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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000184:88581..91159+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_007346-T1 ID=ATCC10864_007346-T1|Name=ATCC10864_007346-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=2579bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000184:88581..91159+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGGGTTACAACGACGTGGACCAATTGGCCATCAACACCATCCGCACTCT
CGCGGTATGCAACTCTTGCTCCCATTCTCTTTGCTTCTATTCCACTCCCA
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CCATCCCTGGTATCACGGGGACTCCGCGGAGCACAGTCTCCCACACTGAG
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TACGGATTGCGGAGTGGTCATATCTATCAGAACTATCACTCTTAGTCAAC
TTTGAAGCTAATCCTCCTCTAGGTTGATGCCACCTTCAAGGCCAACTCCG
GTCACCCCGGTGCCCCTATGGGCATGGCCCCCGTGTCCCACGTCCTTTTC
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CCGCTTCGTTCTCTCGTAAGCTTCAACTGGCAATCTTTGTGTCCAGGTGA
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TCACCCCGAGGCTCACGACACCCCCGGTGTTGAGGTCACCACTGGTCCCC
TGGGCCAGGGTTTCGCCAACGCCGTTGGTCTTGCTATTGCCGAGCGTCAC
TCCGCTGCTGTCTTCAACAAGCCCGGCTACACCCTCTTCAACAACTACAC
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TCATTATCACAGCCATACTAACGAGGGCTTGTTTTGCAGACGGTGACACC
AAGTGCGCCTTCACTGAGGATGTTATGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTG
GCACACCGAGTACGTCAAGGACGGTGACCACGACCTCGAGGGCATTGAGG
CTGCTATCAAGAAGTGCCAGGCTGTCACTGACAAGCCCTCCGTCATTCGT
CTGACTACTACCATCGGTTTCGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGT
CCACGGTAACCCCCTGAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCT
TCGGCTTCGACCCCAAGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGAC
CTCTACCACAAGCACGCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAA
CCAGCTCCTCCAGAAGTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGC
TCACCCGCCGTCTCTCCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTG
CCCGTCTACAAGCCCACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGA
GGCTGTCCTCGAGAAGATCCACGATGTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCT
CTGCCGACTTGACTGGCTCCAACAACACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGAC
TTCCAGCCCCCCGAGTACAACATCGGTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCG
CTACGGTGTCCGTGAGCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCG
CCTACGGCACCGTCATCCCCGCTGGTGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCC
TACGCCGCCGGTGCTGTCCGTCTGTCGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCAT
CTACGTTGCCACCCACGACTCCATCGGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTC
ACCAGCCCATTGAGACTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATG
GTTTGGCGCCCTGCTGACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGC
TCTGACCTCCAAGCACACCCCCAGCATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACC
TGCCCCAGCTCGAGGCTTCCACCATCGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTAC
GTTGCCCTCGAGGCCCCCGACGCTGCCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTC
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GCATCGCTGCCCGCGTTGTCTCCGTTCCTTGCTTCGAGGTCTTCGATGCC
CAGGACAAGGCCTACAAGCTCCAGGTCCTCCCCGACAACATCCCCGTCCT
CTCCGTCGAGGCTCTCACCACCATGGGCTGGGAGCGCTACGCTCACGAGC
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TCAACCGTGCTTTCCAGCAGATTCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000184:88581..91159+ >ATCC10864_007346-T1 ID=ATCC10864_007346-T1|Name=ATCC10864_007346-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=12330bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000184:88581..91159+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGGGTTACAACGACGTGGACCAATTGGCCATCAACACCATCCGCACTCT CGCGGTTGATGCCACCTTCAAGGCCAACTCCGGTCACCCCGGTGCCCCTA TGGGCATGGCCCCCGTGTCCCACGTCCTTTTCAACAAGTTCATGAGCTTC AACCCCCAAAATCCCGACTGGGCTAACCGTGACCGCTTCGTTCTCTCCAA CGGCCACGGCTGCATGCTCCAATATGCTCTCCTTCACCTTTTCGGCTACC AGGTCTCCATGGATGACCTGAAGTCCTTCAGACAACTCGACAGCATCACC CCCGGTCACCCCGAGGCTCACGACACCCCCGGTGTTGAGGTCACCACTGG TCCCCTGGGCCAGGGTTTCGCCAACGCCGTTGGTCTTGCTATTGCCGAGC GTCACTCCGCTGCTGTCTTCAACAAGCCCGGCTACACCCTCTTCAACAAC TACACATACTGCTTCTTCGGTGATGGCTGCGCCATGGAGGGTATTGCCAG CGAGGCCGCCTCCATGGCTGGTCACCTGAAGCTCGGTAACCTCATTGCTA TCTACGACGACAACGGAATCTCCATCGACGGTGACACCAAGTGCGCCTTC 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ACGGTGTCCGTGAGCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCGCC TACGGCACCGTCATCCCCGCTGGTGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCCTA CGCCGCCGGTGCTGTCCGTCTGTCGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCATCT ACGTTGCCACCCACGACTCCATCGGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTCAC CAGCCCATTGAGACTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGT TTGGCGCCCTGCTGACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTC TGACCTCCAAGCACACCCCCAGCATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACCTG CCCCAGCTCGAGGCTTCCACCATCGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTACGT TGCCCTCGAGGCCCCCGACGCTGCCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTCCG AGGTCAGCATCTGTATCGAGGCTGCCACCTACCTCAAGGAGAAGCACGGC ATCGCTGCCCGCGTTGTCTCCGTTCCTTGCTTCGAGGTCTTCGATGCCCA GGACAAGGCCTACAAGCTCCAGGTCCTCCCCGACAACATCCCCGTCCTCT CCGTCGAGGCTCTCACCACCATGGGCTGGGAGCGCTACGCTCACGAGCAG TTCGGTCTCAACCGCTTCGGTGCCTCTGGCCCCTACAAGGATGTCTACAA GAAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAGCAAGCGCGCTGTCGCCACCA TTGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCTCCCCCATCAACCGTGCTTTC CAGCAGATTCTGTAAATGGGTTACAACGACGTGGACCAATTGGCCATCAA CACCATCCGCACTCTCGCGGTTGATGCCACCTTCAAGGCCAACTCCGGTC ACCCCGGTGCCCCTATGGGCATGGCCCCCGTGTCCCACGTCCTTTTCAAC AAGTTCATGAGCTTCAACCCCCAAAATCCCGACTGGGCTAACCGTGACCG CTTCGTTCTCTCCAACGGCCACGGCTGCATGCTCCAATATGCTCTCCTTC ACCTTTTCGGCTACCAGGTCTCCATGGATGACCTGAAGTCCTTCAGACAA CTCGACAGCATCACCCCCGGTCACCCCGAGGCTCACGACACCCCCGGTGT TGAGGTCACCACTGGTCCCCTGGGCCAGGGTTTCGCCAACGCCGTTGGTC TTGCTATTGCCGAGCGTCACTCCGCTGCTGTCTTCAACAAGCCCGGCTAC ACCCTCTTCAACAACTACACATACTGCTTCTTCGGTGATGGCTGCGCCAT GGAGGGTATTGCCAGCGAGGCCGCCTCCATGGCTGGTCACCTGAAGCTCG GTAACCTCATTGCTATCTACGACGACAACGGAATCTCCATCGACGGTGAC ACCAAGTGCGCCTTCACTGAGGATGTTATGAAGCGTTTTGAGGCCTACGG CTGGCACACCGAGTACGTCAAGGACGGTGACCACGACCTCGAGGGCATTG AGGCTGCTATCAAGAAGTGCCAGGCTGTCACTGACAAGCCCTCCGTCATT CGTCTGACTACTACCATCGGTTTCGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGGCGG TGTCCACGGTAACCCCCTGAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGC TCTTCGGCTTCGACCCCAAGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTAC GACCTCTACCACAAGCACGCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTG GAACCAGCTCCTCCAGAAGTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACGCTG AGCTCACCCGCCGTCTCTCCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGC CTGCCCGTCTACAAGCCCACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCTCTC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003824 | catalytic activity |
GO:0004802 | transketolase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
Database | Accession |
PFAM | PF00456 |
PFAM | PF02780 |
InterPro | IPR009014 |
InterPro | IPR033247 |
InterPro | IPR005478 |
PFAM | PF02779 |
InterPro | IPR029061 |
InterPro | IPR005474 |
InterPro | IPR033248 |
InterPro | IPR005475 |
InterPro | IPR020826 |
Properties
Property Name | Value |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
MCQH01000184 | supercontig | MCQH01000184:88581..91159 + |
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