTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGGGCATGGCT CCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTGCTTGGTGT CATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGGATTCCTCT TCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCATGGTTCAG CGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTCTCCCTCTA CTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGCTCTCTTCC TCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTGGTGTCTGG ACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTTTCCGTTGT CTTCCTGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCC TTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCC GTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGT GTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCA ACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTC ATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCAT GGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCG GTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAAATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGA ACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGTCAATCC CGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCT ATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAG CATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCCTATCATTCTCACAACATGGCATTT GGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCTGC TCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTGCT ATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAATGT TACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGGCTACCA CCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGGGCATGGCTCCTGTC AACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTGCTTGGTGTCATCAT TGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGGATTCCTCTTCCAGC TCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTG CTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTT CGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGG TCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTGGTGTCTGGACATTG CTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCT GATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGG ATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACC TTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTA CAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTG CCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTT TTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCC CAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCG CTACTGCTGGAAATGCCTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR004853 |
DBxref | PFAM:PF03151 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ACJE01000010.1 | supercontig | ACJE01000010.1:2242051..2243788 + |
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